MDN
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| O3 | P1 | sing | 1.61Å | 1.59Å | |
| O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| P1 | O1 | doub | 1.48Å | 1.46Å | |
| P1 | O2 | sing | 1.61Å | 1.63Å | |
| P1 | C4 | sing | 1.82Å | 1.48Å | |
| O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| C4 | P5 | sing | 1.82Å | 1.61Å | |
| C4 | H41 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| C4 | H42 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| P5 | O6 | doub | 1.48Å | 1.58Å | |
| P5 | O7 | sing | 1.61Å | 1.45Å | |
| P5 | O8 | sing | 1.61Å | 1.49Å | |
| O7 | HO7 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| O8 | HO8 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| P1 | O3 | HO3 | 110.0° | 106.8° |
| O3 | P1 | O1 | 109.9° | 109.5° |
| O3 | P1 | O2 | 99.8° | 109.5° |
| O3 | P1 | C4 | 91.0° | 109.5° |
| O1 | P1 | O2 | 121.6° | 109.5° |
| O1 | P1 | C4 | 116.2° | 109.5° |
| O2 | P1 | C4 | 112.1° | 109.5° |
| P1 | O2 | HO2 | 99.8° | 106.8° |
| P1 | C4 | P5 | 128.8° | 109.4° |
| P1 | C4 | H41 | 105.5° | 109.5° |
| P1 | C4 | H42 | 105.5° | 109.5° |
| P5 | C4 | H41 | 105.5° | 109.5° |
| P5 | C4 | H42 | 105.5° | 109.5° |
| C4 | P5 | O6 | 111.2° | 109.5° |
| C4 | P5 | O7 | 103.8° | 109.5° |
| C4 | P5 | O8 | 98.8° | 109.5° |
| H41 | C4 | H42 | 103.7° | 109.4° |
| O6 | P5 | O7 | 115.6° | 109.5° |
| O6 | P5 | O8 | 111.7° | 109.5° |
| O7 | P5 | O8 | 114.1° | 109.5° |
| P5 | O7 | HO7 | 103.8° | 106.8° |
| P5 | O8 | HO8 | 98.9° | 106.8° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| O3 | P1 | O1 | O2 | 115.8° | 120.0° |
| O3 | P1 | O1 | C4 | 101.5° | 120.0° |
| O3 | P1 | O2 | C4 | 95.1° | 120.0° |
| O3 | P1 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
| O3 | P1 | C4 | P5 | 126.8° | 180.0° |
| O3 | P1 | C4 | H41 | 107.8° | 60.0° |
| O3 | P1 | C4 | H42 | 1.5° | 60.0° |
| HO3 | O3 | P1 | O1 | 180.0° | 60.0° |
| HO3 | O3 | P1 | O2 | 51.2° | 60.0° |
| HO3 | O3 | P1 | C4 | 61.5° | 180.0° |
| O1 | P1 | O2 | C4 | 144.1° | 120.0° |
| O1 | P1 | O2 | HO2 | 59.3° | 180.0° |
| O1 | P1 | C4 | P5 | 120.3° | 60.0° |
| O1 | P1 | C4 | H41 | 5.0° | 60.0° |
| O1 | P1 | C4 | H42 | 114.4° | 179.9° |
| O2 | P1 | C4 | P5 | 25.8° | 60.0° |
| O2 | P1 | C4 | H41 | 151.2° | 180.0° |
| O2 | P1 | C4 | H42 | 99.5° | 60.0° |
| C4 | P1 | O2 | HO2 | 84.9° | 60.0° |
| P1 | C4 | P5 | H41 | 125.3° | 120.0° |
| P1 | C4 | P5 | H42 | 125.3° | 120.0° |
| P1 | C4 | H41 | H42 | 110.7° | 120.0° |
| P1 | C4 | P5 | O6 | 20.1° | 60.0° |
| P1 | C4 | P5 | O7 | 104.8° | 180.0° |
| P1 | C4 | P5 | O8 | 137.6° | 60.0° |
| P5 | C4 | H41 | H42 | 110.6° | 120.0° |
| C4 | P5 | O6 | O7 | 118.0° | 120.0° |
| C4 | P5 | O6 | O8 | 109.4° | 120.0° |
| C4 | P5 | O7 | O8 | 106.4° | 120.0° |
| C4 | P5 | O7 | HO7 | 179.9° | 180.0° |
| C4 | P5 | O8 | HO8 | 180.0° | 60.0° |
| H41 | C4 | P5 | O6 | 145.4° | 60.0° |
| H41 | C4 | P5 | O7 | 20.6° | 60.0° |
| H41 | C4 | P5 | O8 | 97.1° | 180.0° |
| H42 | C4 | P5 | O6 | 105.2° | 179.9° |
| H42 | C4 | P5 | O7 | 129.9° | 60.0° |
| H42 | C4 | P5 | O8 | 12.3° | 60.0° |
| O6 | P5 | O7 | O8 | 131.6° | 120.0° |
| O6 | P5 | O7 | HO7 | 58.1° | 60.0° |
| O6 | P5 | O8 | HO8 | 62.9° | 180.0° |
| O7 | P5 | O8 | HO8 | 70.5° | 60.0° |
| O8 | P5 | O7 | HO7 | 73.5° | 60.0° |
