51N

Bonds

First atom	Second atom	Bond order type	Distance (experimental model)	Distance (ideal model)	Properties
O21	P20	doub	1.48Å	1.47Å
O22	P20	sing	1.61Å	1.48Å
O19	P17	doub	1.48Å	1.49Å
O18	P17	sing	1.61Å	1.57Å
P20	O16	sing	1.61Å	1.58Å
P20	O5	sing	1.61Å	1.59Å
O16	P17	sing	1.61Å	1.57Å
P17	O15	sing	1.61Å	1.50Å
O5	C5	sing	1.43Å	1.40Å
C5	C4	sing	1.53Å	1.53Å
C4	C3	sing	1.55Å	1.31Å
C4	O4	sing	1.44Å	1.54Å
O3	C3	sing	1.43Å	1.44Å
C3	C2	sing	1.55Å	1.66Å
O4	C1	sing	1.43Å	1.56Å
C2	C1	sing	1.54Å	1.30Å
C2	O2	sing	1.43Å	1.43Å
C1	O1	sing	1.43Å	1.43Å
O1	P09	sing	1.61Å	1.62Å
O11	P09	doub	1.48Å	1.47Å
P09	O08	sing	1.61Å	1.51Å
P09	O10	sing	1.61Å	1.59Å
C1	H1	sing	1.09Å	1.10Å
C4	H4	sing	1.09Å	1.10Å
C3	H3	sing	1.09Å	1.10Å
C2	H2	sing	1.09Å	1.10Å
C5	H51	sing	1.09Å	1.10Å
C5	H52	sing	1.09Å	1.10Å
O08	H7	sing	0.97Å	0.95Å
O10	H8	sing	0.97Å	0.95Å
O3	HO3	sing	0.97Å	0.95Å
O2	HO2	sing	0.97Å	0.95Å
O15	H11	sing	0.97Å	0.95Å
O18	H12	sing	0.97Å	0.95Å
O22	H13	sing	0.97Å	0.95Å

Angles

First atom	Second atom	Third atom	Angle (experimental model)	Angle (ideal model)
O21	P20	O22	108.6°	109.5°
O21	P20	O16	112.5°	109.4°
O21	P20	O5	110.8°	109.5°
O22	P20	O16	107.2°	109.4°
O22	P20	O5	112.6°	109.5°
P20	O22	H13	109.5°	114.0°
O19	P17	O18	111.0°	109.5°
O19	P17	O16	113.3°	109.5°
O19	P17	O15	105.1°	109.5°
O18	P17	O16	107.4°	109.5°
O18	P17	O15	110.5°	109.5°
P17	O18	H12	109.5°	114.0°
O16	P20	O5	105.2°	109.5°
P20	O16	P17	128.2°	134.0°
P20	O5	C5	117.1°	123.0°
O16	P17	O15	109.7°	109.5°
P17	O15	H11	109.5°	114.0°
O5	C5	C4	107.9°	109.5°
O5	C5	H51	109.9°	109.4°
O5	C5	H52	109.9°	109.5°
C5	C4	C3	112.7°	110.4°
C5	C4	O4	107.0°	110.4°
C5	C4	H4	109.7°	110.4°
C4	C5	H51	109.8°	109.5°
C4	C5	H52	109.9°	109.5°
C3	C4	O4	104.3°	105.1°
C4	C3	O3	110.6°	111.1°
C4	C3	C2	103.8°	101.0°
C3	C4	H4	113.2°	110.3°
C4	C3	H3	112.8°	111.1°
C4	O4	C1	101.7°	110.0°
O4	C4	H4	109.6°	110.2°
O3	C3	C2	111.0°	111.2°
O3	C3	H3	110.6°	111.0°
C3	O3	HO3	109.5°	114.0°
C3	C2	C1	106.0°	102.2°
C3	C2	O2	105.9°	110.8°
C2	C3	H3	107.8°	111.0°
C3	C2	H2	108.0°	110.8°
O4	C1	C2	108.4°	107.7°
O4	C1	O1	104.6°	109.9°
O4	C1	H1	108.9°	109.9°
C1	C2	O2	112.5°	110.8°
C2	C1	O1	111.0°	109.8°
C2	C1	H1	112.8°	109.8°
C1	C2	H2	113.1°	110.9°
O2	C2	H2	110.9°	110.9°
C2	O2	HO2	109.5°	114.0°
C1	O1	P09	116.4°	123.0°
O1	C1	H1	110.8°	109.8°
O1	P09	O11	114.4°	109.5°
O1	P09	O08	107.4°	109.5°
O1	P09	O10	105.7°	109.5°
O11	P09	O08	102.1°	109.5°
O11	P09	O10	114.4°	109.5°
O08	P09	O10	112.7°	109.4°
P09	O08	H7	109.5°	114.0°
P09	O10	H8	109.5°	114.0°
H51	C5	H52	109.5°	109.5°

