BEM
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O3 | C3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
O2 | C2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
C3 | C2 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
O4 | C4 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C2 | C1 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
O6A | C6 | doub | 1.21Å | 1.25Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.39Å | |
C5 | C6 | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C6 | O6B | sing | 1.34Å | 1.25Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O6B | HO6B | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O3 | C3 | C4 | 111.6° | 109.5° |
O3 | C3 | C2 | 110.5° | 109.5° |
O3 | C3 | H3 | 108.4° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
O2 | C2 | C3 | 112.1° | 109.5° |
O2 | C2 | C1 | 108.2° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 108.4° | 109.5° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 113.9° |
C4 | C3 | C2 | 112.6° | 109.0° |
C3 | C4 | O4 | 111.7° | 109.5° |
C3 | C4 | C5 | 111.3° | 109.1° |
C4 | C3 | H3 | 106.1° | 109.6° |
C3 | C4 | H4 | 104.7° | 109.6° |
C3 | C2 | C1 | 109.0° | 109.1° |
C3 | C2 | H2 | 107.6° | 109.5° |
C2 | C3 | H3 | 107.4° | 109.5° |
O4 | C4 | C5 | 102.3° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 113.3° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C5 | O5 | 106.5° | 109.4° |
C4 | C5 | C6 | 119.9° | 109.4° |
C5 | C4 | H4 | 113.7° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 102.5° | 109.5° |
C2 | C1 | O5 | 106.1° | 109.4° |
C2 | C1 | O1 | 109.7° | 109.4° |
C2 | C1 | H1 | 110.3° | 109.5° |
C1 | C2 | H2 | 111.5° | 109.6° |
O6A | C6 | C5 | 119.9° | 120.0° |
O6A | C6 | O6B | 123.9° | 120.0° |
O5 | C5 | C6 | 102.6° | 109.4° |
C5 | O5 | C1 | 112.7° | 114.1° |
O5 | C5 | H5 | 119.9° | 109.5° |
C5 | C6 | O6B | 116.1° | 120.0° |
C6 | C5 | H5 | 106.5° | 109.5° |
O5 | C1 | O1 | 105.5° | 109.5° |
O5 | C1 | H1 | 114.2° | 109.5° |
O1 | C1 | H1 | 110.9° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
C6 | O6B | HO6B | 109.5° | 117.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O3 | C3 | C2 | O2 | 54.0° | 56.9° |
O3 | C3 | C4 | C2 | 124.9° | 119.8° |
O3 | C3 | C4 | H3 | 117.9° | 120.3° |
O3 | C3 | C2 | H3 | 118.0° | 120.3° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 76.4° | 63.3° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 170.0° | 176.9° |
O3 | C3 | C2 | C1 | 173.8° | 176.8° |
O3 | C3 | C2 | H2 | 65.1° | 63.2° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 46.7° | 56.9° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 71.5° | 62.9° |
O2 | C2 | C3 | C1 | 119.8° | 119.9° |
O2 | C2 | C3 | H2 | 119.1° | 120.2° |
O2 | C2 | C1 | H2 | 119.2° | 120.2° |
O2 | C2 | C1 | O5 | 63.4° | 62.3° |
O2 | C2 | C1 | O1 | 50.1° | 57.7° |
O2 | C2 | C1 | H1 | 172.5° | 177.7° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 172.0° | 177.2° |
C4 | C3 | C2 | H3 | 116.4° | 119.9° |
C3 | C4 | O4 | C5 | 119.1° | 119.6° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 118.0° | 120.2° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 118.0° | 120.0° |
C4 | C3 | C2 | C1 | 48.2° | 57.0° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 52.6° | 57.7° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 168.3° | 177.6° |
C4 | C3 | C2 | H2 | 169.3° | 176.9° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 55.7° | 180.0° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 110.6° | 180.0° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 74.1° | 62.4° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 158.7° | 176.9° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 45.0° | 57.0° |
C3 | C2 | C1 | H2 | 118.6° | 119.9° |
C3 | C2 | C1 | O5 | 58.8° | 57.6° |
C3 | C2 | C1 | O1 | 172.3° | 177.6° |
C3 | C2 | C1 | H1 | 65.3° | 62.4° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 123.0° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 70.4° | 60.4° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 78.3° | 62.9° |
O4 | C4 | C5 | H4 | 122.6° | 120.2° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 172.0° | 177.6° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 72.3° | 62.5° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 41.5° | 57.0° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 45.3° | 57.5° |
C4 | C5 | C6 | O6A | 15.7° | 115.0° |
C4 | C5 | O5 | C6 | 126.8° | 119.9° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 115.6° | 120.0° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 115.5° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | C1 | 69.8° | 61.2° |
C4 | C5 | C6 | O6B | 164.7° | 65.1° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 72.2° | 62.8° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 8.4° | 60.3° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 74.3° | 61.2° |
C2 | C1 | O5 | O1 | 116.3° | 119.9° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 121.7° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | H1 | 122.1° | 120.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 2.7° | 60.0° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 68.2° | 62.9° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 2.1° | 180.0° |
O6A | C6 | C5 | O5 | 102.0° | 4.9° |
O6A | C6 | C5 | O6B | 179.6° | 179.9° |
O6A | C6 | C5 | H5 | 131.2° | 125.0° |
O6A | C6 | O6B | HO6B | 0.0° | 0.1° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 126.8° | 120.1° |
C5 | O5 | C1 | O1 | 169.4° | 178.8° |
O5 | C5 | C6 | O6B | 77.6° | 175.0° |
C5 | O5 | C1 | H1 | 47.4° | 58.8° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 65.3° | 62.3° |
C6 | C5 | O5 | C1 | 163.4° | 178.9° |
C6 | C5 | C4 | H4 | 50.3° | 57.6° |
C5 | C6 | O6B | HO6B | 179.6° | 180.0° |
O5 | C1 | O1 | H1 | 124.1° | 120.1° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 177.5° | 177.5° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 45.8° | 58.8° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 111.8° | 60.0° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 69.1° | 62.5° |
O6B | C6 | C5 | H5 | 49.2° | 54.9° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 53.3° | 57.5° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 124.1° | 60.1° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 118.4° | 60.2° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 52.9° | 57.0° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 172.2° | 59.8° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 164.5° | 177.2° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 131.4° | 59.8° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 167.9° | 177.7° |