TRQ
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
N | CA | sing | 1.47Å | 1.46Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
CA | C | sing | 1.51Å | 1.54Å | |
CA | CB | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C | O | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 1.34Å | |
OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
CB | CG | sing | 1.51Å | 1.51Å | |
CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CG | CD1 | doub | 1.36Å | 1.36Å | Aromatic |
CG | CD2 | sing | 1.41Å | 1.44Å | Aromatic |
CD1 | NE1 | sing | 1.35Å | 1.37Å | Aromatic |
CD1 | HD1 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
NE1 | CE2 | sing | 1.37Å | 1.37Å | Aromatic |
NE1 | HE1 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
CE2 | CZ2 | sing | 1.46Å | 1.40Å | |
CE2 | CD2 | doub | 1.39Å | 1.42Å | Aromatic |
CZ2 | CH2 | sing | 1.50Å | 1.37Å | |
CZ2 | O7 | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
CH2 | CZ3 | sing | 1.42Å | 1.41Å | |
CH2 | O6 | doub | 1.21Å | 1.24Å | |
CZ3 | CE3 | doub | 1.35Å | 1.40Å | |
CZ3 | HZ3 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
CE3 | CD2 | sing | 1.47Å | 1.40Å | |
CE3 | HE3 | sing | 1.08Å | 1.10Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
CA | N | H | 106.6° | 106.7° |
CA | N | H2 | 113.3° | 106.7° |
N | CA | C | 106.6° | 109.5° |
N | CA | CB | 110.2° | 109.5° |
N | CA | HA | 111.2° | 109.4° |
H | N | H2 | 113.2° | 106.7° |
C | CA | CB | 110.4° | 109.5° |
C | CA | HA | 111.0° | 109.5° |
CA | C | O | 120.9° | 120.1° |
CA | C | OXT | 117.3° | 120.0° |
CB | CA | HA | 107.5° | 109.4° |
CA | CB | CG | 113.9° | 109.5° |
CA | CB | HB2 | 110.6° | 109.4° |
CA | CB | HB3 | 110.6° | 109.5° |
O | C | OXT | 121.8° | 120.0° |
C | OXT | HXT | 117.3° | 120.0° |
CG | CB | HB2 | 110.6° | 109.5° |
CG | CB | HB3 | 110.6° | 109.5° |
CB | CG | CD1 | 126.9° | 126.2° |
CB | CG | CD2 | 126.9° | 126.2° |
HB2 | CB | HB3 | 99.8° | 109.4° |
CD1 | CG | CD2 | 106.2° | 107.5° |
CG | CD1 | NE1 | 110.3° | 109.3° |
CG | CD1 | HD1 | 124.6° | 125.3° |
CG | CD2 | CE2 | 107.2° | 106.5° |
CG | CD2 | CE3 | 134.0° | 133.0° |
NE1 | CD1 | HD1 | 125.1° | 125.3° |
CD1 | NE1 | CE2 | 109.0° | 109.1° |
CD1 | NE1 | HE1 | 125.6° | 125.4° |
CE2 | NE1 | HE1 | 125.4° | 125.5° |
NE1 | CE2 | CZ2 | 130.1° | 133.3° |
NE1 | CE2 | CD2 | 107.3° | 107.6° |
CZ2 | CE2 | CD2 | 122.6° | 119.1° |
CE2 | CZ2 | CH2 | 117.4° | 118.2° |
CE2 | CZ2 | O7 | 119.8° | 120.9° |
CE2 | CD2 | CE3 | 118.9° | 120.5° |
CH2 | CZ2 | O7 | 122.8° | 120.9° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | 121.5° | 119.2° |
CZ2 | CH2 | O6 | 119.8° | 120.4° |
CZ3 | CH2 | O6 | 118.7° | 120.3° |
CH2 | CZ3 | CE3 | 121.0° | 121.2° |
CH2 | CZ3 | HZ3 | 119.7° | 119.4° |
CE3 | CZ3 | HZ3 | 119.3° | 119.4° |
CZ3 | CE3 | CD2 | 118.6° | 121.7° |
CZ3 | CE3 | HE3 | 120.6° | 119.1° |
CD2 | CE3 | HE3 | 120.7° | 119.1° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
CA | N | H | H2 | 125.3° | 113.8° |
N | CA | C | CB | 119.7° | 120.0° |
N | CA | C | HA | 121.2° | 120.0° |
N | CA | CB | HA | 121.3° | 119.9° |
N | CA | C | O | 111.7° | 30.0° |
N | CA | C | OXT | 68.7° | 150.0° |
N | CA | CB | CG | 60.7° | 60.0° |
N | CA | CB | HB2 | 64.5° | 60.1° |
N | CA | CB | HB3 | 174.0° | 180.0° |
