IGP
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| C1 | OP4 | sing | 1.43Å | 1.28Å | |
| C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
| C1 | H11 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| C1 | H12 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| P | OP1 | sing | 1.61Å | 1.44Å | |
| P | OP2 | sing | 1.61Å | 1.46Å | |
| P | OP3 | doub | 1.48Å | 1.47Å | |
| P | OP4 | sing | 1.61Å | 1.52Å | |
| OP1 | HOP1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| OP2 | HOP2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.46Å | |
| C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.49Å | |
| C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
| C3 | CG | sing | 1.51Å | 1.49Å | |
| C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| CG | CD2 | sing | 1.46Å | 1.43Å | Aromatic |
| CG | CD1 | doub | 1.34Å | 1.36Å | Aromatic |
| CD2 | CE2 | doub | 1.41Å | 1.43Å | Aromatic |
| CD2 | CE3 | sing | 1.40Å | 1.43Å | Aromatic |
| CE2 | NE1 | sing | 1.38Å | 1.39Å | Aromatic |
| CE2 | CZ2 | sing | 1.39Å | 1.42Å | Aromatic |
| CE3 | CZ3 | doub | 1.37Å | 1.41Å | Aromatic |
| CE3 | HE3 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| CD1 | NE1 | sing | 1.37Å | 1.39Å | Aromatic |
| CD1 | HD1 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| NE1 | HN1 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
| CZ2 | CH2 | doub | 1.38Å | 1.38Å | Aromatic |
| CZ2 | HZ2 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| CZ3 | CH2 | sing | 1.39Å | 1.44Å | Aromatic |
| CZ3 | HZ3 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| CH2 | HH2 | sing | 1.08Å | 1.10Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| OP4 | C1 | C2 | 120.9° | 109.5° |
| OP4 | C1 | H11 | 108.1° | 109.4° |
| OP4 | C1 | H12 | 108.1° | 109.5° |
| C1 | OP4 | P | 125.4° | 106.8° |
| C2 | C1 | H11 | 108.1° | 109.5° |
| C2 | C1 | H12 | 108.1° | 109.4° |
| C1 | C2 | O2 | 109.2° | 109.4° |
| C1 | C2 | C3 | 115.9° | 109.5° |
| C1 | C2 | H2 | 107.9° | 109.4° |
| H11 | C1 | H12 | 101.7° | 109.4° |
| OP1 | P | OP2 | 113.2° | 109.5° |
| OP1 | P | OP3 | 108.8° | 109.5° |
| OP1 | P | OP4 | 107.0° | 109.5° |
| P | OP1 | HOP1 | 113.2° | 106.8° |
| OP2 | P | OP3 | 113.8° | 109.5° |
| OP2 | P | OP4 | 105.0° | 109.4° |
| P | OP2 | HOP2 | 113.2° | 106.9° |
| OP3 | P | OP4 | 108.6° | 109.5° |
| O2 | C2 | C3 | 116.3° | 109.5° |
| O2 | C2 | H2 | 107.4° | 109.5° |
| C2 | O2 | HO2 | 109.2° | 106.9° |
| C3 | C2 | H2 | 99.1° | 109.5° |
| C2 | C3 | O3 | 87.5° | 109.5° |
| C2 | C3 | CG | 120.4° | 109.5° |
| C2 | C3 | H3 | 113.6° | 109.4° |
| O3 | C3 | CG | 98.1° | 109.5° |
| O3 | C3 | H3 | 132.4° | 109.5° |
| C3 | O3 | HO3 | 87.4° | 106.8° |
| CG | C3 | H3 | 105.3° | 109.5° |
| C3 | CG | CD2 | 130.8° | 126.6° |
| C3 | CG | CD1 | 120.7° | 126.5° |
| CD2 | CG | CD1 | 107.9° | 107.0° |
| CG | CD2 | CE2 | 106.4° | 106.1° |
