J8W
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| N | CA | sing | 1.47Å | 1.46Å | |
| O | C | doub | 1.21Å | 1.22Å | |
| CA | C | sing | 1.51Å | 1.54Å | |
| CA | CB | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
| CB | OG | sing | 1.45Å | 1.44Å | |
| OG | C2 | sing | 1.34Å | 1.47Å | |
| C2 | O7 | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
| C2 | C1 | sing | 1.51Å | 1.50Å | |
| O9 | C3 | doub | 1.21Å | 1.27Å | |
| C3 | C1 | sing | 1.51Å | 1.51Å | |
| C3 | O8 | sing | 1.34Å | 1.24Å | |
| N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
| CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| CB | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| CB | H6 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C1 | H8 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C1 | H9 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| O8 | H10 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| C | OXT | sing | 1.34Å | 1.34Å | |
| OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| N | CA | C | 109.6° | 109.4° |
| N | CA | CB | 108.2° | 109.5° |
| CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
| CA | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
| N | CA | HA | 107.5° | 109.5° |
| O | C | CA | 119.8° | 120.0° |
| O | C | OXT | 122.6° | 120.0° |
| C | CA | CB | 117.9° | 109.5° |
| C | CA | HA | 106.6° | 109.5° |
| CA | C | OXT | 117.6° | 119.9° |
| CA | CB | OG | 112.7° | 109.5° |
| CB | CA | HA | 106.6° | 109.5° |
| CA | CB | H5 | 108.7° | 109.5° |
| CA | CB | H6 | 108.7° | 109.5° |
| CB | OG | C2 | 131.1° | 117.0° |
| OG | CB | H5 | 108.7° | 109.4° |
| OG | CB | H6 | 108.6° | 109.4° |
| OG | C2 | O7 | 122.0° | 120.0° |
| OG | C2 | C1 | 116.1° | 120.0° |
| O7 | C2 | C1 | 121.7° | 120.0° |
| C2 | C1 | C3 | 108.8° | 109.5° |
| C2 | C1 | H8 | 109.6° | 109.4° |
| C2 | C1 | H9 | 109.6° | 109.5° |
| O9 | C3 | C1 | 123.1° | 120.0° |
| O9 | C3 | O8 | 118.0° | 120.0° |
| C1 | C3 | O8 | 118.7° | 120.0° |
| C3 | C1 | H8 | 109.6° | 109.5° |
| C3 | C1 | H9 | 109.6° | 109.5° |
| C3 | O8 | H10 | 109.5° | 117.0° |
| H | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
| H5 | CB | H6 | 109.5° | 109.5° |
| H8 | C1 | H9 | 109.5° | 109.5° |
| C | OXT | HXT | 109.5° | 117.0° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| N | CA | C | O | 73.1° | 20.0° |
| N | CA | C | CB | 124.3° | 120.0° |
| N | CA | C | HA | 116.1° | 120.0° |
| N | CA | CB | HA | 115.4° | 120.0° |
| N | CA | CB | OG | 121.7° | 65.0° |
| CA | N | H | H2 | 120.0° | 123.9° |
| N | CA | CB | H5 | 117.8° | 55.0° |
| N | CA | CB | H6 | 1.2° | 175.0° |
| N | CA | C | OXT | 103.8° | 160.0° |
| O | C | CA | OXT | 176.8° | 180.0° |
| O | C | CA | CB | 162.7° | 100.0° |
| O | C | CA | HA | 43.0° | 140.0° |
| O | C | OXT | HXT | 0.0° | 0.0° |
| C | CA | CB | HA | 119.7° | 120.0° |
| C | CA | CB | OG | 3.2° | 175.0° |
| C | CA | N | H | 180.0° | 60.0° |
| C | CA | N | H2 | 60.0° | 176.1° |
| C | CA | CB | H5 | 117.2° | 65.0° |
| C | CA | CB | H6 | 123.7° | 55.0° |
| CA | C | OXT | HXT | 176.7° | 180.0° |
| CA | CB | OG | H5 | 120.5° | 120.0° |
| CA | CB | OG | H6 | 120.5° | 120.0° |
| CA | CB | OG | C2 | 169.8° | 180.0° |
| CB | CA | N | H | 50.3° | 60.0° |
| CB | CA | N | H2 | 170.3° | 64.0° |
| CA | CB | H5 | H6 | 118.5° | 120.1° |
| CB | CA | C | OXT | 20.5° | 80.0° |
| CB | OG | C2 | O7 | 99.5° | 0.0° |
| CB | OG | C2 | C1 | 85.3° | 180.0° |
| OG | CB | CA | HA | 122.9° | 55.0° |
| OG | CB | H5 | H6 | 118.5° | 119.9° |
| OG | C2 | O7 | C1 | 174.9° | 180.0° |
| OG | C2 | C1 | C3 | 41.6° | 180.0° |
| C2 | OG | CB | H5 | 49.3° | 60.0° |
| C2 | OG | CB | H6 | 69.7° | 59.9° |
| OG | C2 | C1 | H8 | 78.3° | 60.0° |
| OG | C2 | C1 | H9 | 161.5° | 59.9° |
| O7 | C2 | C1 | C3 | 133.6° | 0.0° |
| O7 | C2 | C1 | H8 | 106.5° | 120.0° |
| O7 | C2 | C1 | H9 | 13.7° | 120.1° |
| C2 | C1 | C3 | O9 | 107.1° | 0.0° |
| C2 | C1 | C3 | H8 | 119.9° | 120.0° |
| C2 | C1 | C3 | H9 | 119.9° | 120.0° |
| C2 | C1 | C3 | O8 | 68.8° | 180.0° |
| C2 | C1 | H8 | H9 | 120.3° | 120.0° |
| O9 | C3 | C1 | O8 | 175.9° | 180.0° |
| O9 | C3 | C1 | H8 | 12.8° | 120.0° |
| O9 | C3 | C1 | H9 | 133.0° | 120.0° |
| O9 | C3 | O8 | H10 | 0.0° | 0.1° |
| C3 | C1 | H8 | H9 | 120.3° | 120.0° |
| C1 | C3 | O8 | H10 | 176.1° | 180.0° |
| O8 | C3 | C1 | H8 | 171.3° | 60.0° |
| O8 | C3 | C1 | H9 | 51.1° | 60.0° |
| H | N | CA | HA | 64.5° | 180.0° |
| H2 | N | CA | HA | 55.6° | 56.0° |
| HA | CA | CB | H5 | 2.4° | 175.0° |
| HA | CA | CB | H6 | 116.6° | 65.0° |
| HA | CA | C | OXT | 140.1° | 40.0° |
