SEE
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
N | CA | sing | 1.47Å | 1.46Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
CA | CB | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
CA | C | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | OG | sing | 1.43Å | 1.40Å | |
CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
OG | B | sing | 1.37Å | 1.50Å | |
B | O1B | sing | 1.37Å | 1.42Å | |
B | O2B | sing | 1.37Å | 1.43Å | |
B | O3B | sing | 1.37Å | 1.42Å | |
C | O | doub | 1.21Å | 1.20Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 1.43Å | |
O1B | H6 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2B | H7 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3B | H8 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
CA | N | H2 | 109.4° | 111.0° |
N | CA | CB | 108.0° | 109.5° |
N | CA | C | 113.2° | 109.5° |
N | CA | HA | 107.7° | 109.5° |
H | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
CB | CA | C | 108.8° | 109.5° |
CB | CA | HA | 112.3° | 109.4° |
CA | CB | OG | 115.8° | 109.5° |
CA | CB | HB2 | 107.4° | 109.5° |
CA | CB | HB3 | 105.9° | 109.5° |
C | CA | HA | 107.0° | 109.5° |
CA | C | O | 119.8° | 120.0° |
CA | C | OXT | 120.1° | 120.0° |
OG | CB | HB2 | 107.4° | 109.4° |
OG | CB | HB3 | 106.0° | 109.5° |
CB | OG | B | 119.6° | 114.0° |
HB2 | CB | HB3 | 114.6° | 109.4° |
OG | B | O1B | 111.3° | 109.5° |
OG | B | O2B | 108.4° | 109.4° |
OG | B | O3B | 111.0° | 109.5° |
O1B | B | O2B | 108.5° | 109.5° |
O1B | B | O3B | 107.1° | 109.5° |
B | O1B | H6 | 109.5° | 114.0° |
O2B | B | O3B | 110.5° | 109.5° |
B | O2B | H7 | 109.5° | 114.1° |
B | O3B | H8 | 109.5° | 114.0° |
O | C | OXT | 120.1° | 120.0° |
C | OXT | HXT | 109.5° | 117.1° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
CA | N | H | H2 | 120.0° | 123.9° |
N | CA | CB | C | 123.2° | 120.0° |
N | CA | CB | HA | 118.6° | 120.0° |
N | CA | C | HA | 118.5° | 120.0° |
N | CA | CB | OG | 81.0° | 65.0° |
N | CA | CB | HB2 | 38.9° | 55.0° |
N | CA | CB | HB3 | 161.8° | 175.0° |
N | CA | C | O | 171.1° | 20.0° |
N | CA | C | OXT | 8.9° | 160.0° |
H | N | CA | CB | 164.9° | 60.0° |
H | N | CA | C | 74.6° | 60.0° |
H | N | CA | HA | 43.5° | 180.0° |
H2 | N | CA | CB | 75.1° | 63.9° |
H2 | N | CA | C | 45.4° | 176.1° |
H2 | N | CA | HA | 163.5° | 56.1° |
CB | CA | C | HA | 121.5° | 120.0° |
CA | CB | OG | HB2 | 120.0° | 120.0° |
CA | CB | OG | HB3 | 117.1° | 120.0° |
CA | CB | HB2 | HB3 | 117.4° | 120.0° |
CA | CB | OG | B | 74.2° | 180.0° |
CB | CA | C | O | 68.8° | 100.0° |
CB | CA | C | OXT | 111.1° | 80.0° |
C | CA | CB | OG | 155.7° | 175.0° |
C | CA | CB | HB2 | 84.3° | 65.0° |
C | CA | CB | HB3 | 38.6° | 55.0° |
CA | C | O | OXT | 180.0° | 180.0° |
CA | C | OXT | HXT | 180.0° | 180.0° |
HA | CA | CB | OG | 37.6° | 55.0° |
HA | CA | CB | HB2 | 157.5° | 175.0° |
HA | CA | CB | HB3 | 79.6° | 65.0° |
HA | CA | C | O | 52.6° | 140.0° |
HA | CA | C | OXT | 127.4° | 40.0° |
OG | CB | HB2 | HB3 | 117.4° | 120.0° |
CB | OG | B | O1B | 93.0° | 60.0° |
CB | OG | B | O2B | 147.7° | 180.0° |
CB | OG | B | O3B | 26.1° | 60.0° |
HB2 | CB | OG | B | 45.8° | 60.0° |
HB3 | CB | OG | B | 168.7° | 59.9° |
OG | B | O1B | O2B | 119.2° | 120.0° |
OG | B | O1B | O3B | 121.5° | 120.0° |
OG | B | O2B | O3B | 121.9° | 120.0° |
OG | B | O1B | H6 | 36.1° | 60.0° |
OG | B | O2B | H7 | 140.9° | 60.0° |
OG | B | O3B | H8 | 161.3° | 180.0° |
O1B | B | O2B | O3B | 117.1° | 120.0° |
O1B | B | O2B | H7 | 98.1° | 180.0° |
O1B | B | O3B | H8 | 77.0° | 60.0° |
O2B | B | O1B | H6 | 83.2° | 180.0° |
O2B | B | O3B | H8 | 41.0° | 60.0° |
O3B | B | O1B | H6 | 157.5° | 60.0° |
O3B | B | O2B | H7 | 19.0° | 60.0° |
O | C | OXT | HXT | 0.0° | 0.0° |