RE3
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
CA | N | sing | 1.47Å | 1.44Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
C | CA | sing | 1.51Å | 1.54Å | |
CB | CA | sing | 1.53Å | 1.50Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | CG | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
CB | H10 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | H10A | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CD1 | CG | sing | 1.51Å | 1.54Å | |
OG | CG | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
CG | CD2 | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
OG | HOG | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
OD1 | CD1 | doub | 1.21Å | 1.21Å | |
CD1 | NE1 | sing | 1.34Å | 1.36Å | |
NE1 | CE2 | sing | 1.40Å | 1.39Å | |
NE1 | HNE1 | sing | 0.97Å | 1.00Å | |
CE2 | CD2 | doub | 1.39Å | 1.42Å | Aromatic |
CE2 | CZ2 | sing | 1.39Å | 1.42Å | Aromatic |
CZ2 | CH2 | doub | 1.38Å | 1.43Å | Aromatic |
CZ2 | H17 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
CH2 | CZ3 | sing | 1.38Å | 1.42Å | Aromatic |
CH2 | H18 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
CE3 | CZ3 | doub | 1.38Å | 1.43Å | Aromatic |
CZ3 | H19 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
CD2 | CE3 | sing | 1.38Å | 1.42Å | Aromatic |
CE3 | H20 | sing | 1.08Å | 1.08Å | |
O | C | doub | 1.21Å | 1.26Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 139.21Å | |
OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.00Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
N | CA | C | 107.0° | 109.5° |
N | CA | CB | 108.4° | 109.5° |
N | CA | HA | 112.0° | 109.5° |
CA | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
H | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
C | CA | CB | 110.0° | 109.5° |
C | CA | HA | 110.4° | 109.5° |
CA | C | O | 118.6° | 120.0° |
CA | C | OXT | 106.2° | 120.0° |
CB | CA | HA | 109.0° | 109.4° |
CA | CB | CG | 121.1° | 109.5° |
CA | CB | H10 | 105.8° | 109.5° |
CA | CB | H10A | 105.8° | 109.5° |
CG | CB | H10 | 105.8° | 109.5° |
CG | CB | H10A | 105.8° | 109.4° |
CB | CG | CD1 | 112.4° | 110.5° |
CB | CG | OG | 110.8° | 110.4° |
CB | CG | CD2 | 113.4° | 110.5° |
H10 | CB | H10A | 112.9° | 109.5° |
CD1 | CG | OG | 108.7° | 110.6° |
CD1 | CG | CD2 | 100.9° | 104.1° |
CG | CD1 | OD1 | 123.2° | 126.5° |
CG | CD1 | NE1 | 110.9° | 107.1° |
OG | CG | CD2 | 110.2° | 110.5° |
CG | OG | HOG | 109.5° | 114.0° |
CG | CD2 | CE2 | 107.0° | 106.3° |
CG | CD2 | CE3 | 132.1° | 132.9° |
OD1 | CD1 | NE1 | 125.9° | 126.5° |
CD1 | NE1 | CE2 | 109.1° | 112.2° |
CD1 | NE1 | HNE1 | 125.5° | 123.8° |
CE2 | NE1 | HNE1 | 125.4° | 123.9° |
NE1 | CE2 | CD2 | 112.0° | 110.3° |
NE1 | CE2 | CZ2 | 125.9° | 130.8° |
CD2 | CE2 | CZ2 | 122.0° | 119.0° |
CE2 | CD2 | CE3 | 120.9° | 120.8° |
CE2 | CZ2 | CH2 | 117.5° | 120.1° |
CE2 | CZ2 | H17 | 121.3° | 119.9° |
CH2 | CZ2 | H17 | 121.3° | 119.9° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | 120.5° | 120.4° |
CZ2 | CH2 | H18 | 119.8° | 119.8° |
CZ3 | CH2 | H18 | 119.7° | 119.8° |
CH2 | CZ3 | CE3 | 121.8° | 119.8° |
CH2 | CZ3 | H19 | 119.1° | 120.1° |
CE3 | CZ3 | H19 | 119.1° | 120.1° |
CZ3 | CE3 | CD2 | 117.3° | 119.9° |
CZ3 | CE3 | H20 | 121.4° | 120.1° |
CD2 | CE3 | H20 | 121.3° | 120.0° |
O | C | OXT | 120.3° | 120.0° |
C | OXT | HXT | 90.0° | 117.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
CA | N | H | H2 | 120.0° | 123.9° |
N | CA | C | CB | 117.6° | 120.0° |
N | CA | C | HA | 122.1° | 120.0° |
N | CA | CB | HA | 122.1° | 120.0° |
N | CA | CB | CG | 116.2° | 61.8° |
N | CA | CB | H10 | 3.8° | 58.2° |
N | CA | CB | H10A | 123.8° | 178.2° |
N | CA | C | O | 50.8° | 20.0° |
N | CA | C | OXT | 88.3° | 160.0° |
H | N | CA | C | 180.0° | 67.4° |
