D7P
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| N1' | C | sing | 1.35Å | 1.32Å | |
| N1' | H1'1 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
| N1' | H1'2 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
| N' | CA' | sing | 1.47Å | 1.48Å | |
| N' | HN'1 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| N' | HN'2 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| CA' | C' | sing | 1.51Å | 1.55Å | |
| CA' | CB' | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
| CA' | HA' | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| C' | O' | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
| C' | N | sing | 1.35Å | 1.34Å | |
| CB' | CG' | sing | 1.51Å | 1.54Å | |
| CB' | HB'1 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| CB' | HB'2 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| CG' | CD1 | doub | 1.38Å | 1.42Å | Aromatic |
| CG' | CD2 | sing | 1.38Å | 1.42Å | Aromatic |
| CD1 | CE1 | sing | 1.38Å | 1.41Å | Aromatic |
| CD1 | HD1 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| CE1 | CZ' | doub | 1.38Å | 1.42Å | Aromatic |
| CE1 | HE1 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| CZ' | CE2 | sing | 1.38Å | 1.42Å | Aromatic |
| CZ' | HZ' | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| CE2 | CD2 | doub | 1.38Å | 1.42Å | Aromatic |
| CE2 | HE2 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| CD2 | HD2 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
| N | CA | sing | 1.47Å | 1.51Å | |
| N | HN | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
| CA | C | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
| CA | CB | sing | 1.53Å | 1.50Å | |
| CA | HA | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| C | O | doub | 1.21Å | 1.20Å | |
| CB | CG | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
| CB | HB1 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| CG | CD | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
| CG | HG1 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| CG | HG2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| CD | NE | sing | 1.46Å | 1.47Å | |
| CD | HD1A | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| CD | HD2A | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| NE | CZ | sing | 1.37Å | 1.31Å | |
| NE | HNE | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
| CZ | NH1 | sing | 1.37Å | 1.32Å | |
| CZ | NH2 | doub | 1.30Å | 1.33Å | |
| NH1 | NO | sing | 1.37Å | 1.35Å | |
