T09
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| C67 | C05 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
| C | CA | sing | 1.51Å | 1.55Å | |
| C | O | doub | 1.21Å | 1.19Å | |
| C06 | CA | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
| C06 | C05 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
| CA | N | sing | 1.47Å | 1.45Å | |
| C05 | C04 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
| C04 | C03 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
| C03 | C02 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
| C02 | C01 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
| C | OXT | sing | 1.34Å | 1.51Å | |
| C01 | H011 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C01 | H012 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C01 | H013 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C02 | H021 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C02 | H022 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C03 | H031 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C03 | H032 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C04 | H042 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C04 | H041 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C05 | H051 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C06 | H062 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C06 | H061 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C67 | H672 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C67 | H671 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C67 | H673 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| C67 | C05 | C06 | 109.9° | 109.5° |
| C67 | C05 | C04 | 109.4° | 109.5° |
| C67 | C05 | H051 | 109.4° | 109.5° |
| C05 | C67 | H672 | 109.5° | 109.5° |
| C05 | C67 | H671 | 109.5° | 109.4° |
| C05 | C67 | H673 | 109.5° | 109.5° |
| CA | C | O | 118.1° | 120.0° |
| C | CA | C06 | 110.5° | 109.5° |
| C | CA | N | 106.2° | 109.5° |
| CA | C | OXT | 123.4° | 120.0° |
| C | CA | HA | 109.6° | 109.5° |
| O | C | OXT | 118.4° | 120.0° |
| CA | C06 | C05 | 110.7° | 109.5° |
| C06 | CA | N | 109.8° | 109.4° |
| CA | C06 | H062 | 109.2° | 109.5° |
| CA | C06 | H061 | 109.2° | 109.5° |
| C06 | CA | HA | 109.6° | 109.5° |
| C06 | C05 | C04 | 110.1° | 109.5° |
| C06 | C05 | H051 | 108.9° | 109.5° |
| C05 | C06 | H062 | 109.2° | 109.4° |
| C05 | C06 | H061 | 109.1° | 109.5° |
| N | CA | HA | 111.0° | 109.5° |
| CA | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
| CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
| C05 | C04 | C03 | 109.0° | 109.5° |
| C05 | C04 | H042 | 109.6° | 109.5° |
| C05 | C04 | H041 | 109.6° | 109.5° |
| C04 | C05 | H051 | 109.1° | 109.4° |
| C04 | C03 | C02 | 111.3° | 109.5° |
| C04 | C03 | H031 | 109.0° | 109.4° |
| C04 | C03 | H032 | 109.0° | 109.4° |
| C03 | C04 | H042 | 109.6° | 109.5° |
