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Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O1 | C1 | sing | 1.43Å | 1.38Å | |
C2 | C1 | sing | 1.53Å | 1.50Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.47Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.49Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.49Å | |
O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
O4 | C4 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
O3 | C3 | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.46Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C5 | H51 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C5 | H52 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | 108.6° | 109.5° |
O1 | C1 | O5 | 108.4° | 109.5° |
O1 | C1 | H1 | 111.4° | 109.5° |
C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.1° |
C1 | C2 | O2 | 109.7° | 109.5° |
C1 | C2 | C3 | 110.5° | 109.2° |
C2 | C1 | O5 | 109.4° | 109.4° |
C1 | C2 | H2 | 109.5° | 109.5° |
C2 | C1 | H1 | 109.4° | 109.4° |
O2 | C2 | C3 | 107.4° | 109.5° |
C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
O2 | C2 | H2 | 110.1° | 109.5° |
C2 | C3 | O3 | 108.7° | 109.6° |
C2 | C3 | C4 | 112.1° | 109.0° |
C3 | C2 | H2 | 109.7° | 109.6° |
C2 | C3 | H3 | 109.6° | 109.6° |
C1 | O5 | C5 | 105.9° | 114.1° |
O5 | C1 | H1 | 109.7° | 109.5° |
O5 | C5 | C4 | 108.8° | 109.4° |
O5 | C5 | H51 | 109.6° | 109.5° |
O5 | C5 | H52 | 109.6° | 109.5° |
O4 | C4 | C3 | 112.0° | 109.5° |
O4 | C4 | C5 | 107.6° | 109.5° |
O4 | C4 | H4 | 109.6° | 109.6° |
C4 | O4 | HO4 | 109.5° | 114.0° |
O3 | C3 | C4 | 106.1° | 109.5° |
O3 | C3 | H3 | 110.9° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
C3 | C4 | C5 | 109.8° | 109.1° |
C4 | C3 | H3 | 109.3° | 109.5° |
C3 | C4 | H4 | 108.5° | 109.5° |
C5 | C4 | H4 | 109.3° | 109.5° |
C4 | C5 | H51 | 109.6° | 109.4° |
C4 | C5 | H52 | 109.6° | 109.5° |
H51 | C5 | H52 | 109.5° | 109.4° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O1 | C1 | C2 | O5 | 118.1° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | H1 | 121.8° | 120.0° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 67.4° | 62.5° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 174.4° | 177.6° |
O1 | C1 | O5 | H1 | 121.8° | 120.0° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 174.9° | 178.8° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 53.5° | 57.7° |
C1 | C2 | O2 | C3 | 120.1° | 119.7° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 120.6° | 120.1° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 120.8° | 119.9° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 120.0° | 120.0° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 66.9° | 61.1° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 165.2° | 176.8° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 48.2° | 57.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 73.4° | 62.9° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 180.0° |
O2 | C2 | C3 | H2 | 119.6° | 120.2° |
O2 | C2 | C1 | O5 | 174.5° | 177.5° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 75.2° | 63.3° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 167.8° | 176.9° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 46.2° | 57.1° |
O2 | C2 | C1 | H1 | 54.4° | 57.5° |
C3 | C2 | C1 | O5 | 56.4° | 57.6° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 68.4° | 62.9° |
C2 | C3 | O3 | C4 | 120.8° | 119.5° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 120.6° | 120.3° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 121.8° | 119.8° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 51.1° | 57.0° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 59.9° | 179.7° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 180.0° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 170.5° | 176.9° |
C3 | C2 | C1 | H1 | 63.8° | 62.4° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 70.3° | 61.2° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 64.6° | 62.4° |
C1 | O5 | C5 | H51 | 49.6° | 178.9° |
C1 | O5 | C5 | H52 | 169.8° | 58.9° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 61.3° | 60.0° |
O5 | C5 | C4 | O4 | 59.7° | 62.3° |
O5 | C5 | C4 | C3 | 62.4° | 57.6° |
O5 | C5 | C4 | H51 | 119.9° | 120.0° |
O5 | C5 | C4 | H52 | 119.9° | 120.1° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 178.7° | 177.5° |
O5 | C5 | H51 | H52 | 120.3° | 120.1° |
C5 | O5 | C1 | H1 | 53.2° | 58.8° |
O4 | C4 | C3 | O3 | 50.2° | 56.9° |
O4 | C4 | C3 | C5 | 119.4° | 119.9° |
O4 | C4 | C3 | H4 | 121.1° | 120.2° |
O4 | C4 | C5 | H4 | 119.0° | 120.2° |
O4 | C4 | C3 | H3 | 169.8° | 177.2° |
O4 | C4 | C5 | H51 | 179.6° | 57.7° |
O4 | C4 | C5 | H52 | 60.2° | 177.7° |
O3 | C3 | C4 | H3 | 119.7° | 120.3° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 169.6° | 176.9° |
O3 | C3 | C2 | H2 | 44.3° | 56.9° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 70.9° | 63.2° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 118.9° | 119.9° |
C4 | C3 | C2 | H2 | 72.7° | 62.9° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 59.2° | 60.5° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 179.9° |
C3 | C4 | C5 | H51 | 57.5° | 177.6° |
C3 | C4 | C5 | H52 | 177.7° | 62.4° |
C5 | C4 | C3 | H3 | 70.7° | 62.9° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 59.2° | 60.4° |
C4 | C5 | H51 | H52 | 120.3° | 120.0° |
HO2 | O2 | C2 | H2 | 59.4° | 60.1° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 165.7° | 177.2° |
H2 | C2 | C1 | H1 | 175.3° | 177.7° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 59.4° | 59.8° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 48.7° | 57.1° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 59.6° | 59.8° |
H4 | C4 | C5 | H51 | 61.4° | 62.5° |
H4 | C4 | C5 | H52 | 58.8° | 57.5° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 59.4° | 60.0° |