CAV
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
N | CA | sing | 1.47Å | 1.44Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
CA | CB | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
CA | CH | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CB | CG | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CG | CD1 | sing | 1.53Å | 1.58Å | |
CG | CD2 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
CG | HG | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CD1 | CE1 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
CD1 | HD12 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CD1 | HD13 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CD2 | CE2 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
CD2 | HD23 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CD2 | HD22 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CE1 | CZ | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
CE1 | HE12 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CE1 | HE13 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CE2 | CZ | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
CE2 | HE23 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CE2 | HE22 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CZ | HZ2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CZ | HZ3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CH | OH | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
CH | CB1 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
CH | HH | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
OH | HO | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
CB1 | CA' | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
CB1 | OB1 | sing | 1.43Å | 1.35Å | |
CB1 | HB1 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CA' | CB' | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
CA' | C | sing | 1.51Å | 1.52Å | |
CA' | HA' | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CB' | CG1 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
CB' | CG2 | sing | 1.53Å | 1.57Å | |
CB' | HB' | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CG1 | HG11 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CG1 | HG12 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CG1 | HG13 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CG2 | HG21 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CG2 | HG22 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CG2 | HG23 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
OB1 | HOB1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C | O | doub | 1.21Å | 1.24Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 1.34Å | |
OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
CA | N | H | 108.1° | 106.7° |
CA | N | H2 | 112.7° | 106.7° |
N | CA | CB | 108.1° | 109.4° |
N | CA | CH | 115.8° | 109.5° |