| C03 | C04 | H041 | 109.6° | 109.4° |
| C03 | C02 | C01 | 108.8° | 109.4° |
| C03 | C02 | H021 | 109.7° | 109.5° |
| C03 | C02 | H022 | 109.6° | 109.4° |
| C02 | C03 | H031 | 109.0° | 109.5° |
| C02 | C03 | H032 | 109.0° | 109.5° |
| C02 | C01 | H011 | 109.5° | 109.5° |
| C02 | C01 | H012 | 109.5° | 109.5° |
| C02 | C01 | H013 | 109.4° | 109.5° |
| C01 | C02 | H021 | 109.6° | 109.5° |
| C01 | C02 | H022 | 109.7° | 109.5° |
| C | OXT | HXT | 109.5° | 117.0° |
| H011 | C01 | H012 | 109.5° | 109.4° |
| H011 | C01 | H013 | 109.5° | 109.5° |
| H012 | C01 | H013 | 109.5° | 109.5° |
| H021 | C02 | H022 | 109.5° | 109.5° |
| H031 | C03 | H032 | 109.4° | 109.5° |
| H042 | C04 | H041 | 109.5° | 109.4° |
| H062 | C06 | H061 | 109.5° | 109.5° |
| H672 | C67 | H671 | 109.4° | 109.5° |
| H672 | C67 | H673 | 109.4° | 109.5° |
| H671 | C67 | H673 | 109.5° | 109.4° |
| H2 | N | H | 109.4° | 111.1° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| C67 | C05 | C06 | CA | 70.7° | 65.0° |
| C67 | C05 | C06 | C04 | 120.6° | 120.0° |
| C67 | C05 | C06 | H051 | 119.8° | 120.0° |
| C67 | C05 | C04 | H051 | 119.6° | 120.0° |
| C67 | C05 | C04 | C03 | 168.2° | 65.0° |
| C67 | C05 | C04 | H042 | 71.8° | 55.0° |
| C67 | C05 | C04 | H041 | 48.3° | 175.0° |
| C67 | C05 | C06 | H062 | 169.1° | 55.0° |
| C67 | C05 | C06 | H061 | 49.5° | 175.0° |
| C05 | C67 | H672 | H671 | 120.0° | 120.0° |
| C05 | C67 | H672 | H673 | 120.0° | 120.0° |
| C05 | C67 | H671 | H673 | 120.0° | 119.9° |
| CA | C | O | OXT | 178.3° | 180.0° |
| C | CA | C06 | N | 116.9° | 120.0° |
| C | CA | C06 | HA | 120.9° | 120.0° |
| C | CA | C06 | C05 | 175.9° | 175.0° |
| C | CA | N | HA | 119.1° | 120.0° |
| C | CA | C06 | H062 | 55.7° | 55.0° |
| C | CA | C06 | H061 | 63.9° | 65.0° |
| C | CA | N | H2 | 180.0° | 60.0° |
| C | CA | N | H | 60.0° | 176.0° |
| CA | C | OXT | HXT | 178.2° | 180.0° |
| O | C | CA | C06 | 27.8° | 100.0° |
| O | C | CA | N | 91.2° | 20.0° |
| O | C | CA | HA | 148.8° | 140.0° |
| O | C | OXT | HXT | 0.0° | 0.1° |
| CA | C06 | C05 | H062 | 120.2° | 120.0° |
| CA | C06 | C05 | H061 | 120.2° | 120.1° |
| C06 | CA | N | HA | 121.4° | 120.0° |
| CA | C06 | C05 | C04 | 168.7° | 175.0° |
| C06 | CA | C | OXT | 154.0° | 80.1° |
| CA | C06 | C05 | H051 | 49.1° | 55.0° |
| CA | C06 | H062 | H061 | 119.5° | 120.0° |
| C06 | CA | N | H2 | 60.5° | 60.0° |
| C06 | CA | N | H | 179.6° | 64.0° |
| C05 | C06 | CA | N | 59.0° | 65.0° |
| C06 | C05 | C04 | H051 | 119.5° | 120.0° |
| C06 | C05 | C04 | C03 | 70.9° | 175.0° |
| C06 | C05 | C04 | H042 | 49.1° | 65.0° |
| C06 | C05 | C04 | H041 | 169.2° | 55.0° |
| C05 | C06 | H062 | H061 | 119.4° | 120.0° |
| C05 | C06 | CA | HA | 63.1° | 55.0° |
| C06 | C05 | C67 | H672 | 180.0° | 60.0° |
| C06 | C05 | C67 | H671 | 60.0° | 180.0° |
| C06 | C05 | C67 | H673 | 60.0° | 60.0° |
| N | CA | C | OXT | 87.0° | 160.0° |
