2KY
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
O | C | doub | 1.21Å | 1.23Å | |
C | CA | sing | 1.51Å | 1.57Å | |
N | CA | sing | 1.47Å | 1.49Å | |
CA | C33 | sing | 1.53Å | 1.56Å | |
C33 | C34 | sing | 1.54Å | 1.54Å | |
C33 | C37 | sing | 1.55Å | 1.53Å | |
C34 | C35 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
C37 | C36 | sing | 1.55Å | 1.52Å | |
C35 | C36 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
CA | HA | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
N | H | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
C33 | H33 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C34 | H341 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C34 | H342 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C35 | H352 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C35 | H351 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C36 | H361 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C36 | H362 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C37 | H371 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
C37 | H372 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
N | H2 | sing | 1.01Å | 1.00Å | |
C | OXT | sing | 1.34Å | 124.76Å | |
OXT | HXT | sing | 0.97Å | 0.00Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
O | C | CA | 120.6° | 120.0° |
O | C | OXT | 96.2° | 120.0° |
C | CA | N | 108.4° | 109.5° |
C | CA | C33 | 108.7° | 109.5° |
C | CA | HA | 108.9° | 109.4° |
CA | C | OXT | 141.2° | 120.0° |
N | CA | C33 | 111.5° | 109.5° |
N | CA | HA | 110.2° | 109.5° |
CA | N | H | 109.5° | 111.0° |
CA | N | H2 | 109.4° | 111.0° |
CA | C33 | C34 | 114.4° | 110.5° |
CA | C33 | C37 | 114.4° | 110.5° |
C33 | CA | HA | 109.1° | 109.5° |
CA | C33 | H33 | 108.7° | 110.4° |
C34 | C33 | C37 | 100.8° | 104.2° |
C33 | C34 | C35 | 105.2° | 106.6° |
C34 | C33 | H33 | 109.1° | 110.5° |
C33 | C34 | H341 | 110.5° | 110.0° |
C33 | C34 | H342 | 110.5° | 110.1° |
C33 | C37 | C36 | 103.6° | 102.7° |
C37 | C33 | H33 | 109.1° | 110.6° |
C33 | C37 | H371 | 110.9° | 110.8° |
C33 | C37 | H372 | 110.9° | 110.8° |
C34 | C35 | C36 | 106.2° | 106.6° |
C35 | C34 | H341 | 110.6° | 110.0° |
C35 | C34 | H342 | 110.6° | 110.1° |
C34 | C35 | H352 | 110.3° | 110.0° |
C34 | C35 | H351 | 110.3° | 110.1° |
C37 | C36 | C35 | 105.4° | 104.2° |
C37 | C36 | H361 | 110.5° | 110.5° |
C37 | C36 | H362 | 110.5° | 110.6° |
C36 | C37 | H371 | 110.9° | 110.7° |
C36 | C37 | H372 | 110.9° | 110.8° |
C36 | C35 | H352 | 110.3° | 110.0° |
C36 | C35 | H351 | 110.3° | 110.0° |
C35 | C36 | H361 | 110.5° | 110.5° |
C35 | C36 | H362 | 110.5° | 110.5° |
H | N | H2 | 109.5° | 110.9° |
H341 | C34 | H342 | 109.5° | 110.0° |
H352 | C35 | H351 | 109.5° | 110.1° |
H361 | C36 | H362 | 109.5° | 110.4° |
H371 | C37 | H372 | 109.5° | 110.8° |
C | OXT | HXT | 90.0° | 117.0° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
O | C | CA | OXT | 159.6° | 179.8° |
O | C | CA | N | 27.3° | 19.8° |
O | C | CA | C33 | 94.1° | 100.3° |
O | C | CA | HA | 147.2° | 139.8° |
O | C | OXT | HXT | 90.0° | 0.2° |
C | CA | N | C33 | 119.7° | 120.0° |
C | CA | N | HA | 119.1° | 120.0° |
C | CA | C33 | HA | 118.7° | 120.0° |
C | CA | C33 | C34 | 162.4° | 180.0° |
C | CA | C33 | C37 | 82.0° | 65.2° |
C | CA | N | H | 180.0° | 60.1° |
C | CA | C33 | H33 | 40.3° | 57.5° |
C | CA | N | H2 | 60.0° | 176.1° |
