1NT
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| O2P | P | sing | 1.62Å | 1.61Å | |
| O2P | HO2P | sing | 0.98Å | 0.95Å | |
| P | O3P | doub | 1.50Å | 1.61Å | |
| P | O2 | sing | 1.62Å | 1.61Å | |
| P | O1P | sing | 1.62Å | 1.48Å | |
| O1P | HO1P | sing | 0.98Å | 0.95Å | |
| O2 | C2 | sing | 1.42Å | 1.43Å | |
| C2 | O3 | sing | 1.42Å | 1.43Å | |
| C2 | C1 | sing | 1.52Å | 1.53Å | |
| C2 | CI3 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
| C1 | O2' | doub | 1.22Å | 1.25Å | |
| C1 | O1 | sing | 1.36Å | 1.25Å | |
| O1 | HO1 | sing | 0.98Å | 0.95Å | |
| O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| CI3 | CA1 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
| CI3 | HI31 | sing | 1.10Å | 1.10Å | |
| CI3 | HI32 | sing | 1.10Å | 1.10Å | |
| CA1 | OA1 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
| CA1 | CA2 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
| CA1 | HA1 | sing | 1.10Å | 1.10Å | |
| OA1 | HOA1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| CA2 | CA3 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
| CA2 | OA2 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
| CA2 | HA2 | sing | 1.10Å | 1.10Å | |
| OA2 | HOA2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| CA3 | OA3 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
| CA3 | CA4 | sing | 1.54Å | 1.53Å | |
| CA3 | HA3 | sing | 1.10Å | 1.10Å | |
| OA3 | HOA3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| CA4 | CA5 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
| CA4 | OA4 | sing | 1.43Å | 1.43Å | |
| CA4 | HA4 | sing | 1.10Å | 1.10Å | |
| OA4 | HOA4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| CA5 | OP4 | sing | 1.42Å | 1.43Å | |
| CA5 | HA51 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| CA5 | HA52 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| OP4 | PA | sing | 1.62Å | 1.61Å | |
| PA | OP2 | doub | 1.50Å | 1.48Å | |
| PA | OP1 | sing | 1.62Å | 1.61Å | |
| PA | OP3 | sing | 1.62Å | 1.61Å | |
| OP3 | HOP3 | sing | 0.98Å | 0.95Å | |
| OP1 | HOP1 | sing | 0.98Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| P | O2P | HO2P | 109.5° | 119.0° |
| O2P | P | O3P | 105.6° | 114.7° |
| O2P | P | O2 | 107.1° | 103.0° |
| O2P | P | O1P | 112.5° | 102.9° |
| O3P | P | O2 | 105.6° | 115.6° |
| O3P | P | O1P | 113.1° | 114.8° |
| O2 | P | O1P | 112.4° | 104.1° |
| P | O2 | C2 | 120.5° | 121.6° |
| P | O1P | HO1P | 109.5° | 118.9° |
| O2 | C2 | O3 | 109.7° | 113.9° |
| O2 | C2 | C1 | 109.8° | 107.7° |
| O2 | C2 | CI3 | 108.0° | 107.5° |
| O3 | C2 | C1 | 109.7° | 109.7° |
| O3 | C2 | CI3 | 109.7° | 109.2° |
| C2 | O3 | HO3 | 109.5° | 108.0° |
