Z2D
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.48Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.58Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.50Å | |
C5 | C6 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H62 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | O6 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | 110.2° | 109.5° |
O1 | C1 | O5 | 108.9° | 109.5° |
O1 | C1 | H1 | 108.8° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 113.9° |
C2 | C1 | O5 | 113.2° | 109.4° |
C2 | C1 | H1 | 107.4° | 109.4° |
C1 | C2 | O2 | 110.8° | 109.6° |
C1 | C2 | C3 | 107.8° | 109.2° |
C1 | C2 | H2 | 108.4° | 109.6° |
O5 | C1 | H1 | 108.3° | 109.5° |
C1 | O5 | C5 | 115.5° | 114.1° |
O2 | C2 | C3 | 111.7° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 109.8° | 109.5° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C3 | C2 | H2 | 108.3° | 109.5° |
C2 | C3 | O3 | 112.1° | 109.5° |
C2 | C3 | C4 | 112.4° | 109.0° |
C2 | C3 | H3 | 107.1° | 109.6° |
O3 | C3 | C4 | 109.9° | 109.5° |
O3 | C3 | H3 | 108.4° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C3 | H3 | 106.7° | 109.6° |
C3 | C4 | H4 | 107.0° | 109.5° |
C3 | C4 | C5 | 111.7° | 109.2° |
C3 | C4 | O4 | 112.3° | 109.5° |
H4 | C4 | C5 | 107.2° | 109.5° |
H4 | C4 | O4 | 109.1° | 109.5° |
C5 | C4 | O4 | 109.3° | 109.6° |
C4 | C5 | O5 | 112.6° | 109.4° |
C4 | C5 | C6 | 111.7° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 105.5° | 109.4° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
O5 | C5 | C6 | 114.2° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 106.0° | 109.5° |
C6 | C5 | H5 | 106.0° | 109.5° |
C5 | C6 | H61 | 109.3° | 109.5° |
C5 | C6 | H62 | 109.3° | 109.5° |
C5 | C6 | O6 | 110.2° | 109.5° |
H61 | C6 | H62 | 109.4° | 109.4° |
H61 | C6 | O6 | 109.3° | 109.5° |
H62 | C6 | O6 | 109.3° | 109.5° |
C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 114.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | O5 | 122.2° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | H1 | 118.4° | 120.0° |
O1 | C1 | O5 | H1 | 118.1° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 57.1° | 57.5° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 179.6° | 62.4° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 63.4° | 177.6° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 178.2° | 58.8° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 119.0° | 120.0° |
C1 | C2 | O2 | C3 | 120.1° | 119.7° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 119.7° | 120.2° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 117.1° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 179.7° | 62.9° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 55.9° | 57.0° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 60.9° | 176.9° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 55.3° | 61.2° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 65.0° | 177.5° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 57.4° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 174.4° | 62.3° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 48.3° | 61.1° |
C1 | O5 | C5 | C6 | 80.6° | 178.9° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 163.1° | 58.8° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 55.4° | 60.0° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 175.5° | 62.5° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 62.1° | 177.6° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 55.0° | 57.7° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 63.7° | 178.9° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 62.4° | 60.1° |
O2 | C2 | C3 | H2 | 121.0° | 120.1° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 58.4° | 57.1° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 65.9° | 176.9° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 177.2° | 63.2° |
C2 | C3 | O3 | C4 | 125.7° | 119.5° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 118.0° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 117.1° | 119.9° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 168.7° | 62.9° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 51.6° | 56.9° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 71.6° | 176.9° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 59.9° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.1° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 62.6° | 177.2° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 173.0° | 63.0° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 56.1° | 56.9° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 60.3° | 60.2° |
O3 | C3 | C4 | H3 | 117.3° | 120.2° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 65.8° | 177.2° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 177.2° | 62.9° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 54.0° | 57.1° |
C3 | C4 | H4 | C5 | 120.0° | 119.7° |
C3 | C4 | H4 | O4 | 121.7° | 120.2° |
C3 | C4 | C5 | O4 | 124.9° | 120.0° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 45.5° | 57.6° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 84.6° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 160.7° | 62.4° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 54.3° | 179.6° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 60.0° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 51.6° | 57.0° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 65.5° | 176.9° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 171.3° | 63.1° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 62.0° | 60.2° |
H4 | C4 | C5 | O4 | 118.2° | 120.1° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 162.5° | 62.3° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 32.4° | 57.7° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 82.3° | 177.7° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 61.5° | 60.2° |
C4 | C5 | O5 | C6 | 128.8° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 114.9° | 119.9° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 114.4° | 119.9° |
C4 | C5 | C6 | H61 | 164.1° | 54.9° |
C4 | C5 | C6 | H62 | 44.4° | 65.0° |
C4 | C5 | C6 | O6 | 75.8° | 175.0° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 55.4° | 179.7° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 79.4° | 177.5° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 150.5° | 62.4° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 35.8° | 57.5° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 116.3° | 120.1° |
O5 | C5 | C6 | H61 | 34.9° | 174.9° |
O5 | C5 | C6 | H62 | 84.9° | 55.0° |
O5 | C5 | C6 | O6 | 155.0° | 65.0° |
C5 | C6 | H61 | H62 | 119.7° | 120.0° |
C5 | C6 | H61 | O6 | 120.6° | 120.1° |
C5 | C6 | H62 | O6 | 120.6° | 120.0° |
C5 | C6 | O6 | HO6 | 180.0° | 180.0° |
H5 | C5 | C6 | H61 | 81.5° | 65.0° |
H5 | C5 | C6 | H62 | 158.8° | 175.0° |
H5 | C5 | C6 | O6 | 38.6° | 55.0° |
H61 | C6 | H62 | O6 | 119.7° | 120.0° |
H61 | C6 | O6 | HO6 | 59.9° | 60.0° |
H62 | C6 | O6 | HO6 | 59.9° | 60.0° |