Z3L
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | O2 | sing | 1.45Å | 1.43Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C21 | C2M | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
C21 | O21 | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
C21 | O2 | sing | 1.34Å | 1.36Å | |
C2M | H2M1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2M | H2M2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2M | H2M3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | O3 | sing | 1.45Å | 1.44Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C31 | O3 | sing | 1.34Å | 1.36Å | |
C31 | C3M | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
C31 | O31 | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
C3M | H3M2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3M | H3M3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3M | H3M1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C4 | O4 | sing | 1.45Å | 1.43Å | |
C41 | O4 | sing | 1.34Å | 1.44Å | |
C41 | O41 | doub | 1.21Å | 1.43Å | |
C41 | C4M | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
C4M | H4M1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4M | H4M2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4M | H4M3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | C6 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H62 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | O6 | sing | 1.45Å | 1.44Å | |
C61 | O61 | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
C61 | C6M | sing | 1.51Å | 1.52Å | |
C61 | O6 | sing | 1.34Å | 1.36Å | |
C6M | H6M2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6M | H6M3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6M | H6M1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | 109.0° | 109.5° |
O1 | C1 | O5 | 111.1° | 109.5° |
O1 | C1 | H1 | 111.2° | 109.4° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
C2 | C1 | O5 | 104.0° | 109.5° |
C2 | C1 | H1 | 110.0° | 109.4° |
C1 | C2 | O2 | 112.2° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 109.5° | 109.2° |
C1 | C2 | H2 | 108.9° | 109.5° |
O5 | C1 | H1 | 111.2° | 109.5° |
C1 | O5 | C5 | 108.7° | 114.1° |
O2 | C2 | C3 | 107.2° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 110.1° | 109.5° |
C2 | O2 | C21 | 113.2° | 117.0° |
C3 | C2 | H2 | 108.9° | 109.6° |
C2 | C3 | O3 | 112.2° | 109.5° |
C2 | C3 | C4 | 108.8° | 109.0° |
C2 | C3 | H3 | 108.0° | 109.5° |
C2M | C21 | O21 | 119.6° | 120.0° |
C2M | C21 | O2 | 122.7° | 120.0° |
C21 | C2M | H2M1 | 109.5° | 109.5° |
C21 | C2M | H2M2 | 109.5° | 109.5° |
C21 | C2M | H2M3 | 109.5° | 109.4° |
O21 | C21 | O2 | 117.7° | 120.0° |
H2M1 | C2M | H2M2 | 109.5° | 109.5° |
H2M1 | C2M | H2M3 | 109.5° | 109.5° |
H2M2 | C2M | H2M3 | 109.5° | 109.4° |
O3 | C3 | C4 | 110.5° | 109.6° |
O3 | C3 | H3 | 109.1° | 109.5° |
C3 | O3 | C31 | 111.0° | 117.0° |
C4 | C3 | H3 | 108.0° | 109.6° |
C3 | C4 | H4 | 109.3° | 109.5° |
C3 | C4 | C5 | 106.9° | 109.2° |
C3 | C4 | O4 | 110.7° | 109.5° |
O3 | C31 | C3M | 120.8° | 120.0° |
O3 | C31 | O31 | 119.8° | 120.0° |
C3M | C31 | O31 | 119.4° | 120.0° |
C31 | C3M | H3M2 | 109.5° | 109.5° |
C31 | C3M | H3M3 | 109.5° | 109.4° |
C31 | C3M | H3M1 | 109.5° | 109.4° |
H3M2 | C3M | H3M3 | 109.4° | 109.6° |
H3M2 | C3M | H3M1 | 109.4° | 109.4° |
H3M3 | C3M | H3M1 | 109.5° | 109.5° |
H4 | C4 | C5 | 109.3° | 109.5° |
H4 | C4 | O4 | 110.4° | 109.5° |
C5 | C4 | O4 | 110.1° | 109.6° |
C4 | C5 | H5 | 108.2° | 109.5° |
C4 | C5 | C6 | 109.1° | 109.5° |
C4 | C5 | O5 | 110.0° | 109.4° |
C4 | O4 | C41 | 110.2° | 117.0° |
O4 | C41 | O41 | 120.6° | 120.1° |
O4 | C41 | C4M | 120.0° | 120.0° |
O41 | C41 | C4M | 119.4° | 120.0° |
C41 | C4M | H4M1 | 109.5° | 109.5° |
C41 | C4M | H4M2 | 109.5° | 109.4° |
C41 | C4M | H4M3 | 109.5° | 109.5° |
H4M1 | C4M | H4M2 | 109.5° | 109.5° |
H4M1 | C4M | H4M3 | 109.5° | 109.5° |
H4M2 | C4M | H4M3 | 109.5° | 109.4° |
