Loading
PDBj
MenuPDBj@FacebookPDBj@TwitterPDBj@YouTubewwPDB FoundationwwPDB
RCSB PDBPDBeBMRBAdv. SearchSearch help

ZED

Bonds
First atomSecond atomBond order typeDistance
(experimental model)
Distance
(ideal model)
Properties
CZ1CZ2doub1.39Å1.41ÅAromatic
CZ1CZ6sing1.38Å1.42ÅAromatic
CZ1HZ1sing1.08Å1.08Å
CZ2CZ3sing1.39Å1.41ÅAromatic
CZ2SZ1sing1.76Å1.81Å
CZ3CZ4doub1.38Å1.42ÅAromatic
CZ3HZ3sing1.08Å1.08Å
CZ4CZ5sing1.38Å1.42ÅAromatic
CZ4HZ4sing1.08Å1.08Å
CZ5CZ6doub1.38Å1.42ÅAromatic
CZ5HZ5sing1.08Å1.08Å
CZ6HZ6sing1.08Å1.08Å
CZ7CZ8sing1.51Å1.54Å
CZ7CZ9sing1.54Å1.53Å
CZ7NZ1sing1.47Å1.47Å
CZ7HZ7sing1.09Å1.10Å
CZ8OZ1sing1.34Å1.23Å
CZ8OZ2doub1.21Å1.24Å
CZ9CZAsing1.55Å1.52Å
CZ9HZ91sing1.09Å1.10Å
CZ9HZ92sing1.09Å1.10Å
CZACZBsing1.55Å1.51Å
CZASZ1sing1.81Å1.82Å
CZAH100sing1.09Å1.10Å
CZBNZ1sing1.47Å1.48Å
CZBH111sing1.09Å1.10Å
CZBH112sing1.09Å1.10Å
CZCCZDsing1.53Å1.55Å
CZCH121sing1.09Å1.10Å
CZCH122sing1.09Å1.10Å
CZCH123sing1.09Å1.10Å
CZDCZEsing1.51Å1.54Å
CZDCZFsing1.53Å1.53Å
CZDH133sing1.09Å1.10Å
CZEOZ3doub1.21Å1.24Å
CZENZ1sing1.35Å1.36Å
CZFSZ2sing1.81Å1.78Å
CZFH151sing1.09Å1.10Å
CZFH152sing1.09Å1.10Å
OZ1HOZ1sing0.97Å0.95Å
SZ2HSZ2sing1.35Å1.30Å
Angles
First atomSecond atomThird atomAngle
(experimental model)
Angle
(ideal model)
CZ2CZ1CZ6120.9°119.9°
CZ2CZ1HZ1119.6°120.1°
CZ1CZ2CZ3119.1°119.8°
CZ1CZ2SZ1120.2°120.1°
CZ6CZ1HZ1119.6°120.0°
CZ1CZ6CZ5119.8°120.1°
CZ1CZ6HZ6120.1°120.0°
CZ3CZ2SZ1120.7°120.1°
CZ2CZ3CZ4121.0°120.0°
CZ2CZ3HZ3119.5°120.0°
CZ2SZ1CZA101.2°100.0°
CZ4CZ3HZ3119.5°120.1°
CZ3CZ4CZ5119.7°120.1°
CZ3CZ4HZ4120.2°120.0°
CZ5CZ4HZ4120.2°120.0°
CZ4CZ5CZ6119.6°120.2°
CZ4CZ5HZ5120.2°119.9°
CZ6CZ5HZ5120.2°119.9°
CZ5CZ6HZ6120.1°120.0°
CZ8CZ7CZ9114.0°109.9°
CZ8CZ7NZ1114.3°110.3°
CZ8CZ7HZ7100.8°109.9°
CZ7CZ8OZ1119.5°120.0°
CZ7CZ8OZ2119.1°120.0°
CZ9CZ7NZ1102.5°107.3°
CZ9CZ7HZ7112.9°109.9°
CZ7CZ9CZA102.9°103.0°
CZ7CZ9HZ91113.1°110.9°
CZ7CZ9HZ92111.7°110.5°
NZ1CZ7HZ7112.7°109.6°
CZ7NZ1CZB110.2°108.7°
CZ7NZ1CZE118.0°125.6°
OZ1CZ8OZ2121.4°120.0°
CZ8OZ1HOZ1109.5°120.0°
CZACZ9HZ91113.1°110.7°
CZACZ9HZ92111.7°110.7°
CZ9CZACZB100.1°101.6°
CZ9CZASZ1117.6°111.0°
CZ9CZAH100111.5°111.0°
HZ91CZ9HZ92104.5°110.8°
CZBCZASZ1112.0°111.0°
CZBCZAH100117.2°111.0°
CZACZBNZ1102.8°104.9°
