PUF
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
O5 | C2 | sing | 1.44Å | 1.44Å | |
O5 | C5 | sing | 1.44Å | 1.44Å | |
C6 | C5 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
O2 | C2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C2 | C3 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
C5 | C4 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
C3 | C4 | sing | 1.55Å | 1.53Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | H11 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | H12 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H62 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H12A | sing | 1.09Å | 1.10Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | 110.9° | 109.5° |
O1 | C1 | H11 | 109.1° | 109.5° |
O1 | C1 | H12 | 109.1° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
C1 | C2 | O5 | 107.4° | 110.3° |
C1 | C2 | O2 | 110.0° | 110.4° |
C1 | C2 | C3 | 113.3° | 110.4° |
C2 | C1 | H11 | 109.1° | 109.5° |
C2 | C1 | H12 | 109.1° | 109.4° |
C2 | O5 | C5 | 111.1° | 105.3° |
O5 | C2 | O2 | 108.5° | 110.5° |
O5 | C2 | C3 | 107.3° | 104.8° |
O5 | C5 | C6 | 107.4° | 110.4° |
O5 | C5 | C4 | 106.9° | 104.8° |
O5 | C5 | H5 | 110.6° | 110.4° |
C6 | C5 | C4 | 113.1° | 110.3° |
C6 | C5 | H5 | 109.5° | 110.3° |
C5 | C6 | H61 | 109.5° | 109.5° |
C5 | C6 | H62 | 109.5° | 109.4° |
C5 | C6 | H12A | 109.4° | 109.5° |
O2 | C2 | C3 | 110.2° | 110.4° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C2 | C3 | C4 | 104.7° | 104.1° |
C2 | C3 | O3 | 109.3° | 110.5° |
C2 | C3 | H3 | 110.5° | 110.5° |
C5 | C4 | C3 | 104.4° | 104.1° |
C5 | C4 | O4 | 110.2° | 110.5° |
C5 | C4 | H4 | 110.0° | 110.7° |
C4 | C5 | H5 | 109.3° | 110.4° |
C4 | C3 | O3 | 109.4° | 110.5° |
C3 | C4 | O4 | 110.1° | 110.5° |
C4 | C3 | H3 | 110.6° | 110.5° |
C3 | C4 | H4 | 110.1° | 110.5° |
O3 | C3 | H3 | 112.2° | 110.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
O4 | C4 | H4 | 111.7° | 110.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
H11 | C1 | H12 | 109.5° | 109.4° |
H61 | C6 | H62 | 109.4° | 109.5° |
H61 | C6 | H12A | 109.5° | 109.5° |
H62 | C6 | H12A | 109.5° | 109.4° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | H11 | 120.2° | 120.1° |
O1 | C1 | C2 | H12 | 120.2° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | O5 | 177.2° | 64.6° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 64.9° | 57.7° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 58.9° | 180.0° |
O1 | C1 | H11 | H12 | 119.4° | 120.0° |
C1 | C2 | O5 | O2 | 118.8° | 122.3° |
C1 | C2 | O5 | C3 | 122.1° | 118.8° |
C1 | C2 | O5 | C5 | 117.0° | 159.4° |
C1 | C2 | O2 | C3 | 125.6° | 122.3° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 100.3° | 142.8° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 142.7° | 98.6° |
C2 | C1 | H11 | H12 | 119.4° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 59.2° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 18.8° | 24.2° |
C2 | O5 | C5 | C6 | 131.7° | 159.4° |
O5 | C2 | O2 | C3 | 117.2° | 115.4° |
C2 | O5 | C5 | C4 | 10.1° | 40.5° |
O5 | C2 | C3 | C4 | 18.1° | 24.0° |
O5 | C2 | C3 | O3 | 99.0° | 142.6° |
O5 | C2 | C1 | H11 | 62.6° | 55.4° |
O5 | C2 | C1 | H12 | 57.0° | 175.4° |
O5 | C2 | O2 | HO2 | 62.8° | 63.1° |
O5 | C2 | C3 | H3 | 137.1° | 94.6° |
C2 | O5 | C5 | H5 | 108.8° | 78.3° |
O5 | C5 | C6 | C4 | 117.6° | 115.4° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 120.2° | 122.3° |
C5 | O5 | C2 | O2 | 124.2° | 78.3° |
C5 | O5 | C2 | C3 | 5.1° | 40.5° |
O5 | C5 | C4 | H5 | 119.7° | 118.9° |
O5 | C5 | C4 | C3 | 21.0° | 24.0° |
O5 | C5 | C4 | O4 | 139.2° | 142.6° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 97.2° | 94.7° |
O5 | C5 | C6 | H61 | 180.0° | 175.5° |
O5 | C5 | C6 | H62 | 60.0° | 64.6° |
O5 | C5 | C6 | H12A | 60.0° | 55.4° |
C6 | C5 | C4 | H5 | 122.3° | 122.2° |
C6 | C5 | C4 | C3 | 138.9° | 142.9° |
C6 | C5 | C4 | O4 | 102.8° | 98.5° |
C6 | C5 | C4 | H4 | 20.8° | 24.2° |
C5 | C6 | H61 | H62 | 120.0° | 119.9° |
C5 | C6 | H61 | H12A | 120.0° | 120.1° |
C5 | C6 | H62 | H12A | 120.0° | 120.0° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 136.1° | 94.9° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 19.0° | 23.7° |
O2 | C2 | C1 | H11 | 55.3° | 177.8° |
O2 | C2 | C1 | H12 | 174.9° | 62.3° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 104.9° | 146.4° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 23.5° | 0.0° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 117.0° | 118.6° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 119.0° | 118.6° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 122.9° | 122.7° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 141.8° | 118.6° |
C3 | C2 | C1 | H11 | 179.1° | 59.9° |
C3 | C2 | C1 | H12 | 61.3° | 60.0° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 54.4° | 178.5° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 180.0° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 94.7° | 118.8° |
C5 | C4 | C3 | O4 | 118.3° | 118.6° |
C5 | C4 | C3 | H4 | 118.1° | 118.8° |
C5 | C4 | C3 | O3 | 93.5° | 118.6° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 122.6° | 122.8° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 142.5° | 118.6° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 65.4° |
C4 | C5 | C6 | H61 | 62.4° | 60.1° |
C4 | C5 | C6 | H62 | 177.6° | 180.0° |
C4 | C5 | C6 | H12A | 57.7° | 60.0° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 123.1° | 122.7° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 122.7° | 122.6° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 66.0° | 65.4° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 65.3° | 180.0° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 98.8° | 94.9° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 24.8° | 0.0° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 148.4° | 122.6° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 99.2° | 122.8° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 19.5° | 23.8° |
H11 | C1 | O1 | HO1 | 59.8° | 59.9° |
H12 | C1 | O1 | HO1 | 59.8° | 60.0° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 57.1° | 57.3° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 24.4° | 0.2° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 57.4° | 57.4° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 143.1° | 146.4° |
H5 | C5 | C6 | H61 | 59.8° | 62.2° |
H5 | C5 | C6 | H62 | 60.2° | 57.7° |
H5 | C5 | C6 | H12A | 179.8° | 177.7° |
H61 | C6 | H62 | H12A | 120.0° | 120.1° |