| C1 | C2 | CI3 | 109.8° | 108.7° |
| C2 | C1 | O2' | 117.0° | 124.5° |
| C2 | C1 | O1 | 117.1° | 112.6° |
| C2 | CI3 | CA1 | 110.0° | 114.5° |
| C2 | CI3 | HI31 | 109.3° | 109.0° |
| C2 | CI3 | HI32 | 109.1° | 108.1° |
| O2' | C1 | O1 | 125.8° | 122.9° |
| C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 114.6° |
| CA1 | CI3 | HI31 | 109.3° | 108.4° |
| CA1 | CI3 | HI32 | 109.2° | 108.9° |
| CI3 | CA1 | OA1 | 110.0° | 109.5° |
| CI3 | CA1 | CA2 | 108.5° | 113.3° |
| CI3 | CA1 | HA1 | 109.6° | 110.9° |
| HI31 | CI3 | HI32 | 109.9° | 107.7° |
| OA1 | CA1 | CA2 | 109.0° | 106.7° |
| OA1 | CA1 | HA1 | 109.1° | 106.6° |
| CA1 | OA1 | HOA1 | 109.5° | 106.2° |
| CA2 | CA1 | HA1 | 110.6° | 109.5° |
| CA1 | CA2 | CA3 | 111.3° | 115.9° |
| CA1 | CA2 | OA2 | 108.3° | 108.3° |
| CA1 | CA2 | HA2 | 109.2° | 109.2° |
| CA3 | CA2 | OA2 | 110.0° | 109.2° |
| CA3 | CA2 | HA2 | 107.5° | 108.9° |
| CA2 | CA3 | OA3 | 109.7° | 108.5° |
| CA2 | CA3 | CA4 | 109.8° | 115.7° |
| CA2 | CA3 | HA3 | 108.9° | 109.1° |
| OA2 | CA2 | HA2 | 110.5° | 104.8° |
| CA2 | OA2 | HOA2 | 109.5° | 106.2° |
| OA3 | CA3 | CA4 | 109.0° | 108.8° |
| OA3 | CA3 | HA3 | 109.8° | 106.0° |
| CA3 | OA3 | HOA3 | 109.5° | 106.2° |
| CA4 | CA3 | HA3 | 109.6° | 108.3° |
| CA3 | CA4 | CA5 | 111.0° | 112.0° |
| CA3 | CA4 | OA4 | 109.4° | 110.0° |
| CA3 | CA4 | HA4 | 108.5° | 110.1° |
| CA5 | CA4 | OA4 | 109.5° | 108.2° |
| CA5 | CA4 | HA4 | 108.4° | 109.5° |
| CA4 | CA5 | OP4 | 109.3° | 109.8° |
| CA4 | CA5 | HA51 | 109.5° | 111.5° |
| CA4 | CA5 | HA52 | 109.6° | 111.4° |
| OA4 | CA4 | HA4 | 110.0° | 106.9° |
| CA4 | OA4 | HOA4 | 109.5° | 106.4° |
| OP4 | CA5 | HA51 | 109.5° | 108.0° |
| OP4 | CA5 | HA52 | 109.6° | 107.0° |
| CA5 | OP4 | PA | 120.8° | 118.3° |
| HA51 | CA5 | HA52 | 109.3° | 108.9° |
| OP4 | PA | OP2 | 112.9° | 115.1° |
| OP4 | PA | OP1 | 105.5° | 102.7° |
| OP4 | PA | OP3 | 105.6° | 103.8° |
| OP2 | PA | OP1 | 112.4° | 115.0° |
| OP2 | PA | OP3 | 112.7° | 115.3° |
| OP1 | PA | OP3 | 107.2° | 103.3° |
| PA | OP1 | HOP1 | 109.5° | 119.0° |
| PA | OP3 | HOP3 | 109.5° | 118.9° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| O2P | P | O3P | O2 | 113.3° | 119.7° |
| O2P | P | O3P | O1P | 123.4° | 119.0° |
| O2P | P | O2 | O1P | 124.0° | 107.2° |
| O2P | P | O1P | HO1P | 75.4° | 77.7° |
| O2P | P | O2 | C2 | 9.0° | 54.0° |
| HO2P | O2P | P | O3P | 153.7° | 47.7° |
| HO2P | O2P | P | O2 | 94.1° | 78.8° |
| HO2P | O2P | P | O1P | 29.8° | 173.1° |
| O3P | P | O2 | O1P | 123.8° | 126.9° |
| O3P | P | O1P | HO1P | 165.1° | 47.6° |
| O3P | P | O2 | C2 | 103.2° | 180.0° |
| O2 | P | O1P | HO1P | 45.6° | 175.0° |
| P | O2 | C2 | O3 | 59.7° | 62.0° |