CZACZBH111113.2°110.4°
CZACZBH112111.7°110.4°
SZ1CZAH10099.5°110.9°
NZ1CZBH111113.2°110.4°
NZ1CZBH112111.8°110.3°
CZBNZ1CZE129.3°125.7°
H111CZBH112104.4°110.4°
CZDCZCH121109.5°109.5°
CZDCZCH122109.4°109.5°
CZDCZCH123109.5°109.4°
CZCCZDCZE112.4°109.5°
CZCCZDCZF109.7°109.5°
CZCCZDH133108.7°109.5°
H121CZCH122109.5°109.5°
H121CZCH123109.5°109.5°
H122CZCH123109.5°109.5°
CZECZDCZF113.3°109.5°
CZECZDH133104.7°109.5°
CZDCZEOZ3119.5°120.0°
CZDCZENZ1118.4°120.0°
CZFCZDH133107.7°109.5°
CZDCZFSZ2115.9°109.4°
CZDCZFH151105.9°109.5°
CZDCZFH152107.4°109.4°
OZ3CZENZ1122.1°120.0°
SZ2CZFH151105.9°109.5°
SZ2CZFH152107.4°109.4°
CZFSZ2HSZ2109.5°100.0°
H151CZFH152114.6°109.5°
Dihedrals
First atomSecond atomThird atomFourth atomTorsion
(experimental model)
Torsion
(ideal model)
CZ2CZ1CZ6HZ1180.0°180.0°
CZ1CZ2CZ3SZ1179.5°179.8°
CZ1CZ2CZ3CZ40.2°0.6°
CZ1CZ2CZ3HZ3179.8°179.9°
CZ2CZ1CZ6CZ50.2°0.1°
CZ2CZ1CZ6HZ6179.8°180.0°
CZ1CZ2SZ1CZA76.8°174.1°
CZ6CZ1CZ2CZ30.0°0.2°
CZ6CZ1CZ2SZ1179.5°180.0°
CZ1CZ6CZ5CZ40.2°0.1°
CZ1CZ6CZ5HZ6180.0°179.9°
CZ1CZ6CZ5HZ5179.8°180.0°
HZ1CZ1CZ2CZ3180.0°179.8°
HZ1CZ1CZ2SZ10.5°0.0°
HZ1CZ1CZ6CZ5179.8°179.9°
HZ1CZ1CZ6HZ60.2°0.0°
CZ2CZ3CZ4HZ3180.0°179.3°
CZ2CZ3CZ4CZ50.2°0.6°
CZ2CZ3CZ4HZ4179.8°179.7°
CZ3CZ2SZ1CZA102.7°5.7°
SZ1CZ2CZ3CZ4179.3°179.6°
SZ1CZ2CZ3HZ30.7°0.3°
CZ2SZ1CZACZ960.0°74.0°
CZ2SZ1CZACZB175.1°173.7°
CZ2SZ1CZAH10060.4°49.8°
CZ3CZ4CZ5HZ4180.0°179.7°
CZ3CZ4CZ5CZ60.0°0.3°
CZ3CZ4CZ5HZ5180.0°179.7°
HZ3CZ3CZ4CZ5179.8°180.0°
HZ3CZ3CZ4HZ40.2°0.4°
CZ4CZ5CZ6HZ5180.0°180.0°
CZ4CZ5CZ6HZ6179.8°180.0°
HZ4CZ4CZ5CZ6180.0°180.0°
HZ4CZ4CZ5HZ50.0°0.0°
HZ5CZ5CZ6HZ60.2°0.1°
CZ8CZ7CZ9NZ1124.1°119.9°
CZ8CZ7CZ9HZ7114.3°121.0°
CZ8CZ7NZ1HZ7114.4°121.1°
CZ7CZ8OZ1OZ2179.9°180.0°
CZ8CZ7CZ9CZA92.2°141.8°
CZ8CZ7CZ9HZ91145.4°99.8°
CZ8CZ7CZ9HZ9227.8°23.5°
CZ8CZ7NZ1CZB118.0°118.3°
CZ8CZ7NZ1CZE78.4°61.5°
CZ7CZ8OZ1HOZ1179.9°180.0°
CZ9CZ7NZ1HZ7121.7°119.2°
CZ9CZ7CZ8OZ164.7°61.5°
CZ9CZ7CZ8OZ2115.2°118.6°
CZ7CZ9CZAHZ91122.4°118.6°
CZ7CZ9CZAHZ92120.0°118.2°
CZ7CZ9HZ91HZ92121.8°123.1°
CZ7CZ9CZACZB45.6°35.3°
CZ7CZ9CZASZ175.8°153.4°
CZ7CZ9CZAH100170.3°82.8°
CZ9CZ7NZ1CZB5.9°1.4°
CZ9CZ7NZ1CZE157.7°178.9°
NZ1CZ7CZ8OZ1177.8°179.5°
NZ1CZ7CZ8OZ22.3°0.5°
NZ1CZ7CZ9CZA31.9°21.8°
NZ1CZ7CZ9HZ9190.5°140.3°
