GUP
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O5 | C1 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.08Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.39Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.09Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.96Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.96Å | |
C5 | C6 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.09Å | |
C6 | O6 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.08Å | |
C6 | H62 | sing | 1.09Å | 1.09Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.96Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C1 | O5 | C5 | 114.6° | 107.7° |
O5 | C1 | O1 | 112.6° | 109.4° |
O5 | C1 | C2 | 110.2° | 109.8° |
O5 | C1 | H1 | 105.9° | 109.5° |
O5 | C5 | C4 | 110.6° | 109.7° |
O5 | C5 | C6 | 104.7° | 109.4° |
O5 | C5 | H5 | 107.2° | 109.4° |
O1 | C1 | C2 | 110.5° | 109.3° |
O1 | C1 | H1 | 110.0° | 109.4° |
C1 | O1 | HO1 | 112.6° | 106.8° |
C2 | C1 | H1 | 107.3° | 109.4° |
C1 | C2 | O2 | 100.6° | 109.6° |
C1 | C2 | C3 | 110.1° | 109.0° |
C1 | C2 | H2 | 105.7° | 109.5° |
O2 | C2 | C3 | 105.8° | 109.6° |
O2 | C2 | H2 | 115.3° | 109.6° |
C2 | O2 | HO2 | 100.6° | 106.8° |
C3 | C2 | H2 | 117.9° | 109.5° |
C2 | C3 | O3 | 104.1° | 109.6° |
C2 | C3 | C4 | 109.9° | 108.6° |
C2 | C3 | H3 | 105.8° | 109.7° |
O3 | C3 | C4 | 110.7° | 109.8° |
O3 | C3 | H3 | 110.3° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 103.8° | 106.8° |
C4 | C3 | H3 | 115.3° | 109.6° |
C3 | C4 | O4 | 108.2° | 109.6° |
C3 | C4 | C5 | 107.9° | 109.1° |
C3 | C4 | H4 | 111.8° | 109.5° |
O4 | C4 | C5 | 109.6° | 109.7° |
O4 | C4 | H4 | 109.3° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.0° | 106.8° |
C5 | C4 | H4 | 110.0° | 109.4° |
C4 | C5 | C6 | 114.8° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 110.8° | 109.4° |
C6 | C5 | H5 | 108.4° | 109.4° |
C5 | C6 | O6 | 108.2° | 109.5° |
C5 | C6 | H61 | 110.4° | 109.5° |
C5 | C6 | H62 | 106.8° | 109.4° |
O6 | C6 | H61 | 109.4° | 109.5° |
O6 | C6 | H62 | 109.5° | 109.5° |
C6 | O6 | HO6 | 106.9° | 106.8° |
H61 | C6 | H62 | 112.3° | 109.5° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O5 | C1 | O1 | C2 | 123.8° | 120.3° |
O5 | C1 | O1 | H1 | 117.9° | 119.9° |
O5 | C1 | C2 | H1 | 114.9° | 120.1° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 179.9° | 60.0° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 167.1° | 178.8° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 55.8° | 61.2° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 72.6° | 58.6° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 61.5° | 67.6° |
C1 | O5 | C5 | C6 | 174.3° | 172.3° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 59.3° | 52.4° |
C5 | O5 | C1 | O1 | 63.5° | 52.4° |
C5 | O5 | C1 | C2 | 60.5° | 67.6° |
C5 | O5 | C1 | H1 | 176.3° | 172.3° |
O5 | C5 | C4 | C3 | 56.6° | 61.3° |
O5 | C5 | C4 | O4 | 61.0° | 58.7° |
O5 | C5 | C4 | C6 | 118.2° | 120.1° |
O5 | C5 | C4 | H5 | 118.7° | 120.0° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 178.8° | 178.9° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 114.1° | 119.8° |
O5 | C5 | C6 | O6 | 57.0° | 59.8° |
O5 | C5 | C6 | H61 | 176.7° | 179.8° |
O5 | C5 | C6 | H62 | 60.9° | 60.2° |
O1 | C1 | C2 | H1 | 119.9° | 119.8° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 41.9° | 61.1° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 69.4° | 58.9° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 162.2° | 178.7° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 56.3° | 179.7° |
C1 | C2 | O2 | C3 | 114.5° | 119.6° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 113.2° | 120.2° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 121.4° | 119.8° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 179.9° | 60.0° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 63.8° | 66.2° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 54.8° | 53.7° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 180.0° | 173.5° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 62.0° | 59.9° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 78.0° | 58.7° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 170.7° | 178.7° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 42.3° | 61.6° |
O2 | C2 | C3 | H2 | 130.8° | 120.2° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 44.0° | 53.7° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 162.7° | 173.7° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 72.2° | 66.6° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 65.5° | 179.6° |
C2 | C3 | O3 | C4 | 118.1° | 119.2° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 113.1° | 120.4° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 119.5° | 119.8° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 34.6° | 60.0° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 64.1° | 66.3° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 54.4° | 53.8° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 175.5° | 173.6° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 66.8° | 60.2° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 174.8° | 173.9° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 66.5° | 66.1° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 58.6° | 53.6° |
O3 | C3 | C4 | H3 | 126.1° | 120.4° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 178.5° | 173.9° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 60.1° | 66.0° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 61.1° | 53.7° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 83.4° | 179.2° |
C3 | C4 | O4 | C5 | 117.4° | 119.7° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 121.9° | 120.2° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 122.2° | 119.8° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 73.2° | 60.0° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 174.7° | 178.6° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 62.1° | 58.7° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 147.7° | 60.4° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 55.4° | 53.5° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 173.9° | 173.6° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 65.0° | 66.6° |
O4 | C4 | C5 | H4 | 120.2° | 120.2° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 57.2° | 61.4° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 179.7° | 178.7° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 169.4° | 179.7° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 124.4° | 119.9° |
C4 | C5 | C6 | O6 | 178.4° | 179.9° |
C4 | C5 | C6 | H61 | 61.8° | 59.9° |
C4 | C5 | C6 | H62 | 60.6° | 60.1° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 48.7° | 60.2° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 63.1° | 58.7° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 60.1° | 61.1° |
C5 | C6 | O6 | H61 | 120.4° | 120.0° |
C5 | C6 | O6 | H62 | 116.0° | 119.9° |
C5 | C6 | H61 | H62 | 119.1° | 119.9° |
C5 | C6 | O6 | HO6 | 59.7° | 180.0° |
H5 | C5 | C6 | O6 | 57.2° | 60.0° |
H5 | C5 | C6 | H61 | 62.6° | 60.0° |
H5 | C5 | C6 | H62 | 175.0° | 180.0° |
O6 | C6 | H61 | H62 | 121.9° | 120.0° |
H61 | C6 | O6 | HO6 | 179.9° | 60.0° |
H62 | C6 | O6 | HO6 | 56.4° | 60.0° |