| NH1 | HH1 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
| NH2 | HH2 | sing | 0.97Å | 1.02Å | |
| NO | O2 | sing | 1.46Å | 1.28Å | |
| NO | O3 | sing | 1.46Å | 1.28Å | |
| O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| C | N1' | H1'1 | 119.8° | 120.0° |
| C | N1' | H1'2 | 118.1° | 120.0° |
| N1' | C | CA | 119.8° | 120.0° |
| N1' | C | O | 118.1° | 120.0° |
| H1'1 | N1' | H1'2 | 122.1° | 120.0° |
| CA' | N' | HN'1 | 112.8° | 106.7° |
| CA' | N' | HN'2 | 107.9° | 106.7° |
| N' | CA' | C' | 107.9° | 109.4° |
| N' | CA' | CB' | 108.8° | 109.5° |
| N' | CA' | HA' | 112.0° | 109.5° |
| HN'1 | N' | HN'2 | 112.8° | 106.7° |
| C' | CA' | CB' | 112.4° | 109.5° |
| C' | CA' | HA' | 108.3° | 109.4° |
| CA' | C' | O' | 121.1° | 120.0° |
| CA' | C' | N | 117.8° | 120.0° |
| CB' | CA' | HA' | 107.5° | 109.5° |
| CA' | CB' | CG' | 115.0° | 109.5° |
| CA' | CB' | HB'1 | 110.2° | 109.5° |
| CA' | CB' | HB'2 | 110.2° | 109.5° |
| O' | C' | N | 121.2° | 120.0° |
| C' | N | CA | 122.5° | 120.0° |
| C' | N | HN | 112.8° | 120.0° |
| CG' | CB' | HB'1 | 110.2° | 109.5° |
| CG' | CB' | HB'2 | 110.2° | 109.4° |
| CB' | CG' | CD1 | 120.2° | 120.0° |
| CB' | CG' | CD2 | 120.2° | 120.0° |
| HB'1 | CB' | HB'2 | 100.1° | 109.5° |
| CD1 | CG' | CD2 | 119.5° | 120.0° |
| CG' | CD1 | CE1 | 120.5° | 120.0° |
| CG' | CD1 | HD1 | 119.9° | 120.0° |
| CG' | CD2 | CE2 | 120.1° | 119.9° |
| CG' | CD2 | HD2 | 120.1° | 120.0° |
| CE1 | CD1 | HD1 | 119.5° | 120.0° |
| CD1 | CE1 | CZ' | 119.9° | 120.0° |
| CD1 | CE1 | HE1 | 119.9° | 119.9° |
| CZ' | CE1 | HE1 | 120.2° | 120.1° |
| CE1 | CZ' | CE2 | 120.1° | 120.0° |
| CE1 | CZ' | HZ' | 119.8° | 120.0° |
| CE2 | CZ' | HZ' | 120.0° | 120.0° |
| CZ' | CE2 | CD2 | 119.9° | 120.0° |
| CZ' | CE2 | HE2 | 120.1° | 120.0° |
| CD2 | CE2 | HE2 | 120.0° | 120.0° |
| CE2 | CD2 | HD2 | 119.9° | 120.0° |
| CA | N | HN | 124.8° | 120.0° |
| N | CA | C | 112.1° | 109.5° |
| N | CA | CB | 106.0° | 109.4° |
| N | CA | HA | 111.9° | 109.5° |
| C | CA | CB | 114.6° | 109.5° |
| C | CA | HA | 102.9° | 109.5° |
| CA | C | O | 122.1° | 120.0° |
| CB | CA | HA | 109.4° | 109.5° |
| CA | CB | CG | 112.3° | 109.5° |
| CA | CB | HB1 | 111.2° | 109.5° |
| CA | CB | HB2 | 111.2° | 109.5° |
| CG | CB | HB1 | 111.2° | 109.5° |
| CG | CB | HB2 | 111.2° | 109.5° |
| CB | CG | CD | 110.3° | 109.5° |
| CB | CG | HG1 | 111.9° | 109.4° |
| CB | CG | HG2 | 111.9° | 109.4° |
| HB1 | CB | HB2 | 99.1° | 109.5° |
| CD | CG | HG1 | 111.9° | 109.5° |
| CD | CG | HG2 | 111.9° | 109.5° |
