2RX
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O43 | P40 | doub | 1.48Å | 1.51Å | |
O42 | P40 | sing | 1.61Å | 1.51Å | |
P40 | OG | sing | 1.61Å | 1.59Å | |
P40 | S41 | sing | 2.12Å | 2.06Å | |
OG | CB | sing | 1.43Å | 1.41Å | |
O | C | doub | 1.21Å | 1.22Å | |
N | CA | sing | 1.47Å | 1.42Å | |
CB | CA | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C | CA | sing | 1.51Å | 1.51Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | H6 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
CB | H7 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
S41 | H8 | sing | 1.35Å | 1.30Å | |
O42 | H9 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 23.29Å | |
OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.00Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O43 | P40 | O42 | 110.0° | 109.5° |
O43 | P40 | OG | 111.3° | 109.4° |
O43 | P40 | S41 | 107.9° | 109.5° |
O42 | P40 | OG | 110.4° | 109.5° |
O42 | P40 | S41 | 108.4° | 109.5° |
P40 | O42 | H9 | 109.5° | 113.9° |
OG | P40 | S41 | 108.8° | 109.5° |
P40 | OG | CB | 119.0° | 123.0° |
P40 | S41 | H8 | 102.0° | 103.0° |
OG | CB | CA | 112.2° | 109.4° |
OG | CB | H6 | 108.8° | 109.5° |
OG | CB | H7 | 108.8° | 109.5° |
O | C | CA | 119.8° | 120.0° |
O | C | OXT | 44.0° | 120.1° |
N | CA | CB | 110.7° | 109.5° |
N | CA | C | 107.3° | 109.5° |
CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
CA | N | H2 | 109.5° | 111.0° |
N | CA | HA | 110.1° | 109.5° |
CB | CA | C | 111.3° | 109.4° |
CB | CA | HA | 108.7° | 109.5° |
CA | CB | H6 | 108.8° | 109.5° |
CA | CB | H7 | 108.8° | 109.5° |
C | CA | HA | 108.8° | 109.4° |
CA | C | OXT | 77.9° | 120.0° |
H | N | H2 | 109.4° | 111.0° |
H6 | CB | H7 | 109.4° | 109.5° |
C | OXT | HXT | 90.0° | 117.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O43 | P40 | O42 | OG | 123.2° | 120.0° |
O43 | P40 | O42 | S41 | 117.7° | 120.0° |
O43 | P40 | OG | S41 | 118.8° | 120.0° |
O43 | P40 | OG | CB | 126.0° | 55.0° |
O43 | P40 | S41 | H8 | 0.0° | 180.0° |
O43 | P40 | O42 | H9 | 0.0° | 60.0° |
O42 | P40 | OG | S41 | 118.8° | 120.0° |
O42 | P40 | OG | CB | 111.6° | 175.0° |
O42 | P40 | S41 | H8 | 119.0° | 60.0° |
P40 | OG | CB | CA | 114.3° | 180.0° |
P40 | OG | CB | H6 | 6.1° | 60.0° |
P40 | OG | CB | H7 | 125.2° | 60.0° |
OG | P40 | S41 | H8 | 120.9° | 60.0° |
OG | P40 | O42 | H9 | 123.2° | 180.0° |
S41 | P40 | OG | CB | 7.2° | 65.0° |
S41 | P40 | O42 | H9 | 117.7° | 60.0° |
OG | CB | CA | N | 52.0° | 65.0° |
OG | CB | CA | H6 | 120.4° | 120.0° |
OG | CB | CA | H7 | 120.4° | 120.0° |
OG | CB | CA | C | 67.2° | 175.0° |
OG | CB | CA | HA | 173.0° | 55.0° |
OG | CB | H6 | H7 | 118.7° | 120.0° |
O | C | CA | N | 21.0° | 20.0° |
O | C | CA | CB | 100.2° | 100.0° |
O | C | CA | OXT | 13.8° | 180.0° |
O | C | CA | HA | 140.0° | 140.0° |
O | C | OXT | HXT | 90.0° | 0.0° |
N | CA | CB | C | 119.2° | 120.0° |
N | CA | CB | HA | 121.0° | 120.1° |
N | CA | C | HA | 119.0° | 120.0° |
CA | N | H | H2 | 120.0° | 124.0° |
N | CA | CB | H6 | 68.4° | 55.0° |
N | CA | CB | H7 | 172.4° | 175.0° |
N | CA | C | OXT | 34.8° | 160.0° |
CB | CA | C | HA | 119.8° | 120.0° |
CB | CA | N | H | 180.0° | 176.1° |
CB | CA | N | H2 | 60.0° | 60.0° |
CA | CB | H6 | H7 | 118.7° | 120.0° |
CB | CA | C | OXT | 86.4° | 80.0° |
C | CA | N | H | 58.4° | 63.9° |
C | CA | N | H2 | 61.5° | 60.0° |
C | CA | CB | H6 | 172.4° | 65.0° |
C | CA | CB | H7 | 53.2° | 55.0° |
CA | C | OXT | HXT | 90.0° | 180.0° |
H | N | CA | HA | 59.8° | 56.0° |
H2 | N | CA | HA | 179.8° | 179.9° |
HA | CA | CB | H6 | 52.6° | 175.1° |
HA | CA | CB | H7 | 66.6° | 64.9° |
HA | CA | C | OXT | 153.8° | 40.0° |