VXX
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | CO1 | sing | 1.39Å | 1.40Å | Aromatic |
C1 | CO2 | doub | 1.39Å | 1.39Å | Aromatic |
C1 | CC | sing | 1.45Å | 1.46Å | |
CO1 | CM1 | doub | 1.39Å | 1.40Å | Aromatic |
CO1 | HO1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CO2 | CM2 | sing | 1.39Å | 1.39Å | Aromatic |
CO2 | HO2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CM1 | CZ | sing | 1.39Å | 1.39Å | Aromatic |
CM1 | HM1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CM2 | OM | sing | 1.36Å | 1.36Å | |
CM2 | CZ | doub | 1.40Å | 1.45Å | Aromatic |
OM | CV | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
CZ | O3 | sing | 1.36Å | 1.37Å | |
CC | O1 | doub | 1.24Å | 1.21Å | |
CC | O2 | sing | 1.37Å | 1.42Å | |
CV | HVC1 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CV | HVC2 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CV | HVC3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
O2 | C9 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
O3 | H3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C9 | H9C1 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C9 | H9C2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C9 | H9C3 | sing | 1.09Å | 1.11Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
CO1 | C1 | CO2 | 121.0° | 120.0° |
CO1 | C1 | CC | 119.0° | 120.0° |
C1 | CO1 | CM1 | 120.5° | 120.0° |
C1 | CO1 | HO1 | 119.8° | 120.6° |
CO2 | C1 | CC | 120.0° | 120.0° |
C1 | CO2 | CM2 | 118.9° | 120.0° |
C1 | CO2 | HO2 | 120.5° | 120.2° |
C1 | CC | O1 | 123.4° | 124.5° |
C1 | CC | O2 | 114.1° | 111.6° |
CM1 | CO1 | HO1 | 119.7° | 119.4° |
CO1 | CM1 | CZ | 119.7° | 120.0° |
CO1 | CM1 | HM1 | 120.2° | 119.7° |
CM2 | CO2 | HO2 | 120.5° | 119.7° |
CO2 | CM2 | OM | 123.6° | 119.5° |
CO2 | CM2 | CZ | 120.6° | 120.0° |
CZ | CM1 | HM1 | 120.1° | 120.3° |
CM1 | CZ | CM2 | 119.2° | 120.0° |
CM1 | CZ | O3 | 123.8° | 119.5° |
OM | CM2 | CZ | 115.7° | 120.5° |
CM2 | OM | CV | 120.8° | 117.1° |
CM2 | CZ | O3 | 117.0° | 120.6° |
OM | CV | HVC1 | 120.8° | 109.5° |
OM | CV | HVC2 | 108.1° | 109.5° |
OM | CV | HVC3 | 108.2° | 109.0° |
CZ | O3 | H3 | 123.8° | 110.2° |
O1 | CC | O2 | 122.4° | 123.9° |
CC | O2 | C9 | 118.6° | 116.9° |
HVC1 | CV | HVC2 | 108.2° | 110.1° |
HVC1 | CV | HVC3 | 108.2° | 109.4° |
HVC2 | CV | HVC3 | 101.7° | 109.4° |
O2 | C9 | H9C1 | 118.6° | 109.6° |
O2 | C9 | H9C2 | 108.9° | 109.5° |
