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検索結果

検索 (著者・登録者: sidhu & s)の結果全44件を表示しています

EMDB-54793:
Structure of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2~L3A2-1~Ub
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

EMDB-54794:
Structure of RBR E2 variant binding to CUL5-RBX2 bound ARIH2
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

EMDB-54795:
Cryo-EM map of focus refined ASB9-Elob/C-CKB bound to Nedd8-CUL5-RBX2-ARIH2-L3A2-1
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

EMDB-54892:
consensus map of Neddylated CUL5-ARIH2-L3A2-1 bound to ASB9-EloB/C-CKB
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

EMDB-54893:
Focus refined map of Neddylated CUL5-ARIH2-L3A2-1 bound to ASB9-EloB/C-CKB, focus refined on ARIH2-L3A2-1
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

EMDB-54933:
Consensus Map of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2~L3A2-1~Ub
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

EMDB-54934:
Focus refined map of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2~L3A2-1~Ub
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

PDB-9sdx:
Structure of RBR binding E2 variant crosslinked with NEDD8-CUL5-RBX2 bound ARIH2 and Ub
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

PDB-9sdy:
Structure of RBR E2 variant binding to CUL5-RBX2 bound ARIH2
手法: 単粒子 / : Schulman BA, Du J

EMDB-16242:
Cryo-EM structure of RANBP10-CTLH SR4 complex
手法: 単粒子 / : Sherpa D, Chrustowicz J

EMDB-16243:
Cryo-EM map of ARMC8-specific nanobody bound to CTLH-SR4
手法: 単粒子 / : Chrustowicz J, Sherpa D

EMDB-14454:
70S E. coli ribosome with an extended uL23 loop from Candidatus marinimicrobia and a stalled filamin domain 5 nascent chain
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Plessa E, Wlodarski T, Ahn M, Sidhu H, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J, Cassaignau AME

EMDB-14846:
70S E. coli ribosome with an extended uL23 loop from Candidatus marinimicrobia
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Plessa E, Wlodarski T, Ahn M, Sidhu H, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

EMDB-14850:
70S E. coli ribosome with a stalled filamin domain 5 nascent chain
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Plessa E, Wlodarski T, Ahn M, Chan SHS, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

EMDB-14864:
70S E. coli ribosome with truncated uL23 and uL24 loops
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Wlodarski T, Ahn M, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

EMDB-14865:
70S E. coli ribosome with truncated uL23 and uL24 loops and a stalled filamin domain 5 nascent chain
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Wlodarski T, Ahn M, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

PDB-7z20:
70S E. coli ribosome with an extended uL23 loop from Candidatus marinimicrobia and a stalled filamin domain 5 nascent chain
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Plessa E, Wlodarski T, Ahn M, Sidhu H, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

PDB-7zod:
70S E. coli ribosome with an extended uL23 loop from Candidatus marinimicrobia
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Plessa E, Wlodarski T, Ahn M, Sidhu H, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

PDB-7zp8:
70S E. coli ribosome with a stalled filamin domain 5 nascent chain
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Plessa E, Wlodarski T, Ahn M, Chan SHS, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

PDB-7zq5:
70S E. coli ribosome with truncated uL23 and uL24 loops
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Wlodarski T, Ahn M, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

PDB-7zq6:
70S E. coli ribosome with truncated uL23 and uL24 loops and a stalled filamin domain 5 nascent chain
手法: 単粒子 / : Mitropoulou A, Wlodarski T, Ahn M, Becker TA, Beckmann R, Cabrita LD, Christodoulou J

EMDB-22925:
cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with Fab 15033-7, two RBDs bound
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini JM

EMDB-22926:
cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with Fab 15033-7, three RBDs bound
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini JM

PDB-7kmk:
cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with Fab 15033-7, two RBDs bound
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini JM

PDB-7kml:
cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike in complex with Fab 15033-7, three RBDs bound
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini JM

EMDB-23064:
SARS-CoV-2 spike protein in complex with Fab 15033-7, 3-"up", asymmetric
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini J

EMDB-23065:
SARS-CoV-2 spike protein in complex with Fab 15033-7, 2-"up"-1-"down" conformation
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini J

PDB-7kxj:
SARS-CoV-2 spike protein in complex with Fab 15033-7, 3-"up", asymmetric
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini J

