ALN
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
N | CA | sing | 1.47Å | 1.47Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.02Å | |
CA | C | sing | 1.51Å | 1.53Å | |
CA | CB | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C | O | doub | 1.21Å | 1.24Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 1.34Å | |
CB | CG1 | sing | 1.51Å | 1.52Å | |
CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
CG1 | CD1 | doub | 1.36Å | 1.40Å | Aromatic |
CG1 | CD2 | sing | 1.40Å | 1.40Å | Aromatic |
CD1 | CE1 | sing | 1.39Å | 1.39Å | Aromatic |
CD1 | HD1 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
CE1 | CZ1 | doub | 1.36Å | 1.38Å | Aromatic |
CE1 | HE1 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
CD2 | CE2 | doub | 1.42Å | 1.41Å | Aromatic |
CD2 | CG2 | sing | 1.40Å | 1.39Å | Aromatic |
CE2 | CZ1 | sing | 1.41Å | 1.45Å | Aromatic |
CE2 | CZ2 | sing | 1.40Å | 1.41Å | Aromatic |
CZ1 | HZ1 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
CG2 | CD3 | doub | 1.36Å | 1.34Å | Aromatic |
CG2 | HG2 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
CD3 | CE3 | sing | 1.39Å | 1.41Å | Aromatic |
CD3 | HD3 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
CE3 | CZ2 | doub | 1.36Å | 1.39Å | Aromatic |
CE3 | HE3 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
CZ2 | HZ2 | sing | 1.08Å | 1.10Å | |
OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
CA | N | H | 111.2° | 106.7° |
CA | N | H2 | 111.6° | 106.7° |
N | CA | C | 111.2° | 109.4° |
N | CA | CB | 111.0° | 109.4° |
N | CA | HA | 106.9° | 109.4° |
H | N | H2 | 111.6° | 106.7° |
C | CA | CB | 108.2° | 109.5° |
C | CA | HA | 109.7° | 109.6° |
CA | C | O | 123.7° | 120.1° |
CA | C | OXT | 116.0° | 120.0° |
CB | CA | HA | 109.9° | 109.5° |
CA | CB | CG1 | 111.0° | 109.5° |
CA | CB | HB2 | 111.7° | 109.5° |
CA | CB | HB3 | 111.6° | 109.4° |
O | C | OXT | 120.3° | 120.0° |
C | OXT | HXT | 116.0° | 120.1° |
CG1 | CB | HB2 | 111.7° | 109.5° |
CG1 | CB | HB3 | 111.7° | 109.5° |
CB | CG1 | CD1 | 114.9° | 120.1° |
CB | CG1 | CD2 | 125.8° | 120.2° |
HB2 | CB | HB3 | 98.7° | 109.4° |
CD1 | CG1 | CD2 | 119.3° | 119.7° |
CG1 | CD1 | CE1 | 119.7° | 120.9° |
CG1 | CD1 | HD1 | 120.5° | 119.6° |
CG1 | CD2 | CE2 | 124.2° | 119.4° |
