AFD
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O6 | C6 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C6 | C5 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C4 | C3 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.39Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.46Å | |
C3 | C2 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C6 | H62 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O6 | C6 | C5 | 112.1° | 109.5° |
O6 | C6 | H61 | 108.8° | 109.5° |
O6 | C6 | H62 | 108.8° | 109.5° |
C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 114.0° |
C6 | C5 | C4 | 113.9° | 109.5° |
C6 | C5 | O5 | 107.1° | 109.5° |
C6 | C5 | H5 | 107.7° | 109.5° |
C5 | C6 | H61 | 108.8° | 109.5° |
C5 | C6 | H62 | 108.8° | 109.5° |
O4 | C4 | C5 | 110.4° | 109.5° |
O4 | C4 | C3 | 110.3° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 109.5° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
C5 | C4 | C3 | 110.6° | 109.2° |
C4 | C5 | O5 | 111.9° | 109.4° |
C5 | C4 | H4 | 107.9° | 109.5° |
C4 | C5 | H5 | 107.5° | 109.4° |
C4 | C3 | C2 | 111.0° | 109.1° |
C4 | C3 | O3 | 110.3° | 109.5° |
C4 | C3 | H3 | 108.0° | 109.6° |
C3 | C4 | H4 | 108.0° | 109.6° |
O1 | C1 | O5 | 108.4° | 109.5° |
O1 | C1 | C2 | 109.8° | 109.5° |
O1 | C1 | H1 | 110.4° | 109.4° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.0° |
O5 | C1 | C2 | 110.3° | 109.5° |
C1 | O5 | C5 | 114.5° | 114.1° |
O5 | C1 | H1 | 109.6° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 110.4° | 109.1° |
C1 | C2 | O2 | 109.6° | 109.6° |
C2 | C1 | H1 | 108.4° | 109.5° |
C1 | C2 | H2 | 108.5° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 108.5° | 109.5° |
C2 | C3 | O3 | 109.8° | 109.6° |
C3 | C2 | O2 | 109.9° | 109.5° |
C3 | C2 | H2 | 108.4° | 109.5° |
C2 | C3 | H3 | 108.1° | 109.6° |
O3 | C3 | H3 | 109.6° | 109.5° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
O2 | C2 | H2 | 110.0° | 109.6° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
H61 | C6 | H62 | 109.5° | 109.4° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O6 | C6 | C5 | H61 | 120.4° | 120.1° |
O6 | C6 | C5 | H62 | 120.4° | 120.0° |
O6 | C6 | C5 | C4 | 16.3° | 175.0° |
O6 | C6 | C5 | O5 | 108.1° | 65.0° |
O6 | C6 | C5 | H5 | 135.4° | 55.0° |
O6 | C6 | H61 | H62 | 118.8° | 120.0° |
C6 | C5 | C4 | O4 | 58.2° | 62.5° |
C6 | C5 | C4 | O5 | 121.7° | 120.0° |
C6 | C5 | C4 | H5 | 119.2° | 120.0° |
C6 | C5 | C4 | C3 | 179.3° | 177.6° |
C6 | C5 | O5 | C1 | 134.8° | 178.9° |
C6 | C5 | O5 | H5 | 116.0° | 120.0° |
C6 | C5 | C4 | H4 | 61.4° | 57.6° |
C5 | C6 | H61 | H62 | 118.8° | 120.0° |
C5 | C6 | O6 | HO6 | 180.0° | 180.0° |
O4 | C4 | C5 | C3 | 122.4° | 119.9° |
O4 | C4 | C5 | H4 | 119.6° | 120.1° |
O4 | C4 | C3 | H4 | 119.6° | 120.2° |
O4 | C4 | C5 | O5 | 180.0° | 177.5° |
O4 | C4 | C3 | C2 | 165.6° | 176.9° |
O4 | C4 | C3 | O3 | 43.6° | 57.0° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 76.1° | 63.2° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 60.9° | 57.5° |
C5 | C4 | C3 | H4 | 117.9° | 119.9° |
C4 | C5 | O5 | C1 | 9.2° | 61.1° |
C4 | C5 | O5 | H5 | 118.5° | 119.9° |
C5 | C4 | C3 | C2 | 43.1° | 56.9° |
C5 | C4 | C3 | O3 | 78.8° | 63.0° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 161.4° | 176.9° |
C4 | C5 | C6 | H61 | 104.1° | 54.9° |
C4 | C5 | C6 | H62 | 136.7° | 65.0° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 180.0° |
C4 | C3 | C2 | C1 | 13.5° | 57.0° |
C3 | C4 | C5 | O5 | 57.6° | 57.6° |
C4 | C3 | C2 | O3 | 122.2° | 119.9° |
C4 | C3 | C2 | H3 | 118.3° | 119.9° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 118.8° | 120.2° |
C4 | C3 | C2 | O2 | 107.5° | 176.9° |
C4 | C3 | C2 | H2 | 132.2° | 62.9° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 61.5° | 62.4° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 179.5° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 57.4° | 60.3° |
O1 | C1 | O5 | C2 | 120.2° | 120.0° |
O1 | C1 | O5 | H1 | 120.5° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | H1 | 120.7° | 120.0° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 170.3° | 58.9° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 178.0° | 62.4° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 60.8° | 57.5° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 59.4° | 177.7° |
O5 | C1 | C2 | H1 | 120.0° | 120.0° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 62.6° | 57.6° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 58.6° | 177.5° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 178.7° | 62.3° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 109.3° | 58.8° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 60.0° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 50.1° | 61.1° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 120.9° | 119.9° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 118.8° | 119.9° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 135.7° | 62.9° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 119.2° | 120.2° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 104.8° | 176.9° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 59.5° | 179.9° |
C5 | O5 | C1 | H1 | 69.2° | 178.8° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 60.3° | 62.4° |
O5 | C5 | C6 | H61 | 131.6° | 174.9° |
O5 | C5 | C6 | H62 | 12.3° | 55.0° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 118.5° | 120.2° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 119.3° | 120.1° |
C3 | C2 | C1 | H1 | 57.4° | 177.6° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 74.8° | 63.0° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 58.5° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 57.3° | 59.9° |
O3 | C3 | C2 | O2 | 14.8° | 57.0° |
O3 | C3 | C2 | H2 | 105.5° | 177.2° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 163.3° | 177.1° |
O2 | C2 | C1 | H1 | 178.6° | 62.5° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 134.2° | 63.2° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 61.3° | 57.7° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 60.0° | 60.0° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 13.9° | 57.0° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 60.8° | 60.2° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 43.5° | 57.0° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 61.2° | 60.3° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 179.4° | 177.6° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 61.3° | 59.9° |
H5 | C5 | C6 | H61 | 15.0° | 65.0° |
H5 | C5 | C6 | H62 | 104.3° | 175.0° |
H61 | C6 | O6 | HO6 | 59.6° | 60.0° |
H62 | C6 | O6 | HO6 | 59.6° | 60.0° |