Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C1 | O2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | H11 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C1 | H12 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C2 | C5 | sing | 1.54Å | 1.52Å | |
C2 | O5 | sing | 1.45Å | 1.43Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C3 | C7 | sing | 1.50Å | 1.44Å | |
C3 | N1 | sing | 1.46Å | 1.37Å | |
C3 | O5 | sing | 1.43Å | 1.48Å | |
C4 | C5 | sing | 1.55Å | 1.55Å | |
C4 | O7 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C5 | O6 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C6 | N1 | sing | 1.35Å | 1.38Å | |
C6 | N2 | sing | 1.34Å | 1.37Å | |
C6 | O9 | doub | 1.22Å | 1.18Å | |
C7 | N2 | sing | 1.35Å | 1.38Å | |
C7 | O8 | doub | 1.21Å | 1.24Å | |
N1 | HN1 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
N2 | HN2 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
O1 | P1 | doub | 1.48Å | 1.46Å | |
O2 | P1 | sing | 1.61Å | 1.61Å | |
O3 | P1 | sing | 1.61Å | 1.50Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | P1 | sing | 1.61Å | 1.45Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O7 | HO7 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C2 | C1 | O2 | 111.1° | 109.5° |
C2 | C1 | H11 | 111.6° | 109.5° |
C2 | C1 | H12 | 111.6° | 109.5° |
C1 | C2 | C5 | 113.0° | 110.6° |
C1 | C2 | O5 | 109.9° | 110.3° |
C1 | C2 | H2 | 105.0° | 110.3° |
O2 | C1 | H11 | 111.6° | 109.4° |
O2 | C1 | H12 | 111.6° | 109.5° |
C1 | O2 | P1 | 123.0° | 106.8° |
H11 | C1 | H12 | 98.7° | 109.5° |
C5 | C2 | O5 | 103.2° | 105.0° |
C5 | C2 | H2 | 111.5° | 110.2° |
C2 | C5 | C4 | 100.2° | 104.2° |
C2 | C5 | O6 | 110.4° | 110.6° |
C2 | C5 | H5 | 114.7° | 110.5° |
O5 | C2 | H2 | 114.5° | 110.3° |
C2 | O5 | C3 | 112.7° | 105.3° |
C4 | C3 | C7 | 117.4° | 111.3° |
C4 | C3 | N1 | 103.8° | 111.5° |
C4 | C3 | O5 | 101.6° | 106.2° |
C3 | C4 | C5 | 103.8° | 103.8° |
C3 | C4 | O7 | 111.0° | 110.7° |
C3 | C4 | H4 | 112.1° | 110.6° |
C7 | C3 | N1 | 103.3° | 104.7° |
C7 | C3 | O5 | 117.7° | 111.6° |
C3 | C7 | N2 | 110.5° | 105.2° |
C3 | C7 | O8 | 129.4° | 127.4° |
N1 | C3 | O5 | 112.4° | 111.8° |
C3 | N1 | C6 | 111.0° | 106.1° |
C3 | N1 | HN1 | 111.7° | 126.9° |
C5 | C4 | O7 | 109.4° | 110.5° |
C5 | C4 | H4 | 113.7° | 110.6° |
C4 | C5 | O6 | 109.1° | 110.6° |
C4 | C5 | H5 | 115.8° | 110.5° |
O7 | C4 | H4 | 106.9° | 110.5° |
C4 | O7 | HO7 | 111.0° | 106.8° |
O6 | C5 | H5 | 106.5° | 110.4° |
