FGV
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O13 | P1 | doub | 1.48Å | 1.74Å | |
O12 | P1 | sing | 1.61Å | 1.74Å | |
P1 | O1 | sing | 1.61Å | 1.75Å | |
P1 | O11 | sing | 1.61Å | 1.55Å | |
O6 | C6 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
O51 | P5 | doub | 1.48Å | 1.55Å | |
O1 | C1 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C6 | C1 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C6 | C5 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
O52 | P5 | sing | 1.61Å | 1.74Å | |
P5 | O5 | sing | 1.61Å | 1.75Å | |
P5 | O53 | sing | 1.61Å | 1.74Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C5 | C4 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C4 | C3 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.40Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
O33 | P3 | doub | 1.48Å | 1.55Å | |
O3 | P3 | sing | 1.61Å | 1.75Å | |
O31 | P3 | sing | 1.61Å | 1.73Å | |
P3 | O32 | sing | 1.61Å | 1.74Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H6 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O11 | H7 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O12 | H11 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2 | H12 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | H14 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O52 | H8 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O53 | H9 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O6 | H16 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O31 | H10 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O32 | H13 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O13 | P1 | O12 | 110.9° | 109.5° |
O13 | P1 | O1 | 112.0° | 109.4° |
O13 | P1 | O11 | 108.3° | 109.5° |
O12 | P1 | O1 | 110.4° | 109.5° |
O12 | P1 | O11 | 107.0° | 109.5° |
P1 | O12 | H11 | 109.5° | 114.0° |
O1 | P1 | O11 | 108.1° | 109.5° |
P1 | O1 | C1 | 110.3° | 123.0° |
P1 | O11 | H7 | 109.5° | 114.1° |
O6 | C6 | C1 | 108.8° | 109.5° |
O6 | C6 | C5 | 109.9° | 109.5° |
O6 | C6 | H6 | 110.4° | 109.5° |
C6 | O6 | H16 | 109.5° | 114.0° |
O51 | P5 | O52 | 106.7° | 109.5° |
O51 | P5 | O5 | 108.0° | 109.4° |
O51 | P5 | O53 | 107.9° | 109.5° |
O1 | C1 | C6 | 108.8° | 109.5° |
O1 | C1 | C2 | 109.7° | 109.5° |
O1 | C1 | H1 | 110.5° | 109.5° |
C1 | C6 | C5 | 110.6° | 109.5° |
C6 | C1 | C2 | 110.5° | 109.5° |
C6 | C1 | H1 | 108.7° | 109.5° |
C1 | C6 | H6 | 108.6° | 109.5° |
C6 | C5 | O5 | 109.0° | 109.5° |
C6 | C5 | C4 | 110.4° | 109.5° |
C6 | C5 | H5 | 108.9° | 109.5° |
C5 | C6 | H6 | 108.5° | 109.5° |
O52 | P5 | O5 | 110.8° | 109.4° |
O52 | P5 | O53 | 110.8° | 109.5° |
P5 | O52 | H8 | 109.5° | 113.9° |
O5 | P5 | O53 | 112.3° | 109.5° |
P5 | O5 | C5 | 110.5° | 123.0° |
P5 | O53 | H9 | 109.5° | 114.0° |
C1 | C2 | O2 | 110.5° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 110.1° | 109.5° |
C2 | C1 | H1 | 108.7° | 109.5° |
C1 | C2 | H2 | 108.2° | 109.5° |
O5 | C5 | C4 | 108.9° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 110.7° | 109.5° |
C5 | C4 | C3 | 110.7° | 109.5° |
C5 | C4 | O4 | 109.1° | 109.5° |
C5 | C4 | H4 | 108.4° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 108.9° | 109.5° |
O2 | C2 | C3 | 109.6° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 110.1° | 109.5° |
C2 | O2 | H12 | 109.5° | 114.0° |
C2 | C3 | C4 | 110.6° | 109.4° |
C2 | C3 | O3 | 109.4° | 109.5° |
