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検索結果

検索 (著者・登録者: matsuura & y)の結果59件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-36688:
alpha-Hemolysin(G122S/K147R)-SpyTag/SpyCatcher head to head 14-mer
手法: 単粒子 / : Ishii Y, Naito K, Yokoyama T, Tanaka Y, Matsuura T

EMDB-36689:
alpha-Hemolysin(G122S/K147R/K237C)-SpyTag/SpyCatcher head to head 14-mer
手法: 単粒子 / : Ishii Y, Naito K, Yokoyama T, Tanaka Y, Matsuura T

PDB-8jx2:
alpha-Hemolysin(G122S/K147R)-SpyTag/SpyCatcher head to head 14-mer
手法: 単粒子 / : Ishii Y, Naito K, Yokoyama T, Tanaka Y, Matsuura T

PDB-8jx3:
alpha-Hemolysin(G122S/K147R/K237C)-SpyTag/SpyCatcher head to head 14-mer
手法: 単粒子 / : Ishii Y, Naito K, Yokoyama T, Tanaka Y, Matsuura T

EMDB-35029:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2, no ACE2 binding.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35030:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 1 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35031:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 2 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35032:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 3 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35036:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy.no ACE2 decoy binding
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35037:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 1 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35038:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 1 ACE2 decoy bound and 2 RBD up form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35039:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 2 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35040:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 3 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-36345:
RBD of SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

PDB-8jje:
RBD of SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-33972:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (3-up RBD) bound to neutralizing antibody CSW1-1805
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-33973:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) bound to neutralizing antibody CSW2-1353
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-33974:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing antibody CSW2-1353
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-33975:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) with C480A mutation
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-34106:
GroEL on EG-grid stored for 3 months after graphene oxidation
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-34743:
GroEL on Quantifoil grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-34031:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing antibody NIBIC-71
手法: 単粒子 / : Otsubo R, Minamitani T, Kobiyama K, Fujita J, Ito T, Ueno S, Anzai I, Tanino H, Aoyama H, Matsuura Y, Namba K, Imadome K, Ishii KJ, Tsumoto K, Kamitani W, Yasui T

EMDB-34032:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) bound to neutralizing antibody 7G7.2
手法: 単粒子 / : Otsubo R, Minamitani T, Kobiyama K, Fujita J, Ito T, Ueno S, Anzai I, Tanino H, Aoyama H, Matsuura Y, Namba K, Imadome K, Ishii KJ, Tsumoto K, Kamitani W, Yasui T

EMDB-32159:
GroEL on hydrophilized graphene grid (high particle density)
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-32160:
SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) on EG-grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-32161:
SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) on Quantifoil grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-32162:
GAPDH on EG-grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-32064:
The oligomerized complex of hemolysin AF3 mutant protomers.
手法: 単粒子 / : Ghanem N, Hashimoto T, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-32065:
The oligomerized complex of AG2 hemolysin mutant protomers
手法: 単粒子 / : Ghanem N, Hashimoto T, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-33409:
Detergent-solubilized E. coli RseP in complex with Fab
手法: 単粒子 / : Hirose M, Aruga R, Hirose T, Katagiri S, Iwasaki K, Kato T, Nogi T

EMDB-33410:
Deterget-solubilized E. coli RseP(L358C) mutant in complex with Fab
手法: 単粒子 / : Aruga R, Hirose M, Hirose T, Katagiri S, Iwasaki K, Kato T, Nogi T

EMDB-32078:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J

EMDB-32079:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (3-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32080:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32081:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

PDB-7vq0:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-31465:
human delta-METTL18 60S ribosome
手法: 単粒子 / : Takahashi M, Kashiwagi K, Ito T

PDB-7f5s:
human delta-METTL18 60S ribosome
手法: 単粒子 / : Takahashi M, Kashiwagi K, Ito T

EMDB-31310:
GroEL on EG-grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-31311:
GroEL on hydrophilized graphene grid (low particle density)
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-31312:
A3B3 ring of V1-ATPase on EG-grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-31313:
Beta-galactosidase on EG-grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-31314:
Apoferritin on EG-grid
手法: 単粒子 / : Fujita J, Makino F, Asahara H, Moriguchi M, Kumano S, Anzai I, Kishikawa J, Matsuura Y, Kato T, Namba K, Inoue T

EMDB-30915:
Apo spike protein of SARS-CoV2
手法: 単粒子 / : Liu Y, Soh WT, Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okada M, Arase H

EMDB-30916:
SARS-CoV2 spike protein with Fab fragment of enhancing antibody 8D2
手法: 単粒子 / : Liu Y, Soh WT, Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okada M, Arase H

EMDB-30917:
SARS-CoV2 spike protein with Fab fragment of enhancing antibody (8D2)-1
手法: 単粒子 / : Liu Y, Soh WT, Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okada M, Arase H

EMDB-30918:
SARS-CoV2 spike protein with Fab fragment of enhancing antibody (8D2)-2
手法: 単粒子 / : Liu Y, Soh WT, Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okada M, Arase H

EMDB-30919:
SARS-CoV2 spike protein with Fab fragment of enhancing antibody (8D2)-3
手法: 単粒子 / : Liu Y, Soh WT, Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okada M, Arase H

EMDB-30920:
SARS-CoV2 spike protein with Fab fragment of enhancing antibody (8D2)-4
手法: 単粒子 / : Liu Y, Soh WT, Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okada M, Arase H

EMDB-30921:
SARS-CoV2 spike protein with Fab fragment of enhancing antibody (2940)-1
手法: 単粒子 / : Liu Y, Soh WT, Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okada M, Arase H

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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