YYH
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O6 | C6 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C5 | C6 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | C6M | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6M | H6M1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6M | H6M3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6M | H6M2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 114.0° |
O6 | C6 | C5 | 114.2° | 109.5° |
O6 | C6 | C6M | 104.7° | 109.5° |
O6 | C6 | H61 | 112.1° | 109.5° |
O5 | C1 | H1 | 109.0° | 109.4° |
O5 | C1 | O1 | 110.3° | 109.5° |
O5 | C1 | C2 | 105.8° | 109.4° |
C1 | O5 | C5 | 116.2° | 114.1° |
H1 | C1 | O1 | 109.3° | 109.5° |
H1 | C1 | C2 | 108.2° | 109.5° |
O1 | C1 | C2 | 114.1° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
C1 | C2 | H2 | 108.3° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 109.8° | 109.2° |
C1 | C2 | O2 | 109.0° | 109.6° |
H2 | C2 | C3 | 108.2° | 109.5° |
H2 | C2 | O2 | 109.7° | 109.5° |
C3 | C2 | O2 | 111.8° | 109.6° |
C2 | C3 | C4 | 115.2° | 109.0° |
C2 | C3 | H3 | 103.1° | 109.5° |
C2 | C3 | O3 | 115.6° | 109.6° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C3 | H3 | 103.2° | 109.5° |
C4 | C3 | O3 | 113.5° | 109.6° |
C3 | C4 | O4 | 105.3° | 109.5° |
C3 | C4 | C5 | 106.6° | 109.2° |
C3 | C4 | H4 | 112.3° | 109.5° |
H3 | C3 | O3 | 104.1° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
O4 | C4 | C5 | 106.0° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 113.9° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
C5 | C4 | H4 | 112.1° | 109.6° |
C4 | C5 | O5 | 114.3° | 109.4° |
C4 | C5 | C6 | 116.7° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 103.9° | 109.5° |
O5 | C5 | C6 | 111.7° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 104.6° | 109.5° |
C6 | C5 | H5 | 103.8° | 109.5° |
C5 | C6 | C6M | 103.4° | 109.5° |
C5 | C6 | H61 | 110.7° | 109.5° |
C6M | C6 | H61 | 111.2° | 109.4° |
C6 | C6M | H6M1 | 109.5° | 109.5° |
C6 | C6M | H6M3 | 109.5° | 109.4° |
C6 | C6M | H6M2 | 109.4° | 109.5° |
H6M1 | C6M | H6M3 | 109.5° | 109.5° |
H6M1 | C6M | H6M2 | 109.5° | 109.5° |
H6M3 | C6M | H6M2 | 109.5° | 109.4° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O6 | C6 | C5 | C4 | 104.1° | 55.0° |
O6 | C6 | C5 | O5 | 30.1° | 64.9° |
O6 | C6 | C5 | C6M | 113.2° | 120.0° |
O6 | C6 | C5 | H61 | 127.6° | 120.0° |
O6 | C6 | C5 | H5 | 142.3° | 175.1° |
O6 | C6 | C6M | H61 | 121.3° | 120.0° |
O6 | C6 | C6M | H6M1 | 180.0° | 180.0° |
O6 | C6 | C6M | H6M3 | 60.0° | 60.0° |
O6 | C6 | C6M | H6M2 | 60.0° | 59.9° |
HO6 | O6 | C6 | C5 | 180.0° | 180.0° |
HO6 | O6 | C6 | C6M | 67.5° | 60.0° |
HO6 | O6 | C6 | H61 | 53.1° | 60.0° |
O5 | C1 | H1 | O1 | 120.6° | 120.0° |
O5 | C1 | H1 | C2 | 114.6° | 119.9° |
O5 | C1 | O1 | C2 | 119.0° | 119.9° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 176.3° | 177.5° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 58.3° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 64.4° | 62.4° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 56.5° | 61.2° |
C1 | O5 | C5 | C6 | 168.1° | 178.8° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 56.5° | 58.8° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 60.1° |
H1 | C1 | O1 | C2 | 121.2° | 120.1° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 67.0° | 62.6° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 175.0° | 177.5° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 52.3° | 57.5° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 176.1° | 178.9° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 60.2° | 60.0° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 54.8° | 57.6° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 63.2° | 62.4° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 174.1° | 177.7° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 63.9° | 58.8° |
C1 | C2 | H2 | C3 | 119.0° | 119.7° |
C1 | C2 | H2 | O2 | 118.8° | 120.1° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 121.1° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 58.6° | 57.0° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 53.0° | 62.8° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 165.8° | 176.9° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 59.9° | 61.2° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 61.0° | 180.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
H2 | C2 | C3 | O2 | 120.9° | 120.1° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 176.6° | 176.9° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 65.1° | 57.1° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 47.8° | 63.2° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 61.6° | 60.1° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 111.5° | 119.8° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 136.5° | 119.9° |
C2 | C3 | H3 | O3 | 121.0° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 161.8° | 176.9° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 49.4° | 56.9° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 73.7° | 63.0° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 58.4° | 179.8° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.0° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 62.5° | 63.0° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 174.1° | 177.2° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 73.1° | 56.9° |
C4 | C3 | H3 | O3 | 118.8° | 120.3° |
C3 | C4 | O4 | C5 | 112.8° | 119.7° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 123.5° | 120.1° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 123.3° | 119.9° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 46.4° | 57.6° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 179.5° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 67.0° | 62.4° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 43.7° | 179.6° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 60.0° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 50.3° | 57.1° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 62.1° | 62.9° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 174.8° | 177.1° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 67.8° | 60.2° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 61.7° | 63.2° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 174.1° | 176.8° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 62.8° | 56.9° |
O4 | C4 | C5 | H4 | 124.8° | 120.1° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 158.3° | 177.5° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 68.6° | 62.5° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 44.9° | 57.6° |
C4 | C5 | O5 | C6 | 135.4° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 113.0° | 120.0° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 113.6° | 120.1° |
C4 | C5 | C6 | C6M | 142.7° | 175.0° |
C4 | C5 | C6 | H61 | 23.5° | 65.0° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 67.2° | 179.7° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 76.8° | 62.3° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 56.2° | 57.6° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 169.7° | 177.7° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 56.5° | 60.1° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 112.2° | 120.0° |
O5 | C5 | C6 | C6M | 83.1° | 55.1° |
O5 | C5 | C6 | H61 | 157.8° | 175.1° |
C5 | C6 | C6M | H61 | 118.9° | 120.0° |
C5 | C6 | C6M | H6M1 | 60.1° | 60.0° |
C5 | C6 | C6M | H6M3 | 179.9° | 60.0° |
C5 | C6 | C6M | H6M2 | 59.9° | 180.0° |
H5 | C5 | C6 | C6M | 29.1° | 64.9° |
H5 | C5 | C6 | H61 | 90.0° | 55.1° |
C6 | C6M | H6M1 | H6M3 | 120.0° | 120.0° |
C6 | C6M | H6M1 | H6M2 | 120.0° | 120.1° |
C6 | C6M | H6M3 | H6M2 | 120.0° | 120.0° |
H61 | C6 | C6M | H6M1 | 58.7° | 60.0° |
H61 | C6 | C6M | H6M3 | 61.3° | 180.0° |
H61 | C6 | C6M | H6M2 | 178.8° | 60.0° |
H6M1 | C6M | H6M3 | H6M2 | 120.0° | 120.0° |