NZ1CZ7CZ9HZ92151.9°96.4°
CZ7NZ1CZBCZA22.6°24.3°
CZ7NZ1CZBCZE161.2°179.8°
CZ7NZ1CZBH11199.8°143.2°
CZ7NZ1CZBH112142.6°94.5°
CZ7NZ1CZECZD177.2°179.7°
CZ7NZ1CZEOZ33.5°0.3°
HZ7CZ7CZ8OZ156.6°59.6°
HZ7CZ7CZ8OZ2123.5°120.4°
HZ7CZ7CZ9CZA153.5°97.2°
HZ7CZ7CZ9HZ9131.1°21.2°
HZ7CZ7CZ9HZ9286.5°144.5°
HZ7CZ7NZ1CZB127.6°120.6°
HZ7CZ7NZ1CZE35.9°59.6°
OZ2CZ8OZ1HOZ10.0°0.0°
CZACZ9HZ91HZ92121.7°123.2°
CZ9CZACZBSZ1125.4°118.1°
CZ9CZACZBH100120.6°118.0°
CZ9CZASZ1H100120.4°123.9°
CZ9CZACZBNZ141.3°37.0°
CZ9CZACZBH11181.1°155.9°
CZ9CZACZBH112161.3°81.8°
HZ91CZ9CZACZB76.8°153.9°
HZ91CZ9CZASZ1161.8°88.0°
HZ91CZ9CZAH10047.9°35.8°
HZ92CZ9CZACZB165.6°82.9°
HZ92CZ9CZASZ144.2°35.2°
HZ92CZ9CZAH10069.7°159.1°
CZBCZASZ1H100124.5°123.9°
CZACZBNZ1H111122.4°118.9°
CZACZBNZ1H112120.0°118.9°
CZACZBH111H112121.8°122.3°
CZACZBNZ1CZE176.2°155.9°
SZ1CZACZBNZ184.0°155.1°
SZ1CZACZBH111153.5°86.0°
SZ1CZACZBH11236.0°36.3°
H100CZACZBNZ1161.9°81.0°
H100CZACZBH11139.5°37.9°
H100CZACZBH11278.1°160.2°
NZ1CZBH111H112121.8°122.2°
CZBNZ1CZECZD17.3°0.0°
CZBNZ1CZEOZ3163.4°180.0°
H111CZBNZ1CZE61.4°37.0°
H112CZBNZ1CZE56.2°85.2°
CZDCZCH121H122120.0°120.0°
CZDCZCH121H123120.0°120.0°
CZDCZCH122H123120.0°120.0°
CZCCZDCZECZF125.0°120.0°
CZCCZDCZEH133117.9°120.0°
CZCCZDCZFH133118.2°120.0°
CZCCZDCZEOZ339.4°120.0°
CZCCZDCZENZ1139.9°60.0°
CZCCZDCZFSZ273.4°65.0°
CZCCZDCZFH151169.5°175.0°
CZCCZDCZFH15246.6°55.0°
H121CZCH122H123120.0°120.0°
H121CZCCZDCZE50.8°60.0°
H121CZCCZDCZF76.2°60.0°
H121CZCCZDH133166.3°180.0°
H122CZCCZDCZE170.8°60.0°
H122CZCCZDCZF43.8°180.0°
H122CZCCZDH13373.7°60.0°
H123CZCCZDCZE69.2°180.0°
H123CZCCZDCZF163.8°60.0°
H123CZCCZDH13346.3°60.0°
CZECZDCZFH133115.4°120.0°
CZDCZEOZ3NZ1179.3°180.0°
CZECZDCZFSZ253.1°175.0°
CZECZDCZFH15164.0°55.0°
CZECZDCZFH152173.1°65.0°
CZFCZDCZEOZ385.6°0.0°
CZFCZDCZENZ195.0°180.0°
CZDCZFSZ2H151117.1°120.0°
CZDCZFSZ2H152120.0°119.9°
CZDCZFH151H152118.2°120.0°
CZDCZFSZ2HSZ2164.4°180.0°
H133CZDCZEOZ3157.3°120.0°
H133CZDCZENZ122.1°60.0°
H133CZDCZFSZ2168.4°55.0°
H133CZDCZFH15151.3°65.0°
H133CZDCZFH15271.6°175.0°
SZ2CZFH151H152118.2°120.0°
H151CZFSZ2HSZ278.5°60.0°
H152CZFSZ2HSZ244.4°60.1°

220760

PDB entries from 2024-06-05

PDB statisticsPDBj update infoContact PDBjnumon