GM0
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
P | O1A | sing | 1.61Å | 1.57Å | |
P | O4 | sing | 1.61Å | 1.57Å | |
P | O8 | sing | 1.61Å | 1.66Å | |
P | O9 | doub | 1.48Å | 1.43Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.50Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.48Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.61Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.36Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.51Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C5 | C6 | sing | 1.53Å | 1.58Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | O6 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C6 | C7 | sing | 1.53Å | 1.50Å | |
C6 | H6 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C7 | O7 | sing | 1.43Å | 1.51Å | |
C7 | H71 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C7 | H72 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O7 | HO7 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O1A | H13 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O8 | H14 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O1A | P | O4 | 99.7° | 109.5° |
O1A | P | O8 | 116.7° | 109.5° |
O1A | P | O9 | 112.5° | 109.5° |
P | O1A | H13 | 109.5° | 114.0° |
O4 | P | O8 | 105.4° | 109.5° |
O4 | P | O9 | 123.8° | 109.5° |
P | O4 | C4 | 121.9° | 123.0° |
O8 | P | O9 | 99.6° | 109.4° |
P | O8 | H14 | 109.5° | 114.0° |
C2 | C1 | O5 | 109.3° | 109.4° |
C2 | C1 | H1 | 109.0° | 109.5° |
C2 | C1 | O1 | 109.5° | 109.5° |
C1 | C2 | O2 | 109.4° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 109.6° | 109.2° |
C1 | C2 | H2 | 111.7° | 109.6° |
O5 | C1 | H1 | 109.3° | 109.5° |
O5 | C1 | O1 | 109.5° | 109.5° |
C1 | O5 | C5 | 115.5° | 114.1° |
H1 | C1 | O1 | 110.2° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 113.9° |
O2 | C2 | C3 | 103.0° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 112.3° | 109.5° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C3 | C2 | H2 | 110.4° | 109.5° |
C2 | C3 | O3 | 106.7° | 109.6° |
C2 | C3 | C4 | 109.4° | 109.1° |
C2 | C3 | H3 | 108.8° | 109.6° |
O3 | C3 | C4 | 110.0° | 109.5° |
O3 | C3 | H3 | 112.4° | 109.5° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C3 | H3 | 109.5° | 109.6° |
C3 | C4 | O4 | 110.1° | 109.6° |
C3 | C4 | C5 | 105.2° | 109.2° |
C3 | C4 | H4 | 112.7° | 109.5° |
O4 | C4 | C5 | 101.4° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 113.4° | 109.6° |
C5 | C4 | H4 | 113.3° | 109.5° |
C4 | C5 | O5 | 111.8° | 109.4° |
C4 | C5 | C6 | 115.7° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 107.7° | 109.5° |
O5 | C5 | C6 | 105.7° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 108.7° | 109.5° |
C6 | C5 | H5 | 106.9° | 109.5° |
C5 | C6 | O6 | 110.8° | 109.5° |
C5 | C6 | C7 | 110.6° | 109.5° |
C5 | C6 | H6 | 108.8° | 109.5° |
O6 | C6 | C7 | 106.4° | 109.5° |
O6 | C6 | H6 | 110.6° | 109.4° |
C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 113.9° |
C7 | C6 | H6 | 109.8° | 109.5° |
C6 | C7 | O7 | 103.2° | 109.5° |
C6 | C7 | H71 | 111.0° | 109.5° |
C6 | C7 | H72 | 111.0° | 109.5° |
O7 | C7 | H71 | 111.0° | 109.5° |
O7 | C7 | H72 | 111.0° | 109.4° |
C7 | O7 | HO7 | 109.5° | 114.0° |
H71 | C7 | H72 | 109.5° | 109.5° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O1A | P | O4 | O8 | 121.3° | 120.0° |
O1A | P | O4 | O9 | 125.6° | 120.0° |
O1A | P | O8 | O9 | 121.4° | 120.0° |
O1A | P | O4 | C4 | 57.9° | 65.0° |
O1A | P | O8 | H14 | 121.4° | 60.0° |
O4 | P | O8 | O9 | 129.2° | 120.0° |
P | O4 | C4 | C3 | 120.1° | 120.0° |
P | O4 | C4 | C5 | 128.9° | 120.3° |
P | O4 | C4 | H4 | 7.1° | 0.2° |
O4 | P | O1A | H13 | 132.9° | 60.0° |
O4 | P | O8 | H14 | 129.1° | 180.0° |
O8 | P | O4 | C4 | 179.2° | 175.0° |
O8 | P | O1A | H13 | 114.3° | 60.0° |
O9 | P | O4 | C4 | 67.7° | 55.1° |
O9 | P | O1A | H13 | 0.0° | 180.0° |
O9 | P | O8 | H14 | 0.0° | 60.0° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 119.2° | 120.0° |
C2 | C1 | O5 | O1 | 120.0° | 120.0° |
C2 | C1 | H1 | O1 | 120.2° | 120.0° |
C1 | C2 | O2 | C3 | 116.5° | 119.7° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 124.7° | 120.2° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 123.5° | 120.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 177.8° | 176.9° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 58.8° | 57.0° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 60.8° | 63.0° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 54.6° | 61.2° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
O5 | C1 | H1 | O1 | 120.4° | 120.0° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 60.4° | 62.3° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 51.9° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 174.6° | 177.6° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 60.9° | 61.1° |
