Loading
PDBj
MenuPDBj@FacebookPDBj@TwitterPDBj@YouTubewwPDB FoundationwwPDB
RCSB PDBPDBeBMRBAdv. SearchSearch help

2IBA

Urate oxidase from Aspergillus flavus complexed with its inhibitor 8-azaxanthine

Functional Information from GO Data
ChainGOidnamespacecontents
A0004846molecular_functionurate oxidase activity
A0005777cellular_componentperoxisome
A0006144biological_processpurine nucleobase metabolic process
A0006145biological_processpurine nucleobase catabolic process
A0016491molecular_functionoxidoreductase activity
A0019628biological_processurate catabolic process
Functional Information from PDB Data
site_idAC1
Number of Residues6
DetailsBINDING SITE FOR RESIDUE NA A 650
ChainResidue
AILE88
ATYR91
AASN92
AILE94
AGLU136
AHOH802

site_idAC2
Number of Residues10
DetailsBINDING SITE FOR RESIDUE AZA A 651
ChainResidue
APHE159
AARG176
ASER226
AVAL227
AGLN228
AASN254
AHOH660
AILE54
AALA56
ATHR57

Functional Information from PROSITE/UniProt
site_idPS00366
Number of Residues28
DetailsURICASE Uricase signature. LtVLKSTnSqFwgFlrdeYttLketwdR
ChainResidueDetails
ALEU149-ARG176

Functional Information from SwissProt/UniProt
site_idSWS_FT_FI1
Number of Residues3
DetailsACT_SITE: Charge relay system => ECO:0000269|PubMed:24466188, ECO:0007744|PDB:4N3M, ECO:0007744|PDB:4N9M, ECO:0007744|PDB:4N9S, ECO:0007744|PDB:4N9V
ChainResidueDetails
AASP11
AASP58
ATYR257

site_idSWS_FT_FI2
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:9360612, ECO:0007744|PDB:1R4S, ECO:0007744|PDB:1R51, ECO:0007744|PDB:1WS2, ECO:0007744|PDB:2FUB, ECO:0007744|PDB:2FXL, ECO:0007744|PDB:2IBA, ECO:0007744|PDB:2IC0, ECO:0007744|PDB:2ICQ, ECO:0007744|PDB:2PES, ECO:0007744|PDB:2ZKA, ECO:0007744|PDB:2ZKB, ECO:0007744|PDB:3BK8, ECO:0007744|PDB:3CKS, ECO:0007744|PDB:3CKU, ECO:0007744|PDB:3F2M, ECO:0007744|PDB:3GKO, ECO:0007744|PDB:3LBG, ECO:0007744|PDB:3LD4, ECO:0007744|PDB:3P9F, ECO:0007744|PDB:3PJK, ECO:0007744|PDB:3PK3, ECO:0007744|PDB:3PK4, ECO:0007744|PDB:3PK5, ECO:0007744|PDB:3PK6, ECO:0007744|PDB:3PK8, ECO:0007744|PDB:3PKF, ECO:0007744|PDB:3PKG, ECO:0007744|PDB:3PKH, ECO:0007744|PDB:3PKK, ECO:0007744|PDB:3PKL, ECO:0007744|PDB:3PKS, ECO:0007744|PDB:3PKT, ECO:0007744|PDB:3PKU, ECO:0007744|PDB:3PLE, ECO:0007744|PDB:3PLG, ECO:0007744|PDB:3PLH, ECO:0007744|PDB:3PLI, ECO:0007744|PDB:3PLJ, ECO:0007744|PDB:3PLM, ECO:0007744|PDB:4CW0, ECO:0007744|PDB:4CW2, ECO:0007744|PDB:4CW3, ECO:0007744|PDB:4CW6, ECO:0007744|PDB:4N9S, ECO:0007744|PDB:4N9V, ECO:0007744|PDB:4OP6, ECO:0007744|PDB:4OP9, ECO:0007744|PDB:5FRC
ChainResidueDetails
AASP58

site_idSWS_FT_FI3
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:9360612, ECO:0007744|PDB:1R4S, ECO:0007744|PDB:3LBG, ECO:0007744|PDB:3LD4, ECO:0007744|PDB:4CW0, ECO:0007744|PDB:4CW2, ECO:0007744|PDB:4CW3, ECO:0007744|PDB:4CW6, ECO:0007744|PDB:4N9S
ChainResidueDetails
ASER59

