B9D
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C5 | O1 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.46Å | |
O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.47Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
F1 | C1 | sing | 1.40Å | 1.37Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | C3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2 | C2 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C2 | C1 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C6 | C1 | sing | 1.53Å | 1.59Å | |
C6 | O6 | sing | 1.43Å | 1.46Å | |
C6 | H6 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H6A | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C5 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
O1 | C5 | O5 | 111.6° | 109.5° |
O1 | C5 | C4 | 110.0° | 109.5° |
O1 | C5 | H5 | 109.3° | 109.5° |
C1 | O5 | C5 | 114.3° | 114.1° |
O5 | C1 | F1 | 110.6° | 109.5° |
O5 | C1 | C2 | 108.3° | 109.4° |
O5 | C1 | C6 | 111.4° | 109.5° |
O5 | C5 | C4 | 109.0° | 109.4° |
O5 | C5 | H5 | 108.9° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 108.0° | 109.5° |
C5 | C4 | C3 | 107.8° | 109.2° |
C5 | C4 | O4 | 109.9° | 109.5° |
C5 | C4 | H4 | 108.8° | 109.5° |
F1 | C1 | C2 | 109.8° | 109.5° |
F1 | C1 | C6 | 103.9° | 109.5° |
C3 | C4 | O4 | 110.8° | 109.6° |
C3 | C4 | H4 | 108.9° | 109.6° |
C4 | C3 | O3 | 110.5° | 109.6° |
C4 | C3 | C2 | 110.1° | 109.0° |
C4 | C3 | H3 | 108.5° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 110.5° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.1° |
O3 | C3 | C2 | 109.2° | 109.6° |
O3 | C3 | H3 | 110.1° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
C2 | C3 | H3 | 108.5° | 109.5° |
C3 | C2 | O2 | 110.1° | 109.5° |
C3 | C2 | C1 | 111.1° | 109.2° |
C3 | C2 | H2 | 108.3° | 109.6° |
O2 | C2 | C1 | 109.8° | 109.5° |
O2 | C2 | H2 | 109.4° | 109.5° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
C1 | C2 | H2 | 108.0° | 109.5° |
C2 | C1 | C6 | 112.8° | 109.5° |
C1 | C6 | O6 | 113.2° | 109.5° |
C1 | C6 | H6 | 108.5° | 109.4° |
C1 | C6 | H6A | 108.5° | 109.5° |
O6 | C6 | H6 | 108.5° | 109.5° |
O6 | C6 | H6A | 108.6° | 109.5° |
C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 114.0° |
H6 | C6 | H6A | 109.5° | 109.5° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O1 | C5 | O5 | C1 | 175.6° | 58.9° |
O1 | C5 | O5 | C4 | 121.7° | 120.0° |
O1 | C5 | O5 | H5 | 120.8° | 120.0° |
O1 | C5 | C4 | H5 | 119.2° | 120.0° |
O1 | C5 | C4 | C3 | 177.4° | 62.4° |
O1 | C5 | C4 | O4 | 56.6° | 177.7° |
O1 | C5 | C4 | H4 | 64.6° | 57.6° |
HO1 | O1 | C5 | O5 | 180.0° | 59.9° |
HO1 | O1 | C5 | C4 | 58.9° | 179.9° |
HO1 | O1 | C5 | H5 | 59.5° | 60.1° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 62.7° | 61.1° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 54.8° | 178.9° |
O5 | C1 | F1 | C2 | 119.4° | 119.9° |
O5 | C1 | F1 | C6 | 119.7° | 120.0° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 54.3° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 176.4° | 62.3° |
O5 | C1 | C2 | C6 | 123.7° | 120.0° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 64.3° | 177.5° |