Dihedrals

First atom	Second atom	Third atom	Fourth atom	Torsion (experimental model)	Torsion (ideal model)
O21	P20	O22	O16	121.7°	119.9°
O21	P20	O22	O5	123.0°	120.1°
O21	P20	O16	O5	120.7°	120.0°
O21	P20	O16	P17	44.0°	44.9°
O21	P20	O5	C5	62.1°	55.1°
O21	P20	O22	H13	0.0°	180.0°
O22	P20	O16	O5	120.1°	120.0°
O22	P20	O16	P17	163.2°	75.0°
O22	P20	O5	C5	59.6°	65.0°
O19	P17	O18	O16	124.3°	120.0°
O19	P17	O18	O15	116.2°	120.0°
O19	P17	O16	P20	22.0°	45.1°
O19	P17	O16	O15	117.1°	120.0°
O19	P17	O15	H11	0.0°	180.0°
O19	P17	O18	H12	0.0°	60.0°
O18	P17	O16	P20	144.9°	165.1°
O18	P17	O16	O15	120.1°	120.0°
O18	P17	O15	H11	119.8°	60.0°
P20	O16	P17	O15	95.1°	74.9°
O16	P20	O5	C5	176.1°	175.1°
O16	P20	O22	H13	121.7°	60.0°
O5	P20	O16	P17	76.7°	165.0°
P20	O5	C5	C4	155.3°	180.0°
P20	O5	C5	H51	35.6°	60.0°
P20	O5	C5	H52	84.9°	60.0°
O5	P20	O22	H13	123.0°	60.0°
O16	P17	O15	H11	122.1°	60.0°
O16	P17	O18	H12	124.3°	179.9°
O15	P17	O18	H12	116.2°	60.0°
O5	C5	C4	H51	119.7°	119.9°
O5	C5	C4	H52	119.8°	120.0°
O5	C5	C4	C3	59.3°	175.0°
O5	C5	C4	O4	54.8°	69.3°
O5	C5	C4	H4	173.6°	52.8°
O5	C5	H51	H52	120.8°	120.0°
C5	C4	C3	O4	115.7°	119.0°
C5	C4	C3	H4	125.2°	122.2°
C5	C4	O4	H4	118.8°	122.2°
C5	C4	C3	O3	86.7°	86.7°
C5	C4	C3	C2	154.2°	155.3°
C5	C4	O4	C1	157.2°	143.4°
C5	C4	C3	H3	37.8°	37.5°
C4	C5	H51	H52	120.7°	120.0°
C3	C4	O4	H4	121.5°	118.8°
C4	C3	O3	C2	114.6°	111.6°
C4	C3	O3	H3	125.7°	124.2°
C4	C3	C2	H3	119.8°	117.9°
C3	C4	O4	C1	37.6°	24.4°
C4	C3	C2	C1	27.7°	34.0°
C4	C3	C2	O2	92.1°	84.1°
C4	C3	C2	H2	149.1°	152.3°
C3	C4	C5	H51	60.5°	55.0°
C3	C4	C5	H52	179.0°	65.0°
C4	C3	O3	HO3	180.0°	180.0°
O4	C4	C3	O3	157.7°	154.3°
O4	C4	C3	C2	38.6°	36.4°
C4	O4	C1	C2	18.9°	1.7°
C4	O4	C1	O1	99.5°	117.8°
C4	O4	C1	H1	142.0°	121.3°
O4	C4	C3	H3	77.8°	81.5°
O4	C4	C5	H51	174.5°	170.8°
O4	C4	C5	H52	65.0°	50.7°
O3	C3	C2	H3	121.3°	124.2°
O3	C3	C2	C1	146.5°	152.0°
O3	C3	C2	O2	26.8°	33.9°
O3	C3	C4	H4	38.6°	35.5°
O3	C3	C2	H2	92.0°	89.7°
C3	C2	C1	O4	2.6°	21.3°
C3	C2	C1	O2	115.3°	118.2°
C3	C2	C1	H2	118.1°	118.2°
C3	C2	O2	H2	116.9°	123.5°
C3	C2	C1	O1	117.0°	140.9°
C3	C2	C1	H1	118.0°	98.3°
C2	C3	C4	H4	80.5°	82.5°
C2	C3	O3	HO3	65.4°	68.4°
C3	C2	O2	HO2	180.0°	180.0°
O4	C1	C2	O1	114.4°	119.6°
O4	C1	C2	H1	120.7°	119.6°
O4	C1	C2	O2	112.7°	96.9°
O4	C1	O1	H1	117.2°	120.9°
O4	C1	O1	P09	105.7°	91.5°
C1	O4	C4	H4	84.0°	94.5°
O4	C1	C2	H2	120.7°	139.5°
C1	C2	O2	H2	127.7°	123.7°
C2	C1	O1	H1	126.1°	120.9°
C2	C1	O1	P09	137.6°	150.2°
C1	C2	C3	H3	92.2°	83.8°
C1	C2	O2	HO2	64.6°	67.3°
O2	C2	C1	O1	1.7°	22.7°
O2	C2	C1	H1	126.6°	143.5°
O2	C2	C3	H3	148.1°	158.0°
C1	O1	P09	O11	72.6°	55.0°
C1	O1	P09	O08	174.8°	175.0°
C1	O1	P09	O10	54.2°	65.0°
O1	C1	C2	H2	124.9°	101.0°
O1	P09	O11	O08	115.7°	120.0°
O1	P09	O11	O10	122.2°	120.0°
O1	P09	O08	O10	116.1°	120.0°
P09	O1	C1	H1	11.5°	29.4°
O1	P09	O08	H7	120.7°	180.0°
O1	P09	O10	H8	126.9°	60.0°
O11	P09	O08	O10	123.2°	120.0°
O11	P09	O08	H7	0.0°	60.0°
O11	P09	O10	H8	0.0°	180.0°
O08	P09	O10	H8	116.1°	60.0°
O10	P09	O08	H7	123.2°	60.0°
H1	C1	C2	H2	0.1°	19.8°
H4	C4	C3	H3	163.1°	159.7°
H4	C4	C5	H51	66.7°	67.1°
H4	C4	C5	H52	53.8°	172.8°
H3	C3	C2	H2	29.3°	34.4°
H3	C3	O3	HO3	54.3°	55.8°
H2	C2	O2	HO2	63.1°	56.4°

Release date:	2016-07-20
Definition date:	2015-06-15
Last modified:	2020-07-17
Release status:	REL
Processing site:	RCSB
Derived from:	5C1R