C5 | O6 | HO6 | 110.4° | 106.9° |
N1 | C6 | N2 | 109.2° | 112.4° |
N1 | C6 | O9 | 124.8° | 123.8° |
C6 | N1 | HN1 | 111.7° | 127.0° |
N2 | C6 | O9 | 126.0° | 123.9° |
C6 | N2 | C7 | 106.0° | 111.6° |
C6 | N2 | HN2 | 126.7° | 124.2° |
N2 | C7 | O8 | 120.1° | 127.4° |
C7 | N2 | HN2 | 127.3° | 124.2° |
O1 | P1 | O2 | 108.8° | 109.5° |
O1 | P1 | O3 | 108.4° | 109.5° |
O1 | P1 | O4 | 110.0° | 109.5° |
O2 | P1 | O3 | 106.2° | 109.5° |
O2 | P1 | O4 | 112.7° | 109.5° |
P1 | O3 | HO3 | 108.3° | 106.8° |
O3 | P1 | O4 | 110.7° | 109.5° |
P1 | O4 | HO4 | 110.0° | 106.8° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
C2 | C1 | O2 | H11 | 125.3° | 120.0° |
C2 | C1 | O2 | H12 | 125.3° | 120.0° |
C2 | C1 | H11 | H12 | 117.5° | 120.0° |
C1 | C2 | C5 | O5 | 118.7° | 119.0° |
C1 | C2 | C5 | H2 | 118.0° | 122.3° |
C1 | C2 | O5 | H2 | 117.8° | 122.1° |
C1 | C2 | O5 | C3 | 95.7° | 158.1° |
C1 | C2 | C5 | C4 | 78.9° | 142.4° |
C1 | C2 | C5 | O6 | 166.2° | 98.8° |
C1 | C2 | C5 | H5 | 45.9° | 23.7° |
C2 | C1 | O2 | P1 | 141.6° | 180.0° |
O2 | C1 | H11 | H12 | 117.5° | 119.9° |
O2 | C1 | C2 | C5 | 55.7° | 177.1° |
O2 | C1 | C2 | O5 | 59.0° | 61.4° |
O2 | C1 | C2 | H2 | 177.4° | 60.7° |
C1 | O2 | P1 | O1 | 91.6° | 60.0° |
C1 | O2 | P1 | O3 | 152.0° | 180.0° |
C1 | O2 | P1 | O4 | 30.6° | 60.0° |
H11 | C1 | C2 | C5 | 179.1° | 62.9° |
H11 | C1 | C2 | O5 | 66.2° | 178.6° |
H11 | C1 | C2 | H2 | 57.3° | 59.3° |
H11 | C1 | O2 | P1 | 16.4° | 60.0° |
H12 | C1 | C2 | C5 | 69.6° | 57.1° |
H12 | C1 | C2 | O5 | 175.6° | 58.6° |
H12 | C1 | C2 | H2 | 52.1° | 179.3° |
H12 | C1 | O2 | P1 | 93.1° | 59.9° |
C5 | C2 | O5 | H2 | 121.4° | 118.7° |
C2 | C5 | C4 | C3 | 41.0° | 0.5° |
C5 | C2 | O5 | C3 | 25.1° | 38.9° |
C2 | C5 | C4 | O6 | 115.9° | 118.8° |
C2 | C5 | C4 | H5 | 123.9° | 118.6° |
C2 | C5 | C4 | O7 | 159.6° | 118.1° |
C2 | C5 | C4 | H4 | 81.0° | 119.1° |
C2 | C5 | O6 | H5 | 125.1° | 122.6° |
C2 | C5 | O6 | HO6 | 180.0° | 63.2° |
C2 | O5 | C3 | C4 | 1.1° | 38.9° |
C2 | O5 | C3 | C7 | 128.7° | 82.5° |
C2 | O5 | C3 | N1 | 111.4° | 160.7° |
O5 | C2 | C5 | C4 | 39.8° | 23.4° |
O5 | C2 | C5 | O6 | 75.1° | 142.2° |
O5 | C2 | C5 | H5 | 164.5° | 95.3° |
H2 | C2 | O5 | C3 | 146.5° | 79.8° |
H2 | C2 | C5 | C4 | 163.2° | 95.3° |
H2 | C2 | C5 | O6 | 48.2° | 23.5° |
H2 | C2 | C5 | H5 | 72.1° | 146.0° |
C4 | C3 | C7 | N1 | 113.5° | 120.6° |
C4 | C3 | C7 | O5 | 122.0° | 118.4° |
C4 | C3 | N1 | O5 | 109.0° | 118.6° |