C3 | C2 | H2 | 108.3° | 109.4° |
C2 | C3 | H3 | 108.7° | 109.5° |
C3 | C4 | O4 | 109.9° | 109.5° |
C4 | C3 | O3 | 108.9° | 109.5° |
C4 | C3 | H3 | 108.7° | 109.5° |
C3 | C4 | H4 | 108.4° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 110.3° | 109.5° |
C4 | O4 | H14 | 109.5° | 114.0° |
C3 | O3 | P3 | 110.3° | 123.0° |
O3 | C3 | H3 | 110.5° | 109.5° |
O33 | P3 | O3 | 108.4° | 109.4° |
O33 | P3 | O31 | 108.0° | 109.5° |
O33 | P3 | O32 | 106.7° | 109.5° |
O3 | P3 | O31 | 112.1° | 109.5° |
O3 | P3 | O32 | 110.7° | 109.4° |
O31 | P3 | O32 | 110.7° | 109.5° |
P3 | O31 | H10 | 109.5° | 113.9° |
P3 | O32 | H13 | 109.5° | 114.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O13 | P1 | O12 | O1 | 124.6° | 120.0° |
O13 | P1 | O12 | O11 | 117.9° | 120.0° |
O13 | P1 | O1 | O11 | 119.3° | 120.0° |
O13 | P1 | O1 | C1 | 59.4° | 55.0° |
O13 | P1 | O11 | H7 | 0.0° | 60.0° |
O13 | P1 | O12 | H11 | 0.0° | 180.0° |
O12 | P1 | O1 | O11 | 116.7° | 120.0° |
O12 | P1 | O1 | C1 | 176.6° | 65.0° |
O12 | P1 | O11 | H7 | 119.5° | 60.0° |
P1 | O1 | C1 | C6 | 137.0° | 120.0° |
P1 | O1 | C1 | C2 | 102.1° | 120.0° |
P1 | O1 | C1 | H1 | 17.7° | 0.0° |
O1 | P1 | O11 | H7 | 121.6° | 180.0° |
O1 | P1 | O12 | H11 | 124.7° | 60.1° |
O11 | P1 | O1 | C1 | 59.9° | 175.0° |
O11 | P1 | O12 | H11 | 117.9° | 60.0° |
O6 | C6 | C1 | O1 | 61.1° | 60.0° |
O6 | C6 | C1 | C5 | 120.8° | 120.0° |
O6 | C6 | C1 | H6 | 120.2° | 120.0° |
O6 | C6 | C5 | H6 | 120.8° | 120.0° |
O6 | C6 | C1 | C2 | 178.5° | 180.0° |
O6 | C6 | C5 | O5 | 63.0° | 60.0° |
O6 | C6 | C5 | C4 | 177.3° | 180.0° |
O6 | C6 | C1 | H1 | 59.3° | 60.0° |
O6 | C6 | C5 | H5 | 57.8° | 60.0° |
O51 | P5 | O52 | O5 | 117.4° | 120.0° |
O51 | P5 | O52 | O53 | 117.2° | 120.0° |
O51 | P5 | O5 | O53 | 118.9° | 120.0° |
O51 | P5 | O5 | C5 | 65.9° | 55.0° |
O51 | P5 | O52 | H8 | 0.0° | 60.0° |
O51 | P5 | O53 | H9 | 0.0° | 180.0° |
O1 | C1 | C6 | C2 | 120.4° | 120.0° |
O1 | C1 | C6 | H1 | 120.4° | 120.0° |
O1 | C1 | C6 | C5 | 178.1° | 180.0° |
O1 | C1 | C2 | H1 | 120.9° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 56.5° | 60.0° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 177.6° | 180.0° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 64.2° | 60.1° |
O1 | C1 | C6 | H6 | 59.1° | 60.0° |
C1 | C6 | C5 | H6 | 119.0° | 120.0° |
C6 | C1 | C2 | H1 | 119.2° | 120.0° |
C1 | C6 | C5 | O5 | 176.8° | 180.0° |
C1 | C6 | C5 | C4 | 57.2° | 60.0° |
C6 | C1 | C2 | O2 | 63.4° | 60.0° |
C6 | C1 | C2 | C3 | 57.7° | 60.0° |
C6 | C1 | C2 | H2 | 175.9° | 179.9° |
C1 | C6 | C5 | H5 | 62.3° | 60.0° |
C1 | C6 | O6 | H16 | 180.0° | 180.0° |
C6 | C5 | O5 | P5 | 122.5° | 120.0° |
C5 | C6 | C1 | C2 | 57.7° | 60.0° |
C6 | C5 | O5 | C4 | 120.5° | 120.0° |
C6 | C5 | O5 | H5 | 119.7° | 120.0° |
C6 | C5 | C4 | H5 | 119.5° | 120.0° |
C6 | C5 | C4 | C3 | 57.0° | 60.0° |
C6 | C5 | C4 | O4 | 178.0° | 180.0° |
C5 | C6 | C1 | H1 | 61.5° | 60.0° |
C6 | C5 | C4 | H4 | 61.8° | 60.0° |
C5 | C6 | O6 | H16 | 58.8° | 60.0° |
O52 | P5 | O5 | O53 | 124.5° | 120.0° |
O52 | P5 | O5 | C5 | 177.5° | 175.0° |
O52 | P5 | O53 | H9 | 116.5° | 60.0° |
P5 | O5 | C5 | C4 | 117.0° | 120.0° |
P5 | O5 | C5 | H5 | 2.8° | 0.0° |
O5 | P5 | O52 | H8 | 117.4° | 179.9° |
O5 | P5 | O53 | H9 | 119.0° | 60.0° |
O53 | P5 | O5 | C5 | 53.0° | 65.0° |
O53 | P5 | O52 | H8 | 117.2° | 60.1° |
