IPD
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C1 | C6 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.46Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | C6 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | O6 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C6 | H6 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
P1 | O1 | sing | 1.61Å | 1.57Å | |
P1 | O7 | doub | 1.57Å | 1.47Å | |
P1 | O8 | sing | 1.57Å | 1.49Å | |
P1 | O9 | sing | 1.57Å | 1.49Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O5 | HO5 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C2 | C1 | C6 | 108.2° | 109.5° |
C2 | C1 | O1 | 107.1° | 109.5° |
C2 | C1 | H1 | 110.4° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 108.4° | 109.5° |
C1 | C2 | O2 | 109.7° | 109.5° |
C1 | C2 | H2 | 108.9° | 109.5° |
C6 | C1 | O1 | 109.3° | 109.5° |
C6 | C1 | H1 | 110.3° | 109.4° |
C1 | C6 | C5 | 112.2° | 109.5° |
C1 | C6 | O6 | 108.7° | 109.5° |
C1 | C6 | H6 | 108.1° | 109.4° |
O1 | C1 | H1 | 111.4° | 109.5° |
C1 | O1 | P1 | 123.1° | 123.0° |
C3 | C2 | O2 | 110.9° | 109.5° |
C3 | C2 | H2 | 108.8° | 109.5° |
C2 | C3 | C4 | 110.5° | 109.5° |
C2 | C3 | O3 | 108.9° | 109.5° |
C2 | C3 | H3 | 108.9° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 110.0° | 109.4° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C3 | O3 | 108.9° | 109.5° |
C4 | C3 | H3 | 109.0° | 109.5° |
C3 | C4 | C5 | 109.7° | 109.5° |
C3 | C4 | O4 | 110.5° | 109.5° |
C3 | C4 | H4 | 108.5° | 109.4° |
O3 | C3 | H3 | 110.6° | 109.4° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
C5 | C4 | O4 | 109.6° | 109.5° |
C5 | C4 | H4 | 108.6° | 109.5° |
C4 | C5 | C6 | 109.0° | 109.5° |
C4 | C5 | O5 | 108.3° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 109.6° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 109.9° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
C6 | C5 | O5 | 109.4° | 109.4° |
C6 | C5 | H5 | 109.6° | 109.4° |
C5 | C6 | O6 | 110.0° | 109.5° |
C5 | C6 | H6 | 108.1° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 110.9° | 109.5° |
C5 | O5 | HO5 | 109.5° | 114.0° |
O6 | C6 | H6 | 109.6° | 109.5° |
C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 114.0° |
O1 | P1 | O7 | 109.1° | 109.5° |
O1 | P1 | O8 | 108.0° | 109.5° |
O1 | P1 | O9 | 106.5° | 109.4° |
O7 | P1 | O8 | 113.7° | 109.5° |
O7 | P1 | O9 | 113.8° | 109.4° |
O8 | P1 | O9 | 105.4° | 109.5° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
C2 | C1 | C6 | O1 | 116.4° | 120.1° |
C2 | C1 | C6 | H1 | 120.8° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | H1 | 120.8° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 120.5° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 118.3° | 120.0° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 119.8° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 62.0° | 60.0° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 178.3° | 180.0° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 57.7° | 60.0° |
C2 | C1 | C6 | C5 | 60.1° | 60.0° |
C2 | C1 | C6 | O6 | 178.0° | 180.0° |
C2 | C1 | C6 | H6 | 59.0° | 60.0° |
C2 | C1 | O1 | P1 | 122.1° | 119.9° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 180.0° |
C6 | C1 | O1 | H1 | 122.1° | 120.0° |
C6 | C1 | C2 | C3 | 60.6° | 60.0° |
C6 | C1 | C2 | O2 | 60.7° | 60.0° |
C6 | C1 | C2 | H2 | 178.9° | 180.0° |
C1 | C6 | C5 | C4 | 57.8° | 60.0° |
C1 | C6 | C5 | O6 | 121.2° | 120.0° |
C1 | C6 | C5 | H6 | 119.1° | 120.0° |
C1 | C6 | C5 | O5 | 176.1° | 180.0° |
C1 | C6 | C5 | H5 | 62.1° | 60.0° |
C1 | C6 | O6 | H6 | 118.0° | 120.0° |
C6 | C1 | O1 | P1 | 120.8° | 120.0° |
C1 | C6 | O6 | HO6 | 180.0° | 180.0° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 178.4° | 180.0° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 57.1° | 60.0° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 63.4° | 60.0° |
O1 | C1 | C6 | C5 | 176.5° | 180.0° |
O1 | C1 | C6 | O6 | 61.6° | 60.0° |
O1 | C1 | C6 | H6 | 57.4° | 60.0° |
C1 | O1 | P1 | O7 | 177.2° | 55.1° |
