TOX
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| O | C | doub | 1.21Å | 1.26Å | |
| CH2 | CZ3 | doub | 1.39Å | 1.42Å | Aromatic |
| CH2 | CZ2 | sing | 1.38Å | 1.35Å | Aromatic |
| CZ3 | CE3 | sing | 1.37Å | 1.32Å | Aromatic |
| C | CA | sing | 1.51Å | 1.57Å | |
| CZ2 | CE2 | doub | 1.39Å | 1.34Å | Aromatic |
| CE3 | CD2 | doub | 1.40Å | 1.41Å | Aromatic |
| CE2 | CD2 | sing | 1.41Å | 1.41Å | Aromatic |
| CE2 | NE1 | sing | 1.38Å | 1.37Å | Aromatic |
| CD2 | CG | sing | 1.47Å | 1.40Å | Aromatic |
| O2 | O1 | sing | 1.47Å | 1.49Å | |
| CA | N | sing | 1.47Å | 1.47Å | |
| CA | CB | sing | 1.53Å | 1.57Å | |
| NE1 | CD1 | sing | 1.37Å | 1.38Å | Aromatic |
| CG | CD1 | doub | 1.34Å | 1.37Å | Aromatic |
| CG | CB | sing | 1.51Å | 1.50Å | |
| NE1 | O1 | sing | 1.42Å | 2.36Å | |
| N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| CB | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| CB | H6 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| CD1 | H7 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
| CE3 | H8 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
| CZ3 | H9 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
| CH2 | H10 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
| CZ2 | H11 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
| O2 | H13 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| C | OXT | sing | 1.34Å | 44.11Å | |
| OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.00Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| O | C | CA | 120.3° | 120.0° |
| O | C | OXT | 29.1° | 120.0° |
| CZ3 | CH2 | CZ2 | 123.1° | 120.6° |
| CH2 | CZ3 | CE3 | 120.2° | 120.6° |
| CH2 | CZ3 | H9 | 119.9° | 119.7° |
| CZ3 | CH2 | H10 | 118.5° | 119.7° |
| CH2 | CZ2 | CE2 | 116.6° | 119.8° |
| CZ2 | CH2 | H10 | 118.4° | 119.7° |
| CH2 | CZ2 | H11 | 121.7° | 120.1° |
| CZ3 | CE3 | CD2 | 118.4° | 119.7° |
| CZ3 | CE3 | H8 | 120.8° | 120.1° |
| CE3 | CZ3 | H9 | 119.9° | 119.7° |
| C | CA | N | 110.9° | 109.5° |
| C | CA | CB | 114.6° | 109.4° |
| C | CA | HA | 106.2° | 109.5° |
| CA | C | OXT | 91.3° | 120.0° |
| CZ2 | CE2 | CD2 | 122.2° | 119.3° |
| CZ2 | CE2 | NE1 | 129.6° | 133.5° |
| CE2 | CZ2 | H11 | 121.7° | 120.2° |
| CE3 | CD2 | CE2 | 119.4° | 120.0° |
| CE3 | CD2 | CG | 133.1° | 134.0° |
| CD2 | CE3 | H8 | 120.8° | 120.1° |
| CD2 | CE2 | NE1 | 108.2° | 107.2° |
| CE2 | CD2 | CG | 107.3° | 106.0° |
| CE2 | NE1 | CD1 | 107.4° | 109.9° |
| CE2 | NE1 | O1 | 145.8° | 125.1° |
| CD2 | CG | CD1 | 106.8° | 107.1° |
| CD2 | CG | CB | 125.3° | 126.5° |
| O2 | O1 | NE1 | 129.2° | 114.0° |
| O1 | O2 | H13 | 109.5° | 114.0° |
| N | CA | CB | 111.2° | 109.4° |
| CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
| CA | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
| N | CA | HA | 107.3° | 109.4° |
| CA | CB | CG | 114.3° | 109.5° |
| CB | CA | HA | 106.1° | 109.4° |
| CA | CB | H5 | 108.3° | 109.5° |
| CA | CB | H6 | 108.2° | 109.5° |
| NE1 | CD1 | CG | 110.2° | 109.9° |
| CD1 | NE1 | O1 | 104.8° | 125.1° |
| NE1 | CD1 | H7 | 124.9° | 125.0° |
| CD1 | CG | CB | 127.9° | 126.5° |
| CG | CD1 | H7 | 124.9° | 125.1° |
| CG | CB | H5 | 108.2° | 109.5° |
| CG | CB | H6 | 108.3° | 109.5° |
| H | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
| H5 | CB | H6 | 109.5° | 109.5° |
| C | OXT | HXT | 90.0° | 117.0° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| O | C | CA | OXT | 2.2° | 179.9° |
| O | C | CA | N | 133.6° | 19.9° |
| O | C | CA | CB | 99.5° | 100.0° |
| O | C | CA | HA | 17.4° | 140.0° |
| O | C | OXT | HXT | 90.0° | 0.1° |
| CZ3 | CH2 | CZ2 | H10 | 180.0° | 179.5° |