| CG | CD2 | CE3 | 136.6° | 134.0° |
| CG | CD1 | NE1 | 109.6° | 110.0° |
| CG | CD1 | HD1 | 124.2° | 125.1° |
| CE2 | CD2 | CE3 | 116.9° | 119.9° |
| CD2 | CE2 | NE1 | 107.2° | 107.2° |
| CD2 | CE2 | CZ2 | 124.4° | 119.4° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | 119.3° | 119.7° |
| CD2 | CE3 | HE3 | 121.1° | 120.1° |
| NE1 | CE2 | CZ2 | 128.3° | 133.5° |
| CE2 | NE1 | CD1 | 108.7° | 109.8° |
| CE2 | NE1 | HN1 | 125.5° | 125.1° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | 117.0° | 119.8° |
| CE2 | CZ2 | HZ2 | 122.8° | 120.2° |
| CZ3 | CE3 | HE3 | 119.6° | 120.2° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | 121.2° | 120.6° |
| CE3 | CZ3 | HZ3 | 118.2° | 119.7° |
| NE1 | CD1 | HD1 | 126.2° | 125.0° |
| CD1 | NE1 | HN1 | 125.8° | 125.1° |
| CH2 | CZ2 | HZ2 | 120.2° | 120.0° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | 121.0° | 120.6° |
| CZ2 | CH2 | HH2 | 117.2° | 119.7° |
| CH2 | CZ3 | HZ3 | 120.6° | 119.7° |
| CZ3 | CH2 | HH2 | 121.8° | 119.6° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| OP4 | C1 | C2 | H11 | 125.3° | 120.0° |
| OP4 | C1 | C2 | H12 | 125.3° | 120.1° |
| OP4 | C1 | H11 | H12 | 113.7° | 120.0° |
| C1 | OP4 | P | OP1 | 70.1° | 180.0° |
| C1 | OP4 | P | OP2 | 169.3° | 60.1° |
| C1 | OP4 | P | OP3 | 47.2° | 60.0° |
| OP4 | C1 | C2 | O2 | 102.8° | 60.0° |
| OP4 | C1 | C2 | C3 | 30.9° | 180.0° |
| OP4 | C1 | C2 | H2 | 140.8° | 60.0° |
| C2 | C1 | H11 | H12 | 113.7° | 119.9° |
| C2 | C1 | OP4 | P | 169.5° | 180.0° |
| C1 | C2 | O2 | C3 | 133.5° | 120.0° |
| C1 | C2 | O2 | H2 | 116.7° | 119.9° |
| C1 | C2 | C3 | H2 | 115.0° | 120.0° |
| C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.1° |
| C1 | C2 | C3 | O3 | 89.5° | 60.0° |
| C1 | C2 | C3 | CG | 172.6° | 180.0° |
| C1 | C2 | C3 | H3 | 46.4° | 60.0° |
| H11 | C1 | OP4 | P | 44.2° | 60.0° |
| H11 | C1 | C2 | O2 | 131.9° | 180.0° |
| H11 | C1 | C2 | C3 | 94.4° | 60.0° |
| H11 | C1 | C2 | H2 | 15.5° | 60.0° |
| H12 | C1 | OP4 | P | 65.2° | 59.9° |
| H12 | C1 | C2 | O2 | 22.5° | 60.1° |
| H12 | C1 | C2 | C3 | 156.2° | 59.9° |
| H12 | C1 | C2 | H2 | 93.9° | 179.9° |
| OP1 | P | OP2 | OP3 | 125.0° | 120.1° |
| OP1 | P | OP2 | OP4 | 116.4° | 120.0° |
| OP1 | P | OP3 | OP4 | 116.2° | 120.0° |
| OP1 | P | OP2 | HOP2 | 180.0° | 60.0° |
| OP2 | P | OP3 | OP4 | 116.5° | 120.0° |
| OP2 | P | OP1 | HOP1 | 179.9° | 60.0° |
| OP3 | P | OP1 | HOP1 | 52.3° | 60.1° |
| OP3 | P | OP2 | HOP2 | 55.0° | 180.0° |
| OP4 | P | OP1 | HOP1 | 64.9° | 179.9° |
| OP4 | P | OP2 | HOP2 | 63.7° | 60.0° |
| O2 | C2 | C3 | H2 | 114.6° | 120.1° |
| O2 | C2 | C3 | O3 | 140.2° | 179.9° |
| O2 | C2 | C3 | CG | 42.2° | 60.0° |
| O2 | C2 | C3 | H3 | 84.0° | 60.0° |
| C3 | C2 | O2 | HO2 | 46.5° | 60.0° |
| C2 | C3 | O3 | CG | 120.4° | 120.0° |
| C2 | C3 | O3 | H3 | 120.2° | 120.0° |
| C2 | C3 | CG | H3 | 130.0° | 119.9° |
