CY4
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| O | C | doub | 1.22Å | 1.25Å | |
| C | CA | sing | 1.52Å | 1.52Å | |
| C | OXT | sing | 1.36Å | 28.16Å | |
| CA | N | sing | 1.44Å | 1.45Å | |
| CA | CB | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
| CA | HA | sing | 1.10Å | 1.11Å | |
| N | H | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| N | H2 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
| CB | SG | sing | 1.81Å | 1.83Å | |
| CB | HB2 | sing | 1.10Å | 1.12Å | |
| CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| SG | CA1 | sing | 1.77Å | 1.78Å | |
| CA1 | CA2 | sing | 1.52Å | 1.54Å | |
| CA1 | OA1 | doub | 1.22Å | 1.19Å | |
| CA2 | CA3 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
| CA2 | HA22 | sing | 1.10Å | 1.11Å | |
| CA2 | HA23 | sing | 1.10Å | 1.12Å | |
| CA3 | CA4 | sing | 1.52Å | 1.53Å | |
| CA3 | HA32 | sing | 1.10Å | 1.12Å | |
| CA3 | HA33 | sing | 1.10Å | 1.11Å | |
| CA4 | HA41 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| CA4 | HA42 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
| CA4 | HA43 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
| OXT | HXT | sing | 0.98Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| O | C | CA | 120.0° | 123.8° |
| O | C | OXT | 141.4° | 123.0° |
| CA | C | OXT | 98.3° | 113.3° |
| C | CA | N | 112.6° | 111.9° |
| C | CA | CB | 110.8° | 112.4° |
| C | CA | HA | 105.4° | 106.1° |
| C | OXT | HXT | 141.4° | 111.9° |
| N | CA | CB | 106.5° | 112.0° |
| N | CA | HA | 109.8° | 105.2° |
| CA | N | H | 112.7° | 119.1° |
| CA | N | H2 | 111.1° | 119.0° |
| CB | CA | HA | 111.7° | 108.8° |
| CA | CB | SG | 108.5° | 113.7° |
| CA | CB | HB2 | 112.5° | 109.8° |
| CA | CB | HB3 | 112.5° | 110.5° |
| H | N | H2 | 111.0° | 120.5° |
| SG | CB | HB2 | 112.6° | 107.3° |
| SG | CB | HB3 | 112.6° | 107.6° |
| CB | SG | CA1 | 96.3° | 100.5° |
| HB2 | CB | HB3 | 97.9° | 107.7° |
| SG | CA1 | CA2 | 114.4° | 113.1° |
| SG | CA1 | OA1 | 124.2° | 122.7° |
| CA2 | CA1 | OA1 | 121.2° | 124.2° |
| CA1 | CA2 | CA3 | 110.9° | 112.0° |
| CA1 | CA2 | HA22 | 111.7° | 108.6° |
| CA1 | CA2 | HA23 | 111.7° | 108.6° |
| CA3 | CA2 | HA22 | 111.7° | 109.4° |
| CA3 | CA2 | HA23 | 111.7° | 109.5° |
| CA2 | CA3 | CA4 | 112.9° | 111.5° |
| CA2 | CA3 | HA32 | 110.9° | 109.9° |
| CA2 | CA3 | HA33 | 110.9° | 109.9° |
| HA22 | CA2 | HA23 | 98.7° | 108.6° |
| CA4 | CA3 | HA32 | 111.0° | 109.3° |
| CA4 | CA3 | HA33 | 111.0° | 109.3° |
| CA3 | CA4 | HA41 | 112.9° | 110.2° |
| CA3 | CA4 | HA42 | 110.9° | 111.0° |
| CA3 | CA4 | HA43 | 111.0° | 111.0° |
| HA32 | CA3 | HA33 | 99.4° | 106.8° |
| HA41 | CA4 | HA42 | 111.0° | 108.0° |
| HA41 | CA4 | HA43 | 111.0° | 108.1° |
| HA42 | CA4 | HA43 | 99.3° | 108.4° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| O | C | CA | OXT | 175.3° | 179.3° |
| O | C | CA | N | 166.3° | 5.8° |
| O | C | CA | CB | 74.5° | 121.2° |
| O | C | CA | HA | 46.5° | 120.0° |
| O | C | OXT | HXT | 179.9° | 0.0° |
