English 日本語简体中文繁體中文 한국어

✖

Menu

RCSB PDB PDBe BMRB Adv. Search Search help

Summary Geometry Related PDB entries

J7N

Bonds

First atom	Second atom	Bond order type	Distance (experimental model)	Distance (ideal model)	Properties
O1	MO1	sing	2.00Å	2.10Å
MO1	O3	sing	2.01Å	2.22Å
MO1	O2	sing	2.01Å	2.32Å
O3	MO2	sing	2.01Å	2.21Å
O4	MO2	sing	2.00Å	1.80Å
MO2	O2	sing	2.01Å	2.30Å
MO2	O5	sing	2.00Å	2.10Å
O1	H1	sing	0.97Å	0.95Å
O4	H2	sing	0.97Å	0.95Å
O5	H3	sing	0.97Å	0.95Å

Angles

First atom	Second atom	Third atom	Angle (experimental model)	Angle (ideal model)
O1	MO1	O3	92.9°	109.5°
O1	MO1	O2	138.5°	109.5°
MO1	O1	H1	109.5°	114.0°
O3	MO1	O2	72.7°	86.8°
MO1	O3	MO2	110.3°	86.8°
MO1	O2	MO2	103.7°	86.8°
O3	MO2	O4	92.3°	90.0°
O3	MO2	O2	73.2°	86.8°
O3	MO2	O5	94.2°	90.0°
O4	MO2	O2	91.0°	90.0°
O4	MO2	O5	173.4°	180.0°
MO2	O4	H2	109.5°	114.0°
O2	MO2	O5	91.8°	90.0°
MO2	O5	H3	109.5°	114.0°

Dihedrals

First atom	Second atom	Third atom	Fourth atom	Torsion (experimental model)	Torsion (ideal model)
O1	MO1	O3	O2	140.4°	109.5°
O1	MO1	O3	MO2	139.9°	82.8°
O1	MO1	O2	MO2	73.8°	82.9°
MO1	O3	MO2	O4	90.0°	63.3°
O3	MO1	O2	MO2	0.4°	26.7°
MO1	O3	MO2	O5	91.1°	116.7°
O3	MO1	O1	H1	0.0°	180.0°
MO1	O2	MO2	O4	91.7°	63.3°
MO1	O2	MO2	O5	94.3°	116.7°
O2	MO1	O1	H1	66.9°	86.4°
O3	MO2	O4	O2	73.3°	86.8°
O3	MO2	O4	O5	171.3°	44.0°
O3	MO2	O2	O5	93.9°	90.0°
O3	MO2	O4	H2	180.0°	93.2°
O3	MO2	O5	H3	180.0°	93.3°
O4	MO2	O2	O5	174.0°	180.0°
O4	MO2	O5	H3	8.7°	136.3°
O2	MO2	O4	H2	106.7°	180.0°
O2	MO2	O5	H3	106.7°	180.0°
O5	MO2	O4	H2	8.7°	132.2°

248636

PDB entries from 2026-02-04

PDB statistics

PDBj update info

Contact PDBj

numon