N | CA | HA | 107.2° | 109.5° |
H | N | H2 | 112.6° | 106.7° |
CB | CA | CH | 112.7° | 109.5° |
CB | CA | HA | 110.7° | 109.5° |
CA | CB | CG | 113.5° | 109.5° |
CA | CB | HB2 | 110.7° | 109.4° |
CA | CB | HB3 | 110.7° | 109.4° |
CH | CA | HA | 102.0° | 109.4° |
CA | CH | OH | 120.9° | 109.5° |
CA | CH | CB1 | 110.2° | 109.5° |
CA | CH | HH | 99.0° | 109.5° |
CG | CB | HB2 | 110.8° | 109.5° |
CG | CB | HB3 | 110.7° | 109.5° |
CB | CG | CD1 | 110.0° | 109.5° |
CB | CG | CD2 | 111.2° | 109.5° |
CB | CG | HG | 108.2° | 109.5° |
HB2 | CB | HB3 | 99.6° | 109.5° |
CD1 | CG | CD2 | 110.2° | 109.5° |
CD1 | CG | HG | 109.1° | 109.4° |
CG | CD1 | CE1 | 104.9° | 109.5° |
CG | CD1 | HD12 | 113.9° | 109.5° |
CG | CD1 | HD13 | 113.9° | 109.4° |
CD2 | CG | HG | 108.0° | 109.5° |
CG | CD2 | CE2 | 113.7° | 109.5° |
CG | CD2 | HD23 | 110.6° | 109.5° |
CG | CD2 | HD22 | 110.7° | 109.4° |
CE1 | CD1 | HD12 | 113.9° | 109.4° |
CE1 | CD1 | HD13 | 113.9° | 109.5° |
CD1 | CE1 | CZ | 109.8° | 109.5° |
CD1 | CE1 | HE12 | 112.1° | 109.5° |
CD1 | CE1 | HE13 | 112.1° | 109.4° |
HD12 | CD1 | HD13 | 96.6° | 109.5° |
CE2 | CD2 | HD23 | 110.7° | 109.5° |
CE2 | CD2 | HD22 | 110.6° | 109.4° |
CD2 | CE2 | CZ | 112.7° | 109.5° |
CD2 | CE2 | HE23 | 111.1° | 109.5° |
CD2 | CE2 | HE22 | 111.1° | 109.5° |
HD23 | CD2 | HD22 | 99.7° | 109.5° |
CZ | CE1 | HE12 | 112.1° | 109.5° |
CZ | CE1 | HE13 | 112.1° | 109.4° |
CE1 | CZ | CE2 | 110.2° | 109.5° |
CE1 | CZ | HZ2 | 111.9° | 109.5° |
CE1 | CZ | HZ3 | 111.9° | 109.5° |
HE12 | CE1 | HE13 | 98.3° | 109.5° |
CZ | CE2 | HE23 | 111.0° | 109.4° |
CZ | CE2 | HE22 | 111.0° | 109.4° |
CE2 | CZ | HZ2 | 112.0° | 109.5° |
CE2 | CZ | HZ3 | 112.0° | 109.4° |
HE23 | CE2 | HE22 | 99.3° | 109.5° |
HZ2 | CZ | HZ3 | 98.5° | 109.4° |
OH | CH | CB1 | 103.8° | 109.4° |
OH | CH | HH | 106.1° | 109.5° |
CH | OH | HO | 120.9° | 106.8° |
CB1 | CH | HH | 117.6° | 109.5° |
CH | CB1 | CA' | 119.0° | 109.5° |
CH | CB1 | OB1 | 108.9° | 109.5° |
CH | CB1 | HB1 | 104.8° | 109.5° |
CA' | CB1 | OB1 | 114.3° | 109.5° |
CA' | CB1 | HB1 | 98.1° | 109.4° |
CB1 | CA' | CB' | 113.7° | 109.5° |
CB1 | CA' | C | 109.0° | 109.5° |
CB1 | CA' | HA' | 108.3° | 109.4° |
OB1 | CB1 | HB1 | 110.6° | 109.4° |
CB1 | OB1 | HOB1 | 109.0° | 106.8° |
CB' | CA' | C | 113.5° | 109.5° |
CB' | CA' | HA' | 103.3° | 109.4° |
CA' | CB' | CG1 | 114.3° | 109.5° |
CA' | CB' | CG2 | 110.9° | 109.5° |
CA' | CB' | HB' | 105.3° | 109.5° |
C | CA' | HA' | 108.6° | 109.5° |
CA' | C | O | 120.5° | 119.9° |
CA' | C | OXT | 117.1° | 120.0° |
CG1 | CB' | CG2 | 110.5° | 109.4° |
CG1 | CB' | HB' | 105.8° | 109.4° |
CB' | CG1 | HG11 | 114.3° | 109.5° |
CB' | CG1 | HG12 | 110.4° | 109.5° |
CB' | CG1 | HG13 | 110.5° | 109.4° |
CG2 | CB' | HB' | 109.6° | 109.5° |
CB' | CG2 | HG21 | 110.9° | 109.5° |
CB' | CG2 | HG22 | 111.7° | 109.4° |
