5R5
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
OG | CB | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
CB | CA | sing | 1.53Å | 1.55Å | |
N | CA | sing | 1.47Å | 1.46Å | |
CA | C | sing | 1.51Å | 1.54Å | |
C | O | doub | 1.21Å | 1.21Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 1.34Å | |
OXT | C1 | sing | 1.45Å | 1.42Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | HB2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | HB3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
OG | HG | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C1 | H11 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | H12 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C1 | H13 | sing | 1.09Å | 1.10Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
OG | CB | CA | 113.1° | 109.5° |
OG | CB | HB2 | 108.5° | 109.5° |
OG | CB | HB3 | 108.5° | 109.5° |
CB | OG | HG | 109.5° | 114.0° |
CB | CA | N | 111.5° | 109.4° |
CB | CA | C | 111.8° | 109.5° |
CB | CA | HA | 109.7° | 109.5° |
CA | CB | HB2 | 108.5° | 109.4° |
CA | CB | HB3 | 108.5° | 109.4° |
N | CA | C | 102.8° | 109.5° |
CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
CA | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
N | CA | HA | 111.0° | 109.5° |
CA | C | O | 121.1° | 120.0° |
CA | C | OXT | 119.3° | 120.0° |
C | CA | HA | 109.9° | 109.5° |
O | C | OXT | 119.3° | 120.0° |
C | OXT | C1 | 117.0° | 117.0° |
OXT | C1 | H11 | 109.5° | 109.4° |
OXT | C1 | H12 | 109.4° | 109.4° |
OXT | C1 | H13 | 109.4° | 109.5° |
H | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
HB2 | CB | HB3 | 109.5° | 109.5° |
H11 | C1 | H12 | 109.5° | 109.5° |
H11 | C1 | H13 | 109.4° | 109.5° |
H12 | C1 | H13 | 109.5° | 109.5° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
OG | CB | CA | HB2 | 120.5° | 120.0° |
OG | CB | CA | HB3 | 120.5° | 120.0° |
OG | CB | CA | N | 60.9° | 65.0° |
OG | CB | CA | C | 53.5° | 175.0° |
OG | CB | CA | HA | 175.7° | 55.0° |
OG | CB | HB2 | HB3 | 118.3° | 120.1° |
CB | CA | N | C | 119.9° | 120.0° |
CB | CA | N | HA | 122.7° | 120.0° |
CB | CA | C | HA | 122.1° | 120.0° |
CB | CA | C | O | 0.5° | 100.0° |
CB | CA | C | OXT | 174.1° | 80.0° |
CB | CA | N | H | 180.0° | 176.0° |
CB | CA | N | H2 | 60.0° | 60.0° |
CA | CB | HB2 | HB3 | 118.3° | 120.0° |
CA | CB | OG | HG | 46.2° | 180.0° |
N | CA | C | HA | 118.2° | 120.1° |
N | CA | C | O | 119.2° | 19.9° |
N | CA | C | OXT | 54.4° | 160.0° |
CA | N | H | H2 | 120.0° | 124.0° |
N | CA | CB | HB2 | 59.6° | 55.0° |
N | CA | CB | HB3 | 178.5° | 175.0° |
CA | C | O | OXT | 173.6° | 180.0° |
CA | C | OXT | C1 | 171.2° | 180.0° |
C | CA | N | H | 60.1° | 64.0° |
C | CA | N | H2 | 59.9° | 59.9° |
C | CA | CB | HB2 | 174.0° | 65.0° |
C | CA | CB | HB3 | 67.0° | 55.0° |
O | C | OXT | C1 | 2.5° | 0.0° |
O | C | CA | HA | 122.6° | 140.0° |
OXT | C | CA | HA | 63.8° | 40.0° |
C | OXT | C1 | H11 | 180.0° | 60.0° |
C | OXT | C1 | H12 | 60.0° | 60.0° |
C | OXT | C1 | H13 | 60.0° | 180.0° |
OXT | C1 | H11 | H12 | 120.0° | 120.0° |
OXT | C1 | H11 | H13 | 120.0° | 120.0° |
OXT | C1 | H12 | H13 | 120.0° | 120.0° |
H | N | CA | HA | 57.3° | 56.1° |
H2 | N | CA | HA | 177.4° | 180.0° |
HA | CA | CB | HB2 | 63.8° | 175.0° |
HA | CA | CB | HB3 | 55.2° | 65.0° |
HB2 | CB | OG | HG | 166.7° | 60.1° |
HB3 | CB | OG | HG | 74.3° | 60.0° |
H11 | C1 | H12 | H13 | 120.0° | 120.0° |