site_idSWS_FT_FI4
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:9360612, ECO:0007744|PDB:1R4S, ECO:0007744|PDB:1R51, ECO:0007744|PDB:1WS3, ECO:0007744|PDB:1XT4, ECO:0007744|PDB:1XY3, ECO:0007744|PDB:2FUB, ECO:0007744|PDB:2IBA, ECO:0007744|PDB:2IC0, ECO:0007744|PDB:2ICQ, ECO:0007744|PDB:2PES, ECO:0007744|PDB:2ZKA, ECO:0007744|PDB:2ZKB, ECO:0007744|PDB:3BK8, ECO:0007744|PDB:3CKS, ECO:0007744|PDB:3CKU, ECO:0007744|PDB:3F2M, ECO:0007744|PDB:3GKO, ECO:0007744|PDB:3L8W, ECO:0007744|PDB:3P9F, ECO:0007744|PDB:3PJK, ECO:0007744|PDB:3PK3, ECO:0007744|PDB:3PK4, ECO:0007744|PDB:3PK5, ECO:0007744|PDB:3PK6, ECO:0007744|PDB:3PK8, ECO:0007744|PDB:3PKF, ECO:0007744|PDB:3PKG, ECO:0007744|PDB:3PKH, ECO:0007744|PDB:3PKK, ECO:0007744|PDB:3PKL, ECO:0007744|PDB:3PKS, ECO:0007744|PDB:3PKT, ECO:0007744|PDB:3PKU, ECO:0007744|PDB:3PLE, ECO:0007744|PDB:3PLG, ECO:0007744|PDB:3PLH, ECO:0007744|PDB:3PLI, ECO:0007744|PDB:3PLJ, ECO:0007744|PDB:3PLM, ECO:0007744|PDB:4CW0, ECO:0007744|PDB:4CW2, ECO:0007744|PDB:4CW3, ECO:0007744|PDB:4CW6, ECO:0007744|PDB:4N9V, ECO:0007744|PDB:4OP6, ECO:0007744|PDB:4OP9, ECO:0007744|PDB:5FRC
ChainResidueDetails
ATRP160

site_idSWS_FT_FI5
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:9360612, ECO:0007744|PDB:1R4S, ECO:0007744|PDB:1R51, ECO:0007744|PDB:1WRR, ECO:0007744|PDB:1WS2, ECO:0007744|PDB:1WS3, ECO:0007744|PDB:1XT4, ECO:0007744|PDB:1XXJ, ECO:0007744|PDB:1XY3, ECO:0007744|PDB:2FUB, ECO:0007744|PDB:2IBA, ECO:0007744|PDB:2IC0, ECO:0007744|PDB:2ICQ, ECO:0007744|PDB:2PES, ECO:0007744|PDB:2ZKA, ECO:0007744|PDB:2ZKB, ECO:0007744|PDB:3BK8, ECO:0007744|PDB:3CKS, ECO:0007744|PDB:3CKU, ECO:0007744|PDB:3F2M, ECO:0007744|PDB:3GKO, ECO:0007744|PDB:3L8W, ECO:0007744|PDB:3LBG, ECO:0007744|PDB:3P9F, ECO:0007744|PDB:3PJK, ECO:0007744|PDB:3PK3, ECO:0007744|PDB:3PK4, ECO:0007744|PDB:3PK5, ECO:0007744|PDB:3PK6, ECO:0007744|PDB:3PK8, ECO:0007744|PDB:3PKF, ECO:0007744|PDB:3PKG, ECO:0007744|PDB:3PKH, ECO:0007744|PDB:3PKK, ECO:0007744|PDB:3PKL, ECO:0007744|PDB:3PKS, ECO:0007744|PDB:3PKT, ECO:0007744|PDB:3PKU, ECO:0007744|PDB:3PLE, ECO:0007744|PDB:3PLG, ECO:0007744|PDB:3PLH, ECO:0007744|PDB:3PLI, ECO:0007744|PDB:3PLJ, ECO:0007744|PDB:3PLM, ECO:0007744|PDB:4CW0, ECO:0007744|PDB:4CW2, ECO:0007744|PDB:4CW3, ECO:0007744|PDB:4CW6, ECO:0007744|PDB:4N9V, ECO:0007744|PDB:4OP6, ECO:0007744|PDB:4OP9, ECO:0007744|PDB:5FRC
ChainResidueDetails
AILE177

site_idSWS_FT_FI6
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:9360612, ECO:0007744|PDB:1R4S, ECO:0007744|PDB:1R51, ECO:0007744|PDB:1WRR, ECO:0007744|PDB:1XT4, ECO:0007744|PDB:1XXJ, ECO:0007744|PDB:1XY3, ECO:0007744|PDB:2FUB, ECO:0007744|PDB:2IBA, ECO:0007744|PDB:2IC0, ECO:0007744|PDB:2ICQ, ECO:0007744|PDB:2PES, ECO:0007744|PDB:2ZKA, ECO:0007744|PDB:2ZKB, ECO:0007744|PDB:3BK8, ECO:0007744|PDB:3CKS, ECO:0007744|PDB:3CKU, ECO:0007744|PDB:3F2M, ECO:0007744|PDB:3GKO, ECO:0007744|PDB:3L8W, ECO:0007744|PDB:3P9F, ECO:0007744|PDB:3PJK, ECO:0007744|PDB:3PK3, ECO:0007744|PDB:3PK4, ECO:0007744|PDB:3PK5, ECO:0007744|PDB:3PK6, ECO:0007744|PDB:3PK8, ECO:0007744|PDB:3PKF, ECO:0007744|PDB:3PKG, ECO:0007744|PDB:3PKH, ECO:0007744|PDB:3PKK, ECO:0007744|PDB:3PKL, ECO:0007744|PDB:3PKS, ECO:0007744|PDB:3PKT, ECO:0007744|PDB:3PKU, ECO:0007744|PDB:3PLE, ECO:0007744|PDB:3PLG, ECO:0007744|PDB:3PLH, ECO:0007744|PDB:3PLI, ECO:0007744|PDB:3PLJ, ECO:0007744|PDB:3PLM, ECO:0007744|PDB:4CW0, ECO:0007744|PDB:4CW2, ECO:0007744|PDB:4CW3, ECO:0007744|PDB:4CW6, ECO:0007744|PDB:4N9V, ECO:0007744|PDB:4OP6, ECO:0007744|PDB:4OP9, ECO:0007744|PDB:5FRC
ChainResidueDetails
AGLN228