H | N | CA | C | 180.0° | 173.8° |
H | N | CA | CB | 60.2° | 53.8° |
H | N | CA | HA | 58.9° | 66.2° |
H2 | N | CA | C | 54.7° | 60.0° |
H2 | N | CA | CB | 65.1° | 60.1° |
H2 | N | CA | HA | 175.8° | 180.0° |
C | CA | CB | HA | 121.2° | 120.0° |
CA | C | O | OXT | 179.6° | 180.0° |
CA | C | OXT | HXT | 180.0° | 179.9° |
C | CA | CB | CG | 178.2° | 180.0° |
C | CA | CB | HB2 | 53.0° | 60.0° |
C | CA | CB | HB3 | 56.5° | 60.0° |
CB | CA | C | O | 8.0° | 90.0° |
CB | CA | C | OXT | 171.6° | 89.9° |
CA | CB | CG | HB2 | 125.2° | 120.0° |
CA | CB | CG | HB3 | 125.3° | 120.1° |
CA | CB | HB2 | HB3 | 116.5° | 120.0° |
CA | CB | CG | CD1 | 72.1° | 90.0° |
CA | CB | CG | CD2 | 109.0° | 90.3° |
HA | CA | C | O | 127.0° | 150.0° |
HA | CA | C | OXT | 52.5° | 30.1° |
HA | CA | CB | CG | 60.6° | 60.0° |
HA | CA | CB | HB2 | 174.2° | 180.0° |
HA | CA | CB | HB3 | 64.7° | 60.1° |
O | C | OXT | HXT | 0.4° | 0.1° |
CG | CB | HB2 | HB3 | 116.4° | 120.0° |
CB | CG | CD1 | CD2 | 179.2° | 179.8° |
CB | CG | CD1 | NE1 | 178.9° | 180.0° |
CB | CG | CD1 | HD1 | 1.1° | 0.1° |
CB | CG | CD2 | CE2 | 178.9° | 179.8° |
CB | CG | CD2 | CE3 | 0.9° | 0.8° |
HB2 | CB | CG | CD1 | 162.7° | 30.0° |
HB2 | CB | CG | CD2 | 16.3° | 149.7° |
HB3 | CB | CG | CD1 | 53.2° | 150.0° |
HB3 | CB | CG | CD2 | 125.8° | 29.8° |
CG | CD1 | NE1 | HD1 | 179.9° | 179.9° |
CG | CD1 | NE1 | CE2 | 0.1° | 0.0° |
CG | CD1 | NE1 | HE1 | 180.0° | 180.0° |
CD1 | CG | CD2 | CE2 | 0.3° | 0.4° |
CD1 | CG | CD2 | CE3 | 180.0° | 179.4° |
CD2 | CG | CD1 | NE1 | 0.2° | 0.2° |
CD2 | CG | CD1 | HD1 | 179.7° | 179.7° |
CG | CD2 | CE2 | NE1 | 0.3° | 0.4° |
CG | CD2 | CE2 | CZ2 | 179.6° | 179.8° |
CG | CD2 | CE2 | CE3 | 179.8° | 179.2° |
CG | CD2 | CE3 | CZ3 | 179.3° | 179.6° |
CG | CD2 | CE3 | HE3 | 0.7° | 0.8° |
CD1 | NE1 | CE2 | HE1 | 180.0° | 180.0° |
CD1 | NE1 | CE2 | CZ2 | 179.7° | 180.0° |
CD1 | NE1 | CE2 | CD2 | 0.1° | 0.3° |
HD1 | CD1 | NE1 | CE2 | 179.9° | 180.0° |
HD1 | CD1 | NE1 | HE1 | 0.1° | 0.0° |
NE1 | CE2 | CZ2 | CD2 | 179.8° | 179.7° |
NE1 | CE2 | CZ2 | CH2 | 179.4° | 180.0° |
NE1 | CE2 | CZ2 | O7 | 1.1° | 0.1° |
NE1 | CE2 | CD2 | CE3 | 179.9° | 179.6° |
HE1 | NE1 | CE2 | CZ2 | 0.4° | 0.1° |
HE1 | NE1 | CE2 | CD2 | 179.8° | 179.7° |
CE2 | CZ2 | CH2 | O7 | 179.4° | 179.9° |
CE2 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 0.8° | 0.1° |
CE2 | CZ2 | CH2 | O6 | 177.1° | 180.0° |
CZ2 | CE2 | CD2 | CE3 | 0.2° | 0.6° |
CD2 | CE2 | CZ2 | CH2 | 0.3° | 0.3° |
CD2 | CE2 | CZ2 | O7 | 179.1° | 179.7° |
CE2 | CD2 | CE3 | CZ3 | 0.4° | 0.7° |
CE2 | CD2 | CE3 | HE3 | 179.6° | 179.7° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | O6 | 177.9° | 180.0° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | CE3 | 0.6° | 0.0° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | HZ3 | 179.4° | 179.9° |
O7 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 178.6° | 180.0° |
O7 | CZ2 | CH2 | O6 | 3.5° | 0.1° |
CH2 | CZ3 | CE3 | HZ3 | 180.0° | 180.0° |
CH2 | CZ3 | CE3 | CD2 | 0.0° | 0.4° |
CH2 | CZ3 | CE3 | HE3 | 180.0° | 180.0° |
O6 | CH2 | CZ3 | CE3 | 177.3° | 180.0° |
O6 | CH2 | CZ3 | HZ3 | 2.8° | 0.0° |
CZ3 | CE3 | CD2 | HE3 | 180.0° | 179.6° |
HZ3 | CZ3 | CE3 | CD2 | 180.0° | 179.7° |
HZ3 | CZ3 | CE3 | HE3 | 0.0° | 0.1° |