TQQ
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| N | CA | sing | 1.44Å | 1.44Å | |
| N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| CA | C | sing | 1.52Å | 1.54Å | |
| CA | CB | sing | 1.55Å | 1.54Å | |
| CA | HA | sing | 1.10Å | 1.10Å | |
| C | O | doub | 1.23Å | 1.23Å | |
| C | OXT | sing | 1.35Å | 5.41Å | |
| OXT | HXT | sing | 0.98Å | 0.00Å | |
| CB | CG | sing | 1.48Å | 1.50Å | |
| CB | HB2 | sing | 1.11Å | 1.10Å | |
| CB | HB3 | sing | 1.11Å | 1.10Å | |
| CG | CD1 | doub | 1.38Å | 1.36Å | Aromatic |
| CG | CD2 | sing | 1.41Å | 1.47Å | Aromatic |
| CD1 | NE1 | sing | 1.37Å | 1.36Å | Aromatic |
| CD1 | HD1 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
| CD2 | CE2 | doub | 1.38Å | 1.40Å | Aromatic |
| CD2 | CE3 | sing | 1.42Å | 1.40Å | |
| NE1 | CE2 | sing | 1.37Å | 1.36Å | Aromatic |
| NE1 | HE1 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| CE2 | CZ2 | sing | 1.44Å | 1.37Å | |
| CE3 | CZ3 | doub | 1.34Å | 1.38Å | |
| CE3 | HE3 | sing | 1.09Å | 1.08Å | |
| CZ2 | CH2 | sing | 1.52Å | 1.31Å | |
| CZ2 | O2 | doub | 1.22Å | 1.37Å | |
| CZ3 | CH2 | sing | 1.49Å | 1.41Å | |
| CZ3 | HZ3 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
| CH2 | N2 | doub | 1.29Å | 1.45Å | |
| N2 | HN2 | sing | 1.02Å | 1.00Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| CA | N | H | 109.5° | 119.0° |
| CA | N | H2 | 109.5° | 119.0° |
| N | CA | C | 109.6° | 111.1° |
| N | CA | CB | 109.1° | 110.7° |
| N | CA | HA | 111.8° | 106.2° |
| H | N | H2 | 109.5° | 120.6° |
| C | CA | CB | 115.0° | 111.1° |
| C | CA | HA | 105.4° | 106.9° |
| CA | C | O | 120.8° | 123.0° |
| CA | C | OXT | 17.0° | 114.8° |
| CB | CA | HA | 105.9° | 110.6° |
| CA | CB | CG | 117.6° | 114.1° |
| CA | CB | HB2 | 105.0° | 108.8° |
| CA | CB | HB3 | 106.9° | 108.5° |
| O | C | OXT | 104.0° | 122.2° |
| C | OXT | HXT | 90.0° | 114.9° |
| CG | CB | HB2 | 105.0° | 109.7° |
| CG | CB | HB3 | 106.9° | 111.4° |
| CB | CG | CD1 | 123.5° | 125.9° |
| CB | CG | CD2 | 131.0° | 127.5° |
| HB2 | CB | HB3 | 116.0° | 103.7° |
| CD1 | CG | CD2 | 105.4° | 106.5° |
| CG | CD1 | NE1 | 111.2° | 108.3° |
| CG | CD1 | HD1 | 124.4° | 131.6° |
| CG | CD2 | CE2 | 106.0° | 108.6° |
| CG | CD2 | CE3 | 136.0° | 131.2° |
| NE1 | CD1 | HD1 | 124.4° | 120.2° |
| CD1 | NE1 | CE2 | 108.8° | 109.4° |
| CD1 | NE1 | HE1 | 125.6° | 125.2° |
| CE2 | CD2 | CE3 | 118.0° | 120.3° |
| CD2 | CE2 | NE1 | 108.5° | 107.2° |
| CD2 | CE2 | CZ2 | 123.6° | 124.8° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | 117.5° | 121.8° |
| CD2 | CE3 | HE3 | 121.3° | 119.1° |
| CE2 | NE1 | HE1 | 125.6° | 125.4° |
| NE1 | CE2 | CZ2 | 127.9° | 128.0° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | 117.8° | 113.7° |
| CE2 | CZ2 | O2 | 117.6° | 126.7° |
| CZ3 | CE3 | HE3 | 121.2° | 119.1° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | 120.8° | 120.2° |
| CE3 | CZ3 | HZ3 | 119.6° | 121.4° |
| CH2 | CZ2 | O2 | 124.7° | 119.6° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | 122.3° | 119.1° |
| CZ2 | CH2 | N2 | 113.5° | 117.0° |
| CH2 | CZ3 | HZ3 | 119.6° | 118.3° |
| CZ3 | CH2 | N2 | 124.2° | 123.9° |
| CH2 | N2 | HN2 | 110.4° | 109.2° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| CA | N | H | H2 | 120.1° | 166.5° |
| N | CA | C | CB | 123.3° | 123.7° |
| N | CA | C | HA | 120.4° | 115.4° |
| N | CA | CB | HA | 120.5° | 117.4° |
| N | CA | C | O | 11.7° | 34.6° |
| N | CA | C | OXT | 1.3° | 145.1° |
| N | CA | CB | CG | 62.6° | 177.4° |
| N | CA | CB | HB2 | 53.6° | 54.5° |
| N | CA | CB | HB3 | 177.4° | 57.7° |
| H | N | CA | C | 36.3° | 36.5° |
| H | N | CA | CB | 90.5° | 160.5° |