CG1 | CD2 | CG2 | 120.1° | 121.3° |
CE1 | CD1 | HD1 | 119.8° | 119.5° |
CD1 | CE1 | CZ1 | 120.0° | 121.0° |
CD1 | CE1 | HE1 | 120.5° | 119.5° |
CZ1 | CE1 | HE1 | 119.5° | 119.5° |
CE1 | CZ1 | CE2 | 123.7° | 119.6° |
CE1 | CZ1 | HZ1 | 115.3° | 120.2° |
CE2 | CD2 | CG2 | 115.7° | 119.3° |
CD2 | CE2 | CZ1 | 113.1° | 119.3° |
CD2 | CE2 | CZ2 | 121.3° | 119.4° |
CD2 | CG2 | CD3 | 125.1° | 119.6° |
CD2 | CG2 | HG2 | 119.9° | 120.2° |
CZ1 | CE2 | CZ2 | 125.6° | 121.3° |
CE2 | CZ1 | HZ1 | 121.0° | 120.2° |
CE2 | CZ2 | CE3 | 119.1° | 119.7° |
CE2 | CZ2 | HZ2 | 121.1° | 120.2° |
CD3 | CG2 | HG2 | 115.0° | 120.2° |
CG2 | CD3 | CE3 | 118.6° | 121.0° |
CG2 | CD3 | HD3 | 118.0° | 119.5° |
CE3 | CD3 | HD3 | 123.4° | 119.4° |
CD3 | CE3 | CZ2 | 120.2° | 120.9° |
CD3 | CE3 | HE3 | 120.7° | 119.6° |
CZ2 | CE3 | HE3 | 119.1° | 119.5° |
CE3 | CZ2 | HZ2 | 119.8° | 120.1° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
CA | N | H | H2 | 125.3° | 113.7° |
N | CA | C | CB | 122.2° | 120.0° |
N | CA | C | HA | 117.9° | 120.0° |
N | CA | CB | HA | 118.0° | 119.9° |
N | CA | C | O | 35.5° | 29.9° |
N | CA | C | OXT | 144.7° | 150.0° |
N | CA | CB | CG1 | 59.9° | 60.0° |
N | CA | CB | HB2 | 65.4° | 60.0° |
N | CA | CB | HB3 | 174.8° | 180.0° |
H | N | CA | C | 180.0° | 173.7° |
H | N | CA | CB | 59.4° | 53.7° |
H | N | CA | HA | 60.4° | 66.2° |
H2 | N | CA | C | 54.7° | 60.0° |
H2 | N | CA | CB | 65.9° | 60.0° |
H2 | N | CA | HA | 174.3° | 179.9° |
C | CA | CB | HA | 119.7° | 120.1° |
CA | C | O | OXT | 179.8° | 179.9° |
C | CA | CB | CG1 | 177.8° | 180.0° |
C | CA | CB | HB2 | 56.9° | 59.9° |
C | CA | CB | HB3 | 52.5° | 60.0° |
CA | C | OXT | HXT | 180.0° | 179.9° |
CB | CA | C | O | 86.7° | 90.0° |
CB | CA | C | OXT | 93.1° | 90.1° |
CA | CB | CG1 | HB2 | 125.3° | 120.0° |
CA | CB | CG1 | HB3 | 125.3° | 120.0° |
CA | CB | HB2 | HB3 | 117.5° | 119.9° |
CA | CB | CG1 | CD1 | 112.1° | 90.0° |
CA | CB | CG1 | CD2 | 67.8° | 90.3° |
HA | CA | C | O | 153.4° | 149.9° |
HA | CA | C | OXT | 26.8° | 30.0° |
HA | CA | CB | CG1 | 58.1° | 59.9° |
HA | CA | CB | HB2 | 176.6° | 180.0° |
HA | CA | CB | HB3 | 67.2° | 60.1° |
O | C | OXT | HXT | 0.2° | 0.0° |
CG1 | CB | HB2 | HB3 | 117.6° | 120.0° |
CB | CG1 | CD1 | CD2 | 179.9° | 179.7° |
CB | CG1 | CD1 | CE1 | 178.5° | 180.0° |