H | N | CA | CB | 61.4° | 52.6° |
H | N | CA | HA | 58.9° | 172.6° |
C | CA | CB | HA | 121.2° | 120.0° |
C | CA | CB | CG | 127.2° | 178.2° |
C | CA | CB | H10 | 112.8° | 61.8° |
C | CA | CB | H10A | 7.2° | 58.2° |
CA | C | O | OXT | 133.3° | 180.0° |
C | CA | N | H2 | 60.0° | 168.7° |
CA | C | OXT | HXT | 90.0° | 180.0° |
CA | CB | CG | H10 | 120.0° | 120.0° |
CA | CB | CG | H10A | 120.0° | 120.0° |
CA | CB | H10 | H10A | 115.2° | 120.0° |
CA | CB | CG | CD1 | 59.7° | 169.5° |
CA | CB | CG | OG | 178.5° | 67.8° |
CA | CB | CG | CD2 | 54.0° | 54.8° |
CB | CA | C | O | 66.8° | 100.0° |
CB | CA | N | H2 | 178.6° | 71.3° |
CB | CA | C | OXT | 154.1° | 80.0° |
HA | CA | CB | CG | 6.0° | 58.2° |
HA | CA | CB | H10 | 126.0° | 178.2° |
HA | CA | CB | H10A | 114.0° | 61.8° |
HA | CA | C | O | 172.9° | 140.0° |
HA | CA | N | H2 | 61.1° | 48.7° |
HA | CA | C | OXT | 33.7° | 40.0° |
CG | CB | H10 | H10A | 115.2° | 120.0° |
CB | CG | CD1 | OG | 123.0° | 122.6° |
CB | CG | CD1 | CD2 | 121.1° | 118.7° |
CB | CG | OG | CD2 | 126.3° | 122.6° |
CB | CG | OG | HOG | 101.9° | 180.0° |
CB | CG | CD1 | OD1 | 59.3° | 61.3° |
CB | CG | CD1 | NE1 | 120.7° | 118.7° |
CB | CG | CD2 | CE2 | 119.1° | 118.6° |
CB | CG | CD2 | CE3 | 58.7° | 61.4° |
H10 | CB | CG | CD1 | 179.7° | 70.5° |
H10 | CB | CG | OG | 58.5° | 52.2° |
H10 | CB | CG | CD2 | 66.0° | 174.8° |
H10A | CB | CG | CD1 | 60.3° | 49.5° |
H10A | CB | CG | OG | 61.5° | 172.2° |
H10A | CB | CG | CD2 | 173.9° | 65.2° |
CD1 | CG | OG | CD2 | 109.7° | 114.7° |
CD1 | CG | OG | HOG | 22.1° | 57.3° |
CG | CD1 | OD1 | NE1 | 179.9° | 180.0° |
CG | CD1 | NE1 | CE2 | 0.8° | 0.0° |
CG | CD1 | NE1 | HNE1 | 179.3° | 180.0° |
CD1 | CG | CD2 | CE2 | 1.3° | 0.0° |
CD1 | CG | CD2 | CE3 | 179.1° | 180.0° |
OG | CG | CD1 | OD1 | 63.7° | 61.3° |
OG | CG | CD1 | NE1 | 116.2° | 118.7° |
OG | CG | CD2 | CE2 | 116.0° | 118.8° |
OG | CG | CD2 | CE3 | 66.1° | 61.2° |
CD2 | CG | OG | HOG | 131.8° | 57.4° |
CD2 | CG | CD1 | OD1 | 179.6° | 180.0° |
CD2 | CG | CD1 | NE1 | 0.4° | 0.0° |
CG | CD2 | CE2 | NE1 | 1.9° | 0.0° |
CG | CD2 | CE2 | CE3 | 178.1° | 180.0° |
CG | CD2 | CE2 | CZ2 | 179.7° | 180.0° |
CG | CD2 | CE3 | CZ3 | 179.5° | 180.0° |
CG | CD2 | CE3 | H20 | 0.5° | 0.0° |
OD1 | CD1 | NE1 | CE2 | 179.3° | 179.9° |
OD1 | CD1 | NE1 | HNE1 | 0.7° | 0.0° |
CD1 | NE1 | CE2 | HNE1 | 180.0° | 179.9° |
CD1 | NE1 | CE2 | CD2 | 1.7° | 0.0° |
CD1 | NE1 | CE2 | CZ2 | 179.4° | 180.0° |
NE1 | CE2 | CD2 | CZ2 | 177.8° | 179.9° |
NE1 | CE2 | CZ2 | CH2 | 179.5° | 179.9° |
NE1 | CE2 | CZ2 | H17 | 0.5° | 0.0° |
NE1 | CE2 | CD2 | CE3 | 180.0° | 179.9° |
HNE1 | NE1 | CE2 | CD2 | 178.3° | 180.0° |
HNE1 | NE1 | CE2 | CZ2 | 0.6° | 0.1° |
CD2 | CE2 | CZ2 | CH2 | 2.0° | 0.0° |
CD2 | CE2 | CZ2 | H17 | 178.0° | 179.9° |
CE2 | CD2 | CE3 | CZ3 | 1.9° | 0.0° |
CE2 | CD2 | CE3 | H20 | 178.1° | 180.0° |
CE2 | CZ2 | CH2 | H17 | 180.0° | 179.9° |
CE2 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 1.7° | 0.0° |
CE2 | CZ2 | CH2 | H18 | 178.3° | 180.0° |
CZ2 | CE2 | CD2 | CE3 | 2.1° | 0.0° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | H18 | 180.0° | 180.0° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | CE3 | 1.6° | 0.0° |
CZ2 | CH2 | CZ3 | H19 | 178.4° | 180.0° |
H17 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 178.3° | 179.9° |
H17 | CZ2 | CH2 | H18 | 1.7° | 0.0° |
CH2 | CZ3 | CE3 | H19 | 180.0° | 180.0° |
CH2 | CZ3 | CE3 | CD2 | 1.7° | 0.0° |
CH2 | CZ3 | CE3 | H20 | 178.4° | 180.0° |
H18 | CH2 | CZ3 | CE3 | 178.4° | 180.0° |
H18 | CH2 | CZ3 | H19 | 1.6° | 0.0° |
CZ3 | CE3 | CD2 | H20 | 180.0° | 180.0° |
H19 | CZ3 | CE3 | CD2 | 178.3° | 180.0° |
H19 | CZ3 | CE3 | H20 | 1.7° | 0.0° |
O | C | OXT | HXT | 90.0° | 0.0° |