site_idSWS_FT_FI7
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:9360612, ECO:0007744|PDB:1R4S, ECO:0007744|PDB:1R51, ECO:0007744|PDB:1WRR, ECO:0007744|PDB:1WS2, ECO:0007744|PDB:1XT4, ECO:0007744|PDB:1XXJ, ECO:0007744|PDB:1XY3, ECO:0007744|PDB:2FUB, ECO:0007744|PDB:2IBA, ECO:0007744|PDB:2IC0, ECO:0007744|PDB:2ICQ, ECO:0007744|PDB:2PES, ECO:0007744|PDB:2ZKA, ECO:0007744|PDB:2ZKB, ECO:0007744|PDB:3BK8, ECO:0007744|PDB:3CKS, ECO:0007744|PDB:3CKU, ECO:0007744|PDB:3F2M, ECO:0007744|PDB:3GKO, ECO:0007744|PDB:3L8W, ECO:0007744|PDB:3LBG, ECO:0007744|PDB:3LD4, ECO:0007744|PDB:3P9F, ECO:0007744|PDB:3PJK, ECO:0007744|PDB:3PK3, ECO:0007744|PDB:3PK4, ECO:0007744|PDB:3PK5, ECO:0007744|PDB:3PK6, ECO:0007744|PDB:3PK8, ECO:0007744|PDB:3PKF, ECO:0007744|PDB:3PKG, ECO:0007744|PDB:3PKH, ECO:0007744|PDB:3PKK, ECO:0007744|PDB:3PKL, ECO:0007744|PDB:3PKS, ECO:0007744|PDB:3PKT, ECO:0007744|PDB:3PKU, ECO:0007744|PDB:3PLE, ECO:0007744|PDB:3PLG, ECO:0007744|PDB:3PLH, ECO:0007744|PDB:3PLI, ECO:0007744|PDB:3PLJ, ECO:0007744|PDB:3PLM, ECO:0007744|PDB:4CW0, ECO:0007744|PDB:4CW2, ECO:0007744|PDB:4CW3, ECO:0007744|PDB:4CW6, ECO:0007744|PDB:4N9S, ECO:0007744|PDB:4N9V, ECO:0007744|PDB:4OP6, ECO:0007744|PDB:4OP9, ECO:0007744|PDB:5FRC
ChainResidueDetails
AALA229

site_idSWS_FT_FI8
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0007744|PDB:4CW2, ECO:0007744|PDB:4CW3, ECO:0007744|PDB:4CW6
ChainResidueDetails
ALYS255

site_idSWS_FT_FI9
Number of Residues1
DetailsMOD_RES: N-acetylserine => ECO:0000305|PubMed:1339455, ECO:0007744|PDB:1R4S, ECO:0007744|PDB:1R4U, ECO:0007744|PDB:1R51, ECO:0007744|PDB:1R56, ECO:0007744|PDB:1WRR, ECO:0007744|PDB:1WS2, ECO:0007744|PDB:1WS3, ECO:0007744|PDB:1XT4, ECO:0007744|PDB:1XXJ, ECO:0007744|PDB:1XY3, ECO:0007744|PDB:2FXL, ECO:0007744|PDB:3BJP, ECO:0007744|PDB:4FSK
ChainResidueDetails
AALA2

Catalytic Information from CSA
site_idMCSA1
Number of Residues5
DetailsM-CSA 118
ChainResidueDetails
AASP11hydrogen bond donor, proton acceptor, proton donor, proton relay
AASP58electrostatic stabiliser, hydrogen bond acceptor, hydrogen bond donor, proton acceptor, proton donor, proton relay
AILE177electrostatic stabiliser
AALA229electrostatic stabiliser, hydrogen bond acceptor, hydrogen bond donor
ATYR257hydrogen bond acceptor, hydrogen bond donor, proton acceptor, proton donor, proton relay

218853

PDB entries from 2024-04-24

PDB statisticsPDBj update infoContact PDBjnumon