SEP
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| N | CA | sing | 1.47Å | 1.45Å | |
| N | H | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| N | H2 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| CA | CB | sing | 1.53Å | 1.50Å | |
| CA | C | sing | 1.51Å | 1.47Å | |
| CA | HA | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| CB | OG | sing | 1.43Å | 1.39Å | |
| CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| OG | P | sing | 1.61Å | 1.58Å | |
| C | O | doub | 1.21Å | 1.24Å | |
| C | OXT | sing | 1.34Å | 1.31Å | |
| OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| P | O1P | doub | 1.48Å | 1.46Å | |
| P | O2P | sing | 1.61Å | 1.47Å | |
| P | O3P | sing | 1.61Å | 1.49Å | |
| O2P | HOP2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| O3P | HOP3 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| CA | N | H | 114.4° | 106.7° |
| CA | N | H2 | 110.4° | 106.7° |
| N | CA | CB | 114.3° | 109.4° |
| N | CA | C | 113.4° | 109.4° |
| N | CA | HA | 103.4° | 109.5° |
| H | N | H2 | 110.4° | 106.7° |
| CB | CA | C | 110.5° | 109.6° |
| CB | CA | HA | 106.7° | 109.5° |
| CA | CB | OG | 107.6° | 109.5° |
| CA | CB | HB2 | 112.9° | 109.5° |
| CA | CB | HB3 | 112.9° | 109.4° |
| C | CA | HA | 107.9° | 109.4° |
| CA | C | O | 121.4° | 120.0° |
| CA | C | OXT | 112.9° | 120.0° |
| OG | CB | HB2 | 112.9° | 109.5° |
| OG | CB | HB3 | 112.9° | 109.4° |
| CB | OG | P | 117.8° | 106.8° |
| HB2 | CB | HB3 | 97.5° | 109.4° |
| OG | P | O1P | 108.7° | 109.5° |
| OG | P | O2P | 105.5° | 109.5° |
| OG | P | O3P | 109.7° | 109.5° |
| O | C | OXT | 125.7° | 119.9° |
| C | OXT | HXT | 112.9° | 120.0° |
| O1P | P | O2P | 110.3° | 109.5° |
| O1P | P | O3P | 110.7° | 109.4° |
| O2P | P | O3P | 111.8° | 109.5° |
| P | O2P | HOP2 | 105.5° | 106.8° |
| P | O3P | HOP3 | 109.7° | 106.8° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| CA | N | H | H2 | 125.2° | 113.8° |
| N | CA | CB | C | 129.3° | 120.0° |
| N | CA | CB | HA | 113.6° | 120.0° |
| N | CA | C | HA | 113.8° | 119.9° |
| N | CA | CB | OG | 176.1° | 60.1° |
| N | CA | CB | HB2 | 58.6° | 60.0° |
| N | CA | CB | HB3 | 50.8° | 180.0° |
| N | CA | C | O | 19.4° | 30.1° |
| N | CA | C | OXT | 159.2° | 150.0° |
| H | N | CA | CB | 179.9° | 53.8° |
| H | N | CA | C | 52.2° | 173.9° |
| H | N | CA | HA | 64.4° | 66.3° |
| H2 | N | CA | CB | 54.7° | 60.0° |
| H2 | N | CA | C | 177.4° | 60.1° |
| H2 | N | CA | HA | 60.8° | 180.0° |
| CB | CA | C | HA | 116.3° | 120.1° |
| CA | CB | OG | HB2 | 125.3° | 120.1° |
| CA | CB | OG | HB3 | 125.3° | 119.9° |
| CA | CB | HB2 | HB3 | 118.8° | 120.0° |
| CA | CB | OG | P | 120.2° | 180.0° |
| CB | CA | C | O | 110.4° | 89.9° |
| CB | CA | C | OXT | 70.9° | 90.0° |
| C | CA | CB | OG | 46.8° | 179.9° |
| C | CA | CB | HB2 | 172.1° | 60.0° |
| C | CA | CB | HB3 | 78.5° | 60.0° |
| CA | C | O | OXT | 178.5° | 179.9° |
| CA | C | OXT | HXT | 180.0° | 179.9° |
| HA | CA | CB | OG | 70.3° | 59.9° |
| HA | CA | CB | HB2 | 55.0° | 180.0° |
| HA | CA | CB | HB3 | 164.5° | 60.0° |
| HA | CA | C | O | 133.3° | 150.0° |
| HA | CA | C | OXT | 45.4° | 30.1° |
| OG | CB | HB2 | HB3 | 118.8° | 119.9° |
| CB | OG | P | O1P | 170.9° | 60.0° |
| CB | OG | P | O2P | 70.8° | 179.9° |
| CB | OG | P | O3P | 49.8° | 59.9° |
| HB2 | CB | OG | P | 5.1° | 59.9° |
| HB3 | CB | OG | P | 114.5° | 60.1° |
| OG | P | O1P | O2P | 115.2° | 120.1° |
| OG | P | O1P | O3P | 120.5° | 120.0° |
| OG | P | O2P | O3P | 119.2° | 120.0° |
| OG | P | O2P | HOP2 | 179.9° | 180.0° |
| OG | P | O3P | HOP3 | 179.9° | 60.0° |
| O | C | OXT | HXT | 1.4° | 0.1° |
| O1P | P | O2P | O3P | 123.6° | 119.9° |
| O1P | P | O2P | HOP2 | 62.8° | 60.0° |
| O1P | P | O3P | HOP3 | 60.1° | 180.0° |
| O2P | P | O3P | HOP3 | 63.3° | 60.0° |
| O3P | P | O2P | HOP2 | 60.8° | 59.9° |
