Z9K
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O4 | C4 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C4 | C3 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C5 | C6 | sing | 1.51Å | 1.54Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O5 | C1 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C6 | O10 | doub | 1.21Å | 1.26Å | |
C6 | O6 | sing | 1.34Å | 1.27Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C3 | C2 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | C7 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C7 | H51 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C7 | H52 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C7 | H53 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C2 | C1 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O2 | S1 | sing | 1.52Å | 1.62Å | |
S1 | O7 | sing | 1.52Å | 1.43Å | |
S1 | O8 | doub | 1.42Å | 1.43Å | |
S1 | O9 | doub | 1.42Å | 1.44Å | |
O7 | H7O | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
HO1 | O1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O4 | C4 | C5 | 107.7° | 109.5° |
O4 | C4 | C3 | 108.5° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 111.4° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
C5 | C4 | C3 | 109.4° | 109.2° |
C5 | C4 | H4 | 109.8° | 109.6° |
C4 | C5 | O5 | 108.2° | 109.4° |
C4 | C5 | C6 | 112.9° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 109.0° | 109.4° |
C3 | C4 | H4 | 109.8° | 109.6° |
C4 | C3 | O3 | 111.3° | 109.5° |
C4 | C3 | C2 | 110.7° | 109.1° |
C4 | C3 | H3 | 107.6° | 109.6° |
O5 | C5 | C6 | 106.9° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 110.7° | 109.5° |
C5 | O5 | C1 | 112.6° | 114.1° |
C6 | C5 | H5 | 109.2° | 109.5° |
C5 | C6 | O10 | 117.8° | 120.0° |
C5 | C6 | O6 | 116.9° | 120.0° |
O5 | C1 | C2 | 112.6° | 109.4° |
O5 | C1 | O1 | 109.0° | 109.5° |
O5 | C1 | H1 | 108.9° | 109.5° |
O10 | C6 | O6 | 116.8° | 120.0° |
C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 117.0° |
O3 | C3 | C2 | 110.1° | 109.5° |
O3 | C3 | H3 | 109.5° | 109.5° |
C3 | O3 | C7 | 112.3° | 114.0° |
C2 | C3 | H3 | 107.6° | 109.6° |
C3 | C2 | O2 | 108.7° | 109.5° |
C3 | C2 | C1 | 108.4° | 109.1° |
C3 | C2 | H2 | 109.3° | 109.5° |
O3 | C7 | H51 | 109.5° | 109.5° |
O3 | C7 | H52 | 109.4° | 109.5° |
O3 | C7 | H53 | 109.5° | 109.5° |
H51 | C7 | H52 | 109.5° | 109.4° |
H51 | C7 | H53 | 109.5° | 109.5° |
H52 | C7 | H53 | 109.5° | 109.5° |
O2 | C2 | C1 | 110.2° | 109.6° |
O2 | C2 | H2 | 111.0° | 109.5° |
C2 | O2 | S1 | 120.1° | 114.0° |
C1 | C2 | H2 | 109.2° | 109.6° |
C2 | C1 | O1 | 110.2° | 109.5° |
C2 | C1 | H1 | 107.2° | 109.4° |
O2 | S1 | O7 | 106.8° | 107.2° |
O2 | S1 | O8 | 105.5° | 106.4° |
O2 | S1 | O9 | 104.3° | 106.4° |
O7 | S1 | O8 | 113.1° | 106.4° |
O7 | S1 | O9 | 113.1° | 106.4° |
S1 | O7 | H7O | 109.5° | 114.0° |
O8 | S1 | O9 | 113.2° | 123.1° |
O1 | C1 | H1 | 108.9° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O4 | C4 | C5 | C3 | 117.8° | 119.9° |
O4 | C4 | C5 | H4 | 121.5° | 120.2° |
O4 | C4 | C3 | H4 | 122.1° | 120.1° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 71.1° | 62.3° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 47.0° | 57.7° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 168.5° | 177.7° |
O4 | C4 | C3 | O3 | 103.6° | 177.2° |
O4 | C4 | C3 | C2 | 133.7° | 63.0° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 16.3° | 57.0° |
C5 | C4 | C3 | H4 | 120.6° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | C6 | 121.8° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 119.4° | 119.9° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 121.3° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | C1 | 72.3° | 61.1° |
C4 | C5 | C6 | O10 | 115.8° | 115.0° |
