HSY
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.50Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.50Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C5 | H51 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | H52 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C2 | C1 | O5 | 108.4° | 109.4° |
C2 | C1 | O1 | 109.9° | 109.4° |
C2 | C1 | H1 | 110.0° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 107.8° | 109.1° |
C1 | C2 | O2 | 112.1° | 109.6° |
C1 | C2 | H2 | 110.0° | 109.5° |
O5 | C1 | O1 | 109.8° | 109.5° |
O5 | C1 | H1 | 110.1° | 109.5° |
C1 | O5 | C5 | 122.2° | 114.1° |
O1 | C1 | H1 | 108.7° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
C3 | C2 | O2 | 112.7° | 109.5° |
C3 | C2 | H2 | 109.4° | 109.5° |
C2 | C3 | C4 | 109.8° | 109.1° |
C2 | C3 | O3 | 111.5° | 109.5° |
C2 | C3 | H3 | 108.5° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 104.9° | 109.6° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C3 | O3 | 111.2° | 109.6° |
C4 | C3 | H3 | 108.8° | 109.6° |
C3 | C4 | C5 | 117.0° | 109.2° |
C3 | C4 | O4 | 106.8° | 109.5° |
C3 | C4 | H4 | 109.7° | 109.5° |
O3 | C3 | H3 | 106.9° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
C5 | C4 | O4 | 117.8° | 109.5° |
C5 | C4 | H4 | 95.9° | 109.5° |
C4 | C5 | O5 | 119.1° | 109.4° |
C4 | C5 | H51 | 106.4° | 109.5° |
C4 | C5 | H52 | 106.4° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 108.7° | 109.6° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 113.9° |
O5 | C5 | H51 | 106.4° | 109.5° |
O5 | C5 | H52 | 106.4° | 109.4° |
H51 | C5 | H52 | 112.4° | 109.5° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
C2 | C1 | O5 | O1 | 120.0° | 119.9° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 120.4° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | H1 | 120.4° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 124.2° | 119.9° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 119.6° | 119.8° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 119.3° | 120.2° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 62.3° | 56.9° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 174.0° | 176.8° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 56.5° | 63.0° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 34.8° | 61.1° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
O5 | C1 | O1 | H1 | 120.5° | 120.1° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 64.1° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 171.3° | 177.5° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 55.1° | 62.3° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 2.8° | 61.1° |
C1 | O5 | C5 | H51 | 122.8° | 178.9° |
C1 | O5 | C5 | H52 | 117.2° | 58.9° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 60.8° | 60.1° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 55.8° | 62.4° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 68.7° | 57.5° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 175.0° | 177.8° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 85.2° | 58.8° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 175.4° | 177.6° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 50.9° | 62.5° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 65.4° | 57.7° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 155.2° | 178.9° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 59.6° | 59.9° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 118.9° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 123.9° | 119.8° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 118.6° | 119.9° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 118.5° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 30.3° | 57.0° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 164.9° | 176.9° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 77.4° | 62.9° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 58.2° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 180.0° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 173.5° | 176.9° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 49.8° | 63.2° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 67.7° | 57.0° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 57.3° | 62.9° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 66.4° | 57.0° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 176.1° | 177.2° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 60.7° | 60.2° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 118.7° | 120.3° |
C3 | C4 | C5 | O4 | 129.6° | 119.9° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 115.6° | 119.9° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 118.3° | 120.1° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 0.3° | 57.6° |
C3 | C4 | C5 | H51 | 120.3° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | H52 | 119.7° | 62.3° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 57.1° | 60.4° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 180.0° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 154.2° | 176.8° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 71.2° | 63.3° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 46.4° | 56.9° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 88.3° | 62.9° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 46.3° | 57.0° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 163.9° | 177.2° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 61.6° | 59.8° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 107.6° | 120.2° |
C4 | C5 | O5 | H51 | 120.0° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | H52 | 120.0° | 120.0° |
C4 | C5 | H51 | H52 | 116.1° | 120.1° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 45.8° | 60.3° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 129.8° | 177.5° |
O4 | C4 | C5 | H51 | 110.2° | 62.6° |
O4 | C4 | C5 | H52 | 9.8° | 57.5° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 115.4° | 62.3° |
H4 | C4 | C5 | H51 | 4.6° | 57.6° |
H4 | C4 | C5 | H52 | 124.6° | 177.7° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 61.7° | 59.8° |
O5 | C5 | H51 | H52 | 116.0° | 120.0° |