CB' | CG2 | HG23 | 111.6° | 109.5° |
HG11 | CG1 | HG12 | 110.4° | 109.5° |
HG11 | CG1 | HG13 | 110.5° | 109.5° |
HG12 | CG1 | HG13 | 99.8° | 109.4° |
HG21 | CG2 | HG22 | 111.7° | 109.5° |
HG21 | CG2 | HG23 | 111.7° | 109.5° |
HG22 | CG2 | HG23 | 98.7° | 109.5° |
O | C | OXT | 122.3° | 120.0° |
C | OXT | HXT | 117.1° | 120.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
CA | N | H | H2 | 125.2° | 113.7° |
N | CA | CB | CH | 129.3° | 120.0° |
N | CA | CB | HA | 117.1° | 120.0° |
N | CA | CH | HA | 116.0° | 120.0° |
N | CA | CB | CG | 54.2° | 60.0° |
N | CA | CB | HB2 | 71.1° | 60.0° |
N | CA | CB | HB3 | 179.4° | 180.0° |
N | CA | CH | OH | 58.1° | 60.0° |
N | CA | CH | CB1 | 62.9° | 60.0° |
N | CA | CH | HH | 173.1° | 180.0° |
H | N | CA | CB | 180.0° | 53.8° |
H | N | CA | CH | 52.4° | 173.8° |
H | N | CA | HA | 60.6° | 66.3° |
H2 | N | CA | CB | 54.8° | 60.0° |
H2 | N | CA | CH | 177.6° | 60.0° |
H2 | N | CA | HA | 64.5° | 180.0° |
CB | CA | CH | HA | 118.7° | 120.0° |
CA | CB | CG | HB2 | 125.2° | 120.0° |
CA | CB | CG | HB3 | 125.2° | 120.0° |
CA | CB | HB2 | HB3 | 116.5° | 120.0° |
CA | CB | CG | CD1 | 77.8° | 180.0° |
CA | CB | CG | CD2 | 159.7° | 60.0° |
CA | CB | CG | HG | 41.3° | 60.0° |
CB | CA | CH | OH | 67.1° | 60.0° |
CB | CA | CH | CB1 | 171.8° | 180.0° |
CB | CA | CH | HH | 47.8° | 60.0° |
CH | CA | CB | CG | 176.5° | 180.0° |
CH | CA | CB | HB2 | 58.2° | 60.0° |
CH | CA | CB | HB3 | 51.2° | 60.0° |
CA | CH | OH | CB1 | 124.2° | 120.0° |
CA | CH | OH | HH | 111.2° | 120.0° |
CA | CH | CB1 | HH | 112.4° | 120.0° |
CA | CH | OH | HO | 179.9° | 60.0° |
CA | CH | CB1 | CA' | 145.5° | 180.0° |
CA | CH | CB1 | OB1 | 81.1° | 60.0° |
CA | CH | CB1 | HB1 | 37.3° | 60.0° |
HA | CA | CB | CG | 63.0° | 60.0° |
HA | CA | CB | HB2 | 171.8° | 180.0° |
HA | CA | CB | HB3 | 62.3° | 60.0° |
HA | CA | CH | OH | 174.1° | 180.0° |
HA | CA | CH | CB1 | 53.1° | 60.0° |
HA | CA | CH | HH | 70.9° | 60.0° |
CG | CB | HB2 | HB3 | 116.6° | 120.0° |
CB | CG | CD1 | CD2 | 123.0° | 120.0° |
CB | CG | CD1 | HG | 118.6° | 120.0° |
CB | CG | CD2 | HG | 118.5° | 120.0° |
CB | CG | CD1 | CE1 | 175.3° | 180.0° |
CB | CG | CD1 | HD12 | 59.5° | 60.0° |
CB | CG | CD1 | HD13 | 50.1° | 60.0° |
CB | CG | CD2 | CE2 | 175.5° | 180.0° |
CB | CG | CD2 | HD23 | 59.3° | 60.0° |
CB | CG | CD2 | HD22 | 50.2° | 60.0° |
HB2 | CB | CG | CD1 | 156.9° | 60.0° |
HB2 | CB | CG | CD2 | 34.5° | 180.0° |
HB2 | CB | CG | HG | 83.9° | 60.0° |
HB3 | CB | CG | CD1 | 47.4° | 60.0° |
HB3 | CB | CG | CD2 | 75.0° | 60.0° |
HB3 | CB | CG | HG | 166.6° | 180.0° |
CD1 | CG | CD2 | HG | 119.2° | 120.0° |
CG | CD1 | CE1 | HD12 | 125.2° | 120.0° |
CG | CD1 | CE1 | HD13 | 125.2° | 120.0° |
CG | CD1 | HD12 | HD13 | 119.9° | 120.0° |
CD1 | CG | CD2 | CE2 | 53.2° | 60.0° |
CD1 | CG | CD2 | HD23 | 178.4° | 60.0° |
CD1 | CG | CD2 | HD22 | 72.1° | 179.9° |