| P | O2 | C2 | C1 | 179.6° | 60.0° |
| P | O2 | C2 | CI3 | 59.9° | 176.9° |
| O1P | P | O2 | C2 | 133.0° | 53.1° |
| O2 | C2 | O3 | C1 | 120.7° | 120.8° |
| O2 | C2 | O3 | CI3 | 118.5° | 120.2° |
| O2 | C2 | C1 | CI3 | 118.6° | 116.2° |
| O2 | C2 | C1 | O2' | 63.4° | 123.9° |
| O2 | C2 | C1 | O1 | 116.2° | 55.6° |
| O2 | C2 | O3 | HO3 | 107.0° | 76.5° |
| O2 | C2 | CI3 | CA1 | 151.4° | 62.2° |
| O2 | C2 | CI3 | HI31 | 88.6° | 176.2° |
| O2 | C2 | CI3 | HI32 | 31.6° | 59.4° |
| O3 | C2 | C1 | CI3 | 120.7° | 119.3° |
| O3 | C2 | C1 | O2' | 57.3° | 0.6° |
| O3 | C2 | C1 | O1 | 123.1° | 179.8° |
| O3 | C2 | CI3 | CA1 | 31.8° | 61.9° |
| O3 | C2 | CI3 | HI31 | 151.8° | 59.7° |
| O3 | C2 | CI3 | HI32 | 88.0° | 176.5° |
| C2 | C1 | O2' | O1 | 179.6° | 179.5° |
| C2 | C1 | O1 | HO1 | 179.5° | 179.4° |
| C1 | C2 | O3 | HO3 | 132.3° | 44.3° |
| C1 | C2 | CI3 | CA1 | 88.9° | 178.4° |
| C1 | C2 | CI3 | HI31 | 31.2° | 59.9° |
| C1 | C2 | CI3 | HI32 | 151.4° | 56.9° |
| CI3 | C2 | C1 | O2' | 177.9° | 119.9° |
| CI3 | C2 | C1 | O1 | 2.5° | 60.6° |
| CI3 | C2 | O3 | HO3 | 11.6° | 163.2° |
| C2 | CI3 | CA1 | HI31 | 120.0° | 121.9° |
| C2 | CI3 | CA1 | HI32 | 119.8° | 121.1° |
| C2 | CI3 | HI31 | HI32 | 119.7° | 117.1° |
| C2 | CI3 | CA1 | OA1 | 78.7° | 62.9° |
| C2 | CI3 | CA1 | CA2 | 162.1° | 178.1° |
| C2 | CI3 | CA1 | HA1 | 41.2° | 54.5° |
| O2' | C1 | O1 | HO1 | 0.0° | 0.1° |
| CA1 | CI3 | HI31 | HI32 | 119.8° | 117.7° |
| CI3 | CA1 | OA1 | CA2 | 118.8° | 123.0° |
| CI3 | CA1 | OA1 | HA1 | 120.3° | 120.0° |
| CI3 | CA1 | CA2 | HA1 | 120.3° | 124.4° |
| CI3 | CA1 | OA1 | HOA1 | 110.6° | 10.2° |
| CI3 | CA1 | CA2 | CA3 | 174.5° | 176.6° |
| CI3 | CA1 | CA2 | OA2 | 53.5° | 53.6° |
| CI3 | CA1 | CA2 | HA2 | 66.9° | 60.0° |
| HI31 | CI3 | CA1 | OA1 | 41.3° | 59.0° |
| HI31 | CI3 | CA1 | CA2 | 77.9° | 60.0° |
| HI31 | CI3 | CA1 | HA1 | 161.2° | 176.4° |
| HI32 | CI3 | CA1 | OA1 | 161.5° | 175.9° |
| HI32 | CI3 | CA1 | CA2 | 42.4° | 57.0° |
| HI32 | CI3 | CA1 | HA1 | 78.5° | 66.7° |
| OA1 | CA1 | CA2 | HA1 | 120.0° | 115.0° |
| OA1 | CA1 | CA2 | CA3 | 65.7° | 62.8° |
| OA1 | CA1 | CA2 | OA2 | 173.2° | 174.2° |
| OA1 | CA1 | CA2 | HA2 | 52.8° | 60.6° |
| CA2 | CA1 | OA1 | HOA1 | 130.6° | 112.8° |
| CA1 | CA2 | CA3 | OA2 | 120.1° | 122.6° |
| CA1 | CA2 | CA3 | HA2 | 119.5° | 123.5° |
| CA1 | CA2 | OA2 | HA2 | 119.6° | 116.4° |
| CA1 | CA2 | OA2 | HOA2 | 129.7° | 105.1° |
| CA1 | CA2 | CA3 | OA3 | 57.7° | 55.1° |
| CA1 | CA2 | CA3 | CA4 | 177.4° | 177.6° |
| CA1 | CA2 | CA3 | HA3 | 62.5° | 60.0° |
| HA1 | CA1 | OA1 | HOA1 | 9.7° | 130.3° |
| HA1 | CA1 | CA2 | CA3 | 54.2° | 52.3° |
| HA1 | CA1 | CA2 | OA2 | 66.8° | 70.8° |
| HA1 | CA1 | CA2 | HA2 | 172.8° | 175.7° |