O5 | C1 | C6 | O6 | 71.7° | 180.0° |
O5 | C1 | C6 | H6 | 167.7° | 60.0° |
O5 | C1 | C6 | H6A | 48.8° | 59.9° |
O5 | C5 | C4 | H5 | 118.1° | 120.0° |
C5 | O5 | C1 | F1 | 178.9° | 58.8° |
O5 | C5 | C4 | C3 | 59.9° | 57.6° |
O5 | C5 | C4 | O4 | 179.2° | 62.3° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 58.0° | 177.6° |
C5 | O5 | C1 | C2 | 58.5° | 61.1° |
C5 | O5 | C1 | C6 | 66.0° | 178.9° |
C5 | C4 | C3 | O4 | 120.3° | 119.9° |
C5 | C4 | C3 | H4 | 117.9° | 119.9° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 120.2° | 120.1° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 60.0° |
C5 | C4 | C3 | O3 | 179.1° | 62.9° |
C5 | C4 | C3 | C2 | 58.4° | 57.0° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 60.2° | 176.8° |
H5 | C5 | C4 | C3 | 58.2° | 177.6° |
H5 | C5 | C4 | O4 | 62.7° | 57.7° |
H5 | C5 | C4 | H4 | 176.1° | 62.4° |
F1 | C1 | C2 | C3 | 175.2° | 62.4° |
F1 | C1 | C2 | O2 | 62.7° | 177.7° |
F1 | C1 | C2 | C6 | 115.4° | 120.1° |
F1 | C1 | C2 | H2 | 56.6° | 57.6° |
F1 | C1 | C6 | O6 | 169.1° | 60.0° |
F1 | C1 | C6 | H6 | 48.6° | 60.0° |
F1 | C1 | C6 | H6A | 70.3° | 180.0° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 120.8° | 120.2° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 61.0° | 179.7° |
C4 | C3 | O3 | C2 | 121.2° | 119.6° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 119.8° | 120.2° |
C4 | C3 | C2 | H3 | 118.5° | 119.8° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.0° |
C4 | C3 | C2 | O2 | 178.5° | 62.9° |
C4 | C3 | C2 | C1 | 56.6° | 57.0° |
C4 | C3 | C2 | H2 | 61.9° | 176.9° |
O4 | C4 | C3 | O3 | 60.6° | 177.1° |
O4 | C4 | C3 | C2 | 178.7° | 62.9° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 60.1° | 56.9° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 59.8° | 60.1° |
H4 | C4 | C3 | O3 | 61.2° | 57.0° |
H4 | C4 | C3 | C2 | 59.5° | 176.9° |
H4 | C4 | C3 | H3 | 178.1° | 63.3° |
O3 | C3 | C2 | H3 | 120.0° | 120.2° |
O3 | C3 | C2 | O2 | 60.0° | 177.2° |
O3 | C3 | C2 | C1 | 178.1° | 62.9° |
O3 | C3 | C2 | H2 | 59.6° | 57.0° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 58.8° | 179.6° |
C3 | C2 | O2 | C1 | 122.7° | 119.7° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 118.9° | 120.2° |
C3 | C2 | C1 | H2 | 118.6° | 120.0° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
C3 | C2 | C1 | C6 | 69.4° | 177.6° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 60.2° | 60.2° |
H3 | C3 | C2 | O2 | 60.0° | 56.9° |
H3 | C3 | C2 | C1 | 61.9° | 176.8° |
H3 | C3 | C2 | H2 | 179.6° | 63.2° |
O2 | C2 | C1 | H2 | 119.3° | 120.1° |
O2 | C2 | C1 | C6 | 52.7° | 57.7° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 57.3° | 179.7° |
C2 | C1 | C6 | O6 | 50.2° | 60.0° |
C2 | C1 | C6 | H6 | 70.3° | 180.0° |
C2 | C1 | C6 | H6A | 170.8° | 60.0° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 61.1° | 60.2° |
H2 | C2 | C1 | C6 | 171.9° | 62.4° |
C1 | C6 | O6 | H6 | 120.5° | 120.0° |
C1 | C6 | O6 | H6A | 120.6° | 120.0° |
C1 | C6 | H6 | H6A | 118.3° | 120.0° |
C1 | C6 | O6 | HO6 | 180.0° | 180.0° |
O6 | C6 | H6 | H6A | 118.3° | 120.1° |
H6 | C6 | O6 | HO6 | 59.5° | 60.0° |
H6A | C6 | O6 | HO6 | 59.5° | 60.0° |