CB | CG1 | CD1 | HD1 | 1.4° | 0.0° |
CB | CG1 | CD2 | CE2 | 178.4° | 179.8° |
CB | CG1 | CD2 | CG2 | 0.1° | 0.6° |
HB2 | CB | CG1 | CD1 | 13.2° | 30.0° |
HB2 | CB | CG1 | CD2 | 166.9° | 149.7° |
HB3 | CB | CG1 | CD1 | 122.7° | 150.0° |
HB3 | CB | CG1 | CD2 | 57.5° | 29.7° |
CG1 | CD1 | CE1 | HD1 | 180.0° | 180.0° |
CG1 | CD1 | CE1 | CZ1 | 1.2° | 0.1° |
CG1 | CD1 | CE1 | HE1 | 178.9° | 180.0° |
CD1 | CG1 | CD2 | CE2 | 1.4° | 0.5° |
CD1 | CG1 | CD2 | CG2 | 180.0° | 179.7° |
CD2 | CG1 | CD1 | CE1 | 1.3° | 0.3° |
CD2 | CG1 | CD1 | HD1 | 178.7° | 179.7° |
CG1 | CD2 | CE2 | CG2 | 178.7° | 179.2° |
CG1 | CD2 | CE2 | CZ1 | 1.1° | 0.5° |
CG1 | CD2 | CE2 | CZ2 | 178.1° | 179.7° |
CG1 | CD2 | CG2 | CD3 | 178.3° | 179.7° |
CG1 | CD2 | CG2 | HG2 | 1.7° | 0.6° |
CD1 | CE1 | CZ1 | HE1 | 180.0° | 179.9° |
CD1 | CE1 | CZ1 | CE2 | 1.0° | 0.1° |
CD1 | CE1 | CZ1 | HZ1 | 179.1° | 180.0° |
HD1 | CD1 | CE1 | CZ1 | 178.9° | 179.9° |
HD1 | CD1 | CE1 | HE1 | 1.1° | 0.0° |
CE1 | CZ1 | CE2 | CD2 | 0.9° | 0.3° |
CE1 | CZ1 | CE2 | HZ1 | 180.0° | 179.9° |
CE1 | CZ1 | CE2 | CZ2 | 178.2° | 179.9° |
HE1 | CE1 | CZ1 | CE2 | 179.0° | 180.0° |
HE1 | CE1 | CZ1 | HZ1 | 0.9° | 0.1° |
CD2 | CE2 | CZ1 | CZ2 | 179.1° | 179.8° |
CD2 | CE2 | CZ1 | HZ1 | 179.1° | 179.8° |
CE2 | CD2 | CG2 | CD3 | 0.4° | 0.6° |
CE2 | CD2 | CG2 | HG2 | 179.6° | 179.8° |
CD2 | CE2 | CZ2 | CE3 | 1.1° | 0.2° |
CD2 | CE2 | CZ2 | HZ2 | 178.9° | 179.8° |
CG2 | CD2 | CE2 | CZ1 | 179.8° | 179.7° |
CG2 | CD2 | CE2 | CZ2 | 0.6° | 0.5° |
CD2 | CG2 | CD3 | HG2 | 180.0° | 179.7° |
CD2 | CG2 | CD3 | CE3 | 1.5° | 0.3° |
CD2 | CG2 | CD3 | HD3 | 178.5° | 179.7° |
CZ1 | CE2 | CZ2 | CE3 | 177.9° | 180.0° |
CZ1 | CE2 | CZ2 | HZ2 | 2.0° | 0.0° |
CZ2 | CE2 | CZ1 | HZ1 | 1.7° | 0.0° |
CE2 | CZ2 | CE3 | CD3 | 3.1° | 0.1° |
CE2 | CZ2 | CE3 | HZ2 | 180.0° | 180.0° |
CE2 | CZ2 | CE3 | HE3 | 176.9° | 180.0° |
CG2 | CD3 | CE3 | HD3 | 180.0° | 180.0° |
CG2 | CD3 | CE3 | CZ2 | 3.2° | 0.0° |
CG2 | CD3 | CE3 | HE3 | 176.8° | 179.9° |
HG2 | CG2 | CD3 | CE3 | 178.5° | 180.0° |
HG2 | CG2 | CD3 | HD3 | 1.5° | 0.0° |
CD3 | CE3 | CZ2 | HE3 | 180.0° | 179.9° |
CD3 | CE3 | CZ2 | HZ2 | 177.0° | 179.9° |
HD3 | CD3 | CE3 | CZ2 | 176.8° | 180.0° |
HD3 | CD3 | CE3 | HE3 | 3.2° | 0.0° |
HE3 | CE3 | CZ2 | HZ2 | 3.0° | 0.0° |