C3 | C4 | C5 | O7 | 118.6° | 118.7° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 122.1° | 118.6° |
C3 | C4 | O7 | H4 | 122.5° | 122.9° |
C3 | C4 | C5 | O6 | 74.9° | 119.4° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 165.0° | 118.1° |
C4 | C3 | N1 | C6 | 122.5° | 120.5° |
C4 | C3 | C7 | N2 | 113.0° | 120.6° |
C4 | C3 | C7 | O8 | 66.6° | 59.4° |
C4 | C3 | N1 | HN1 | 2.8° | 59.6° |
C3 | C4 | O7 | HO7 | 180.0° | 175.9° |
C7 | C3 | N1 | O5 | 127.9° | 120.9° |
C7 | C3 | C4 | C5 | 103.5° | 98.8° |
C7 | C3 | C4 | O7 | 13.9° | 19.8° |
C7 | C3 | C4 | H4 | 133.4° | 142.7° |
C7 | C3 | N1 | C6 | 0.5° | 0.1° |
C3 | C7 | N2 | C6 | 0.3° | 0.0° |
C3 | C7 | N2 | O8 | 179.6° | 180.0° |
C7 | C3 | N1 | HN1 | 125.9° | 180.0° |
C3 | C7 | N2 | HN2 | 179.7° | 179.9° |
N1 | C3 | C4 | C5 | 143.2° | 144.8° |
N1 | C3 | C4 | O7 | 99.3° | 96.7° |
N1 | C3 | C4 | H4 | 20.1° | 26.2° |
C3 | N1 | C6 | HN1 | 125.3° | 179.9° |
C3 | N1 | C6 | N2 | 0.4° | 0.1° |
C3 | N1 | C6 | O9 | 177.8° | 180.0° |
N1 | C3 | C7 | N2 | 0.5° | 0.0° |
N1 | C3 | C7 | O8 | 179.9° | 180.0° |
O5 | C3 | C4 | C5 | 26.4° | 22.8° |
O5 | C3 | C4 | O7 | 143.8° | 141.4° |
O5 | C3 | C4 | H4 | 96.7° | 95.7° |
O5 | C3 | N1 | C6 | 128.5° | 120.8° |
O5 | C3 | C7 | N2 | 125.1° | 121.0° |
O5 | C3 | C7 | O8 | 55.3° | 59.0° |
O5 | C3 | N1 | HN1 | 106.2° | 59.0° |
C5 | C4 | O7 | H4 | 123.5° | 122.7° |
C4 | C5 | O6 | H5 | 125.7° | 122.6° |
C4 | C5 | O6 | HO6 | 70.9° | 178.1° |
C5 | C4 | O7 | HO7 | 66.0° | 61.5° |
O7 | C4 | C5 | O6 | 43.7° | 0.7° |
O7 | C4 | C5 | H5 | 76.5° | 123.2° |
H4 | C4 | C5 | O6 | 163.1° | 122.0° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 42.9° | 0.5° |
H4 | C4 | O7 | HO7 | 57.5° | 61.2° |
H5 | C5 | O6 | HO6 | 54.9° | 59.3° |
N1 | C6 | N2 | O9 | 178.1° | 179.8° |
N1 | C6 | N2 | C7 | 0.0° | 0.1° |
N1 | C6 | N2 | HN2 | 180.0° | 180.0° |
C6 | N2 | C7 | HN2 | 180.0° | 179.9° |
C6 | N2 | C7 | O8 | 180.0° | 180.0° |
N2 | C6 | N1 | HN1 | 125.7° | 180.0° |
O9 | C6 | N2 | C7 | 178.1° | 179.9° |
O9 | C6 | N1 | HN1 | 52.5° | 0.2° |
O9 | C6 | N2 | HN2 | 1.9° | 0.1° |
O8 | C7 | N2 | HN2 | 0.0° | 0.1° |
O1 | P1 | O2 | O3 | 116.4° | 120.0° |
O1 | P1 | O2 | O4 | 122.2° | 120.0° |
O1 | P1 | O3 | O4 | 120.7° | 120.0° |
O1 | P1 | O3 | HO3 | 179.9° | 60.0° |
O1 | P1 | O4 | HO4 | 180.0° | 180.0° |
O2 | P1 | O3 | O4 | 122.6° | 120.0° |
O2 | P1 | O3 | HO3 | 63.4° | 180.0° |
O2 | P1 | O4 | HO4 | 58.5° | 60.0° |
O3 | P1 | O4 | HO4 | 60.2° | 60.0° |
HO3 | O3 | P1 | O4 | 59.2° | 60.0° |