| C | CA | N | CB | 121.7° | 127.2° |
| C | CA | N | HA | 117.1° | 114.8° |
| C | CA | CB | HA | 117.2° | 117.2° |
| C | CA | N | H | 180.0° | 170.5° |
| C | CA | N | H2 | 54.7° | 3.9° |
| C | CA | CB | SG | 164.9° | 59.7° |
| C | CA | CB | HB2 | 69.9° | 179.9° |
| C | CA | CB | HB3 | 39.6° | 61.5° |
| CA | C | OXT | HXT | 6.6° | 179.3° |
| OXT | C | CA | N | 9.0° | 175.0° |
| OXT | C | CA | CB | 110.2° | 58.0° |
| OXT | C | CA | HA | 128.8° | 60.8° |
| N | CA | CB | HA | 119.9° | 115.8° |
| CA | N | H | H2 | 125.3° | 166.4° |
| N | CA | CB | SG | 72.3° | 67.3° |
| N | CA | CB | HB2 | 53.0° | 53.0° |
| N | CA | CB | HB3 | 162.4° | 171.6° |
| CB | CA | N | H | 58.3° | 43.3° |
| CB | CA | N | H2 | 67.0° | 123.3° |
| CA | CB | SG | HB2 | 125.3° | 121.7° |
| CA | CB | SG | HB3 | 125.3° | 122.7° |
| CA | CB | HB2 | HB3 | 118.4° | 120.3° |
| CA | CB | SG | CA1 | 101.4° | 178.3° |
| HA | CA | N | H | 62.8° | 74.7° |
| HA | CA | N | H2 | 171.8° | 118.7° |
| HA | CA | CB | SG | 47.6° | 176.9° |
| HA | CA | CB | HB2 | 172.9° | 62.9° |
| HA | CA | CB | HB3 | 77.7° | 55.7° |
| SG | CB | HB2 | HB3 | 118.5° | 115.6° |
| CB | SG | CA1 | CA2 | 167.4° | 180.0° |
| CB | SG | CA1 | OA1 | 19.0° | 0.1° |
| HB2 | CB | SG | CA1 | 23.9° | 60.0° |
| HB3 | CB | SG | CA1 | 133.4° | 55.6° |
| SG | CA1 | CA2 | OA1 | 173.9° | 179.9° |
| SG | CA1 | CA2 | CA3 | 40.2° | 179.1° |
| SG | CA1 | CA2 | HA22 | 85.0° | 59.9° |
| SG | CA1 | CA2 | HA23 | 165.5° | 58.0° |
| CA1 | CA2 | CA3 | HA22 | 125.2° | 120.5° |
| CA1 | CA2 | CA3 | HA23 | 125.3° | 120.5° |
| CA1 | CA2 | HA22 | HA23 | 117.6° | 117.9° |
| CA1 | CA2 | CA3 | CA4 | 86.9° | 178.7° |
| CA1 | CA2 | CA3 | HA32 | 38.4° | 60.0° |
| CA1 | CA2 | CA3 | HA33 | 147.8° | 57.3° |
| OA1 | CA1 | CA2 | CA3 | 145.9° | 1.0° |
| OA1 | CA1 | CA2 | HA22 | 88.8° | 119.9° |
| OA1 | CA1 | CA2 | HA23 | 20.6° | 122.1° |
| CA3 | CA2 | HA22 | HA23 | 117.6° | 119.5° |
| CA2 | CA3 | CA4 | HA32 | 125.3° | 121.7° |
| CA2 | CA3 | CA4 | HA33 | 125.2° | 121.8° |
| CA2 | CA3 | HA32 | HA33 | 116.8° | 119.2° |
| CA2 | CA3 | CA4 | HA41 | 180.0° | 179.9° |
| CA2 | CA3 | CA4 | HA42 | 54.7° | 60.2° |
| CA2 | CA3 | CA4 | HA43 | 54.7° | 60.4° |
| HA22 | CA2 | CA3 | CA4 | 147.9° | 58.2° |
| HA22 | CA2 | CA3 | HA32 | 86.8° | 179.5° |
| HA22 | CA2 | CA3 | HA33 | 22.6° | 63.2° |
| HA23 | CA2 | CA3 | CA4 | 38.4° | 60.8° |
| HA23 | CA2 | CA3 | HA32 | 163.7° | 60.5° |
| HA23 | CA2 | CA3 | HA33 | 86.9° | 177.8° |
| CA4 | CA3 | HA32 | HA33 | 116.9° | 118.1° |
| CA3 | CA4 | HA41 | HA42 | 125.3° | 121.4° |
| CA3 | CA4 | HA41 | HA43 | 125.3° | 121.5° |
| CA3 | CA4 | HA42 | HA43 | 116.8° | 122.2° |
| HA32 | CA3 | CA4 | HA41 | 54.8° | 58.4° |
| HA32 | CA3 | CA4 | HA42 | 180.0° | 178.0° |
| HA32 | CA3 | CA4 | HA43 | 70.6° | 61.4° |
| HA33 | CA3 | CA4 | HA41 | 54.7° | 58.1° |
| HA33 | CA3 | CA4 | HA42 | 70.5° | 61.5° |
| HA33 | CA3 | CA4 | HA43 | 179.9° | 177.9° |
| HA41 | CA4 | HA42 | HA43 | 116.9° | 116.9° |