CG | CD1 | CE1 | CZ | 67.4° | 60.0° |
CG | CD1 | CE1 | HE12 | 167.2° | 60.0° |
CG | CD1 | CE1 | HE13 | 57.8° | 179.9° |
CD2 | CG | CD1 | CE1 | 61.7° | 60.0° |
CD2 | CG | CD1 | HD12 | 63.5° | 180.0° |
CD2 | CG | CD1 | HD13 | 173.0° | 60.0° |
CG | CD2 | CE2 | HD23 | 125.2° | 120.1° |
CG | CD2 | CE2 | HD22 | 125.2° | 119.9° |
CG | CD2 | HD23 | HD22 | 116.6° | 120.0° |
CG | CD2 | CE2 | CZ | 46.9° | 60.0° |
CG | CD2 | CE2 | HE23 | 78.3° | 60.0° |
CG | CD2 | CE2 | HE22 | 172.1° | 180.0° |
HG | CG | CD1 | CE1 | 56.7° | 60.0° |
HG | CG | CD1 | HD12 | 178.0° | 60.0° |
HG | CG | CD1 | HD13 | 68.5° | 180.0° |
HG | CG | CD2 | CE2 | 66.0° | 60.0° |
HG | CG | CD2 | HD23 | 59.2° | 180.0° |
HG | CG | CD2 | HD22 | 168.8° | 60.0° |
CE1 | CD1 | HD12 | HD13 | 119.9° | 120.0° |
CD1 | CE1 | CZ | HE12 | 125.3° | 120.0° |
CD1 | CE1 | CZ | HE13 | 125.3° | 119.9° |
CD1 | CE1 | HE12 | HE13 | 118.0° | 120.0° |
CD1 | CE1 | CZ | CE2 | 62.9° | 60.0° |
CD1 | CE1 | CZ | HZ2 | 62.3° | 180.0° |
CD1 | CE1 | CZ | HZ3 | 171.8° | 60.0° |
HD12 | CD1 | CE1 | CZ | 57.8° | 180.0° |
HD12 | CD1 | CE1 | HE12 | 67.5° | 60.0° |
HD12 | CD1 | CE1 | HE13 | 176.9° | 60.1° |
HD13 | CD1 | CE1 | CZ | 167.3° | 60.0° |
HD13 | CD1 | CE1 | HE12 | 42.0° | 180.0° |
HD13 | CD1 | CE1 | HE13 | 67.4° | 60.0° |
CE2 | CD2 | HD23 | HD22 | 116.5° | 120.0° |
CD2 | CE2 | CZ | CE1 | 50.5° | 60.0° |
CD2 | CE2 | CZ | HE23 | 125.3° | 120.0° |
CD2 | CE2 | CZ | HE22 | 125.3° | 120.0° |
CD2 | CE2 | HE23 | HE22 | 117.0° | 120.0° |
CD2 | CE2 | CZ | HZ2 | 74.7° | 180.0° |
CD2 | CE2 | CZ | HZ3 | 175.7° | 60.0° |
HD23 | CD2 | CE2 | CZ | 172.1° | 60.0° |
HD23 | CD2 | CE2 | HE23 | 46.9° | 180.0° |
HD23 | CD2 | CE2 | HE22 | 62.6° | 59.9° |
HD22 | CD2 | CE2 | CZ | 78.3° | 179.9° |
HD22 | CD2 | CE2 | HE23 | 156.4° | 60.0° |
HD22 | CD2 | CE2 | HE22 | 46.9° | 60.1° |
CZ | CE1 | HE12 | HE13 | 118.0° | 120.0° |
CE1 | CZ | CE2 | HZ2 | 125.2° | 120.0° |
CE1 | CZ | CE2 | HZ3 | 125.2° | 120.0° |
CE1 | CZ | CE2 | HE23 | 74.7° | 60.0° |
CE1 | CZ | CE2 | HE22 | 175.8° | 180.0° |
CE1 | CZ | HZ2 | HZ3 | 117.8° | 120.0° |
HE12 | CE1 | CZ | CE2 | 171.8° | 60.0° |
HE12 | CE1 | CZ | HZ2 | 63.0° | 60.0° |
HE12 | CE1 | CZ | HZ3 | 46.5° | 180.0° |
HE13 | CE1 | CZ | CE2 | 62.4° | 179.9° |
HE13 | CE1 | CZ | HZ2 | 172.4° | 60.0° |
HE13 | CE1 | CZ | HZ3 | 62.9° | 60.0° |
CZ | CE2 | HE23 | HE22 | 116.9° | 120.0° |
CE2 | CZ | HZ2 | HZ3 | 117.9° | 120.0° |
HE23 | CE2 | CZ | HZ2 | 160.0° | 60.0° |
HE23 | CE2 | CZ | HZ3 | 50.5° | 180.0° |
HE22 | CE2 | CZ | HZ2 | 50.6° | 60.0° |
HE22 | CE2 | CZ | HZ3 | 59.0° | 60.0° |
OH | CH | CB1 | HH | 116.8° | 120.0° |
OH | CH | CB1 | CA' | 83.7° | 60.0° |
OH | CH | CB1 | OB1 | 49.7° | 60.1° |
OH | CH | CB1 | HB1 | 168.1° | 180.0° |
CB1 | CH | OH | HO | 55.8° | 60.1° |
CH | CB1 | CA' | OB1 | 131.0° | 120.1° |
CH | CB1 | CA' | HB1 | 111.9° | 120.0° |