| H | N | CA | HA | 152.7° | 79.4° |
| H2 | N | CA | C | 83.8° | 156.8° |
| H2 | N | CA | CB | 149.5° | 32.8° |
| H2 | N | CA | HA | 32.7° | 87.3° |
| C | CA | CB | HA | 116.0° | 118.6° |
| CA | C | O | OXT | 3.1° | 179.7° |
| CA | C | OXT | HXT | 90.0° | 179.7° |
| C | CA | CB | CG | 60.9° | 58.6° |
| C | CA | CB | HB2 | 177.2° | 178.5° |
| C | CA | CB | HB3 | 59.1° | 66.3° |
| CB | CA | C | O | 111.6° | 89.1° |
| CB | CA | C | OXT | 122.0° | 91.2° |
| CA | CB | CG | HB2 | 116.2° | 122.4° |
| CA | CB | CG | HB3 | 120.0° | 123.3° |
| CA | CB | HB2 | HB3 | 117.7° | 115.3° |
| CA | CB | CG | CD1 | 90.8° | 89.9° |
| CA | CB | CG | CD2 | 93.3° | 90.0° |
| HA | CA | C | O | 132.2° | 150.1° |
| HA | CA | C | OXT | 121.7° | 29.7° |
| HA | CA | CB | CG | 176.9° | 60.0° |
| HA | CA | CB | HB2 | 66.9° | 62.9° |
| HA | CA | CB | HB3 | 56.9° | 175.1° |
| O | C | OXT | HXT | 90.0° | 0.0° |
| CG | CB | HB2 | HB3 | 117.7° | 119.1° |
| CB | CG | CD1 | CD2 | 176.8° | 179.9° |
| CB | CG | CD1 | NE1 | 177.1° | 179.9° |
| CB | CG | CD1 | HD1 | 2.9° | 0.2° |
| CB | CG | CD2 | CE2 | 177.0° | 179.9° |
| CB | CG | CD2 | CE3 | 3.0° | 0.1° |
| HB2 | CB | CG | CD1 | 153.0° | 147.7° |
| HB2 | CB | CG | CD2 | 22.9° | 32.4° |
| HB3 | CB | CG | CD1 | 29.3° | 33.4° |
| HB3 | CB | CG | CD2 | 146.7° | 146.7° |
| CG | CD1 | NE1 | HD1 | 180.0° | 179.9° |
| CD1 | CG | CD2 | CE2 | 0.5° | 0.1° |
| CD1 | CG | CD2 | CE3 | 179.4° | 180.0° |
| CG | CD1 | NE1 | CE2 | 0.0° | 0.0° |
| CG | CD1 | NE1 | HE1 | 180.0° | 180.0° |
| CD2 | CG | CD1 | NE1 | 0.3° | 0.1° |
| CD2 | CG | CD1 | HD1 | 179.7° | 179.9° |
| CG | CD2 | CE2 | CE3 | 179.9° | 180.0° |
| CG | CD2 | CE2 | NE1 | 0.5° | 0.0° |
| CG | CD2 | CE2 | CZ2 | 179.0° | 180.0° |
| CG | CD2 | CE3 | CZ3 | 179.8° | 180.0° |
| CG | CD2 | CE3 | HE3 | 0.2° | 0.0° |
| CD1 | NE1 | CE2 | CD2 | 0.3° | 0.0° |
| CD1 | NE1 | CE2 | HE1 | 180.0° | 180.0° |
| CD1 | NE1 | CE2 | CZ2 | 178.7° | 179.9° |
| HD1 | CD1 | NE1 | CE2 | 180.0° | 179.9° |
| HD1 | CD1 | NE1 | HE1 | 0.0° | 0.1° |
| CD2 | CE2 | NE1 | CZ2 | 178.4° | 179.9° |
| CD2 | CE2 | NE1 | HE1 | 179.6° | 180.0° |
| CE2 | CD2 | CE3 | CZ3 | 0.1° | 0.0° |
| CE2 | CD2 | CE3 | HE3 | 179.9° | 180.0° |
| CD2 | CE2 | CZ2 | CH2 | 0.8° | 0.0° |
| CD2 | CE2 | CZ2 | O2 | 178.5° | 180.0° |
| CE3 | CD2 | CE2 | NE1 | 179.4° | 180.0° |
| CE3 | CD2 | CE2 | CZ2 | 1.0° | 0.1° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | HE3 | 180.0° | 180.0° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | CH2 | 0.8° | 0.0° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | HZ3 | 179.2° | 180.0° |
| NE1 | CE2 | CZ2 | CH2 | 179.0° | 179.9° |
| NE1 | CE2 | CZ2 | O2 | 0.3° | 0.1° |
| HE1 | NE1 | CE2 | CZ2 | 1.3° | 0.0° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | O2 | 179.2° | 180.0° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 0.2° | 0.0° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | N2 | 179.4° | 180.0° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | CZ2 | 1.0° | 0.1° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | HZ3 | 180.0° | 180.0° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | N2 | 178.6° | 180.0° |
| HE3 | CE3 | CZ3 | CH2 | 179.2° | 179.9° |
| HE3 | CE3 | CZ3 | HZ3 | 0.8° | 0.0° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | N2 | 179.6° | 179.9° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | HZ3 | 179.0° | 180.0° |
| CZ2 | CH2 | N2 | HN2 | 0.1° | 0.1° |
| O2 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 179.4° | 179.9° |
| O2 | CZ2 | CH2 | N2 | 0.2° | 0.0° |
| CZ3 | CH2 | N2 | HN2 | 179.8° | 180.0° |
| HZ3 | CZ3 | CH2 | N2 | 1.4° | 0.1° |
