PDBj Mine
PDBj Mine はPDBjで開発した、PDBエントリーの検索サービスです。以下のような特徴があります。
- PDBj Mine は関係データベース(PortgreSQL)を使っています。
- 簡易検索(キーワード検索)、詳細検索、SQL検索などの検索方法を提供しています。後に挙げた検索方法の方がより詳細な検索に向いています。
- 各種検索語には日本語が使え、自動的に英語に変換して検索が行われます。
- 結果はウェブページで得られる他、各種フォーマットでダウンロードすることもできます。
- REST APIを使って検索を行い、結果を得ることもできます。
各検索方法については以下をご覧ください。
その他関連情報
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文献:
PDBj Mine: Design and implementation of relational database interface for Protein Data Bank Japan.
Kinjo AR, Yamashita R, Nakamura H.
Database, 2010:baq021 (2010) PubMed:20798081 DOI:10.1093/database/BAQ021 - PDBj Mineの使い方を紹介した対話型チュートリアル
- PDBj Mine:ローカルインストール PDBj Mineの関係データベースをローカルにインストールする方法について
作成日: 2018-04-09 (最終更新日: more than 1 year ago)