| CA3 | CA2 | OA2 | HA2 | 118.6° | 116.6° |
| CA3 | CA2 | OA2 | HOA2 | 108.4° | 127.9° |
| CA2 | CA3 | OA3 | CA4 | 120.3° | 126.6° |
| CA2 | CA3 | OA3 | HA3 | 119.7° | 117.0° |
| CA2 | CA3 | CA4 | HA3 | 119.7° | 122.8° |
| CA2 | CA3 | OA3 | HOA3 | 50.3° | 99.4° |
| CA2 | CA3 | CA4 | CA5 | 178.4° | 177.2° |
| CA2 | CA3 | CA4 | OA4 | 57.4° | 62.4° |
| CA2 | CA3 | CA4 | HA4 | 62.6° | 55.1° |
| OA2 | CA2 | CA3 | OA3 | 62.4° | 67.5° |
| OA2 | CA2 | CA3 | CA4 | 57.3° | 55.1° |
| OA2 | CA2 | CA3 | HA3 | 177.4° | 177.4° |
| HA2 | CA2 | OA2 | HOA2 | 10.1° | 11.3° |
| HA2 | CA2 | CA3 | OA3 | 177.2° | 178.6° |
| HA2 | CA2 | CA3 | CA4 | 63.1° | 58.9° |
| HA2 | CA2 | CA3 | HA3 | 57.0° | 63.5° |
| OA3 | CA3 | CA4 | HA3 | 120.2° | 114.8° |
| OA3 | CA3 | CA4 | CA5 | 61.4° | 54.8° |
| OA3 | CA3 | CA4 | OA4 | 177.6° | 175.2° |
| OA3 | CA3 | CA4 | HA4 | 57.6° | 67.3° |
| CA4 | CA3 | OA3 | HOA3 | 70.0° | 133.9° |
| CA3 | CA4 | CA5 | OA4 | 120.9° | 121.4° |
| CA3 | CA4 | CA5 | HA4 | 119.1° | 122.4° |
| CA3 | CA4 | OA4 | HA4 | 119.1° | 119.4° |
| CA3 | CA4 | OA4 | HOA4 | 71.3° | 91.1° |
| CA3 | CA4 | CA5 | OP4 | 175.6° | 59.7° |
| CA3 | CA4 | CA5 | HA51 | 55.6° | 60.0° |
| CA3 | CA4 | CA5 | HA52 | 64.3° | 178.1° |
| HA3 | CA3 | OA3 | HOA3 | 170.0° | 17.6° |
| HA3 | CA3 | CA4 | CA5 | 58.8° | 60.0° |
| HA3 | CA3 | CA4 | OA4 | 62.2° | 60.4° |
| HA3 | CA3 | CA4 | HA4 | 177.8° | 177.9° |
| CA5 | CA4 | OA4 | HA4 | 119.0° | 117.9° |
| CA5 | CA4 | OA4 | HOA4 | 50.6° | 31.5° |
| CA4 | CA5 | OP4 | HA51 | 120.0° | 121.8° |
| CA4 | CA5 | OP4 | HA52 | 120.1° | 121.1° |
| CA4 | CA5 | HA51 | HA52 | 120.1° | 123.4° |
| CA4 | CA5 | OP4 | PA | 167.2° | 180.0° |
| OA4 | CA4 | CA5 | OP4 | 63.4° | 61.7° |
| OA4 | CA4 | CA5 | HA51 | 176.6° | 178.7° |
| OA4 | CA4 | CA5 | HA52 | 56.7° | 56.7° |
| HA4 | CA4 | OA4 | HOA4 | 169.6° | 149.4° |
| HA4 | CA4 | CA5 | OP4 | 56.6° | 177.9° |
| HA4 | CA4 | CA5 | HA51 | 63.4° | 62.5° |
| HA4 | CA4 | CA5 | HA52 | 176.7° | 59.5° |
| OP4 | CA5 | HA51 | HA52 | 120.1° | 115.9° |
| CA5 | OP4 | PA | OP2 | 5.2° | 180.0° |
| CA5 | OP4 | PA | OP1 | 117.9° | 54.3° |
| CA5 | OP4 | PA | OP3 | 128.7° | 53.0° |
| HA51 | CA5 | OP4 | PA | 72.8° | 58.2° |
| HA52 | CA5 | OP4 | PA | 47.0° | 58.9° |
| OP4 | PA | OP2 | OP1 | 119.2° | 119.1° |
| OP4 | PA | OP2 | OP3 | 119.5° | 120.9° |
| OP4 | PA | OP1 | OP3 | 112.2° | 107.7° |
| OP4 | PA | OP3 | HOP3 | 125.4° | 175.7° |
| OP4 | PA | OP1 | HOP1 | 104.0° | 173.8° |
| OP2 | PA | OP1 | OP3 | 124.4° | 126.5° |
| OP2 | PA | OP3 | HOP3 | 1.7° | 48.8° |
| OP2 | PA | OP1 | HOP1 | 132.6° | 48.0° |
| OP1 | PA | OP3 | HOP3 | 122.5° | 77.5° |
| OP3 | PA | OP1 | HOP1 | 8.3° | 78.4° |
