XXM
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O1 | C1 | sing | 1.43Å | 1.34Å | |
C4 | O4 | sing | 1.44Å | 1.53Å | |
C4 | C3 | sing | 1.55Å | 1.61Å | |
O3 | C3 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
O4 | C1 | sing | 1.44Å | 1.36Å | |
C1 | C2 | sing | 1.54Å | 1.66Å | |
C3 | C2 | sing | 1.55Å | 1.37Å | |
C3 | C5 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
O5 | HO5 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C5 | H51 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | H52 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C4 | H41 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | H42 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O1 | C1 | O4 | 116.5° | 109.9° |
O1 | C1 | C2 | 108.1° | 109.9° |
O1 | C1 | H1 | 111.4° | 110.0° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
O4 | C4 | C3 | 100.3° | 103.5° |
C4 | O4 | C1 | 109.5° | 107.0° |
O4 | C4 | H41 | 111.7° | 110.6° |
O4 | C4 | H42 | 111.7° | 110.6° |
C4 | C3 | O3 | 104.7° | 110.9° |
C4 | C3 | C2 | 108.7° | 102.1° |
C4 | C3 | C5 | 108.1° | 110.9° |
C3 | C4 | H41 | 111.7° | 110.6° |
C3 | C4 | H42 | 111.7° | 110.6° |
O3 | C3 | C2 | 115.0° | 110.9° |
O3 | C3 | C5 | 108.6° | 110.9° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
O4 | C1 | C2 | 101.5° | 107.3° |
O4 | C1 | H1 | 111.1° | 109.9° |
C1 | C2 | C3 | 106.0° | 104.2° |
C1 | C2 | O2 | 109.4° | 110.5° |
C2 | C1 | H1 | 107.1° | 110.0° |
C1 | C2 | H2 | 105.5° | 110.5° |
C2 | C3 | C5 | 111.5° | 110.9° |
C3 | C2 | O2 | 118.2° | 110.5° |
C3 | C2 | H2 | 108.9° | 110.5° |
C3 | C5 | O5 | 111.5° | 109.5° |
C3 | C5 | H51 | 109.0° | 109.5° |
C3 | C5 | H52 | 108.9° | 109.5° |
C5 | O5 | HO5 | 109.5° | 114.0° |
O5 | C5 | H51 | 109.0° | 109.5° |
O5 | C5 | H52 | 109.0° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 108.0° | 110.5° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
H51 | C5 | H52 | 109.5° | 109.5° |
H41 | C4 | H42 | 109.5° | 110.7° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O1 | C1 | O4 | C4 | 79.0° | 145.9° |
O1 | C1 | O4 | C2 | 117.2° | 119.4° |
O1 | C1 | O4 | H1 | 129.1° | 121.1° |
O1 | C1 | C2 | H1 | 120.2° | 121.2° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 93.7° | 121.4° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 34.8° | 2.7° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 150.8° | 119.9° |
O4 | C4 | C3 | H41 | 118.5° | 118.5° |
O4 | C4 | C3 | H42 | 118.5° | 118.5° |
O4 | C4 | C3 | O3 | 135.1° | 81.2° |
C4 | O4 | C1 | C2 | 38.2° | 26.5° |
O4 | C4 | C3 | C2 | 11.8° | 37.0° |
O4 | C4 | C3 | C5 | 109.3° | 155.2° |
O4 | C4 | H41 | H42 | 124.3° | 123.0° |
C4 | O4 | C1 | H1 | 151.8° | 92.9° |
C4 | C3 | O3 | C2 | 119.1° | 112.7° |
C4 | C3 | O3 | C5 | 115.2° | 123.6° |
C3 | C4 | O4 | C1 | 33.3° | 40.1° |
C4 | C3 | C2 | C1 | 8.9° | 20.9° |
C4 | C3 | C2 | C5 | 119.0° | 118.1° |
C4 | C3 | C5 | O5 | 56.8° | 67.3° |
C4 | C3 | C2 | O2 | 132.1° | 139.6° |
C4 | C3 | C5 | H51 | 177.1° | 52.7° |
C4 | C3 | C5 | H52 | 63.5° | 172.7° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 67.3° |
C3 | C4 | H41 | H42 | 124.3° | 123.0° |
C4 | C3 | C2 | H2 | 104.3° | 97.8° |
O3 | C3 | C2 | C1 | 108.0° | 97.3° |
O3 | C3 | C2 | C5 | 124.1° | 123.6° |
O3 | C3 | C5 | O5 | 56.2° | 56.3° |
O3 | C3 | C2 | O2 | 15.2° | 21.4° |
O3 | C3 | C5 | H51 | 64.1° | 176.4° |
O3 | C3 | C5 | H52 | 176.5° | 63.6° |
O3 | C3 | C4 | H41 | 106.4° | 37.3° |
O3 | C3 | C4 | H42 | 16.6° | 160.3° |
O3 | C3 | C2 | H2 | 138.9° | 144.0° |
O4 | C1 | C2 | H1 | 116.6° | 119.4° |
O4 | C1 | C2 | C3 | 29.4° | 2.0° |
O4 | C1 | C2 | O2 | 158.0° | 116.7° |
C1 | O4 | C4 | H41 | 151.8° | 158.6° |
C1 | O4 | C4 | H42 | 85.2° | 78.4° |
O4 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 61.5° |
O4 | C1 | C2 | H2 | 86.1° | 120.8° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 123.2° | 118.7° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 113.2° | 118.7° |
C1 | C2 | C3 | C5 | 127.9° | 139.0° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 114.4° | 122.5° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 66.5° | 179.3° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 65.2° |
C2 | C3 | C5 | O5 | 176.2° | 180.0° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 124.2° | 122.6° |
C2 | C3 | C5 | H51 | 63.5° | 59.9° |
C2 | C3 | C5 | H52 | 55.9° | 60.1° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 60.9° | 180.0° |
C2 | C3 | C4 | H41 | 130.3° | 155.5° |
C2 | C3 | C4 | H42 | 106.6° | 81.4° |
C3 | C2 | C1 | H1 | 146.1° | 117.4° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 58.6° | 180.0° |
C3 | C5 | O5 | H51 | 120.3° | 120.1° |
C3 | C5 | O5 | H52 | 120.3° | 120.0° |
C5 | C3 | C2 | O2 | 108.9° | 102.3° |
C3 | C5 | O5 | HO5 | 180.0° | 179.9° |
C3 | C5 | H51 | H52 | 119.1° | 120.0° |
C5 | C3 | O3 | HO3 | 64.8° | 56.3° |
C5 | C3 | C4 | H41 | 9.2° | 86.3° |
C5 | C3 | C4 | H42 | 132.2° | 36.7° |
C5 | C3 | C2 | H2 | 14.8° | 20.3° |
O5 | C5 | H51 | H52 | 119.1° | 120.0° |
O2 | C2 | C1 | H1 | 85.4° | 123.9° |
HO5 | O5 | C5 | H51 | 59.7° | 60.0° |
HO5 | O5 | C5 | H52 | 59.7° | 60.0° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 51.0° | 59.5° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 30.6° | 1.3° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 65.6° | 57.4° |