CA | C | OXT | HXT | 90.0° | 180.0° |
N | CA | C33 | HA | 121.9° | 120.0° |
N | CA | C33 | C34 | 43.0° | 60.0° |
N | CA | C33 | C37 | 158.5° | 174.8° |
CA | N | H | H2 | 120.0° | 123.9° |
N | CA | C33 | H33 | 79.2° | 62.5° |
N | CA | C | OXT | 173.1° | 160.0° |
CA | C33 | C34 | C37 | 123.2° | 118.7° |
CA | C33 | C34 | H33 | 122.0° | 122.5° |
CA | C33 | C37 | H33 | 122.0° | 122.6° |
CA | C33 | C34 | C35 | 160.5° | 142.3° |
CA | C33 | C37 | C36 | 166.5° | 156.6° |
C33 | CA | N | H | 60.3° | 59.9° |
CA | C33 | C34 | H341 | 41.1° | 23.0° |
CA | C33 | C34 | H342 | 80.2° | 98.4° |
CA | C33 | C37 | H371 | 74.4° | 85.1° |
CA | C33 | C37 | H372 | 47.5° | 38.3° |
C33 | CA | N | H2 | 179.7° | 63.9° |
C33 | CA | C | OXT | 65.5° | 80.0° |
C34 | C33 | C37 | H33 | 114.7° | 118.8° |
C33 | C34 | C35 | H341 | 119.3° | 119.3° |
C33 | C34 | C35 | H342 | 119.3° | 119.3° |
C34 | C33 | C37 | C36 | 43.3° | 37.9° |
C33 | C34 | C35 | C36 | 17.5° | 0.0° |
C34 | C33 | CA | HA | 78.9° | 60.1° |
C33 | C34 | H341 | H342 | 122.0° | 121.4° |
C33 | C34 | C35 | H352 | 137.0° | 119.2° |
C33 | C34 | C35 | H351 | 102.0° | 119.3° |
C34 | C33 | C37 | H371 | 162.3° | 156.2° |
C34 | C33 | C37 | H372 | 75.8° | 80.4° |
C37 | C33 | C34 | C35 | 37.2° | 23.6° |
C33 | C37 | C36 | H371 | 119.1° | 118.3° |
C33 | C37 | C36 | H372 | 119.0° | 118.4° |
C33 | C37 | C36 | C35 | 33.3° | 38.0° |
C37 | C33 | CA | HA | 36.7° | 54.7° |
C37 | C33 | C34 | H341 | 82.1° | 95.6° |
C37 | C33 | C34 | H342 | 156.6° | 143.0° |
C33 | C37 | C36 | H361 | 86.1° | 156.6° |
C33 | C37 | C36 | H362 | 152.6° | 80.8° |
C33 | C37 | H371 | H372 | 122.7° | 123.4° |
C34 | C35 | C36 | C37 | 9.7° | 23.6° |
C34 | C35 | C36 | H352 | 119.5° | 119.2° |
C34 | C35 | C36 | H351 | 119.5° | 119.3° |
C35 | C34 | C33 | H33 | 77.5° | 95.2° |
C35 | C34 | H341 | H342 | 122.0° | 121.4° |
C34 | C35 | H352 | H351 | 121.5° | 121.5° |
C34 | C35 | C36 | H361 | 109.7° | 142.3° |
C34 | C35 | C36 | H362 | 129.0° | 95.2° |
C37 | C36 | C35 | H361 | 119.3° | 118.7° |
C37 | C36 | C35 | H362 | 119.4° | 118.8° |
C36 | C37 | C33 | H33 | 71.4° | 80.8° |
C37 | C36 | C35 | H352 | 109.8° | 95.6° |
C37 | C36 | C35 | H351 | 129.2° | 142.9° |
C37 | C36 | H361 | H362 | 121.9° | 122.7° |
C36 | C37 | H371 | H372 | 122.7° | 123.3° |
C36 | C35 | C34 | H341 | 101.8° | 119.3° |
C36 | C35 | C34 | H342 | 136.8° | 119.3° |
C36 | C35 | H352 | H351 | 121.5° | 121.4° |
C35 | C36 | H361 | H362 | 121.9° | 122.6° |
C35 | C36 | C37 | H371 | 152.4° | 156.3° |
C35 | C36 | C37 | H372 | 85.8° | 80.4° |
HA | CA | N | H | 60.9° | 180.0° |
HA | CA | C33 | H33 | 158.9° | 177.4° |
HA | CA | N | H2 | 59.1° | 56.1° |
HA | CA | C | OXT | 53.3° | 40.0° |
H33 | C33 | C34 | H341 | 163.1° | 145.5° |
H33 | C33 | C34 | H342 | 41.8° | 24.1° |
H33 | C33 | C37 | H371 | 47.6° | 37.4° |
H33 | C33 | C37 | H372 | 169.5° | 160.8° |
H341 | C34 | C35 | H352 | 17.7° | 0.0° |
H341 | C34 | C35 | H351 | 138.7° | 121.4° |
H342 | C34 | C35 | H352 | 103.7° | 121.4° |
H342 | C34 | C35 | H351 | 17.3° | 0.1° |
H352 | C35 | C36 | H361 | 130.9° | 23.0° |
H352 | C35 | C36 | H362 | 9.6° | 145.6° |
H351 | C35 | C36 | H361 | 9.8° | 98.4° |
H351 | C35 | C36 | H362 | 111.5° | 24.1° |
H361 | C36 | C37 | H371 | 33.0° | 85.1° |
H361 | C36 | C37 | H372 | 154.9° | 38.3° |
H362 | C36 | C37 | H371 | 88.3° | 37.5° |
H362 | C36 | C37 | H372 | 33.6° | 160.9° |