| CG | CD | NE | 110.5° | 109.5° |
| CG | CD | HD1A | 111.8° | 109.5° |
| CG | CD | HD2A | 111.8° | 109.5° |
| HG1 | CG | HG2 | 98.5° | 109.5° |
| NE | CD | HD1A | 111.8° | 109.5° |
| NE | CD | HD2A | 111.8° | 109.5° |
| CD | NE | CZ | 129.1° | 120.1° |
| CD | NE | HNE | 105.3° | 120.0° |
| HD1A | CD | HD2A | 98.6° | 109.4° |
| CZ | NE | HNE | 105.4° | 119.9° |
| NE | CZ | NH1 | 120.0° | 120.1° |
| NE | CZ | NH2 | 117.0° | 120.0° |
| NH1 | CZ | NH2 | 122.9° | 120.0° |
| CZ | NH1 | NO | 130.2° | 120.0° |
| CZ | NH1 | HH1 | 105.0° | 120.0° |
| CZ | NH2 | HH2 | 115.5° | 120.0° |
| NO | NH1 | HH1 | 105.0° | 120.0° |
| NH1 | NO | O2 | 117.7° | 106.7° |
| NH1 | NO | O3 | 122.9° | 106.7° |
| O2 | NO | O3 | 119.4° | 106.7° |
| NO | O2 | HO2 | 117.7° | 106.7° |
| NO | O3 | HO3 | 123.0° | 106.8° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| C | N1' | H1'1 | H1'2 | 177.7° | 179.9° |
| N1' | C | CA | N | 42.4° | 180.0° |
| N1' | C | CA | O | 177.8° | 179.9° |
| N1' | C | CA | CB | 78.5° | 60.0° |
| N1' | C | CA | HA | 162.8° | 60.0° |
| H1'1 | N1' | C | CA | 180.0° | 0.0° |
| H1'1 | N1' | C | O | 2.2° | 179.9° |
| H1'2 | N1' | C | CA | 2.1° | 180.0° |
| H1'2 | N1' | C | O | 180.0° | 0.0° |
| CA' | N' | HN'1 | HN'2 | 122.6° | 113.8° |
| N' | CA' | C' | CB' | 120.0° | 120.0° |
| N' | CA' | C' | HA' | 121.4° | 120.0° |
| N' | CA' | CB' | HA' | 121.5° | 120.1° |
| N' | CA' | C' | O' | 47.4° | 20.0° |
| N' | CA' | C' | N | 132.1° | 160.0° |
| N' | CA' | CB' | CG' | 53.9° | 65.0° |
| N' | CA' | CB' | HB'1 | 71.3° | 175.0° |
| N' | CA' | CB' | HB'2 | 179.2° | 54.9° |
| HN'1 | N' | CA' | C' | 54.7° | 173.8° |
| HN'1 | N' | CA' | CB' | 176.9° | 53.8° |
| HN'1 | N' | CA' | HA' | 64.4° | 66.3° |
| HN'2 | N' | CA' | C' | 180.0° | 60.0° |
| HN'2 | N' | CA' | CB' | 57.8° | 60.0° |
| HN'2 | N' | CA' | HA' | 60.9° | 180.0° |
| C' | CA' | CB' | HA' | 119.1° | 120.0° |
| CA' | C' | O' | N | 179.5° | 180.0° |
| C' | CA' | CB' | CG' | 173.4° | 175.0° |
| C' | CA' | CB' | HB'1 | 48.1° | 55.0° |
| C' | CA' | CB' | HB'2 | 61.4° | 65.0° |
| CA' | C' | N | CA | 179.3° | 180.0° |
| CA' | C' | N | HN | 0.7° | 0.0° |
| CB' | CA' | C' | O' | 72.6° | 100.0° |
| CB' | CA' | C' | N | 107.9° | 80.0° |
| CA' | CB' | CG' | HB'1 | 125.3° | 120.0° |
| CA' | CB' | CG' | HB'2 | 125.2° | 120.0° |
| CA' | CB' | HB'1 | HB'2 | 116.0° | 120.0° |
| CA' | CB' | CG' | CD1 | 62.3° | 90.0° |
| CA' | CB' | CG' | CD2 | 117.5° | 90.3° |
| HA' | CA' | C' | O' | 168.8° | 140.0° |