CH | CB1 | OB1 | HB1 | 114.7° | 120.0° |
CH | CB1 | CA' | CB' | 164.7° | 173.8° |
CH | CB1 | CA' | C | 67.5° | 66.1° |
CH | CB1 | CA' | HA' | 50.5° | 53.9° |
CH | CB1 | OB1 | HOB1 | 180.0° | 60.1° |
HH | CH | OH | HO | 68.8° | 180.0° |
HH | CH | CB1 | CA' | 33.1° | 60.0° |
HH | CH | CB1 | OB1 | 166.5° | 180.0° |
HH | CH | CB1 | HB1 | 75.1° | 60.0° |
CA' | CB1 | OB1 | HB1 | 109.5° | 119.9° |
CB1 | CA' | CB' | C | 125.4° | 120.1° |
CB1 | CA' | CB' | HA' | 117.2° | 119.9° |
CB1 | CA' | C | HA' | 117.8° | 119.9° |
CB1 | CA' | CB' | CG1 | 57.1° | 59.3° |
CB1 | CA' | CB' | CG2 | 177.1° | 179.2° |
CB1 | CA' | CB' | HB' | 58.6° | 60.7° |
CA' | CB1 | OB1 | HOB1 | 44.2° | 60.0° |
CB1 | CA' | C | O | 50.1° | 120.0° |
CB1 | CA' | C | OXT | 126.2° | 59.9° |
OB1 | CB1 | CA' | CB' | 33.6° | 53.8° |
OB1 | CB1 | CA' | C | 161.4° | 173.9° |
OB1 | CB1 | CA' | HA' | 80.6° | 66.1° |
HB1 | CB1 | CA' | CB' | 83.4° | 66.1° |
HB1 | CB1 | CA' | C | 44.4° | 54.0° |
HB1 | CB1 | CA' | HA' | 162.4° | 174.0° |
HB1 | CB1 | OB1 | HOB1 | 65.3° | 179.9° |
CB' | CA' | C | HA' | 114.3° | 120.0° |
CA' | CB' | CG1 | CG2 | 126.0° | 120.0° |
CA' | CB' | CG1 | HB' | 115.4° | 120.0° |
CA' | CB' | CG2 | HB' | 115.9° | 120.1° |
CA' | CB' | CG1 | HG11 | 179.9° | 180.0° |
CA' | CB' | CG1 | HG12 | 54.8° | 60.0° |
CA' | CB' | CG1 | HG13 | 54.7° | 60.0° |
CA' | CB' | CG2 | HG21 | 180.0° | 67.2° |
CA' | CB' | CG2 | HG22 | 54.8° | 52.8° |
CA' | CB' | CG2 | HG23 | 54.7° | 172.8° |
CB' | CA' | C | O | 77.8° | 0.1° |
CB' | CA' | C | OXT | 105.9° | 180.0° |
C | CA' | CB' | CG1 | 68.3° | 60.8° |
C | CA' | CB' | CG2 | 57.5° | 59.1° |
C | CA' | CB' | HB' | 176.0° | 179.2° |
CA' | C | O | OXT | 176.1° | 179.9° |
CA' | C | OXT | HXT | 180.0° | 179.9° |
HA' | CA' | CB' | CG1 | 174.3° | 179.2° |
HA' | CA' | CB' | CG2 | 60.0° | 60.9° |
HA' | CA' | CB' | HB' | 58.6° | 59.2° |
HA' | CA' | C | O | 167.9° | 120.0° |
HA' | CA' | C | OXT | 8.4° | 60.1° |
CG1 | CB' | CG2 | HB' | 116.2° | 119.9° |
CB' | CG1 | HG11 | HG12 | 125.2° | 120.0° |
CB' | CG1 | HG11 | HG13 | 125.3° | 120.0° |
CB' | CG1 | HG12 | HG13 | 116.3° | 119.9° |
CG1 | CB' | CG2 | HG21 | 52.2° | 52.8° |
CG1 | CB' | CG2 | HG22 | 73.1° | 172.8° |
CG1 | CB' | CG2 | HG23 | 177.4° | 67.2° |
CG2 | CB' | CG1 | HG11 | 54.1° | 60.0° |
CG2 | CB' | CG1 | HG12 | 179.3° | 180.0° |
CG2 | CB' | CG1 | HG13 | 71.2° | 60.1° |
CB' | CG2 | HG21 | HG22 | 125.3° | 119.9° |
CB' | CG2 | HG21 | HG23 | 125.2° | 120.0° |
CB' | CG2 | HG22 | HG23 | 117.5° | 120.0° |
HB' | CB' | CG1 | HG11 | 64.5° | 59.9° |
HB' | CB' | CG1 | HG12 | 60.7° | 60.1° |
HB' | CB' | CG1 | HG13 | 170.2° | 180.0° |
HB' | CB' | CG2 | HG21 | 64.0° | 172.8° |
HB' | CB' | CG2 | HG22 | 170.7° | 67.2° |
HB' | CB' | CG2 | HG23 | 61.2° | 52.7° |
HG11 | CG1 | HG12 | HG13 | 116.3° | 120.0° |
HG21 | CG2 | HG22 | HG23 | 117.6° | 120.0° |
O | C | OXT | HXT | 3.8° | 0.0° |