PDB-7kxk:
SARS-CoV-2 spike protein in complex with Fab 15033-7, 2-"up"-1-"down" conformation
手法: 単粒子 / : Li Z, Rini J

EMDB-10072:
cryo EM map of human APC/CCDH1 bound to the avid UbVW_dim trap
手法: 単粒子 / : Watson ER, Prabu JR, Schulman BA

PDB-5l9t:
Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with E2 UBE2S poised for polyubiquitination where UBE2S, APC2, and APC11 are modeled into low resolution density
手法: 単粒子 / : Brown NG, VanderLinden R, Dube P, Haselbach D, Peters JM, Stark H, Schulman BA

PDB-5l9u:
Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with a cross linked Ubiquitin variant-substrate-UBE2C (UBCH10) complex representing key features of multiubiquitination
手法: 単粒子 / : Brown NG, VanderLinden R, Dube P, Haselbach D, Peters JM, Stark H, Schulman BA

PDB-5khu:
Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC15 deletion mutant), in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-CDC20-MCC) based on cryo EM data at 4.8 Angstrom resolution
手法: 単粒子 / : Yamaguchi M, VanderLinden R, Dube P, Stark H, Schulman B

PDB-5khr:
Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome complex (APC15 deletion mutant) in complex with the E2 UBE2C/UBCH10 poised for ubiquitin ligation to substrate (APC/C-CDC20-substrate-UBE2C)
手法: 単粒子 / : VanderLinden R, Yamaguchi M, Dube P, Haselbach D, Stark H, Schulman BA

EMDB-4021:
Human Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (APC/C) APC15 deletion mutant with Mitotic Checkpoint Complex (MCC) in a closed conformation.
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman B, Peters JM

EMDB-4022:
Human Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (APC/C) APC15 deletion mutant with Mitotic Checkpoint Complex (MCC) in an open conformation.
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman BA, Peters JM

EMDB-4023:
Human Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome bound to Mitotic Checkpoint Complex (APC/C-MCC) in a closed conformation.
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman BA, Peters JM

EMDB-4024:
Human Anaphase-promoting complex/Cyclosome bound to Mitotic Checkpoint Complex(APC/C-MCC) in an open conformation.
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman BA, Peters JM

EMDB-4025:
Human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C) APC15 deletion mutant bound to the E2 UBE2C (aka UBCH10) poised for ubiquitin ligation to substrate.
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman BA, Peters JM

EMDB-4026:
Human Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (APC/C) APC15 deletion mutant bound to Mitotic Checkpoint Complex (MCC) and the E2 UBE2S poised for UB chain synthesis.
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman BA, Peters JM

EMDB-4027:
Human Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome bound to Mitotic Checkpoint Complex (APC/C-MCC) and the E2 UBE2C (aka UBCH10) poised for ubiquitination of MCC's CDC20
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman BA, Peters JM

EMDB-4028:
Human Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (APC/C) APC15 deletion mutant bound to Mitotic Checkpoint Complex (MCC) and the E2 UBE2C (aka UBCH10) poised for ubiquitination of MCC's CDC20
手法: 単粒子 / : Stark H, Schulman BA, Peters JM

EMDB-3432:
Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C)-CDH1-UBE2C (aka UBCH10)-substrate-Ubiquitin (variant)
手法: 単粒子 / : Brown N, VanderLinden R, Watson E, Weissmann F, Ordureau A, Wu KP, Yu S, Mercedi P, Harrison J, Davidson I, Coudevylle R, Lu Y, Dube P, Brunner M, Grace CRR, Miller D, Haselbach D, Jarvis M, Yamaguchi M, Yanishevski D, Petzold G, Sidhu S, Kuhlman B, Kirschner M, Harper JW, Peters JM, Stark H, Schulman BA

EMDB-3433:
Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C)-CDH1-UBE2S-Ubiquitin (variant)-substrate
手法: 単粒子 / : Brown N, VanderLinden R, Watson E, Weissmann F, Ordureau A, Wu KP, Yu S, Mercedi P, Harrison J, Davidson I, Coudevylle R, Lu Y, Dube P, Brunner M, Grace CRR, Miller D, Haselbach D, Jarvis M, Yamaguchi M, Yanishevski D, Petzold G, Sidhu S, Kuhlman B, Kirschner M, Harper JW, Peters JM, Stark H, Schulman BA

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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