BDP
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.39Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.51Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.40Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | C6 | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.40Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | O6A | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
C6 | O6B | sing | 1.34Å | 1.25Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O6B | HO6B | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C2 | C1 | O5 | 111.7° | 109.4° |
C2 | C1 | O1 | 103.0° | 109.5° |
C2 | C1 | H1 | 110.3° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 113.0° | 109.1° |
C1 | C2 | O2 | 106.1° | 109.5° |
C1 | C2 | H2 | 110.5° | 109.5° |
O5 | C1 | O1 | 103.0° | 109.5° |
O5 | C1 | H1 | 110.3° | 109.5° |
C1 | O5 | C5 | 118.3° | 114.1° |
O1 | C1 | H1 | 118.1° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
C3 | C2 | O2 | 112.5° | 109.6° |
C3 | C2 | H2 | 103.8° | 109.5° |
C2 | C3 | C4 | 107.7° | 109.1° |
C2 | C3 | O3 | 107.4° | 109.5° |
C2 | C3 | H3 | 112.1° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 111.0° | 109.6° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C4 | C3 | O3 | 109.8° | 109.5° |
C4 | C3 | H3 | 109.7° | 109.6° |
C3 | C4 | C5 | 108.7° | 109.2° |
C3 | C4 | O4 | 111.2° | 109.5° |
C3 | C4 | H4 | 108.3° | 109.6° |
O3 | C3 | H3 | 110.1° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
C5 | C4 | O4 | 107.9° | 109.5° |
C5 | C4 | H4 | 111.6° | 109.5° |
C4 | C5 | C6 | 113.9° | 109.5° |
C4 | C5 | O5 | 109.6° | 109.4° |
C4 | C5 | H5 | 104.3° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 109.1° | 109.6° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
C6 | C5 | O5 | 101.9° | 109.5° |
C6 | C5 | H5 | 111.7° | 109.5° |
C5 | C6 | O6A | 116.6° | 120.0° |
C5 | C6 | O6B | 118.3° | 120.0° |
O5 | C5 | H5 | 115.8° | 109.5° |
O6A | C6 | O6B | 125.0° | 120.0° |
C6 | O6B | HO6B | 109.5° | 117.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
C2 | C1 | O5 | O1 | 109.9° | 120.0° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 123.1° | 120.0° |
C2 | C1 | O1 | H1 | 121.9° | 120.0° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 120.1° | 119.9° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 119.8° | 119.8° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 120.1° | 120.1° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 52.4° | 57.0° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 170.6° | 176.8° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 68.4° | 62.9° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 49.5° | 61.2° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
O5 | C1 | O1 | H1 | 121.9° | 120.1° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 46.4° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 170.1° | 177.5° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 69.4° | 62.3° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 57.3° | 61.2° |
C1 | O5 | C5 | C6 | 178.3° | 178.8° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 60.3° | 58.8° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 63.7° | 60.1° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 156.3° | 177.6° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 79.9° | 62.5° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 40.5° | 57.7° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 159.4° | 178.9° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 76.7° | 62.4° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 47.0° | 57.5° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 167.5° | 177.7° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 73.6° | 58.8° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 58.2° | 60.0° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 115.8° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 116.6° | 119.8° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 122.3° | 119.9° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 122.3° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 58.9° | 57.0° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 177.6° | 176.9° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 62.5° | 62.9° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 55.9° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.0° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 172.6° | 176.9° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 69.2° | 63.2° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 51.8° | 57.0° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 67.3° | 62.8° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 50.9° | 57.0° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 171.9° | 177.3° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 59.9° | 60.1° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 120.9° | 120.3° |
C3 | C4 | C5 | O4 | 120.8° | 119.9° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 119.4° | 120.0° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 119.4° | 120.2° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 173.8° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 60.4° | 57.6° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 64.2° | 62.3° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 63.2° | 179.6° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 146.0° | 180.0° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 175.5° | 176.8° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 65.7° | 63.3° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 54.1° | 56.9° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 63.4° | 62.9° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 55.4° | 57.0° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 175.2° | 177.2° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 57.7° | 60.2° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 121.4° | 120.1° |
C4 | C5 | C6 | O5 | 117.9° | 119.9° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 117.8° | 120.0° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 117.6° | 120.0° |
C4 | C5 | C6 | O6A | 81.1° | 115.0° |
C4 | C5 | C6 | O6B | 101.5° | 65.0° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 26.8° | 60.3° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 65.4° | 62.5° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 178.8° | 177.5° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 56.6° | 57.6° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 54.4° | 57.6° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 59.0° | 62.3° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 176.4° | 177.7° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 94.6° | 59.8° |
C6 | C5 | O5 | H5 | 121.4° | 120.0° |
C5 | C6 | O6A | O6B | 177.2° | 180.0° |
C5 | C6 | O6B | HO6B | 177.1° | 180.0° |
O5 | C5 | C6 | O6A | 160.9° | 4.9° |
O5 | C5 | C6 | O6B | 16.4° | 175.1° |
H5 | C5 | C6 | O6A | 36.7° | 125.0° |
H5 | C5 | C6 | O6B | 140.7° | 55.0° |
O6A | C6 | O6B | HO6B | 0.0° | 0.0° |