H5 | C5 | C6 | 108.2° | 109.5° |
H5 | C5 | O5 | 109.3° | 109.5° |
C6 | C5 | O5 | 111.9° | 109.5° |
C5 | C6 | H61 | 109.0° | 109.5° |
C5 | C6 | H62 | 109.0° | 109.5° |
C5 | C6 | O6 | 111.4° | 109.4° |
H61 | C6 | H62 | 109.4° | 109.5° |
H61 | C6 | O6 | 109.0° | 109.5° |
H62 | C6 | O6 | 109.0° | 109.5° |
C6 | O6 | C61 | 112.4° | 117.0° |
O61 | C61 | C6M | 119.8° | 120.0° |
O61 | C61 | O6 | 120.5° | 120.0° |
C6M | C61 | O6 | 119.7° | 120.0° |
C61 | C6M | H6M2 | 109.5° | 109.4° |
C61 | C6M | H6M3 | 109.5° | 109.5° |
C61 | C6M | H6M1 | 109.5° | 109.5° |
H6M2 | C6M | H6M3 | 109.4° | 109.5° |
H6M2 | C6M | H6M1 | 109.5° | 109.4° |
H6M3 | C6M | H6M1 | 109.5° | 109.5° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | O5 | 118.6° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | H1 | 122.2° | 120.0° |
O1 | C1 | O5 | H1 | 124.5° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 57.2° | 62.5° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 176.1° | 177.6° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 64.9° | 57.6° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 173.3° | 178.8° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 118.4° | 120.0° |
C1 | C2 | O2 | C3 | 120.3° | 119.7° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 121.4° | 120.1° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 118.9° | 119.9° |
C1 | C2 | O2 | C21 | 61.0° | 90.0° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 177.6° | 176.8° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 59.8° | 56.9° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 57.2° | 63.0° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 69.6° | 61.2° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 175.8° | 177.5° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 65.3° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 53.7° | 62.3° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 69.7° | 61.2° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 49.0° | 58.8° |
C1 | O5 | C5 | C6 | 168.8° | 178.9° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 66.0° | 60.1° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 65.0° | 57.5° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 53.9° | 62.5° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 172.9° | 177.6° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 48.8° | 58.8° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 58.5° | 60.0° |
O2 | C2 | C3 | H2 | 119.1° | 120.2° |
C2 | O2 | C21 | C2M | 3.7° | 180.0° |
C2 | O2 | C21 | O21 | 173.4° | 0.0° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 55.6° | 63.2° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 178.2° | 176.9° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 64.8° | 56.9° |
C3 | C2 | O2 | C21 | 59.2° | 150.3° |
C2 | C3 | O3 | C4 | 121.6° | 119.6° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 119.7° | 120.1° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 117.1° | 119.9° |
C2 | C3 | O3 | C31 | 154.2° | 90.0° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 172.8° | 176.9° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 54.7° | 57.0° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 65.3° | 63.0° |
H2 | C2 | O2 | C21 | 177.6° | 30.1° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 63.5° | 57.0° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 59.1° | 62.9° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 176.2° | 177.1° |
C2M | C21 | O21 | O2 | 177.1° | 180.0° |
C21 | C2M | H2M1 | H2M2 | 120.0° | 120.0° |
C21 | C2M | H2M1 | H2M3 | 120.0° | 120.0° |
C21 | C2M | H2M2 | H2M3 | 120.0° | 120.0° |
O21 | C21 | C2M | H2M1 | 0.0° | 0.0° |
O21 | C21 | C2M | H2M2 | 120.0° | 120.0° |
O21 | C21 | C2M | H2M3 | 120.0° | 120.0° |
O2 | C21 | C2M | H2M1 | 177.0° | 180.0° |
O2 | C21 | C2M | H2M2 | 57.0° | 59.9° |