C1 | O5 | C5 | C6 | 172.4° | 178.8° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 57.9° | 58.8° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 60.1° | 60.1° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 59.0° | 57.7° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 171.2° | 177.6° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 66.0° | 62.4° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 173.8° | 178.9° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 60.1° | 60.0° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 179.6° | 177.7° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 68.1° | 62.4° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 54.6° | 57.6° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 65.4° | 58.8° |
O2 | C2 | C3 | H2 | 120.1° | 120.1° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 61.3° | 56.9° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 57.6° | 62.9° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 177.2° | 177.1° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 63.4° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | C4 | 118.6° | 119.6° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 119.2° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 119.2° | 119.9° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.0° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 169.3° | 176.9° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 60.8° | 56.9° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 63.1° | 63.0° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 55.4° | 60.2° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 58.8° | 63.2° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 177.7° | 176.9° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 62.7° | 57.0° |
O3 | C3 | C4 | H3 | 123.9° | 120.2° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 73.8° | 63.2° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 177.7° | 176.8° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 53.8° | 56.9° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 61.4° | 179.6° |
C3 | C4 | O4 | C5 | 111.0° | 119.7° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 127.2° | 120.1° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 123.5° | 119.8° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 61.8° | 57.6° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 177.2° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 57.6° | 62.4° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 60.8° | 60.2° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 50.1° | 57.0° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 58.3° | 63.0° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 177.8° | 177.1° |
O4 | C4 | C5 | H4 | 121.9° | 120.2° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 176.5° | 177.5° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 62.5° | 62.5° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 57.0° | 57.6° |
C4 | C5 | O5 | C6 | 126.6° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 118.8° | 120.0° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 120.0° | 120.0° |
C4 | C5 | C6 | O6 | 42.4° | 55.0° |
C4 | C5 | C6 | C7 | 160.1° | 175.0° |
C4 | C5 | C6 | H6 | 79.3° | 65.0° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 61.7° | 62.3° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 59.3° | 57.7° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 178.9° | 177.8° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 115.7° | 120.0° |
O5 | C5 | C6 | O6 | 81.8° | 65.0° |
O5 | C5 | C6 | C7 | 35.8° | 55.0° |
O5 | C5 | C6 | H6 | 156.4° | 175.1° |
C5 | C6 | O6 | C7 | 120.2° | 120.0° |
C5 | C6 | O6 | H6 | 120.7° | 120.0° |
C5 | C6 | C7 | H6 | 120.0° | 120.0° |
C5 | C6 | O6 | HO6 | 180.0° | 60.0° |
C5 | C6 | C7 | O7 | 158.0° | 175.0° |
C5 | C6 | C7 | H71 | 83.0° | 65.0° |
C5 | C6 | C7 | H72 | 39.0° | 55.0° |
H5 | C5 | C6 | O6 | 162.4° | 175.0° |
H5 | C5 | C6 | C7 | 79.9° | 65.0° |
H5 | C5 | C6 | H6 | 40.7° | 55.1° |
O6 | C6 | C7 | H6 | 119.7° | 120.0° |
O6 | C6 | C7 | O7 | 81.7° | 65.0° |
O6 | C6 | C7 | H71 | 37.3° | 55.0° |
O6 | C6 | C7 | H72 | 159.3° | 175.0° |
C7 | C6 | O6 | HO6 | 59.8° | 60.0° |
C6 | C7 | O7 | H71 | 119.0° | 120.1° |
C6 | C7 | O7 | H72 | 119.0° | 120.0° |
C6 | C7 | H71 | H72 | 122.9° | 120.0° |
C6 | C7 | O7 | HO7 | 180.0° | 180.0° |
H6 | C6 | O6 | HO6 | 59.3° | 180.0° |
H6 | C6 | C7 | O7 | 38.0° | 55.0° |
H6 | C6 | C7 | H71 | 157.0° | 175.0° |
H6 | C6 | C7 | H72 | 81.0° | 65.0° |
O7 | C7 | H71 | H72 | 122.9° | 120.0° |
H71 | C7 | O7 | HO7 | 61.0° | 60.0° |
H72 | C7 | O7 | HO7 | 61.0° | 60.0° |