English 日本語简体中文繁體中文 한국어

✖

Menu

RCSB PDB PDBe BMRB Adv. Search Search help

Summary Geometry Related PDB entries

Obsolete: O4M

Bonds

First atom	Second atom	Bond order type	Distance (experimental model)	Distance (ideal model)	Properties
MN	O4	sing	0.00Å	2.01Å
MN	O3	sing	0.00Å	2.00Å
MN	O2	sing	0.00Å	2.00Å
MN	O1	sing	0.00Å	2.00Å
O4	HO41	sing	0.00Å	0.95Å
O4	HO42	sing	0.00Å	0.95Å
O3	HO31	sing	0.00Å	0.95Å
O3	HO32	sing	0.00Å	0.95Å
O2	HO21	sing	0.00Å	0.95Å
O2	HO22	sing	0.00Å	0.95Å
O1	HO11	sing	0.00Å	0.95Å
O1	HO12	sing	0.00Å	0.95Å

Angles

First atom	Second atom	Third atom	Angle (experimental model)	Angle (ideal model)
O4	MN	O3	90.2°	90.0°
O4	MN	O2	89.6°	90.0°
O4	MN	O1	89.9°	90.0°
MN	O4	HO41	90.2°	90.0°
MN	O4	HO42	116.5°	90.0°
O3	MN	O2	90.1°	90.0°
O3	MN	O1	89.5°	90.0°
MN	O3	HO31	90.2°	90.0°
MN	O3	HO32	116.5°	90.0°
O2	MN	O1	179.3°	90.0°
MN	O2	HO21	89.6°	90.0°
MN	O2	HO22	116.8°	90.0°
MN	O1	HO11	89.9°	90.0°
MN	O1	HO12	116.6°	90.0°
HO41	O4	HO42	116.5°	90.0°
HO31	O3	HO32	116.5°	90.0°
HO21	O2	HO22	116.7°	90.0°
HO11	O1	HO12	116.6°	90.0°

Dihedrals

First atom	Second atom	Third atom	Fourth atom	Torsion (experimental model)	Torsion (ideal model)
O4	MN	O3	O2	89.6°	90.0°
O4	MN	O3	O1	89.9°	90.0°
O4	MN	O2	O1	32.7°	90.0°
MN	O4	HO41	HO42	120.0°	90.0°
O4	MN	O3	HO31	180.0°	90.0°
O4	MN	O3	HO32	60.0°	90.0°
O4	MN	O2	HO21	180.0°	90.0°
O4	MN	O2	HO22	60.0°	90.0°
O4	MN	O1	HO11	180.0°	90.0°
O4	MN	O1	HO12	60.0°	90.0°
O3	MN	O2	O1	57.5°	90.0°
O3	MN	O4	HO41	180.0°	90.0°
O3	MN	O4	HO42	60.0°	90.0°
MN	O3	HO31	HO32	120.0°	90.0°
O3	MN	O2	HO21	89.8°	90.0°
O3	MN	O2	HO22	150.2°	90.0°
O3	MN	O1	HO11	89.8°	90.0°
O3	MN	O1	HO12	30.2°	90.0°
O2	MN	O4	HO41	89.9°	90.0°
O2	MN	O4	HO42	150.1°	90.0°
O2	MN	O3	HO31	90.4°	90.0°
O2	MN	O3	HO32	29.6°	90.0°
MN	O2	HO21	HO22	120.0°	90.0°
O2	MN	O1	HO11	147.3°	90.0°
O2	MN	O1	HO12	27.3°	90.0°
O1	MN	O4	HO41	90.5°	90.0°
O1	MN	O4	HO42	29.5°	90.0°
O1	MN	O3	HO31	90.1°	90.0°
O1	MN	O3	HO32	149.9°	90.0°
O1	MN	O2	HO21	147.3°	90.0°
O1	MN	O2	HO22	92.7°	90.0°
MN	O1	HO11	HO12	120.0°	90.0°

222415

PDB entries from 2024-07-10

PDB statistics

PDBj update info

Contact PDBj

numon