RUU
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C5 | C4 | sing | 1.55Å | 1.53Å | |
C5 | O5 | sing | 1.45Å | 1.44Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C4 | C3 | sing | 1.55Å | 1.53Å | |
O5 | C2 | sing | 1.44Å | 1.43Å | |
C3 | C2 | sing | 1.54Å | 1.52Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C2 | C1 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | H11 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | H12 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C5 | H51 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | H52 | sing | 1.09Å | 1.10Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C4 | C5 | O5 | 106.2° | 103.5° |
C5 | C4 | O4 | 108.6° | 110.9° |
C5 | C4 | C3 | 103.5° | 102.1° |
C5 | C4 | H4 | 111.2° | 110.9° |
C4 | C5 | H51 | 110.3° | 110.7° |
C4 | C5 | H52 | 110.3° | 110.6° |
C5 | O5 | C2 | 110.5° | 106.8° |
O5 | C5 | H51 | 110.3° | 110.6° |
O5 | C5 | H52 | 110.3° | 110.6° |
O4 | C4 | C3 | 109.1° | 110.9° |
O4 | C4 | H4 | 112.9° | 110.8° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C3 | C2 | 102.0° | 104.2° |
C4 | C3 | O3 | 109.8° | 110.4° |
C4 | C3 | H3 | 110.8° | 110.6° |
C3 | C4 | H4 | 111.1° | 110.9° |
O5 | C2 | C3 | 106.3° | 107.4° |
O5 | C2 | O2 | 107.9° | 109.9° |
O5 | C2 | C1 | 107.5° | 109.9° |
C2 | C3 | O3 | 110.1° | 110.5° |
C3 | C2 | O2 | 109.5° | 109.9° |
C3 | C2 | C1 | 115.2° | 109.9° |
C2 | C3 | H3 | 111.0° | 110.5° |
O3 | C3 | H3 | 112.6° | 110.4° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
O2 | C2 | C1 | 110.1° | 109.9° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C2 | C1 | O1 | 110.7° | 109.4° |
C2 | C1 | H11 | 109.2° | 109.5° |
C2 | C1 | H12 | 109.2° | 109.5° |
O1 | C1 | H11 | 109.2° | 109.4° |
O1 | C1 | H12 | 109.2° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
H11 | C1 | H12 | 109.5° | 109.5° |
H51 | C5 | H52 | 109.4° | 110.7° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
C4 | C5 | O5 | H51 | 119.5° | 118.6° |
C4 | C5 | O5 | H52 | 119.5° | 118.5° |
C5 | C4 | O4 | C3 | 112.1° | 112.8° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 123.8° | 123.6° |
C5 | C4 | C3 | H4 | 119.4° | 118.2° |
C4 | C5 | O5 | C2 | 5.4° | 40.0° |
C5 | C4 | C3 | C2 | 33.2° | 20.9° |
C5 | C4 | C3 | O3 | 149.8° | 97.8° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 85.1° | 139.6° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 67.2° |
C4 | C5 | H51 | H52 | 121.6° | 123.0° |
O5 | C5 | C4 | O4 | 91.3° | 155.3° |
O5 | C5 | C4 | C3 | 24.5° | 37.0° |
C5 | O5 | C2 | C3 | 16.3° | 26.5° |
C5 | O5 | C2 | O2 | 101.0° | 93.0° |
C5 | O5 | C2 | C1 | 140.2° | 146.0° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 143.9° | 81.2° |
O5 | C5 | H51 | H52 | 121.5° | 122.9° |
O4 | C4 | C3 | H4 | 125.1° | 123.6° |
O4 | C4 | C3 | C2 | 82.3° | 139.1° |
O4 | C4 | C3 | O3 | 34.4° | 20.4° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 159.4° | 102.1° |
O4 | C4 | C5 | H51 | 149.3° | 86.3° |
O4 | C4 | C5 | H52 | 28.2° | 36.8° |
C4 | C3 | C2 | O5 | 30.7° | 2.1° |
C4 | C3 | C2 | O3 | 116.5° | 118.6° |
C4 | C3 | C2 | H3 | 118.1° | 118.8° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 124.0° | 122.7° |
C4 | C3 | C2 | O2 | 85.6° | 117.4° |
C4 | C3 | C2 | C1 | 149.8° | 121.6° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 65.3° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 67.9° | 180.0° |
C3 | C4 | C5 | H51 | 94.9° | 155.5° |
C3 | C4 | C5 | H52 | 144.0° | 81.5° |
O5 | C2 | C3 | O2 | 116.3° | 119.5° |
O5 | C2 | C3 | C1 | 119.0° | 119.5° |
O5 | C2 | C3 | O3 | 147.3° | 120.8° |
O5 | C2 | O2 | C1 | 117.1° | 121.0° |
O5 | C2 | C1 | O1 | 60.3° | 61.7° |
O5 | C2 | C1 | H11 | 179.5° | 58.3° |
O5 | C2 | C1 | H12 | 59.9° | 178.3° |
O5 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 61.7° |
O5 | C2 | C3 | H3 | 87.4° | 116.7° |
C2 | O5 | C5 | H51 | 114.1° | 158.6° |
C2 | O5 | C5 | H52 | 124.9° | 78.5° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 124.5° | 122.5° |
C3 | C2 | O2 | C1 | 127.6° | 121.0° |
C3 | C2 | C1 | O1 | 178.6° | 179.7° |
C3 | C2 | C1 | H11 | 61.2° | 59.7° |
C3 | C2 | C1 | H12 | 58.4° | 60.3° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 64.7° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 68.5° | 180.0° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 152.6° | 97.3° |
O3 | C3 | C2 | O2 | 30.9° | 1.3° |
O3 | C3 | C2 | C1 | 93.7° | 119.7° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 90.7° | 144.0° |
O2 | C2 | C1 | O1 | 57.1° | 59.3° |
O2 | C2 | C1 | H11 | 63.1° | 179.3° |
O2 | C2 | C1 | H12 | 177.3° | 60.7° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 156.3° | 123.8° |
C2 | C1 | O1 | H11 | 120.2° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | H12 | 120.2° | 120.0° |
C2 | C1 | H11 | H12 | 119.4° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 62.9° | 59.3° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 31.6° | 2.8° |
O1 | C1 | H11 | H12 | 119.4° | 120.0° |
H11 | C1 | O1 | HO1 | 59.8° | 60.0° |
H12 | C1 | O1 | HO1 | 59.8° | 60.0° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 55.9° | 57.4° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 34.3° | 21.4° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 56.2° | 56.4° |
H4 | C4 | C5 | H51 | 24.5° | 37.3° |
H4 | C4 | C5 | H52 | 96.6° | 160.3° |