SER
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| N | CA | sing | 1.47Å | 1.49Å | |
| N | H | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| N | H2 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| CA | C | sing | 1.51Å | 1.52Å | |
| CA | CB | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
| CA | HA | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| C | O | doub | 1.21Å | 1.24Å | |
| C | OXT | sing | 1.34Å | 1.24Å | |
| CB | OG | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
| CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| OG | HG | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| CA | N | H | 109.9° | 106.7° |
| CA | N | H2 | 112.1° | 106.7° |
| N | CA | C | 109.9° | 109.4° |
| N | CA | CB | 110.2° | 109.5° |
| N | CA | HA | 108.8° | 109.4° |
| H | N | H2 | 112.0° | 106.7° |
| C | CA | CB | 109.9° | 109.5° |
| C | CA | HA | 109.2° | 109.5° |
| CA | C | O | 117.6° | 120.0° |
| CA | C | OXT | 118.8° | 120.0° |
| CB | CA | HA | 108.8° | 109.5° |
| CA | CB | OG | 110.3° | 109.5° |
| CA | CB | HB2 | 111.9° | 109.4° |
| CA | CB | HB3 | 111.9° | 109.5° |
| O | C | OXT | 123.7° | 120.0° |
| C | OXT | HXT | 118.7° | 120.0° |
| OG | CB | HB2 | 111.9° | 109.5° |
| OG | CB | HB3 | 111.9° | 109.5° |
| CB | OG | HG | 110.3° | 106.8° |
| HB2 | CB | HB3 | 98.5° | 109.4° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| CA | N | H | H2 | 125.3° | 113.8° |
| N | CA | C | CB | 121.4° | 120.0° |
| N | CA | C | HA | 119.3° | 119.9° |
| N | CA | CB | HA | 119.3° | 120.0° |
| N | CA | C | O | 26.1° | 30.0° |
| N | CA | C | OXT | 154.4° | 150.0° |
| N | CA | CB | OG | 59.9° | 60.0° |
| N | CA | CB | HB2 | 65.4° | 60.0° |
| N | CA | CB | HB3 | 174.8° | 180.0° |
| H | N | CA | C | 180.0° | 60.0° |
| H | N | CA | CB | 58.8° | 60.0° |
| H | N | CA | HA | 60.5° | 179.9° |
| H2 | N | CA | C | 54.7° | 173.7° |
| H2 | N | CA | CB | 66.5° | 53.7° |
| H2 | N | CA | HA | 174.3° | 66.3° |
| C | CA | CB | HA | 119.5° | 120.1° |
| CA | C | O | OXT | 179.5° | 180.0° |
| C | CA | CB | OG | 178.9° | 179.9° |
| C | CA | CB | HB2 | 55.9° | 59.9° |
| C | CA | CB | HB3 | 53.6° | 60.0° |
| CA | C | OXT | HXT | 179.9° | 180.0° |
| CB | CA | C | O | 95.3° | 90.0° |
| CB | CA | C | OXT | 84.2° | 90.0° |
| CA | CB | OG | HB2 | 125.3° | 120.0° |
| CA | CB | OG | HB3 | 125.3° | 120.0° |
| CA | CB | HB2 | HB3 | 117.8° | 120.0° |
| CA | CB | OG | HG | 180.0° | 180.0° |
| HA | CA | C | O | 145.4° | 149.9° |
| HA | CA | C | OXT | 35.1° | 30.1° |
| HA | CA | CB | OG | 59.4° | 60.0° |
| HA | CA | CB | HB2 | 175.4° | 180.0° |
| HA | CA | CB | HB3 | 65.9° | 60.0° |
| O | C | OXT | HXT | 0.4° | 0.0° |
| OG | CB | HB2 | HB3 | 117.8° | 120.0° |
| HB2 | CB | OG | HG | 54.7° | 60.0° |
| HB3 | CB | OG | HG | 54.7° | 59.9° |