C1 | C2 | O2 | C3 | 121.5° | 120.0° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 119.5° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 118.1° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 57.6° | 60.0° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 177.5° | 180.0° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 61.8° | 60.0° |
C2 | C1 | C6 | H6 | 61.3° | 60.0° |
C1 | C2 | O2 | H12 | 180.0° | 180.0° |
O5 | C5 | C4 | H5 | 120.8° | 120.0° |
O5 | C5 | C4 | C3 | 176.7° | 180.0° |
O5 | C5 | C4 | O4 | 62.3° | 60.0° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 57.8° | 60.0° |
O5 | C5 | C6 | H6 | 57.8° | 60.0° |
C5 | C4 | C3 | C2 | 57.4° | 60.0° |
C5 | C4 | C3 | O4 | 120.5° | 120.0° |
C5 | C4 | C3 | H4 | 118.8° | 120.0° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 119.0° | 120.0° |
C5 | C4 | C3 | O3 | 177.7° | 180.0° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 61.9° | 60.0° |
C4 | C5 | C6 | H6 | 61.8° | 60.0° |
C5 | C4 | O4 | H14 | 180.0° | 60.0° |
O2 | C2 | C3 | H2 | 120.1° | 120.0° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 64.2° | 60.0° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 55.7° | 60.0° |
O2 | C2 | C1 | H1 | 177.4° | 180.0° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 176.5° | 180.0° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 120.3° | 120.0° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 119.3° | 120.0° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 178.0° | 180.0° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 119.7° | 120.0° |
C2 | C3 | O3 | P3 | 104.3° | 120.0° |
C3 | C2 | C1 | H1 | 61.5° | 60.0° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 61.4° | 60.0° |
C3 | C2 | O2 | H12 | 58.5° | 60.0° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 119.5° | 120.0° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 119.4° | 120.0° |
C4 | C3 | O3 | P3 | 134.7° | 120.0° |
C4 | C3 | C2 | H2 | 175.7° | 180.0° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 62.5° | 60.0° |
C3 | C4 | O4 | H14 | 58.5° | 179.9° |
O4 | C4 | C3 | O3 | 61.8° | 60.0° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 58.7° | 60.0° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 58.5° | 60.0° |
C3 | O3 | P3 | O33 | 59.7° | 55.0° |
C3 | O3 | P3 | O31 | 59.4° | 175.0° |
C3 | O3 | P3 | O32 | 176.4° | 65.0° |
O3 | C3 | C2 | H2 | 64.4° | 60.1° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 58.9° | 60.0° |
O33 | P3 | O3 | O31 | 119.1° | 120.0° |
O33 | P3 | O3 | O32 | 116.8° | 120.0° |
O33 | P3 | O31 | O32 | 116.5° | 120.1° |
O33 | P3 | O31 | H10 | 0.0° | 60.0° |
O33 | P3 | O32 | H13 | 0.0° | 180.0° |
O3 | P3 | O31 | O32 | 124.1° | 120.0° |
P3 | O3 | C3 | H3 | 15.4° | 0.0° |
O3 | P3 | O31 | H10 | 119.3° | 180.0° |
O3 | P3 | O32 | H13 | 117.8° | 60.0° |
O31 | P3 | O32 | H13 | 117.3° | 60.0° |
O32 | P3 | O31 | H10 | 116.5° | 60.0° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 56.7° | 59.9° |
H1 | C1 | C6 | H6 | 179.5° | 180.0° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 56.4° | 60.0° |
H2 | C2 | O2 | H12 | 60.5° | 60.0° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 179.3° | 180.0° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 178.6° | 180.0° |
H4 | C4 | O4 | H14 | 61.0° | 60.0° |
H5 | C5 | C6 | H6 | 178.6° | 180.0° |
H6 | C6 | O6 | H16 | 60.9° | 60.0° |