1S3

Bonds

First atom	Second atom	Bond order type	Distance (experimental model)	Distance (ideal model)	Properties
O6	C6	sing	1.43Å	1.43Å
O3	C3	sing	1.43Å	1.43Å
C4	O4	sing	1.43Å	1.44Å
C4	C3	sing	1.53Å	1.52Å
C4	C5	sing	1.53Å	1.54Å
C6	C5	sing	1.53Å	1.53Å
O5	C5	sing	1.43Å	1.44Å
O5	C1	sing	1.42Å	1.45Å
C2	C3	sing	1.51Å	1.53Å
C2	C1	sing	1.54Å	1.54Å
C2	O2	sing	1.46Å	1.43Å
C1	O1	sing	1.44Å	1.44Å
O2	P	sing	1.63Å	1.61Å
O1	P	sing	1.63Å	1.62Å
P	O3P	doub	1.48Å	1.51Å
P	O2P	sing	1.61Å	1.51Å
C1	H1	sing	1.09Å	1.10Å
O2P	H2A	sing	0.97Å	0.95Å
C5	H5	sing	1.09Å	1.10Å
C6	H61	sing	1.09Å	1.10Å
C6	H62	sing	1.09Å	1.10Å
O6	HO6	sing	0.97Å	0.95Å
C4	H4	sing	1.09Å	1.10Å
O4	HO4	sing	0.97Å	0.95Å
C3	H3	sing	1.09Å	1.10Å
O3	HO3	sing	0.97Å	0.95Å
C2	H2	sing	1.09Å	1.10Å

Angles

First atom	Second atom	Third atom	Angle (experimental model)	Angle (ideal model)
O6	C6	C5	110.4°	109.5°
O6	C6	H61	109.2°	109.4°
O6	C6	H62	109.2°	109.5°
C6	O6	HO6	109.5°	114.0°
O3	C3	C4	111.5°	109.5°
O3	C3	C2	108.6°	109.6°
O3	C3	H3	109.1°	109.5°
C3	O3	HO3	109.5°	114.0°
O4	C4	C3	108.2°	109.6°
O4	C4	C5	112.3°	109.6°
O4	C4	H4	109.9°	109.6°
C4	O4	HO4	109.5°	114.0°
C3	C4	C5	109.1°	108.8°
C4	C3	C2	111.9°	109.3°
C3	C4	H4	108.7°	109.6°
C4	C3	H3	107.9°	109.4°
C4	C5	C6	112.7°	109.7°
C4	C5	O5	111.8°	108.8°
C4	C5	H5	107.0°	109.6°
C5	C4	H4	108.5°	109.7°
C6	C5	O5	109.8°	109.6°
C6	C5	H5	107.1°	109.6°
C5	C6	H61	109.3°	109.5°
C5	C6	H62	109.2°	109.5°
C5	O5	C1	116.3°	115.4°
O5	C5	H5	108.2°	109.6°
O5	C1	C2	113.7°	111.0°
O5	C1	O1	113.9°	111.3°
O5	C1	H1	107.7°	109.0°
C3	C2	C1	113.9°	110.9°
C3	C2	O2	106.5°	106.2°
C2	C3	H3	107.8°	109.6°
C3	C2	H2	109.0°	111.3°
C1	C2	O2	108.2°	104.8°
C2	C1	O1	106.8°	107.5°
C2	C1	H1	106.6°	109.0°
C1	C2	H2	108.8°	111.0°
C2	O2	P	106.1°	102.0°
O2	C2	H2	110.4°	112.4°
C1	O1	P	106.8°	104.0°
O1	C1	H1	107.8°	108.9°
O2	P	O1	102.5°	103.8°
O2	P	O3P	110.1°	110.6°
O2	P	O2P	109.7°	110.7°
O1	P	O3P	110.3°	110.6°
O1	P	O2P	112.2°	110.6°
O3P	P	O2P	111.6°	110.5°
P	O2P	H2A	109.5°	114.0°
H61	C6	H62	109.5°	109.4°