C1 | O1 | P1 | O8 | 53.2° | 65.0° |
C1 | O1 | P1 | O9 | 59.6° | 175.0° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 60.2° | 60.0° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 178.5° | 180.0° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 58.1° | 60.1° |
H1 | C1 | C6 | C5 | 60.7° | 60.0° |
H1 | C1 | C6 | O6 | 61.2° | 60.0° |
H1 | C1 | C6 | H6 | 179.8° | 180.0° |
H1 | C1 | O1 | P1 | 1.3° | 0.1° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 120.4° | 120.0° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 119.6° | 120.0° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 119.7° | 120.0° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 119.7° | 120.0° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 60.0° | 60.0° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 179.0° | 180.0° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 58.5° | 60.0° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 60.3° | 60.0° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 179.9° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 58.5° | 60.0° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 61.2° | 60.0° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 178.2° | 180.0° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 179.6° | 180.0° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 60.0° | 60.0° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 60.7° | 60.0° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 60.2° | 60.0° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 119.7° | 120.0° |
C3 | C4 | C5 | O4 | 121.5° | 120.0° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 118.5° | 120.0° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 119.8° | 120.0° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 56.3° | 60.0° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 175.3° | 180.0° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 63.6° | 60.0° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 59.4° | 60.0° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 180.0° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 179.6° | 180.0° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 59.4° | 60.0° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 61.1° | 60.0° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 59.7° | 60.0° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 61.3° | 60.0° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 178.2° | 180.0° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 60.3° | 60.1° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 119.2° | 120.0° |
C4 | C5 | C6 | O5 | 118.3° | 120.0° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 119.9° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 120.3° | 120.1° |
C4 | C5 | C6 | O6 | 179.0° | 180.0° |
C4 | C5 | C6 | H6 | 61.3° | 60.0° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 59.0° | 60.0° |
C4 | C5 | O5 | HO5 | 180.0° | 60.0° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 177.8° | 180.0° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 63.2° | 60.0° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 57.9° | 60.0° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 62.1° | 60.0° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 56.9° | 60.0° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 177.9° | 180.0° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 60.3° | 60.0° |
C6 | C5 | O5 | H5 | 121.0° | 119.9° |
C5 | C6 | O6 | H6 | 118.8° | 120.0° |
C6 | C5 | O5 | HO5 | 61.3° | 180.0° |
C5 | C6 | O6 | HO6 | 56.8° | 60.0° |
O5 | C5 | C6 | O6 | 62.8° | 60.0° |
O5 | C5 | C6 | H6 | 56.9° | 60.0° |
H5 | C5 | C6 | O6 | 59.0° | 59.9° |
H5 | C5 | C6 | H6 | 178.7° | 180.0° |
H5 | C5 | O5 | HO5 | 59.7° | 60.0° |
H6 | C6 | O6 | HO6 | 61.9° | 60.1° |
O1 | P1 | O7 | O8 | 120.6° | 120.0° |
O1 | P1 | O7 | O9 | 118.7° | 119.9° |
O1 | P1 | O8 | O9 | 113.5° | 120.0° |
O7 | P1 | O8 | O9 | 125.3° | 120.0° |