| C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.0° |
| C2 | C3 | CG | CD2 | 115.4° | 89.7° |
| C2 | C3 | CG | CD1 | 54.9° | 90.0° |
| H2 | C2 | O2 | HO2 | 63.3° | 180.0° |
| H2 | C2 | C3 | O3 | 25.6° | 60.0° |
| H2 | C2 | C3 | CG | 72.4° | 60.1° |
| H2 | C2 | C3 | H3 | 161.4° | 180.0° |
| O3 | C3 | CG | H3 | 138.2° | 120.0° |
| O3 | C3 | CG | CD2 | 23.5° | 150.3° |
| O3 | C3 | CG | CD1 | 146.7° | 30.0° |
| CG | C3 | O3 | HO3 | 59.6° | 60.0° |
| C3 | CG | CD2 | CD1 | 171.2° | 179.8° |
| C3 | CG | CD2 | CE2 | 166.1° | 179.8° |
| C3 | CG | CD2 | CE3 | 9.8° | 0.7° |
| C3 | CG | CD1 | NE1 | 168.4° | 180.0° |
| C3 | CG | CD1 | HD1 | 11.6° | 0.0° |
| H3 | C3 | O3 | HO3 | 59.8° | 180.0° |
| H3 | C3 | CG | CD2 | 114.7° | 30.2° |
| H3 | C3 | CG | CD1 | 75.1° | 150.0° |
| CG | CD2 | CE2 | CE3 | 176.8° | 179.3° |
| CG | CD2 | CE2 | NE1 | 4.4° | 0.4° |
| CG | CD2 | CE2 | CZ2 | 175.4° | 179.9° |
| CG | CD2 | CE3 | CZ3 | 174.6° | 179.6° |
| CG | CD2 | CE3 | HE3 | 5.4° | 0.6° |
| CD2 | CG | CD1 | NE1 | 3.8° | 0.2° |
| CD2 | CG | CD1 | HD1 | 176.2° | 179.8° |
| CD1 | CG | CD2 | CE2 | 5.0° | 0.4° |
| CD1 | CG | CD2 | CE3 | 179.1° | 179.5° |
| CG | CD1 | NE1 | CE2 | 1.1° | 0.0° |
| CG | CD1 | NE1 | HD1 | 180.0° | 180.0° |
| CG | CD1 | NE1 | HN1 | 178.9° | 179.9° |
| CD2 | CE2 | NE1 | CZ2 | 179.7° | 179.7° |
| CE2 | CD2 | CE3 | CZ3 | 0.9° | 0.6° |
| CE2 | CD2 | CE3 | HE3 | 179.1° | 179.7° |
| CD2 | CE2 | NE1 | CD1 | 2.1° | 0.2° |
| CD2 | CE2 | NE1 | HN1 | 177.9° | 179.7° |
| CD2 | CE2 | CZ2 | CH2 | 1.2° | 0.3° |
| CD2 | CE2 | CZ2 | HZ2 | 178.8° | 179.8° |
| CE3 | CD2 | CE2 | NE1 | 178.8° | 179.7° |
| CE3 | CD2 | CE2 | CZ2 | 1.4° | 0.6° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | HE3 | 180.0° | 179.8° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | CH2 | 0.3° | 0.3° |
| CD2 | CE3 | CZ3 | HZ3 | 179.7° | 179.7° |
| CE2 | NE1 | CD1 | HN1 | 180.0° | 179.9° |
| CE2 | NE1 | CD1 | HD1 | 179.0° | 180.0° |
| NE1 | CE2 | CZ2 | CH2 | 179.1° | 180.0° |
| NE1 | CE2 | CZ2 | HZ2 | 0.9° | 0.0° |
| CZ2 | CE2 | NE1 | CD1 | 177.6° | 180.0° |
| CZ2 | CE2 | NE1 | HN1 | 2.4° | 0.0° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | HZ2 | 180.0° | 179.9° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 0.4° | 0.0° |
| CE2 | CZ2 | CH2 | HH2 | 179.6° | 180.0° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | CZ2 | 0.0° | 0.0° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | HZ3 | 180.0° | 180.0° |
| CE3 | CZ3 | CH2 | HH2 | 180.0° | 180.0° |
| HE3 | CE3 | CZ3 | CH2 | 179.7° | 179.9° |
| HE3 | CE3 | CZ3 | HZ3 | 0.3° | 0.1° |
| HD1 | CD1 | NE1 | HN1 | 1.0° | 0.1° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | HH2 | 180.0° | 180.0° |
| CZ2 | CH2 | CZ3 | HZ3 | 180.0° | 180.0° |
| HZ2 | CZ2 | CH2 | CZ3 | 179.6° | 180.0° |
| HZ2 | CZ2 | CH2 | HH2 | 0.4° | 0.0° |
| HZ3 | CZ3 | CH2 | HH2 | 0.0° | 0.0° |