Dihedrals

First atom	Second atom	Third atom	Fourth atom	Torsion (experimental model)	Torsion (ideal model)
O6	C6	C5	C4	69.7°	175.6°
O6	C6	C5	H61	120.1°	120.0°
O6	C6	C5	H62	120.1°	120.1°
O6	C6	C5	O5	55.6°	65.0°
O6	C6	C5	H5	172.8°	55.2°
O6	C6	H61	H62	119.6°	120.0°
O3	C3	C4	O4	61.9°	61.9°
O3	C3	C4	C2	121.9°	120.1°
O3	C3	C4	H3	119.7°	119.9°
O3	C3	C4	C5	175.6°	178.4°
O3	C3	C2	H3	118.1°	120.1°
O3	C3	C2	C1	170.2°	174.2°
O3	C3	C2	O2	70.6°	72.5°
O3	C3	C4	H4	57.4°	58.4°
O3	C3	C2	H2	48.5°	50.1°
O4	C4	C3	C5	122.5°	119.8°
O4	C4	C3	H4	119.3°	120.3°
O4	C4	C5	H4	121.7°	120.4°
O4	C4	C5	C6	58.1°	60.7°
O4	C4	C5	O5	177.6°	179.5°
O4	C4	C3	C2	176.2°	178.1°
O4	C4	C5	H5	59.4°	59.7°
O4	C4	C3	H3	57.8°	58.1°
C3	C4	C5	H4	118.3°	119.8°
C3	C4	C5	C6	178.1°	179.5°
C3	C4	C5	O5	57.6°	59.7°
C4	C3	C2	H3	118.4°	119.9°
C4	C3	C2	C1	46.8°	54.2°
C4	C3	C2	O2	165.9°	167.5°
C3	C4	C5	H5	60.6°	60.1°
C3	C4	O4	HO4	180.0°	180.0°
C4	C3	O3	HO3	180.0°	60.0°
C4	C3	C2	H2	75.0°	69.9°
C4	C5	C6	O5	125.3°	119.4°
C4	C5	C6	H5	117.4°	120.4°
C4	C5	O5	H5	117.5°	119.8°
C4	C5	O5	C1	55.2°	60.4°
C5	C4	C3	C2	53.7°	58.3°
C4	C5	C6	H61	50.4°	55.7°
C4	C5	C6	H62	170.1°	64.3°
C5	C4	O4	HO4	59.5°	60.8°
C5	C4	C3	H3	64.7°	61.7°
C6	C5	O5	H5	116.6°	120.2°
C6	C5	O5	C1	178.9°	179.6°
C5	C6	H61	H62	119.6°	120.0°
C5	C6	O6	HO6	180.0°	180.0°
C6	C5	C4	H4	63.6°	59.7°
C5	O5	C1	C2	46.4°	56.2°
C5	O5	C1	O1	76.2°	63.4°
C5	O5	C1	H1	164.3°	176.3°
O5	C5	C6	H61	175.7°	175.0°
O5	C5	C6	H62	64.5°	55.0°
O5	C5	C4	H4	60.7°	60.2°
O5	C1	C2	C3	41.6°	51.8°
O5	C1	C2	O1	126.5°	122.0°
O5	C1	C2	H1	118.5°	120.1°
O5	C1	C2	O2	159.7°	166.1°
O5	C1	O1	H1	119.4°	120.3°
O5	C1	O1	P	150.0°	148.3°
C1	O5	C5	H5	62.3°	59.4°
O5	C1	C2	H2	80.3°	72.4°
C3	C2	C1	O2	118.1°	114.2°
C3	C2	C1	H2	121.9°	124.2°
C3	C2	O2	H2	118.2°	121.9°
C3	C2	C1	O1	84.9°	70.1°
C3	C2	O2	P	95.8°	78.4°
C3	C2	C1	H1	160.0°	172.0°
C2	C3	C4	H4	64.4°	61.6°
C2	C3	O3	HO3	56.3°	179.9°
C1	C2	O2	H2	119.0°	120.6°
C2	C1	O1	H1	114.2°	118.0°
C1	C2	O2	P	27.0°	39.0°
C2	C1	O1	P	23.7°	26.5°
C1	C2	C3	H3	71.7°	65.7°
O2	C2	C1	O1	33.2°	44.1°
C2	O2	P	O1	12.1°	22.9°
C2	O2	P	O3P	129.5°	141.5°
C2	O2	P	O2P	107.3°	95.8°
O2	C2	C1	H1	81.8°	73.8°
O2	C2	C3	H3	47.4°	47.6°
C1	O1	P	O2	7.8°	2.7°
C1	O1	P	O3P	109.4°	115.9°
C1	O1	P	O2P	125.4°	121.4°
O1	C1	C2	H2	153.2°	165.7°
O2	P	O1	O3P	117.2°	118.5°
O2	P	O1	O2P	117.6°	118.8°
O2	P	O3P	O2P	122.1°	122.9°
O2	P	O2P	H2A	122.3°	174.4°
P	O2	C2	H2	146.0°	159.7°
O1	P	O3P	O2P	125.5°	122.7°
P	O1	C1	H1	90.6°	91.4°
O1	P	O2P	H2A	124.4°	60.0°
O3P	P	O2P	H2A	0.0°	62.7°
H1	C1	C2	H2	38.2°	47.7°
H5	C5	C6	H61	67.0°	64.7°
H5	C5	C6	H62	52.7°	175.3°
H5	C5	C4	H4	178.9°	179.9°
H61	C6	O6	HO6	59.9°	60.0°
H62	C6	O6	HO6	59.9°	59.9°
H4	C4	O4	HO4	61.4°	59.7°
H4	C4	C3	H3	177.1°	178.4°
H3	C3	O3	HO3	61.0°	59.9°
H3	C3	C2	H2	166.5°	170.2°

Release date:	2013-12-11
Definition date:	2013-05-15
Last modified:	2020-07-17
Release status:	REL
Processing site:	RCSB
Derived from:	4KQ2