C4 | C5 | C6 | O6 | 97.3° | 64.9° |
C5 | C4 | C3 | O3 | 139.1° | 62.9° |
C5 | C4 | C3 | C2 | 16.4° | 56.9° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 101.0° | 176.9° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 59.9° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 46.7° | 57.6° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 164.8° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 73.7° | 62.4° |
C4 | C3 | O3 | C2 | 123.1° | 119.6° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 118.8° | 120.2° |
C4 | C3 | C2 | H3 | 117.3° | 119.9° |
C4 | C3 | O3 | C7 | 111.2° | 90.0° |
C4 | C3 | C2 | O2 | 178.7° | 63.0° |
C4 | C3 | C2 | C1 | 58.9° | 57.0° |
C4 | C3 | C2 | H2 | 60.0° | 176.9° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 61.6° | 179.6° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 167.3° | 177.5° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 74.5° | 62.4° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 46.9° | 57.6° |
H4 | C4 | C3 | O3 | 18.5° | 57.1° |
H4 | C4 | C3 | C2 | 104.3° | 176.9° |
H4 | C4 | C3 | H3 | 138.4° | 63.1° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 59.4° | 60.3° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 119.8° | 120.0° |
O5 | C5 | C6 | O10 | 125.3° | 5.0° |
O5 | C5 | C6 | O6 | 21.6° | 175.1° |
C5 | O5 | C1 | C2 | 26.0° | 61.2° |
C5 | O5 | C1 | O1 | 96.6° | 58.8° |
C5 | O5 | C1 | H1 | 144.8° | 178.9° |
C6 | C5 | O5 | C1 | 165.9° | 178.8° |
C5 | C6 | O10 | O6 | 147.0° | 180.0° |
C5 | C6 | O6 | HO6 | 147.3° | 180.0° |
H5 | C5 | O5 | C1 | 47.1° | 58.8° |
H5 | C5 | C6 | O10 | 5.6° | 125.0° |
H5 | C5 | C6 | O6 | 141.4° | 55.0° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 38.4° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 157.3° | 62.3° |
O5 | C1 | C2 | O1 | 121.9° | 120.0° |
O5 | C1 | C2 | H1 | 119.7° | 120.0° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 80.6° | 177.5° |
O5 | C1 | O1 | H1 | 118.6° | 120.1° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 60.0° |
O10 | C6 | O6 | HO6 | 0.0° | 0.0° |
O3 | C3 | C2 | H3 | 119.2° | 120.2° |
C3 | O3 | C7 | H51 | 180.0° | 60.0° |
C3 | O3 | C7 | H52 | 60.0° | 60.0° |
C3 | O3 | C7 | H53 | 60.0° | 180.0° |
O3 | C3 | C2 | O2 | 57.9° | 177.2° |
O3 | C3 | C2 | C1 | 177.6° | 62.9° |
O3 | C3 | C2 | H2 | 63.4° | 57.1° |
C2 | C3 | O3 | C7 | 125.7° | 150.4° |
C3 | C2 | O2 | C1 | 118.6° | 119.7° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 120.3° | 120.1° |
C3 | C2 | C1 | H2 | 119.0° | 119.9° |
C3 | C2 | O2 | S1 | 136.4° | 145.0° |
C3 | C2 | C1 | O1 | 160.3° | 62.4° |
C3 | C2 | C1 | H1 | 81.3° | 177.6° |
H3 | C3 | O3 | C7 | 7.6° | 30.1° |
H3 | C3 | C2 | O2 | 61.4° | 57.0° |
H3 | C3 | C2 | C1 | 58.4° | 176.9° |
H3 | C3 | C2 | H2 | 177.3° | 63.2° |
O3 | C7 | H51 | H52 | 120.0° | 120.0° |
O3 | C7 | H51 | H53 | 120.0° | 120.0° |
O3 | C7 | H52 | H53 | 120.0° | 120.0° |
H51 | C7 | H52 | H53 | 120.0° | 119.9° |
O2 | C2 | C1 | H2 | 122.2° | 120.2° |
C2 | O2 | S1 | O7 | 51.9° | 75.0° |
C2 | O2 | S1 | O8 | 68.6° | 171.4° |
C2 | O2 | S1 | O9 | 171.9° | 38.5° |
O2 | C2 | C1 | O1 | 80.8° | 177.7° |
O2 | C2 | C1 | H1 | 37.5° | 57.7° |
C1 | C2 | O2 | S1 | 105.0° | 95.3° |
C2 | C1 | O1 | H1 | 117.3° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 55.9° | 179.9° |
H2 | C2 | O2 | S1 | 16.1° | 24.9° |
H2 | C2 | C1 | O1 | 41.3° | 57.5° |
H2 | C2 | C1 | H1 | 159.7° | 62.5° |
O2 | S1 | O7 | O8 | 115.6° | 113.6° |
O2 | S1 | O7 | O9 | 114.1° | 113.5° |
O2 | S1 | O8 | O9 | 113.4° | 122.9° |
O2 | S1 | O7 | H7O | 115.6° | 180.0° |
O7 | S1 | O8 | O9 | 130.3° | 122.9° |
O8 | S1 | O7 | H7O | 0.0° | 66.4° |
O9 | S1 | O7 | H7O | 130.3° | 66.5° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 61.4° | 60.1° |