O2 | C9 | H9C3 | 108.9° | 109.0° |
H9C1 | C9 | H9C2 | 108.9° | 110.1° |
H9C1 | C9 | H9C3 | 108.9° | 109.3° |
H9C2 | C9 | H9C3 | 101.2° | 109.4° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
CO1 | C1 | CO2 | CC | 179.7° | 180.0° |
C1 | CO1 | CM1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
CO1 | C1 | CO2 | CM2 | 0.8° | 0.0° |
CO1 | C1 | CO2 | HO2 | 179.2° | 180.0° |
C1 | CO1 | CM1 | CZ | 2.2° | 0.0° |
C1 | CO1 | CM1 | HM1 | 177.7° | 180.0° |
CO1 | C1 | CC | O1 | 179.7° | 30.0° |
CO1 | C1 | CC | O2 | 3.3° | 149.9° |
CO2 | C1 | CO1 | CM1 | 2.0° | 0.0° |
CO2 | C1 | CO1 | HO1 | 178.0° | 180.0° |
C1 | CO2 | CM2 | HO2 | 180.0° | 180.0° |
C1 | CO2 | CM2 | OM | 179.9° | 180.0° |
C1 | CO2 | CM2 | CZ | 0.1° | 0.0° |
CO2 | C1 | CC | O1 | 0.6° | 150.0° |
CO2 | C1 | CC | O2 | 176.9° | 30.1° |
CC | C1 | CO1 | CM1 | 178.2° | 180.0° |
CC | C1 | CO1 | HO1 | 1.7° | 0.0° |
CC | C1 | CO2 | CM2 | 179.4° | 180.0° |
CC | C1 | CO2 | HO2 | 0.6° | 0.0° |
C1 | CC | O1 | O2 | 176.1° | 179.9° |
C1 | CC | O2 | C9 | 173.9° | 179.9° |
CO1 | CM1 | CZ | HM1 | 180.0° | 180.0° |
CO1 | CM1 | CZ | CM2 | 1.3° | 0.0° |
CO1 | CM1 | CZ | O3 | 179.2° | 180.0° |
HO1 | CO1 | CM1 | CZ | 177.8° | 180.0° |
HO1 | CO1 | CM1 | HM1 | 2.2° | 0.0° |
CO2 | CM2 | CZ | CM1 | 0.1° | 0.0° |
CO2 | CM2 | OM | CZ | 179.8° | 180.0° |
CO2 | CM2 | OM | CV | 3.3° | 90.0° |
CO2 | CM2 | CZ | O3 | 179.7° | 180.0° |
HO2 | CO2 | CM2 | OM | 0.1° | 0.0° |
HO2 | CO2 | CM2 | CZ | 179.9° | 180.0° |
CM1 | CZ | CM2 | OM | 179.7° | 180.0° |
CM1 | CZ | CM2 | O3 | 179.6° | 180.0° |
CM1 | CZ | O3 | H3 | 180.0° | 36.5° |
HM1 | CM1 | CZ | CM2 | 178.7° | 180.0° |
HM1 | CM1 | CZ | O3 | 0.8° | 0.0° |
OM | CM2 | CZ | O3 | 0.2° | 0.0° |
CM2 | OM | CV | HVC1 | 180.0° | 82.1° |
CM2 | OM | CV | HVC2 | 54.7° | 38.6° |
CM2 | OM | CV | HVC3 | 54.7° | 158.3° |
CZ | CM2 | OM | CV | 176.5° | 90.0° |
CM2 | CZ | O3 | H3 | 0.5° | 143.6° |
OM | CV | HVC1 | HVC2 | 125.2° | 120.4° |
OM | CV | HVC1 | HVC3 | 125.3° | 119.4° |
OM | CV | HVC2 | HVC3 | 113.8° | 119.4° |
O1 | CC | O2 | C9 | 2.5° | 0.0° |
CC | O2 | C9 | H9C1 | 180.0° | 6.6° |
CC | O2 | C9 | H9C2 | 54.7° | 127.4° |
CC | O2 | C9 | H9C3 | 54.7° | 113.0° |
HVC1 | CV | HVC2 | HVC3 | 113.8° | 120.2° |
O2 | C9 | H9C1 | H9C2 | 125.2° | 120.5° |
O2 | C9 | H9C1 | H9C3 | 125.3° | 119.4° |
O2 | C9 | H9C2 | H9C3 | 114.6° | 119.4° |
H9C1 | C9 | H9C2 | H9C3 | 114.6° | 120.1° |