| CH2 | CZ3 | CE3 | H9 | 180.0° | 179.9° |
| CZ3 | CH2 | CZ2 | CE2 | 0.4° | 0.9° |
| CH2 | CZ3 | CE3 | CD2 | 3.3° | 0.0° |
| CH2 | CZ3 | CE3 | H8 | 176.7° | 180.0° |
| CZ3 | CH2 | CZ2 | H11 | 179.6° | 180.0° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | CE3 | 2.4° | 0.5° |
| CH2 | CZ2 | CE2 | H11 | 180.0° | 179.1° |
| CH2 | CZ2 | CE2 | CD2 | 0.6° | 0.9° |
| CH2 | CZ2 | CE2 | NE1 | 179.4° | 179.7° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | H9 | 177.6° | 179.5° |
| CZ3 | CE3 | CD2 | H8 | 180.0° | 179.9° |
| CZ3 | CE3 | CD2 | CE2 | 2.3° | 0.0° |
| CZ3 | CE3 | CD2 | CG | 178.4° | 179.5° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | H10 | 177.6° | 180.0° |
| C | CA | N | CB | 128.8° | 120.0° |
| C | CA | N | HA | 115.5° | 120.1° |
| C | CA | CB | HA | 116.9° | 120.0° |
| C | CA | CB | CG | 13.7° | 175.0° |
| C | CA | N | H | 180.0° | 63.9° |
| C | CA | N | H2 | 60.0° | 59.9° |
| C | CA | CB | H5 | 134.4° | 65.0° |
| C | CA | CB | H6 | 107.0° | 55.0° |
| CA | C | OXT | HXT | 90.0° | 180.0° |
| CZ2 | CE2 | CD2 | CE3 | 0.4° | 0.5° |
| CZ2 | CE2 | CD2 | NE1 | 179.0° | 179.5° |
| CZ2 | CE2 | CD2 | CG | 177.4° | 180.0° |
| CZ2 | CE2 | NE1 | CD1 | 178.1° | 179.7° |
| CZ2 | CE2 | NE1 | O1 | 18.7° | 0.4° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | H10 | 179.6° | 179.6° |
| CE3 | CD2 | CE2 | CG | 177.0° | 179.6° |
| CE3 | CD2 | CE2 | NE1 | 178.6° | 180.0° |
| CE3 | CD2 | CG | CD1 | 178.3° | 179.9° |
| CE3 | CD2 | CG | CB | 2.1° | 0.4° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | H9 | 176.8° | 179.9° |
| CD2 | CE2 | NE1 | CD1 | 0.8° | 0.3° |
| CE2 | CD2 | CG | CD1 | 1.8° | 0.4° |
| CE2 | CD2 | CG | CB | 178.6° | 179.9° |
| CD2 | CE2 | NE1 | O1 | 160.2° | 179.8° |
| CE2 | CD2 | CE3 | H8 | 177.7° | 180.0° |
| CD2 | CE2 | CZ2 | H11 | 179.4° | 180.0° |
| NE1 | CE2 | CD2 | CG | 1.6° | 0.4° |
| CE2 | NE1 | O1 | O2 | 23.6° | 90.1° |
| CE2 | NE1 | CD1 | O1 | 168.2° | 179.9° |
| CE2 | NE1 | CD1 | CG | 0.4° | 0.1° |
| CE2 | NE1 | CD1 | H7 | 179.6° | 180.0° |
| NE1 | CE2 | CZ2 | H11 | 0.6° | 0.7° |
| CD2 | CG | CB | CA | 64.1° | 84.7° |
| CD2 | CG | CD1 | NE1 | 1.4° | 0.2° |
| CD2 | CG | CD1 | CB | 179.6° | 179.7° |
| CD2 | CG | CB | H5 | 56.7° | 35.3° |
| CD2 | CG | CB | H6 | 175.2° | 155.3° |
| CD2 | CG | CD1 | H7 | 178.6° | 179.8° |
| CG | CD2 | CE3 | H8 | 1.6° | 0.6° |
| O2 | O1 | NE1 | CD1 | 136.1° | 90.0° |
| N | CA | CB | HA | 116.4° | 119.9° |
| N | CA | CB | CG | 140.4° | 65.0° |
| CA | N | H | H2 | 120.0° | 123.9° |
| N | CA | CB | H5 | 98.9° | 55.0° |
| N | CA | CB | H6 | 19.7° | 175.0° |
| N | CA | C | OXT | 135.8° | 160.0° |
| CA | CB | CG | CD1 | 116.4° | 95.0° |
| CA | CB | CG | H5 | 120.7° | 120.0° |
| CA | CB | CG | H6 | 120.7° | 120.0° |
| CB | CA | N | H | 51.2° | 176.1° |
| CB | CA | N | H2 | 171.2° | 60.0° |
| CA | CB | H5 | H6 | 117.8° | 120.0° |
| CB | CA | C | OXT | 97.3° | 80.1° |
| NE1 | CD1 | CG | H7 | 180.0° | 180.0° |
| NE1 | CD1 | CG | CB | 179.0° | 179.9° |
| CG | CD1 | NE1 | O1 | 167.8° | 180.0° |
| CD1 | CG | CB | H5 | 122.8° | 145.0° |
| CD1 | CG | CB | H6 | 4.3° | 25.0° |
| CG | CB | CA | HA | 103.2° | 55.0° |
| CG | CB | H5 | H6 | 117.8° | 120.0° |
| CB | CG | CD1 | H7 | 1.0° | 0.0° |
| O1 | NE1 | CD1 | H7 | 12.2° | 0.1° |
| NE1 | O1 | O2 | H13 | 180.0° | 180.0° |
| H | N | CA | HA | 64.4° | 56.2° |
| H2 | N | CA | HA | 55.6° | 180.0° |
| HA | CA | CB | H5 | 17.5° | 174.9° |
| HA | CA | CB | H6 | 136.1° | 65.0° |
| HA | CA | C | OXT | 19.5° | 39.9° |
| H8 | CE3 | CZ3 | H9 | 3.2° | 0.0° |
| H9 | CZ3 | CH2 | H10 | 2.4° | 0.0° |
| H10 | CH2 | CZ2 | H11 | 0.4° | 0.5° |
