RIB

Bonds

First atom	Second atom	Bond order type	Distance (experimental model)	Distance (ideal model)	Properties
O5	C5	sing	1.43Å	1.44Å
O5	HO5	sing	0.97Å	0.95Å
C5	C4	sing	1.53Å	1.55Å
C5	H51	sing	1.09Å	1.11Å
C5	H52	sing	1.09Å	1.12Å
C4	O4	sing	1.43Å	1.43Å
C4	C3	sing	1.54Å	1.53Å
C4	H4	sing	1.09Å	1.12Å
O4	C1	sing	1.43Å	1.45Å
C3	O3	sing	1.43Å	1.43Å
C3	C2	sing	1.55Å	1.53Å
C3	H3	sing	1.09Å	1.11Å
O3	HO3	sing	0.97Å	0.95Å
C2	O2	sing	1.43Å	1.43Å
C2	C1	sing	1.55Å	1.54Å
C2	H2	sing	1.09Å	1.11Å
O2	HO2	sing	0.97Å	0.95Å
C1	O1	sing	1.43Å	1.39Å
C1	H1	sing	1.09Å	1.11Å
O1	HO1	sing	0.97Å	0.95Å

Angles

First atom	Second atom	Third atom	Angle (experimental model)	Angle (ideal model)
C5	O5	HO5	104.1°	106.9°
O5	C5	C4	104.1°	109.5°
O5	C5	H51	114.2°	109.5°
O5	C5	H52	114.2°	109.4°
C4	C5	H51	114.2°	109.5°
C4	C5	H52	114.2°	109.5°
C5	C4	O4	109.7°	109.9°
C5	C4	C3	113.1°	109.8°
C5	C4	H4	106.1°	109.8°
H51	C5	H52	96.3°	109.4°
O4	C4	C3	107.0°	107.7°
O4	C4	H4	112.3°	109.9°
C4	O4	C1	105.4°	110.0°
C3	C4	H4	108.7°	109.8°
C4	C3	O3	108.9°	111.2°
C4	C3	C2	103.6°	102.1°
C4	C3	H3	116.5°	110.9°
O4	C1	C2	107.2°	105.1°
O4	C1	O1	106.8°	110.4°
O4	C1	H1	111.9°	110.3°
O3	C3	C2	116.8°	110.8°
O3	C3	H3	103.1°	110.7°
C3	O3	HO3	108.9°	106.8°
C2	C3	H3	108.5°	110.8°
C3	C2	O2	110.6°	111.1°
C3	C2	C1	104.6°	101.0°
C3	C2	H2	112.4°	111.1°
O2	C2	C1	110.6°	111.2°
O2	C2	H2	106.5°	111.0°
C2	O2	HO2	110.6°	106.8°
C1	C2	H2	112.3°	111.1°
C2	C1	O1	106.8°	110.4°
C2	C1	H1	111.8°	110.3°
O1	C1	H1	112.1°	110.2°
C1	O1	HO1	106.8°	106.8°

Dihedrals

First atom	Second atom	Third atom	Fourth atom	Torsion (experimental model)	Torsion (ideal model)
O5	C5	C4	H51	125.3°	120.1°
O5	C5	C4	H52	125.2°	120.0°
O5	C5	H51	H52	120.2°	119.9°
O5	C5	C4	O4	59.3°	61.6°
O5	C5	C4	C3	178.7°	179.9°
O5	C5	C4	H4	62.2°	59.3°
HO5	O5	C5	C4	180.0°	179.9°
HO5	O5	C5	H51	54.8°	59.9°
HO5	O5	C5	H52	54.8°	60.0°
C4	C5	H51	H52	120.1°	119.9°
C5	C4	O4	C3	123.1°	119.6°
C5	C4	O4	H4	117.7°	120.8°
C5	C4	C3	H4	117.6°	120.8°
C5	C4	O4	C1	159.3°	117.9°
C5	C4	C3	O3	87.2°	100.9°
C5	C4	C3	C2	147.7°	140.9°
C5	C4	C3	H3	28.8°	22.8°
H51	C5	C4	O4	66.0°	58.5°
H51	C5	C4	C3	53.4°	59.8°
H51	C5	C4	H4	172.5°	179.4°
H52	C5	C4	O4	175.5°	178.4°
H52	C5	C4	C3	56.1°	60.1°
H52	C5	C4	H4	63.1°	60.7°
O4	C4	C3	H4	121.5°	119.6°
O4	C4	C3	O3	151.9°	139.5°
O4	C4	C3	C2	26.8°	21.3°
O4	C4	C3	H3	92.1°	96.9°
C4	O4	C1	C2	30.9°	24.4°
C4	O4	C1	O1	83.2°	143.5°
C4	O4	C1	H1	153.8°	94.5°
C3	C4	O4	C1	36.2°	1.8°
C4	C3	O3	C2	116.9°	112.9°
C4	C3	O3	H3	124.3°	123.7°
C4	C3	C2	H3	124.4°	118.1°
C4	C3	O3	HO3	180.0°	174.3°
C4	C3	C2	O2	111.6°	84.0°
C4	C3	C2	C1	7.5°	34.0°
C4	C3	C2	H2	129.6°	152.0°
H4	C4	O4	C1	83.0°	121.3°
H4	C4	C3	O3	30.4°	19.9°
H4	C4	C3	C2	94.7°	98.3°
H4	C4	C3	H3	146.4°	143.6°
O4	C1	C2	C3	13.6°	36.4°
O4	C1	C2	O2	132.7°	81.6°
O4	C1	C2	O1	114.1°	119.0°
O4	C1	C2	H1	122.9°	118.9°
O4	C1	C2	H2	108.5°	154.3°
O4	C1	O1	H1	122.9°	122.1°
O4	C1	O1	HO1	180.0°	61.5°
O3	C3	C2	H3	115.9°	123.4°
O3	C3	C2	O2	8.2°	34.5°
O3	C3	C2	C1	127.3°	152.5°
O3	C3	C2	H2	110.7°	89.5°
C2	C3	O3	HO3	63.1°	61.5°
C3	C2	O2	C1	115.4°	111.6°
C3	C2	O2	H2	122.4°	124.2°
C3	C2	C1	H2	122.1°	117.9°
C3	C2	O2	HO2	180.0°	173.1°
C3	C2	C1	O1	100.5°	155.4°
C3	C2	C1	H1	136.6°	82.5°
H3	C3	O3	HO3	55.7°	62.0°
H3	C3	C2	O2	124.0°	157.9°
H3	C3	C2	C1	116.8°	84.1°
H3	C3	C2	H2	5.2°	33.8°
O2	C2	C1	H2	118.8°	124.1°
O2	C2	C1	O1	18.6°	37.5°
O2	C2	C1	H1	104.4°	159.5°
C1	C2	O2	HO2	64.6°	61.4°
C2	C1	O1	H1	122.7°	122.1°
C2	C1	O1	HO1	65.6°	177.3°
H2	C2	O2	HO2	57.7°	62.8°
H2	C2	C1	O1	137.4°	86.6°
H2	C2	C1	H1	14.4°	35.4°
H1	C1	O1	HO1	57.2°	60.7°

Definition date:	1999-07-08
Last modified:	2024-09-27
Release status:	REL
Processing site:	RCSB
Derived from:	1RKD