O2 | C21 | C2M | H2M3 | 63.0° | 60.0° |
H2M1 | C2M | H2M2 | H2M3 | 120.0° | 120.0° |
O3 | C3 | C4 | H3 | 119.3° | 120.2° |
C3 | O3 | C31 | C3M | 2.7° | 180.0° |
C3 | O3 | C31 | O31 | 178.5° | 0.0° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 63.5° | 63.2° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 178.3° | 176.8° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 58.3° | 56.9° |
C4 | C3 | O3 | C31 | 84.1° | 150.4° |
C3 | C4 | H4 | C5 | 116.7° | 119.7° |
C3 | C4 | H4 | O4 | 122.1° | 120.1° |
C3 | C4 | C5 | O4 | 120.4° | 119.9° |
C3 | C4 | O4 | C41 | 98.6° | 150.0° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 59.6° | 62.4° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 177.1° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 59.8° | 57.6° |
H3 | C3 | O3 | C31 | 34.5° | 30.2° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 55.8° | 57.0° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 62.4° | 62.9° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 177.6° | 177.1° |
O3 | C31 | C3M | O31 | 178.8° | 180.0° |
O3 | C31 | C3M | H3M2 | 178.8° | 59.9° |
O3 | C31 | C3M | H3M3 | 61.2° | 180.0° |
O3 | C31 | C3M | H3M1 | 58.8° | 60.0° |
C31 | C3M | H3M2 | H3M3 | 120.0° | 120.0° |
C31 | C3M | H3M2 | H3M1 | 120.0° | 120.0° |
C31 | C3M | H3M3 | H3M1 | 120.0° | 119.9° |
O31 | C31 | C3M | H3M2 | 0.0° | 120.0° |
O31 | C31 | C3M | H3M3 | 120.0° | 0.1° |
O31 | C31 | C3M | H3M1 | 120.0° | 120.0° |
H3M2 | C3M | H3M3 | H3M1 | 120.0° | 120.0° |
H4 | C4 | C5 | O4 | 121.5° | 120.2° |
H4 | C4 | O4 | C41 | 22.6° | 29.9° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 58.6° | 57.5° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 58.9° | 62.5° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 178.0° | 177.5° |
C5 | C4 | O4 | C41 | 143.3° | 90.3° |
C4 | C5 | H5 | C6 | 118.1° | 120.0° |
C4 | C5 | H5 | O5 | 119.8° | 119.9° |
C4 | C5 | C6 | O5 | 122.0° | 119.9° |
C4 | C5 | C6 | H61 | 120.9° | 65.0° |
C4 | C5 | C6 | H62 | 119.7° | 55.0° |
C4 | C5 | C6 | O6 | 0.6° | 175.0° |
C4 | O4 | C41 | O41 | 61.3° | 0.0° |
C4 | O4 | C41 | C4M | 118.8° | 180.0° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 179.9° | 177.7° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 62.5° | 57.7° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 60.6° | 62.3° |
O4 | C41 | O41 | C4M | 179.9° | 179.9° |
O4 | C41 | C4M | H4M1 | 179.9° | 0.0° |
O4 | C41 | C4M | H4M2 | 59.9° | 120.0° |
O4 | C41 | C4M | H4M3 | 60.1° | 120.0° |
O41 | C41 | C4M | H4M1 | 0.0° | 180.0° |
O41 | C41 | C4M | H4M2 | 120.0° | 60.0° |
O41 | C41 | C4M | H4M3 | 120.0° | 59.9° |
C41 | C4M | H4M1 | H4M2 | 120.0° | 119.9° |
C41 | C4M | H4M1 | H4M3 | 120.0° | 120.1° |
C41 | C4M | H4M2 | H4M3 | 120.0° | 120.0° |
H4M1 | C4M | H4M2 | H4M3 | 120.0° | 120.0° |
H5 | C5 | C6 | O5 | 120.4° | 120.1° |
H5 | C5 | C6 | H61 | 121.5° | 175.0° |
H5 | C5 | C6 | H62 | 2.1° | 65.0° |
H5 | C5 | C6 | O6 | 118.2° | 55.0° |
C5 | C6 | H61 | H62 | 119.1° | 120.0° |
C5 | C6 | H61 | O6 | 121.8° | 119.9° |
C5 | C6 | H62 | O6 | 121.8° | 119.9° |
C5 | C6 | O6 | C61 | 101.5° | 180.0° |
O5 | C5 | C6 | H61 | 1.1° | 54.9° |
O5 | C5 | C6 | H62 | 118.3° | 174.9° |
O5 | C5 | C6 | O6 | 121.4° | 65.1° |
H61 | C6 | H62 | O6 | 119.1° | 120.0° |
H61 | C6 | O6 | C61 | 138.2° | 60.0° |
H62 | C6 | O6 | C61 | 18.8° | 60.0° |
C6 | O6 | C61 | O61 | 178.5° | 0.0° |
C6 | O6 | C61 | C6M | 2.6° | 180.0° |
O61 | C61 | C6M | O6 | 178.8° | 179.9° |
O61 | C61 | C6M | H6M2 | 0.0° | 90.0° |
O61 | C61 | C6M | H6M3 | 120.0° | 149.9° |
O61 | C61 | C6M | H6M1 | 120.0° | 29.9° |
C61 | C6M | H6M2 | H6M3 | 120.0° | 120.0° |
C61 | C6M | H6M2 | H6M1 | 120.0° | 119.9° |
C61 | C6M | H6M3 | H6M1 | 120.0° | 120.0° |
O6 | C61 | C6M | H6M2 | 178.8° | 90.1° |
O6 | C61 | C6M | H6M3 | 58.8° | 30.0° |
O6 | C61 | C6M | H6M1 | 61.2° | 150.0° |
H6M2 | C6M | H6M3 | H6M1 | 120.0° | 120.0° |