ARA
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.36Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.38Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.58Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.47Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
C5 | O5 | sing | 1.43Å | 1.50Å | |
C5 | H51 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C5 | H52 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C2 | C1 | O1 | 108.4° | 109.4° |
C2 | C1 | O5 | 105.0° | 109.8° |
C2 | C1 | H1 | 112.3° | 109.4° |
C1 | C2 | C3 | 109.9° | 109.1° |
C1 | C2 | O2 | 106.3° | 109.5° |
C1 | C2 | H2 | 110.3° | 109.6° |
O1 | C1 | O5 | 107.5° | 109.5° |
O1 | C1 | H1 | 110.1° | 109.3° |
C1 | O1 | HO1 | 108.4° | 106.8° |
O5 | C1 | H1 | 113.3° | 109.4° |
C1 | O5 | C5 | 115.9° | 107.6° |
C3 | C2 | O2 | 106.3° | 109.6° |
C3 | C2 | H2 | 110.2° | 109.5° |
C2 | C3 | C4 | 114.5° | 108.6° |
C2 | C3 | O3 | 116.0° | 109.6° |
C2 | C3 | H3 | 99.6° | 109.6° |
O2 | C2 | H2 | 113.6° | 109.5° |
C2 | O2 | HO2 | 106.3° | 106.8° |
C4 | C3 | O3 | 104.8° | 109.9° |
C4 | C3 | H3 | 111.8° | 109.6° |
C3 | C4 | C5 | 108.3° | 109.1° |
C3 | C4 | O4 | 111.7° | 109.5° |
C3 | C4 | H4 | 107.5° | 109.6° |
O3 | C3 | H3 | 110.2° | 109.5° |
C3 | O3 | HO3 | 116.0° | 106.8° |
C5 | C4 | O4 | 105.1° | 109.6° |
C5 | C4 | H4 | 113.8° | 109.5° |
C4 | C5 | O5 | 108.4° | 109.8° |
C4 | C5 | H51 | 112.6° | 109.4° |
C4 | C5 | H52 | 112.6° | 109.4° |
O4 | C4 | H4 | 110.5° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 111.7° | 106.8° |
O5 | C5 | H51 | 112.6° | 109.4° |
O5 | C5 | H52 | 112.6° | 109.4° |
H51 | C5 | H52 | 97.8° | 109.3° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
C2 | C1 | O1 | O5 | 113.0° | 120.4° |
C2 | C1 | O1 | H1 | 123.2° | 119.8° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 122.9° | 120.1° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 114.6° | 119.9° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 121.8° | 119.9° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 121.5° | 120.2° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 60.4° | 53.7° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 177.3° | 173.7° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 59.1° | 66.1° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 65.1° | 67.5° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 179.7° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
O1 | C1 | O5 | H1 | 121.8° | 119.8° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 179.0° | 178.6° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 66.4° | 58.6° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 57.2° | 61.5° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 179.6° | 172.4° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 64.3° | 61.2° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 179.0° | 178.8° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 57.4° | 58.7° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 58.4° | 67.5° |
C1 | O5 | C5 | H51 | 66.9° | 52.6° |
C1 | O5 | C5 | H52 | 176.4° | 172.3° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 67.0° | 59.8° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 59.1° | 58.9° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 55.5° | 61.1° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 179.1° | 178.7° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 57.8° | 52.6° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 56.8° | 59.9° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 121.4° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 128.2° | 119.9° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 112.4° | 119.7° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 112.2° | 120.3° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 51.1° | 53.7° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 64.2° | 66.2° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 174.4° | 173.6° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 62.9° | 179.6° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 180.0° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 175.0° | 173.6° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 62.6° | 66.4° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 55.5° | 53.9° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 61.4° | 66.2° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 60.9° | 53.8° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 179.1° | 174.0° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 58.5° | 60.2° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 120.5° | 120.5° |
C3 | C4 | C5 | O4 | 119.5° | 119.9° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 119.4° | 119.9° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 119.6° | 120.2° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 44.6° | 61.3° |
C3 | C4 | C5 | H51 | 80.7° | 58.8° |
C3 | C4 | C5 | H52 | 169.9° | 178.6° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 52.7° | 60.8° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 179.9° | 179.8° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 179.3° | 173.5° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 64.0° | 53.6° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 57.4° | 66.5° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 61.3° | 66.0° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 176.6° | 174.1° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 62.0° | 53.9° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 67.8° | 59.7° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 123.2° | 120.2° |
C4 | C5 | O5 | H51 | 125.2° | 120.1° |
C4 | C5 | O5 | H52 | 125.2° | 120.1° |
C4 | C5 | H51 | H52 | 118.5° | 119.9° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 62.9° | 60.2° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 74.9° | 58.6° |
O4 | C4 | C5 | H51 | 159.8° | 178.7° |
O4 | C4 | C5 | H52 | 50.4° | 61.5° |
H4 | C4 | C5 | O5 | 164.0° | 178.8° |
H4 | C4 | C5 | H51 | 38.7° | 61.1° |
H4 | C4 | C5 | H52 | 70.7° | 58.7° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 60.4° | 60.0° |
O5 | C5 | H51 | H52 | 118.6° | 119.8° |