| HA' | CA' | C' | N | 10.7° | 40.0° |
| HA' | CA' | CB' | CG' | 67.5° | 55.1° |
| HA' | CA' | CB' | HB'1 | 167.2° | 65.0° |
| HA' | CA' | CB' | HB'2 | 57.7° | 175.0° |
| O' | C' | N | CA | 0.2° | 0.0° |
| O' | C' | N | HN | 179.8° | 179.9° |
| C' | N | CA | HN | 180.0° | 179.9° |
| C' | N | CA | C | 64.6° | 85.0° |
| C' | N | CA | CB | 169.7° | 155.0° |
| C' | N | CA | HA | 50.5° | 35.0° |
| CG' | CB' | HB'1 | HB'2 | 116.1° | 120.0° |
| CB' | CG' | CD1 | CD2 | 179.7° | 179.8° |
| CB' | CG' | CD1 | CE1 | 180.0° | 180.0° |
| CB' | CG' | CD1 | HD1 | 0.0° | 0.0° |
| CB' | CG' | CD2 | CE2 | 179.9° | 179.8° |
| CB' | CG' | CD2 | HD2 | 0.1° | 0.2° |
| HB'1 | CB' | CG' | CD1 | 172.5° | 30.0° |
| HB'1 | CB' | CG' | CD2 | 7.8° | 149.7° |
| HB'2 | CB' | CG' | CD1 | 63.0° | 150.0° |
| HB'2 | CB' | CG' | CD2 | 117.3° | 29.7° |
| CG' | CD1 | CE1 | HD1 | 180.0° | 180.0° |
| CG' | CD1 | CE1 | CZ' | 0.2° | 0.0° |
| CG' | CD1 | CE1 | HE1 | 179.8° | 179.9° |
| CD1 | CG' | CD2 | CE2 | 0.4° | 0.5° |
| CD1 | CG' | CD2 | HD2 | 179.6° | 180.0° |
| CD2 | CG' | CD1 | CE1 | 0.3° | 0.3° |
| CD2 | CG' | CD1 | HD1 | 179.7° | 179.8° |
| CG' | CD2 | CE2 | CZ' | 0.3° | 0.4° |
| CG' | CD2 | CE2 | HD2 | 180.0° | 179.6° |
| CG' | CD2 | CE2 | HE2 | 179.7° | 179.7° |
| CD1 | CE1 | CZ' | HE1 | 180.0° | 180.0° |
| CD1 | CE1 | CZ' | CE2 | 0.1° | 0.0° |
| CD1 | CE1 | CZ' | HZ' | 179.9° | 180.0° |
| HD1 | CD1 | CE1 | CZ' | 179.8° | 180.0° |
| HD1 | CD1 | CE1 | HE1 | 0.2° | 0.0° |
| CE1 | CZ' | CE2 | HZ' | 180.0° | 179.9° |
| CE1 | CZ' | CE2 | CD2 | 0.2° | 0.2° |
| CE1 | CZ' | CE2 | HE2 | 179.8° | 180.0° |
| HE1 | CE1 | CZ' | CE2 | 179.9° | 180.0° |
| HE1 | CE1 | CZ' | HZ' | 0.1° | 0.0° |
| CZ' | CE2 | CD2 | HE2 | 180.0° | 179.8° |
| CZ' | CE2 | CD2 | HD2 | 179.6° | 180.0° |
| HZ' | CZ' | CE2 | CD2 | 179.8° | 179.9° |
| HZ' | CZ' | CE2 | HE2 | 0.2° | 0.0° |
| HE2 | CE2 | CD2 | HD2 | 0.4° | 0.2° |
| N | CA | C | CB | 120.9° | 120.0° |
| N | CA | C | HA | 120.4° | 120.0° |
| N | CA | CB | HA | 120.9° | 120.0° |
| N | CA | C | O | 135.4° | 0.0° |
| N | CA | CB | CG | 147.5° | 65.1° |
| N | CA | CB | HB1 | 22.2° | 175.0° |
| N | CA | CB | HB2 | 87.2° | 54.9° |
| HN | N | CA | C | 115.4° | 95.0° |
| HN | N | CA | CB | 10.3° | 24.9° |
| HN | N | CA | HA | 129.5° | 144.9° |
| C | CA | CB | HA | 114.9° | 120.0° |
| C | CA | CB | CG | 88.3° | 175.0° |
| C | CA | CB | HB1 | 146.4° | 55.0° |
| C | CA | CB | HB2 | 37.0° | 65.0° |
| CB | CA | C | O | 103.7° | 119.9° |
| CA | CB | CG | HB1 | 125.3° | 120.0° |
