SVV
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
N | CA | sing | 1.44Å | 1.48Å | |
CA | C | sing | 1.51Å | 1.56Å | |
C | O | doub | 1.22Å | 1.25Å | |
CA | CB | sing | 1.52Å | 1.53Å | |
CB | OG | sing | 1.42Å | 1.43Å | |
OG | P1 | sing | 1.62Å | 1.61Å | |
O3 | P1 | sing | 1.62Å | 1.51Å | |
P1 | O2 | doub | 1.51Å | 1.49Å | |
P1 | N4 | sing | 1.65Å | 1.74Å | |
C | OXT | sing | 1.36Å | 1.34Å | |
CB | HBC1 | sing | 1.10Å | 1.11Å | |
CB | HA2 | sing | 1.10Å | 1.12Å | |
O3 | H3 | sing | 0.98Å | 0.95Å | |
N4 | H4N1 | sing | 1.02Å | 1.02Å | |
N4 | H4N2 | sing | 1.02Å | 1.02Å | |
OXT | HA | sing | 0.98Å | 4.10Å | |
N | HN1 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
N | HN2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
CA | HC | sing | 1.10Å | 1.10Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
N | CA | C | 112.3° | 107.3° |
N | CA | CB | 111.0° | 111.6° |
CA | N | HN1 | 109.5° | 119.0° |
CA | N | HN2 | 109.5° | 118.9° |
N | CA | HC | 108.0° | 105.3° |
CA | C | O | 118.9° | 125.1° |
C | CA | CB | 113.8° | 110.6° |
CA | C | OXT | 118.6° | 111.9° |
C | CA | HC | 104.9° | 110.0° |
O | C | OXT | 122.5° | 122.9° |
CA | CB | OG | 111.3° | 109.2° |
CA | CB | HBC1 | 111.6° | 111.0° |
CA | CB | HA2 | 111.5° | 111.6° |
CB | CA | HC | 106.3° | 111.7° |
CB | OG | P1 | 122.8° | 120.2° |
OG | CB | HBC1 | 111.5° | 107.8° |
OG | CB | HA2 | 111.6° | 108.7° |
OG | P1 | O3 | 103.7° | 102.2° |
OG | P1 | O2 | 123.9° | 111.6° |
OG | P1 | N4 | 94.3° | 107.7° |
O3 | P1 | O2 | 117.6° | 111.4° |
O3 | P1 | N4 | 109.7° | 106.5° |
P1 | O3 | H3 | 103.8° | 118.7° |
O2 | P1 | N4 | 104.7° | 116.4° |
P1 | N4 | H4N1 | 118.2° | 117.1° |
P1 | N4 | H4N2 | 94.3° | 117.1° |
C | OXT | HA | 27.4° | 115.2° |
HBC1 | CB | HA2 | 98.8° | 108.4° |
H4N1 | N4 | H4N2 | 118.2° | 105.8° |
HN1 | N | HN2 | 109.4° | 120.7° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
N | CA | C | CB | 127.2° | 122.0° |
N | CA | C | HC | 117.0° | 114.1° |
N | CA | C | O | 66.0° | 35.9° |
N | CA | CB | HC | 117.2° | 117.6° |
N | CA | CB | OG | 162.6° | 178.2° |
N | CA | C | OXT | 113.9° | 146.4° |
N | CA | CB | HBC1 | 72.1° | 59.4° |
N | CA | CB | HA2 | 37.3° | 61.6° |
CA | N | HN1 | HN2 | 120.0° | 166.4° |
CA | C | O | OXT | 179.9° | 177.5° |
C | CA | CB | HC | 114.9° | 122.9° |
C | CA | CB | OG | 69.5° | 58.8° |
C | CA | CB | HBC1 | 55.8° | 60.0° |
C | CA | CB | HA2 | 165.2° | 178.9° |
CA | C | OXT | HA | 52.7° | 177.7° |
C | CA | N | HN1 | 45.7° | 58.8° |
C | CA | N | HN2 | 165.7° | 107.8° |
O | C | CA | CB | 166.8° | 86.1° |
O | C | OXT | HA | 127.2° | 0.0° |
O | C | CA | HC | 51.1° | 150.0° |
CA | CB | OG | HBC1 | 125.3° | 120.7° |
CA | CB | OG | HA2 | 125.3° | 122.0° |
CA | CB | OG | P1 | 140.2° | 180.0° |
CB | CA | C | OXT | 13.3° | 91.6° |
CA | CB | HBC1 | HA2 | 117.4° | 122.9° |
CB | CA | N | HN1 | 82.9° | 62.5° |
CB | CA | N | HN2 | 37.1° | 130.8° |
CB | OG | P1 | O3 | 34.1° | 51.9° |
CB | OG | P1 | O2 | 103.5° | 171.1° |
CB | OG | P1 | N4 | 145.7° | 60.0° |
OG | CB | HBC1 | HA2 | 117.4° | 117.5° |
OG | CB | CA | HC | 45.4° | 64.2° |
OG | P1 | O3 | O2 | 140.8° | 119.3° |
OG | P1 | O3 | N4 | 99.8° | 112.9° |
OG | P1 | O2 | N4 | 105.6° | 124.2° |
P1 | OG | CB | HBC1 | 14.9° | 59.2° |
P1 | OG | CB | HA2 | 94.5° | 58.1° |
OG | P1 | O3 | H3 | 180.0° | 72.6° |
OG | P1 | N4 | H4N1 | 54.7° | 62.0° |
OG | P1 | N4 | H4N2 | 180.0° | 170.8° |
O3 | P1 | O2 | N4 | 122.0° | 122.3° |
O3 | P1 | N4 | H4N1 | 161.0° | 170.9° |
O3 | P1 | N4 | H4N2 | 73.7° | 61.9° |
O2 | P1 | O3 | H3 | 39.2° | 46.6° |
O2 | P1 | N4 | H4N1 | 72.0° | 64.2° |
O2 | P1 | N4 | H4N2 | 53.3° | 63.0° |
N4 | P1 | O3 | H3 | 80.2° | 174.5° |
P1 | N4 | H4N1 | H4N2 | 112.6° | 132.5° |
OXT | C | CA | HC | 129.0° | 32.3° |
HBC1 | CB | CA | HC | 170.7° | 177.1° |
HA2 | CB | CA | HC | 79.9° | 56.0° |
HN1 | N | CA | HC | 160.9° | 176.0° |
HN2 | N | CA | HC | 79.1° | 9.4° |