| N | CA | C06 | H062 | 61.2° | 175.0° |
| N | CA | C06 | H061 | 179.2° | 55.0° |
| CA | N | H2 | H | 120.0° | 123.9° |
| C05 | C04 | C03 | H042 | 120.0° | 120.1° |
| C05 | C04 | C03 | H041 | 119.9° | 120.0° |
| C05 | C04 | C03 | C02 | 156.2° | 180.0° |
| C05 | C04 | C03 | H031 | 35.9° | 60.0° |
| C05 | C04 | C03 | H032 | 83.5° | 60.0° |
| C05 | C04 | H042 | H041 | 120.2° | 120.0° |
| C04 | C05 | C06 | H062 | 48.5° | 65.0° |
| C04 | C05 | C06 | H061 | 71.1° | 55.0° |
| C04 | C05 | C67 | H672 | 59.0° | 180.0° |
| C04 | C05 | C67 | H671 | 61.0° | 59.9° |
| C04 | C05 | C67 | H673 | 179.0° | 60.0° |
| C04 | C03 | C02 | H031 | 120.3° | 120.0° |
| C04 | C03 | C02 | H032 | 120.3° | 119.9° |
| C04 | C03 | C02 | C01 | 146.4° | 180.0° |
| C04 | C03 | C02 | H021 | 93.7° | 60.0° |
| C04 | C03 | C02 | H022 | 26.5° | 60.0° |
| C04 | C03 | H031 | H032 | 119.2° | 119.9° |
| C03 | C04 | H042 | H041 | 120.2° | 119.9° |
| C03 | C04 | C05 | H051 | 48.6° | 55.0° |
| C03 | C02 | C01 | H021 | 119.9° | 120.0° |
| C03 | C02 | C01 | H022 | 119.9° | 120.0° |
| C03 | C02 | C01 | H011 | 180.0° | 60.0° |
| C03 | C02 | C01 | H012 | 60.0° | 59.9° |
| C03 | C02 | C01 | H013 | 60.0° | 180.0° |
| C03 | C02 | H021 | H022 | 120.3° | 120.0° |
| C02 | C03 | H031 | H032 | 119.2° | 120.1° |
| C02 | C03 | C04 | H042 | 83.9° | 59.9° |
| C02 | C03 | C04 | H041 | 36.3° | 60.0° |
| C02 | C01 | H011 | H012 | 120.0° | 120.0° |
| C02 | C01 | H011 | H013 | 120.0° | 120.0° |
| C02 | C01 | H012 | H013 | 120.0° | 120.0° |
| C01 | C02 | H021 | H022 | 120.3° | 120.0° |
| C01 | C02 | C03 | H031 | 26.1° | 60.0° |
| C01 | C02 | C03 | H032 | 93.3° | 60.1° |
| OXT | C | CA | HA | 33.0° | 40.0° |
| H011 | C01 | H012 | H013 | 120.0° | 120.0° |
| H011 | C01 | C02 | H021 | 60.1° | 60.0° |
| H011 | C01 | C02 | H022 | 60.1° | 180.0° |
| H012 | C01 | C02 | H021 | 179.9° | 180.0° |
| H012 | C01 | C02 | H022 | 59.9° | 60.0° |
| H013 | C01 | C02 | H021 | 59.9° | 60.0° |
| H013 | C01 | C02 | H022 | 179.9° | 60.0° |
| H021 | C02 | C03 | H031 | 146.0° | 180.0° |
| H021 | C02 | C03 | H032 | 26.6° | 59.9° |
| H022 | C02 | C03 | H031 | 93.8° | 60.0° |
| H022 | C02 | C03 | H032 | 146.8° | 179.9° |
| H031 | C03 | C04 | H042 | 155.9° | 180.0° |
| H031 | C03 | C04 | H041 | 84.0° | 60.1° |
| H032 | C03 | C04 | H042 | 36.5° | 60.0° |
| H032 | C03 | C04 | H041 | 156.6° | 179.9° |
| H042 | C04 | C05 | H051 | 168.6° | 175.0° |
| H041 | C04 | C05 | H051 | 71.3° | 65.1° |
| H051 | C05 | C06 | H062 | 71.2° | 175.0° |
| H051 | C05 | C06 | H061 | 169.2° | 65.0° |
| H051 | C05 | C67 | H672 | 60.5° | 60.0° |
| H051 | C05 | C67 | H671 | 179.5° | 60.0° |
| H051 | C05 | C67 | H673 | 59.5° | 179.9° |
| H062 | C06 | CA | HA | 176.7° | 65.0° |
| H061 | C06 | CA | HA | 57.0° | 175.0° |
| HA | CA | N | H2 | 60.9° | 180.0° |
| HA | CA | N | H | 59.0° | 56.0° |
| H672 | C67 | H671 | H673 | 120.0° | 120.0° |