| CA | CB | CG | HB2 | 125.3° | 120.0° |
| CA | CB | HB1 | HB2 | 117.0° | 120.1° |
| CA | CB | CG | CD | 178.8° | 180.0° |
| CA | CB | CG | HG1 | 53.5° | 60.1° |
| CA | CB | CG | HG2 | 55.9° | 60.0° |
| HA | CA | C | O | 14.9° | 120.1° |
| HA | CA | CB | CG | 26.7° | 55.0° |
| HA | CA | CB | HB1 | 98.6° | 65.0° |
| HA | CA | CB | HB2 | 152.0° | 175.0° |
| CG | CB | HB1 | HB2 | 117.1° | 120.0° |
| CB | CG | CD | HG1 | 125.3° | 119.9° |
| CB | CG | CD | HG2 | 125.3° | 120.0° |
| CB | CG | HG1 | HG2 | 117.8° | 120.0° |
| CB | CG | CD | NE | 168.9° | 180.0° |
| CB | CG | CD | HD1A | 43.6° | 60.0° |
| CB | CG | CD | HD2A | 65.8° | 60.0° |
| HB1 | CB | CG | CD | 55.9° | 60.0° |
| HB1 | CB | CG | HG1 | 178.8° | 180.0° |
| HB1 | CB | CG | HG2 | 69.3° | 60.0° |
| HB2 | CB | CG | CD | 53.5° | 60.0° |
| HB2 | CB | CG | HG1 | 71.8° | 60.0° |
| HB2 | CB | CG | HG2 | 178.8° | 180.0° |
| CD | CG | HG1 | HG2 | 117.8° | 120.1° |
| CG | CD | NE | HD1A | 125.3° | 120.0° |
| CG | CD | NE | HD2A | 125.2° | 120.1° |
| CG | CD | HD1A | HD2A | 117.7° | 120.0° |
| CG | CD | NE | CZ | 131.9° | 180.0° |
| CG | CD | NE | HNE | 6.6° | 0.0° |
| HG1 | CG | CD | NE | 65.8° | 60.1° |
| HG1 | CG | CD | HD1A | 168.9° | 179.9° |
| HG1 | CG | CD | HD2A | 59.4° | 60.0° |
| HG2 | CG | CD | NE | 43.6° | 60.0° |
| HG2 | CG | CD | HD1A | 81.7° | 60.0° |
| HG2 | CG | CD | HD2A | 168.9° | 179.9° |
| NE | CD | HD1A | HD2A | 117.7° | 120.0° |
| CD | NE | CZ | HNE | 125.3° | 180.0° |
| CD | NE | CZ | NH1 | 0.5° | 180.0° |
| CD | NE | CZ | NH2 | 180.0° | 0.0° |
| HD1A | CD | NE | CZ | 102.8° | 60.0° |
| HD1A | CD | NE | HNE | 131.9° | 120.0° |
| HD2A | CD | NE | CZ | 6.7° | 60.0° |
| HD2A | CD | NE | HNE | 118.6° | 120.1° |
| NE | CZ | NH1 | NH2 | 179.6° | 180.0° |
| NE | CZ | NH1 | NO | 176.4° | 180.0° |
| NE | CZ | NH1 | HH1 | 58.4° | 0.0° |
| NE | CZ | NH2 | HH2 | 77.2° | 180.0° |
| HNE | NE | CZ | NH1 | 125.7° | 0.0° |
| HNE | NE | CZ | NH2 | 54.7° | 180.0° |
| CZ | NH1 | NO | HH1 | 125.2° | 180.0° |
| NH1 | CZ | NH2 | HH2 | 103.2° | 0.1° |
| CZ | NH1 | NO | O2 | 168.7° | 126.2° |
| CZ | NH1 | NO | O3 | 12.0° | 120.0° |
| NH2 | CZ | NH1 | NO | 4.1° | 0.0° |
| NH2 | CZ | NH1 | HH1 | 121.2° | 180.0° |
| NH1 | NO | O2 | O3 | 179.4° | 113.8° |
| NH1 | NO | O2 | HO2 | 180.0° | 180.0° |
| NH1 | NO | O3 | HO3 | 180.0° | 180.0° |
| HH1 | NH1 | NO | O2 | 66.0° | 53.8° |
| HH1 | NH1 | NO | O3 | 113.3° | 60.0° |
| O2 | NO | O3 | HO3 | 0.7° | 66.2° |
| O3 | NO | O2 | HO2 | 0.6° | 66.2° |
